MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	TG	3	6	974	979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021813	TG	3	6	1109	1114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021813	GT	3	6	1405	1410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021813	AT	3	6	2402	2407	50 %	50 %	0 %	0 %	525819457
5	NC_021813	TA	3	6	2671	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	525819457
6	NC_021813	AC	4	8	2987	2994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021813	TA	3	6	3005	3010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021813	AT	3	6	3146	3151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021813	GT	3	6	3360	3365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021813	TA	3	6	3459	3464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021813	CT	3	6	3575	3580	0 %	50 %	0 %	50 %	525819446
12	NC_021813	GC	4	8	3902	3909	0 %	0 %	50 %	50 %	525819446
13	NC_021813	GA	3	6	4753	4758	50 %	0 %	50 %	0 %	525819459
14	NC_021813	AG	3	6	5540	5545	50 %	0 %	50 %	0 %	525819459
15	NC_021813	GC	3	6	6865	6870	0 %	0 %	50 %	50 %	525819460
16	NC_021813	AG	3	6	8932	8937	50 %	0 %	50 %	0 %	525819462
17	NC_021813	TC	3	6	10479	10484	0 %	50 %	0 %	50 %	525819463
18	NC_021813	CT	3	6	10531	10536	0 %	50 %	0 %	50 %	525819463
19	NC_021813	AT	3	6	10773	10778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021813	TC	3	6	11463	11468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021813	TA	3	6	12308	12313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021813	GA	3	6	12388	12393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021813	CA	3	6	13000	13005	50 %	0 %	0 %	50 %	525819466
24	NC_021813	GT	3	6	13861	13866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021813	AG	3	6	14154	14159	50 %	0 %	50 %	0 %	525819468
26	NC_021813	TG	3	6	14324	14329	0 %	50 %	50 %	0 %	525819468
27	NC_021813	TA	4	8	14509	14516	50 %	50 %	0 %	0 %	525819468
28	NC_021813	TC	3	6	15285	15290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021813	AT	3	6	16307	16312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021813	GA	3	6	17693	17698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021813	CA	3	6	18334	18339	50 %	0 %	0 %	50 %	525819473
32	NC_021813	GC	3	6	18763	18768	0 %	0 %	50 %	50 %	525819473
33	NC_021813	CG	3	6	19328	19333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021813	CA	3	6	19391	19396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021813	CT	3	6	19632	19637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021813	TA	3	6	19813	19818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021813	TA	3	6	19824	19829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021813	CT	3	6	20911	20916	0 %	50 %	0 %	50 %	525819476
39	NC_021813	GA	3	6	21406	21411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021813	GC	3	6	21644	21649	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
41	NC_021813	GC	3	6	21974	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
42	NC_021813	CG	3	6	22678	22683	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
43	NC_021813	CG	3	6	22887	22892	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
44	NC_021813	GC	3	6	23088	23093	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
45	NC_021813	CG	3	6	23375	23380	0 %	0 %	50 %	50 %	525819478
46	NC_021813	GC	3	6	23618	23623	0 %	0 %	50 %	50 %	525819478
47	NC_021813	CG	3	6	23819	23824	0 %	0 %	50 %	50 %	525819478
48	NC_021813	GT	3	6	24519	24524	0 %	50 %	50 %	0 %	525819479
49	NC_021813	TG	3	6	25031	25036	0 %	50 %	50 %	0 %	525819479
50	NC_021813	CA	4	8	25356	25363	50 %	0 %	0 %	50 %	525819479
51	NC_021813	CG	3	6	26835	26840	0 %	0 %	50 %	50 %	525819481
52	NC_021813	CG	3	6	27063	27068	0 %	0 %	50 %	50 %	525819481
53	NC_021813	AT	3	6	28500	28505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021813	GT	3	6	28684	28689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021813	CG	3	6	28788	28793	0 %	0 %	50 %	50 %	525819483
56	NC_021813	GC	3	6	28893	28898	0 %	0 %	50 %	50 %	525819483
57	NC_021813	CG	3	6	29681	29686	0 %	0 %	50 %	50 %	525819483
58	NC_021813	CA	3	6	29985	29990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021813	TG	3	6	30201	30206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021813	GC	5	10	30236	30245	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
61	NC_021813	GC	3	6	30272	30277	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
62	NC_021813	GC	3	6	30575	30580	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
63	NC_021813	GC	3	6	31178	31183	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
64	NC_021813	GC	3	6	31220	31225	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
65	NC_021813	CG	3	6	31402	31407	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
66	NC_021813	CG	3	6	31600	31605	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
67	NC_021813	GC	3	6	31665	31670	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
68	NC_021813	GC	3	6	31703	31708	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
69	NC_021813	CG	3	6	32237	32242	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
70	NC_021813	CG	3	6	32389	32394	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
71	NC_021813	CG	3	6	32615	32620	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
72	NC_021813	GC	3	6	33361	33366	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
73	NC_021813	GC	4	8	33749	33756	0 %	0 %	50 %	50 %	525819485
74	NC_021813	CG	3	6	33960	33965	0 %	0 %	50 %	50 %	525819485
75	NC_021813	GC	5	10	33979	33988	0 %	0 %	50 %	50 %	525819485
76	NC_021813	AT	3	6	34132	34137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021813	GC	3	6	34208	34213	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
78	NC_021813	GC	3	6	34270	34275	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
79	NC_021813	CG	3	6	34557	34562	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
80	NC_021813	GC	3	6	34911	34916	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
81	NC_021813	AT	3	6	35061	35066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021813	GC	3	6	35287	35292	0 %	0 %	50 %	50 %	525819449
83	NC_021813	CT	3	6	35776	35781	0 %	50 %	0 %	50 %	525819449
84	NC_021813	TG	3	6	35879	35884	0 %	50 %	50 %	0 %	525819449
85	NC_021813	CG	3	6	36824	36829	0 %	0 %	50 %	50 %	525819487
86	NC_021813	GC	3	6	36936	36941	0 %	0 %	50 %	50 %	525819487
87	NC_021813	GC	3	6	38053	38058	0 %	0 %	50 %	50 %	525819450
88	NC_021813	GC	3	6	38208	38213	0 %	0 %	50 %	50 %	525819450
89	NC_021813	GC	3	6	39796	39801	0 %	0 %	50 %	50 %	525819489
90	NC_021813	GC	3	6	41067	41072	0 %	0 %	50 %	50 %	525819489
91	NC_021813	GA	3	6	42133	42138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021813	TC	4	8	42231	42238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021813	GA	3	6	44552	44557	50 %	0 %	50 %	0 %	525819493
94	NC_021813	CA	3	6	44866	44871	50 %	0 %	0 %	50 %	525819494
95	NC_021813	TA	3	6	45672	45677	50 %	50 %	0 %	0 %	525819495
96	NC_021813	CA	3	6	45747	45752	50 %	0 %	0 %	50 %	525819495
97	NC_021813	AT	3	6	46596	46601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021813	TC	3	6	46602	46607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021813	AC	3	6	48730	48735	50 %	0 %	0 %	50 %	525819498
100	NC_021813	GA	3	6	48812	48817	50 %	0 %	50 %	0 %	525819498
101	NC_021813	AG	3	6	48869	48874	50 %	0 %	50 %	0 %	525819498
102	NC_021813	AT	3	6	49776	49781	50 %	50 %	0 %	0 %	525819498
103	NC_021813	AT	3	6	50620	50625	50 %	50 %	0 %	0 %	525819499
104	NC_021813	GC	3	6	51504	51509	0 %	0 %	50 %	50 %	525819501
105	NC_021813	TG	3	6	52023	52028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021813	TG	3	6	52099	52104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021813	GC	3	6	53163	53168	0 %	0 %	50 %	50 %	525819504
108	NC_021813	CT	3	6	53322	53327	0 %	50 %	0 %	50 %	525819504
109	NC_021813	AT	3	6	54780	54785	50 %	50 %	0 %	0 %	525819505
110	NC_021813	GA	3	6	54898	54903	50 %	0 %	50 %	0 %	525819505
111	NC_021813	TA	3	6	55147	55152	50 %	50 %	0 %	0 %	525819506
112	NC_021813	GA	3	6	55921	55926	50 %	0 %	50 %	0 %	525819507
113	NC_021813	TA	3	6	56396	56401	50 %	50 %	0 %	0 %	525819507
114	NC_021813	TA	5	10	57224	57233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021813	CA	3	6	57257	57262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021813	GT	3	6	57437	57442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021813	TG	3	6	57761	57766	0 %	50 %	50 %	0 %	525819509
118	NC_021813	AC	3	6	57846	57851	50 %	0 %	0 %	50 %	525819509
119	NC_021813	TG	3	6	58051	58056	0 %	50 %	50 %	0 %	525819509
120	NC_021813	CA	3	6	59381	59386	50 %	0 %	0 %	50 %	525819510
121	NC_021813	GC	3	6	59612	59617	0 %	0 %	50 %	50 %	525819511
122	NC_021813	GC	3	6	59977	59982	0 %	0 %	50 %	50 %	525819512
123	NC_021813	GC	3	6	62200	62205	0 %	0 %	50 %	50 %	525819516
124	NC_021813	CG	3	6	62611	62616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021813	GT	3	6	62987	62992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021813	GA	3	6	63920	63925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021813	AG	3	6	64164	64169	50 %	0 %	50 %	0 %	525819518
128	NC_021813	CG	3	6	64178	64183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021813	CG	3	6	64840	64845	0 %	0 %	50 %	50 %	525819519
130	NC_021813	TC	3	6	66483	66488	0 %	50 %	0 %	50 %	525819520
131	NC_021813	TG	3	6	67908	67913	0 %	50 %	50 %	0 %	525819522
132	NC_021813	GT	3	6	69331	69336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021813	CT	3	6	70131	70136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021813	CG	3	6	70432	70437	0 %	0 %	50 %	50 %	525819525
135	NC_021813	CA	3	6	71719	71724	50 %	0 %	0 %	50 %	525819527
136	NC_021813	GT	3	6	72209	72214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021813	GC	3	6	72690	72695	0 %	0 %	50 %	50 %	525819528
138	NC_021813	TC	3	6	73608	73613	0 %	50 %	0 %	50 %	525819529
139	NC_021813	TC	3	6	73827	73832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021813	CG	3	6	73987	73992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021813	CA	3	6	75902	75907	50 %	0 %	0 %	50 %	525819531
142	NC_021813	CA	3	6	76345	76350	50 %	0 %	0 %	50 %	525819531
143	NC_021813	GA	3	6	78388	78393	50 %	0 %	50 %	0 %	525819532
144	NC_021813	CA	3	6	78606	78611	50 %	0 %	0 %	50 %	525819532
145	NC_021813	CA	3	6	79698	79703	50 %	0 %	0 %	50 %	525819533
146	NC_021813	AG	3	6	80135	80140	50 %	0 %	50 %	0 %	525819533
147	NC_021813	CT	3	6	80922	80927	0 %	50 %	0 %	50 %	525819534
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.