MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 11209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021812	ATCG	2	8	42	49	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021812	TGGC	2	8	67	74	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021812	GGCC	2	8	825	832	0 %	0 %	50 %	50 %	525826476
4	NC_021812	GCTG	2	8	1837	1844	0 %	25 %	50 %	25 %	525826477
5	NC_021812	TACA	2	8	2548	2555	50 %	25 %	0 %	25 %	525826477
6	NC_021812	GTTG	2	8	2850	2857	0 %	50 %	50 %	0 %	525826478
7	NC_021812	CGCC	2	8	2886	2893	0 %	0 %	25 %	75 %	525826478
8	NC_021812	GCGG	2	8	3133	3140	0 %	0 %	75 %	25 %	525826478
9	NC_021812	GCGG	2	8	3391	3398	0 %	0 %	75 %	25 %	525826478
10	NC_021812	ATTT	2	8	4476	4483	25 %	75 %	0 %	0 %	525826479
11	NC_021812	CTTT	2	8	5765	5772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021812	TTTA	2	8	5814	5821	25 %	75 %	0 %	0 %	525826480
13	NC_021812	CGTC	2	8	6355	6362	0 %	25 %	25 %	50 %	525826480
14	NC_021812	GGCA	2	8	6402	6409	25 %	0 %	50 %	25 %	525826480
15	NC_021812	CAGC	2	8	6505	6512	25 %	0 %	25 %	50 %	525826480
16	NC_021812	GGAG	2	8	7313	7320	25 %	0 %	75 %	0 %	525826481
17	NC_021812	CTGT	2	8	7653	7660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021812	TGGC	2	8	8055	8062	0 %	25 %	50 %	25 %	525826482
19	NC_021812	TCAA	2	8	9510	9517	50 %	25 %	0 %	25 %	525826483
20	NC_021812	AGCA	2	8	9838	9845	50 %	0 %	25 %	25 %	525826483
21	NC_021812	GTTG	2	8	10776	10783	0 %	50 %	50 %	0 %	525826484
22	NC_021812	TTCA	2	8	11127	11134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021812	GGCA	2	8	12147	12154	25 %	0 %	50 %	25 %	525826486
24	NC_021812	AGCG	2	8	12907	12914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021812	CGCC	2	8	13533	13540	0 %	0 %	25 %	75 %	525830073
26	NC_021812	AGTC	2	8	14065	14072	25 %	25 %	25 %	25 %	525830073
27	NC_021812	GCGG	2	8	15008	15015	0 %	0 %	75 %	25 %	525826487
28	NC_021812	GCGA	2	8	15782	15789	25 %	0 %	50 %	25 %	525826488
29	NC_021812	GTTT	2	8	16282	16289	0 %	75 %	25 %	0 %	525826489
30	NC_021812	CTGA	2	8	16446	16453	25 %	25 %	25 %	25 %	525826489
31	NC_021812	CTGA	2	8	17322	17329	25 %	25 %	25 %	25 %	525826490
32	NC_021812	ATTA	2	8	17425	17432	50 %	50 %	0 %	0 %	525826490
33	NC_021812	AGCC	2	8	17760	17767	25 %	0 %	25 %	50 %	525826491
34	NC_021812	GACC	2	8	17829	17836	25 %	0 %	25 %	50 %	525826491
35	NC_021812	CATT	2	8	18752	18759	25 %	50 %	0 %	25 %	525826492
36	NC_021812	ATGA	2	8	18786	18793	50 %	25 %	25 %	0 %	525826492
37	NC_021812	ATAA	2	8	18883	18890	75 %	25 %	0 %	0 %	525826492
38	NC_021812	AAAT	2	8	19062	19069	75 %	25 %	0 %	0 %	525826492
39	NC_021812	CGCC	2	8	19093	19100	0 %	0 %	25 %	75 %	525826492
40	NC_021812	CGTC	2	8	20156	20163	0 %	25 %	25 %	50 %	525826494
41	NC_021812	GCTG	2	8	20672	20679	0 %	25 %	50 %	25 %	525826495
42	NC_021812	TGGC	2	8	21110	21117	0 %	25 %	50 %	25 %	525826495
43	NC_021812	GTCA	2	8	21492	21499	25 %	25 %	25 %	25 %	525826495
44	NC_021812	CTGA	2	8	21945	21952	25 %	25 %	25 %	25 %	525826495
45	NC_021812	CATT	2	8	22463	22470	25 %	50 %	0 %	25 %	525826496
46	NC_021812	GTTT	2	8	22687	22694	0 %	75 %	25 %	0 %	525826497
47	NC_021812	GCAG	2	8	23202	23209	25 %	0 %	50 %	25 %	525826497
48	NC_021812	CTGA	2	8	23869	23876	25 %	25 %	25 %	25 %	525826497
49	NC_021812	CCAG	2	8	24342	24349	25 %	0 %	25 %	50 %	525826497
50	NC_021812	AGAC	2	8	24616	24623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021812	TTTC	2	8	25258	25265	0 %	75 %	0 %	25 %	525826498
52	NC_021812	GAAC	2	8	25492	25499	50 %	0 %	25 %	25 %	525826498
53	NC_021812	TCTT	2	8	26112	26119	0 %	75 %	0 %	25 %	525826498
54	NC_021812	AAAC	2	8	26655	26662	75 %	0 %	0 %	25 %	525826499
55	NC_021812	CCTG	2	8	27213	27220	0 %	25 %	25 %	50 %	525826499
56	NC_021812	TGGC	2	8	27458	27465	0 %	25 %	50 %	25 %	525826499
57	NC_021812	CCAG	2	8	28422	28429	25 %	0 %	25 %	50 %	525826499
58	NC_021812	CCTG	2	8	28911	28918	0 %	25 %	25 %	50 %	525826499
59	NC_021812	CAGC	2	8	30028	30035	25 %	0 %	25 %	50 %	525826499
60	NC_021812	CGCT	2	8	30691	30698	0 %	25 %	25 %	50 %	525826500
61	NC_021812	GCGT	2	8	30883	30890	0 %	25 %	50 %	25 %	525826500
62	NC_021812	GTAC	2	8	31374	31381	25 %	25 %	25 %	25 %	525826500
63	NC_021812	CGCA	2	8	31841	31848	25 %	0 %	25 %	50 %	525826500
64	NC_021812	GGCG	2	8	32661	32668	0 %	0 %	75 %	25 %	525826502
65	NC_021812	CAGT	2	8	33047	33054	25 %	25 %	25 %	25 %	525826502
66	NC_021812	TATG	2	8	33875	33882	25 %	50 %	25 %	0 %	525830075
67	NC_021812	CCAA	2	8	33942	33949	50 %	0 %	0 %	50 %	525830075
68	NC_021812	CTGC	2	8	34515	34522	0 %	25 %	25 %	50 %	525830075
69	NC_021812	GACA	2	8	34578	34585	50 %	0 %	25 %	25 %	525830075
70	NC_021812	GTAT	2	8	34831	34838	25 %	50 %	25 %	0 %	525830075
71	NC_021812	GAAA	2	8	34878	34885	75 %	0 %	25 %	0 %	525830075
72	NC_021812	GATT	2	8	35065	35072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021812	AGGA	2	8	35918	35925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021812	AGCG	2	8	36785	36792	25 %	0 %	50 %	25 %	525826503
75	NC_021812	GCGG	2	8	37283	37290	0 %	0 %	75 %	25 %	525830076
76	NC_021812	TTAA	2	8	37522	37529	50 %	50 %	0 %	0 %	525830076
77	NC_021812	CAAG	2	8	37864	37871	50 %	0 %	25 %	25 %	525830077
78	NC_021812	GATG	2	8	38002	38009	25 %	25 %	50 %	0 %	525830077
79	NC_021812	CTGG	2	8	38236	38243	0 %	25 %	50 %	25 %	525830077
80	NC_021812	TCCA	2	8	38495	38502	25 %	25 %	0 %	50 %	525830077
81	NC_021812	TGGC	2	8	38535	38542	0 %	25 %	50 %	25 %	525830077
82	NC_021812	TCGC	2	8	38836	38843	0 %	25 %	25 %	50 %	525826504
83	NC_021812	GCTT	2	8	39143	39150	0 %	50 %	25 %	25 %	525826504
84	NC_021812	ATTA	2	8	39296	39303	50 %	50 %	0 %	0 %	525826504
85	NC_021812	CGGG	2	8	39398	39405	0 %	0 %	75 %	25 %	525826504
86	NC_021812	CGCT	2	8	41905	41912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021812	ACTC	2	8	41947	41954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021812	AATG	2	8	42141	42148	50 %	25 %	25 %	0 %	525826507
89	NC_021812	TCTT	2	8	42975	42982	0 %	75 %	0 %	25 %	525826508
90	NC_021812	CAGC	2	8	43735	43742	25 %	0 %	25 %	50 %	525826508
91	NC_021812	GTCA	2	8	44144	44151	25 %	25 %	25 %	25 %	525826508
92	NC_021812	TAGA	2	8	44223	44230	50 %	25 %	25 %	0 %	525826508
93	NC_021812	CTGG	2	8	44467	44474	0 %	25 %	50 %	25 %	525826508
94	NC_021812	CAGG	2	8	44492	44499	25 %	0 %	50 %	25 %	525826508
95	NC_021812	GGCT	2	8	44702	44709	0 %	25 %	50 %	25 %	525826508
96	NC_021812	TGGC	2	8	44799	44806	0 %	25 %	50 %	25 %	525826508
97	NC_021812	GATC	2	8	45091	45098	25 %	25 %	25 %	25 %	525826508
98	NC_021812	GTTG	2	8	45164	45171	0 %	50 %	50 %	0 %	525826508
99	NC_021812	AGTG	2	8	45920	45927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021812	ATAA	2	8	45948	45955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021812	GCGG	2	8	46324	46331	0 %	0 %	75 %	25 %	525826509
102	NC_021812	TATT	2	8	46854	46861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021812	TTTC	2	8	47079	47086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021812	CGAA	2	8	47347	47354	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021812	AATA	2	8	47362	47369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021812	AACG	2	8	48165	48172	50 %	0 %	25 %	25 %	525826510
107	NC_021812	TGGG	2	8	49050	49057	0 %	25 %	75 %	0 %	525826510
108	NC_021812	ATTT	2	8	49255	49262	25 %	75 %	0 %	0 %	525826511
109	NC_021812	TCTT	2	8	49313	49320	0 %	75 %	0 %	25 %	525826511
110	NC_021812	TAAG	2	8	50189	50196	50 %	25 %	25 %	0 %	525826512
111	NC_021812	CGTG	2	8	50727	50734	0 %	25 %	50 %	25 %	525826512
112	NC_021812	GGTG	2	8	50781	50788	0 %	25 %	75 %	0 %	525826512
113	NC_021812	GGCT	2	8	51006	51013	0 %	25 %	50 %	25 %	525826512
114	NC_021812	GCTT	2	8	51895	51902	0 %	50 %	25 %	25 %	525826513
115	NC_021812	CTGG	2	8	52351	52358	0 %	25 %	50 %	25 %	525826514
116	NC_021812	CGTG	2	8	52522	52529	0 %	25 %	50 %	25 %	525826514
117	NC_021812	GGAA	2	8	53059	53066	50 %	0 %	50 %	0 %	525826514
118	NC_021812	CTTT	2	8	53164	53171	0 %	75 %	0 %	25 %	525826515
119	NC_021812	CTGG	2	8	53346	53353	0 %	25 %	50 %	25 %	525826515
120	NC_021812	GCGA	2	8	53535	53542	25 %	0 %	50 %	25 %	525826515
121	NC_021812	TCAG	2	8	54340	54347	25 %	25 %	25 %	25 %	525830078
122	NC_021812	CGCC	2	8	54689	54696	0 %	0 %	25 %	75 %	525826516
123	NC_021812	CAGC	2	8	57336	57343	25 %	0 %	25 %	50 %	525826518
124	NC_021812	ATAA	2	8	57577	57584	75 %	25 %	0 %	0 %	525826519
125	NC_021812	TTCC	2	8	57744	57751	0 %	50 %	0 %	50 %	525826519
126	NC_021812	CAGC	2	8	57826	57833	25 %	0 %	25 %	50 %	525826519
127	NC_021812	GGCA	2	8	57865	57872	25 %	0 %	50 %	25 %	525826519
128	NC_021812	CGCA	2	8	58237	58244	25 %	0 %	25 %	50 %	525826520
129	NC_021812	ATAA	2	8	58382	58389	75 %	25 %	0 %	0 %	525826520
130	NC_021812	CAAC	2	8	58929	58936	50 %	0 %	0 %	50 %	525826521
131	NC_021812	CTGC	2	8	59249	59256	0 %	25 %	25 %	50 %	525826521
132	NC_021812	TGGT	2	8	59700	59707	0 %	50 %	50 %	0 %	525826522
133	NC_021812	CATG	2	8	59834	59841	25 %	25 %	25 %	25 %	525826522
134	NC_021812	AGCC	2	8	59968	59975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021812	GCGT	2	8	60781	60788	0 %	25 %	50 %	25 %	525826523
136	NC_021812	TTCT	2	8	60989	60996	0 %	75 %	0 %	25 %	525826524
137	NC_021812	TCGC	2	8	61331	61338	0 %	25 %	25 %	50 %	525826524
138	NC_021812	AGCG	2	8	61492	61499	25 %	0 %	50 %	25 %	525826524
139	NC_021812	GTTT	2	8	62460	62467	0 %	75 %	25 %	0 %	525826526
140	NC_021812	TTGC	2	8	63187	63194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021812	TTGT	2	8	63424	63431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021812	GCAC	2	8	63777	63784	25 %	0 %	25 %	50 %	525826528
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