MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021812	AG	3	6	171082	171087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021812	CAT	2	6	171145	171150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826608
3503	NC_021812	TCC	2	6	171172	171177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826608
3504	NC_021812	CTT	3	9	171193	171201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826608
3505	NC_021812	GCG	2	6	171352	171357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
3506	NC_021812	ATGAA	2	10	171377	171386	60 %	20 %	20 %	0 %	525826608
3507	NC_021812	CCG	2	6	171470	171475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826608
3508	NC_021812	AAC	2	6	171602	171607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826608
3509	NC_021812	GCA	2	6	171613	171618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826608
3510	NC_021812	ACT	2	6	171669	171674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826608
3511	NC_021812	ATG	2	6	171709	171714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826608
3512	NC_021812	GCA	2	6	171798	171803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826608
3513	NC_021812	GCG	2	6	171829	171834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
3514	NC_021812	CAT	2	6	171892	171897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826608
3515	NC_021812	CAG	2	6	171901	171906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826608
3516	NC_021812	GCA	2	6	171909	171914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826608
3517	NC_021812	CAA	2	6	171922	171927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826608
3518	NC_021812	GGA	2	6	171954	171959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826608
3519	NC_021812	TCT	2	6	172006	172011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826608
3520	NC_021812	CAG	2	6	172021	172026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826608
3521	NC_021812	GCC	2	6	172030	172035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826608
3522	NC_021812	AGCC	2	8	172140	172147	25 %	0 %	25 %	50 %	525826608
3523	NC_021812	CCA	2	6	172196	172201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826608
3524	NC_021812	A	7	7	172207	172213	100 %	0 %	0 %	0 %	525826608
3525	NC_021812	CCG	2	6	172226	172231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826608
3526	NC_021812	CGG	2	6	172277	172282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
3527	NC_021812	GGC	2	6	172287	172292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
3528	NC_021812	GGT	2	6	172323	172328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826608
3529	NC_021812	GC	3	6	172361	172366	0 %	0 %	50 %	50 %	525826608
3530	NC_021812	GGC	2	6	172368	172373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
3531	NC_021812	ATGA	2	8	172456	172463	50 %	25 %	25 %	0 %	525826608
3532	NC_021812	TGA	2	6	172521	172526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826608
3533	NC_021812	GTCA	2	8	172549	172556	25 %	25 %	25 %	25 %	525826608
3534	NC_021812	CAA	2	6	172585	172590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826608
3535	NC_021812	CGG	2	6	172619	172624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
3536	NC_021812	CGCTT	2	10	172626	172635	0 %	40 %	20 %	40 %	525826608
3537	NC_021812	GAA	2	6	172636	172641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826608
3538	NC_021812	GCC	2	6	172645	172650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826608
3539	NC_021812	CGA	2	6	172697	172702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826608
3540	NC_021812	ATC	2	6	172707	172712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826608
3541	NC_021812	CGC	2	6	172807	172812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826609
3542	NC_021812	TCT	2	6	172928	172933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826609
3543	NC_021812	CGTAAT	2	12	172962	172973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525826609
3544	NC_021812	GGCA	2	8	173023	173030	25 %	0 %	50 %	25 %	525826609
3545	NC_021812	GAC	2	6	173095	173100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826609
3546	NC_021812	CAG	2	6	173191	173196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826609
3547	NC_021812	GATC	2	8	173250	173257	25 %	25 %	25 %	25 %	525826609
3548	NC_021812	GCAA	2	8	173276	173283	50 %	0 %	25 %	25 %	525826609
3549	NC_021812	GCC	2	6	173351	173356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826609
3550	NC_021812	CAGCG	2	10	173368	173377	20 %	0 %	40 %	40 %	525826609
3551	NC_021812	GC	3	6	173385	173390	0 %	0 %	50 %	50 %	525826609
3552	NC_021812	CAC	2	6	173398	173403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826609
3553	NC_021812	CGG	2	6	173442	173447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826609
3554	NC_021812	GC	3	6	173511	173516	0 %	0 %	50 %	50 %	525826609
3555	NC_021812	GTT	2	6	173553	173558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826609
3556	NC_021812	GTTC	2	8	173562	173569	0 %	50 %	25 %	25 %	525826609
3557	NC_021812	GCTG	2	8	173585	173592	0 %	25 %	50 %	25 %	525826609
3558	NC_021812	CG	3	6	173614	173619	0 %	0 %	50 %	50 %	525826609
3559	NC_021812	T	7	7	173696	173702	0 %	100 %	0 %	0 %	525826609
3560	NC_021812	GTT	2	6	173747	173752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021812	ATT	2	6	173779	173784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021812	TTTTA	2	10	173813	173822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021812	TGA	2	6	173824	173829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021812	TTC	2	6	173943	173948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021812	CAG	2	6	174074	174079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826610
3566	NC_021812	GTACG	2	10	174091	174100	20 %	20 %	40 %	20 %	525826610
3567	NC_021812	AAT	2	6	174143	174148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826610
3568	NC_021812	AGA	2	6	174235	174240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826610
3569	NC_021812	CAT	2	6	174268	174273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826610
3570	NC_021812	TTA	2	6	174292	174297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826610
3571	NC_021812	TC	4	8	174301	174308	0 %	50 %	0 %	50 %	525826610
3572	NC_021812	GGCG	2	8	174310	174317	0 %	0 %	75 %	25 %	525826610
3573	NC_021812	GCGG	2	8	174436	174443	0 %	0 %	75 %	25 %	525826610
3574	NC_021812	ACG	2	6	174504	174509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826610
3575	NC_021812	TGC	2	6	174526	174531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826610
3576	NC_021812	TGA	2	6	174595	174600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826610
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3578	NC_021812	ATG	2	6	174719	174724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826610
3579	NC_021812	CGC	2	6	174770	174775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826610
3580	NC_021812	TGA	2	6	174838	174843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826610
3581	NC_021812	GC	3	6	174863	174868	0 %	0 %	50 %	50 %	525826610
3582	NC_021812	GTC	2	6	174912	174917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826610
3583	NC_021812	CAG	2	6	175031	175036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826610
3584	NC_021812	CGA	2	6	175105	175110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826610
3585	NC_021812	TTC	2	6	175170	175175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826610
3586	NC_021812	GAA	2	6	175316	175321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826610
3587	NC_021812	AAGG	2	8	175388	175395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021812	TGG	2	6	175422	175427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826611
3589	NC_021812	CGT	2	6	175453	175458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826611
3590	NC_021812	GAA	2	6	175463	175468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826611
3591	NC_021812	GCCGC	2	10	175496	175505	0 %	0 %	40 %	60 %	525826611
3592	NC_021812	CGG	3	9	175621	175629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826611
3593	NC_021812	CCG	2	6	175680	175685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826611
3594	NC_021812	CGG	3	9	175723	175731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826611
3595	NC_021812	GCC	2	6	175756	175761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826611
3596	NC_021812	GTG	2	6	175799	175804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826611
3597	NC_021812	CGCTG	2	10	175906	175915	0 %	20 %	40 %	40 %	525826611
3598	NC_021812	GGC	2	6	175946	175951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826611
3599	NC_021812	CCG	2	6	175983	175988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826611
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3601	NC_021812	A	7	7	176101	176107	100 %	0 %	0 %	0 %	525826611
3602	NC_021812	CGT	2	6	176236	176241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826611
3603	NC_021812	CTT	2	6	176266	176271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826611
3604	NC_021812	GCG	2	6	176273	176278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826611
3605	NC_021812	TGA	2	6	176298	176303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826611
3606	NC_021812	A	6	6	176370	176375	100 %	0 %	0 %	0 %	525826611
3607	NC_021812	GCG	2	6	176386	176391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826611
3608	NC_021812	GCT	2	6	176413	176418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826611
3609	NC_021812	CGA	2	6	176437	176442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826611
3610	NC_021812	GGC	2	6	176451	176456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826611
3611	NC_021812	GTC	2	6	176495	176500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826611
3612	NC_021812	GCA	2	6	176509	176514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826611
3613	NC_021812	GTAT	2	8	176614	176621	25 %	50 %	25 %	0 %	525826611
3614	NC_021812	GAATGA	2	12	176662	176673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525826611
3615	NC_021812	CG	3	6	176736	176741	0 %	0 %	50 %	50 %	525826611
3616	NC_021812	TGC	2	6	176745	176750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826611
3617	NC_021812	TGCG	2	8	176850	176857	0 %	25 %	50 %	25 %	525826611
3618	NC_021812	GAA	2	6	176923	176928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021812	TGC	2	6	176929	176934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_021812	TCGG	2	8	176953	176960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_021812	CAA	2	6	177009	177014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021812	ATT	2	6	177019	177024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021812	TGC	2	6	177069	177074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_021812	A	6	6	177077	177082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021812	TTA	2	6	177144	177149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826612
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3627	NC_021812	CCG	2	6	177168	177173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826612
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3630	NC_021812	GC	3	6	177318	177323	0 %	0 %	50 %	50 %	525826612
3631	NC_021812	CGC	2	6	177357	177362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826612
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3646	NC_021812	CTG	2	6	178142	178147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826612
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3655	NC_021812	TCCT	2	8	178906	178913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3656	NC_021812	TGC	2	6	179035	179040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826613
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3663	NC_021812	G	6	6	179475	179480	0 %	0 %	100 %	0 %	525826613
3664	NC_021812	AAT	2	6	179559	179564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3729	NC_021812	GATAA	2	10	182984	182993	60 %	20 %	20 %	0 %	525826618
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3732	NC_021812	CAT	2	6	183136	183141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826618
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3734	NC_021812	AGA	2	6	183230	183235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3735	NC_021812	CT	3	6	183243	183248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3736	NC_021812	CG	3	6	183321	183326	0 %	0 %	50 %	50 %	525826619
3737	NC_021812	T	6	6	183358	183363	0 %	100 %	0 %	0 %	525826619
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3742	NC_021812	AAC	2	6	183623	183628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826619
3743	NC_021812	CGATG	2	10	183648	183657	20 %	20 %	40 %	20 %	525826619
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3745	NC_021812	GAT	2	6	183838	183843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826619
3746	NC_021812	CGG	2	6	183855	183860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826619
3747	NC_021812	CGC	2	6	183927	183932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826619
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3756	NC_021812	ATG	2	6	184476	184481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826620
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3829	NC_021812	CTGC	2	8	188696	188703	0 %	25 %	25 %	50 %	525826625
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3850	NC_021812	TTACT	2	10	189680	189689	20 %	60 %	0 %	20 %	525830103
3851	NC_021812	CGCA	2	8	189708	189715	25 %	0 %	25 %	50 %	525830103
3852	NC_021812	GGC	3	9	189728	189736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830103
3853	NC_021812	TC	3	6	189956	189961	0 %	50 %	0 %	50 %	525830103
3854	NC_021812	GGT	2	6	189965	189970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830103
3855	NC_021812	ATG	2	6	189972	189977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830103
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3858	NC_021812	AAG	2	6	190114	190119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830103
3859	NC_021812	CGC	2	6	190128	190133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830103
3860	NC_021812	T	7	7	190293	190299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3861	NC_021812	GCGCT	2	10	190305	190314	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3862	NC_021812	TAT	2	6	190368	190373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3863	NC_021812	CAT	2	6	190382	190387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3864	NC_021812	TTTA	2	8	190426	190433	25 %	75 %	0 %	0 %	525826626
3865	NC_021812	CA	3	6	190486	190491	50 %	0 %	0 %	50 %	525826626
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3867	NC_021812	GCA	2	6	190669	190674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826626
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3993	NC_021812	ATC	2	6	197262	197267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830104
3994	NC_021812	A	6	6	197334	197339	100 %	0 %	0 %	0 %	525830104
3995	NC_021812	TTC	2	6	197357	197362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830104
3996	NC_021812	CCG	2	6	197374	197379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3997	NC_021812	AAT	2	6	197401	197406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_021812	CAG	2	6	197416	197421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_021812	TA	3	6	197538	197543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_021812	ACA	2	6	197590	197595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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