MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021812	GA	3	6	146744	146749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021812	GC	3	6	146753	146758	0 %	0 %	50 %	50 %	525830095
3003	NC_021812	TGGG	2	8	146766	146773	0 %	25 %	75 %	0 %	525830095
3004	NC_021812	TTA	2	6	146784	146789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830095
3005	NC_021812	CAG	2	6	146817	146822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830095
3006	NC_021812	GCG	2	6	146829	146834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830095
3007	NC_021812	GCG	2	6	146856	146861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830095
3008	NC_021812	GCGAA	2	10	146875	146884	40 %	0 %	40 %	20 %	525830095
3009	NC_021812	GC	3	6	146950	146955	0 %	0 %	50 %	50 %	525830095
3010	NC_021812	GCC	2	6	146991	146996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830095
3011	NC_021812	TTA	2	6	147011	147016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830095
3012	NC_021812	GCG	2	6	147020	147025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_021812	GTT	2	6	147095	147100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826592
3014	NC_021812	CAT	2	6	147208	147213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826592
3015	NC_021812	ATTG	2	8	147276	147283	25 %	50 %	25 %	0 %	525826592
3016	NC_021812	GGT	2	6	147372	147377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826592
3017	NC_021812	CA	3	6	147418	147423	50 %	0 %	0 %	50 %	525826592
3018	NC_021812	ATG	2	6	147434	147439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826592
3019	NC_021812	TTC	2	6	147464	147469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826592
3020	NC_021812	CGG	2	6	147724	147729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
3021	NC_021812	CAT	2	6	147734	147739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826593
3022	NC_021812	CGTT	2	8	147781	147788	0 %	50 %	25 %	25 %	525826593
3023	NC_021812	CATC	2	8	147797	147804	25 %	25 %	0 %	50 %	525826593
3024	NC_021812	TTC	2	6	147826	147831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826593
3025	NC_021812	GCC	2	6	147844	147849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826593
3026	NC_021812	AATC	2	8	147854	147861	50 %	25 %	0 %	25 %	525826593
3027	NC_021812	GC	3	6	147863	147868	0 %	0 %	50 %	50 %	525826593
3028	NC_021812	TGC	2	6	147915	147920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826593
3029	NC_021812	AAC	2	6	147988	147993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826593
3030	NC_021812	GCG	2	6	148030	148035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
3031	NC_021812	GCG	2	6	148096	148101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
3032	NC_021812	CGG	2	6	148216	148221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
3033	NC_021812	TCA	3	9	148229	148237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826593
3034	NC_021812	ACC	2	6	148288	148293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826593
3035	NC_021812	ATT	2	6	148329	148334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826593
3036	NC_021812	T	6	6	148374	148379	0 %	100 %	0 %	0 %	525826593
3037	NC_021812	CGT	2	6	148406	148411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826593
3038	NC_021812	CAG	2	6	148470	148475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826593
3039	NC_021812	A	6	6	148482	148487	100 %	0 %	0 %	0 %	525826593
3040	NC_021812	CA	3	6	148598	148603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_021812	A	6	6	148626	148631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_021812	AAT	2	6	148637	148642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021812	CATA	2	8	148650	148657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_021812	AAT	2	6	148663	148668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021812	GCC	2	6	148829	148834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
3046	NC_021812	CTG	2	6	148850	148855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826594
3047	NC_021812	TGA	2	6	148878	148883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826594
3048	NC_021812	GTTG	2	8	149061	149068	0 %	50 %	50 %	0 %	525826594
3049	NC_021812	CGC	2	6	149137	149142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
3050	NC_021812	TGC	2	6	149172	149177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826594
3051	NC_021812	CAG	2	6	149267	149272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826594
3052	NC_021812	CGC	2	6	149350	149355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
3053	NC_021812	TGG	2	6	149475	149480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826594
3054	NC_021812	TGAT	2	8	149931	149938	25 %	50 %	25 %	0 %	525826594
3055	NC_021812	TGA	2	6	149950	149955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826594
3056	NC_021812	GGCG	2	8	149971	149978	0 %	0 %	75 %	25 %	525826594
3057	NC_021812	CG	3	6	149991	149996	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
3058	NC_021812	TTC	2	6	150057	150062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826594
3059	NC_021812	GC	3	6	150148	150153	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
3060	NC_021812	GC	3	6	150327	150332	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
3061	NC_021812	TGC	2	6	150375	150380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826594
3062	NC_021812	CGGG	2	8	150449	150456	0 %	0 %	75 %	25 %	525826594
3063	NC_021812	TGG	2	6	150518	150523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826594
3064	NC_021812	CCG	2	6	150618	150623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
3065	NC_021812	CAGGGG	2	12	150626	150637	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525826594
3066	NC_021812	CG	3	6	150759	150764	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
3067	NC_021812	GCA	2	6	150934	150939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826594
3068	NC_021812	GCG	2	6	151032	151037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826594
3069	NC_021812	TGGC	2	8	151081	151088	0 %	25 %	50 %	25 %	525826594
3070	NC_021812	GGT	2	6	151141	151146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826594
3071	NC_021812	GGC	2	6	151255	151260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826594
3072	NC_021812	GAA	2	6	151322	151327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826594
3073	NC_021812	CCT	2	6	151409	151414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826594
3074	NC_021812	ATAA	2	8	151440	151447	75 %	25 %	0 %	0 %	525826594
3075	NC_021812	GTG	2	6	151492	151497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826595
3076	NC_021812	CGC	2	6	151521	151526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826595
3077	NC_021812	GAA	2	6	151603	151608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826595
3078	NC_021812	TG	3	6	151699	151704	0 %	50 %	50 %	0 %	525826596
3079	NC_021812	GC	3	6	151724	151729	0 %	0 %	50 %	50 %	525826596
3080	NC_021812	TGG	2	6	151767	151772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826596
3081	NC_021812	ATG	2	6	151782	151787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826596
3082	NC_021812	ATCA	2	8	151814	151821	50 %	25 %	0 %	25 %	525826596
3083	NC_021812	CAG	2	6	151841	151846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826596
3084	NC_021812	ATC	2	6	151860	151865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826596
3085	NC_021812	GC	3	6	151912	151917	0 %	0 %	50 %	50 %	525826596
3086	NC_021812	T	7	7	151984	151990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021812	CTG	2	6	152131	152136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_021812	CGT	2	6	152153	152158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_021812	T	6	6	152327	152332	0 %	100 %	0 %	0 %	525830096
3090	NC_021812	AT	3	6	152349	152354	50 %	50 %	0 %	0 %	525830096
3091	NC_021812	TCA	2	6	152360	152365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830096
3092	NC_021812	ATG	2	6	152452	152457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830096
3093	NC_021812	GGC	2	6	152478	152483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830096
3094	NC_021812	GCG	2	6	152488	152493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830096
3095	NC_021812	ACG	2	6	152568	152573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826597
3096	NC_021812	GCC	2	6	152610	152615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826597
3097	NC_021812	CCG	2	6	152736	152741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826597
3098	NC_021812	GA	3	6	152748	152753	50 %	0 %	50 %	0 %	525826597
3099	NC_021812	ACC	2	6	152754	152759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826597
3100	NC_021812	AGT	2	6	152839	152844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826597
3101	NC_021812	CGT	2	6	152899	152904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826597
3102	NC_021812	TTCAG	2	10	152910	152919	20 %	40 %	20 %	20 %	525826597
3103	NC_021812	TCA	2	6	152928	152933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826597
3104	NC_021812	CTG	2	6	152951	152956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826597
3105	NC_021812	CCA	2	6	152995	153000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826597
3106	NC_021812	GCC	2	6	153030	153035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826597
3107	NC_021812	AGTC	2	8	153094	153101	25 %	25 %	25 %	25 %	525826597
3108	NC_021812	TTG	2	6	153206	153211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021812	AT	3	6	153248	153253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021812	ATT	2	6	153271	153276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021812	AAC	2	6	153278	153283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_021812	A	7	7	153286	153292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021812	TGC	2	6	153347	153352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826598
3114	NC_021812	CAG	2	6	153400	153405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826598
3115	NC_021812	TGC	2	6	153422	153427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826598
3116	NC_021812	GC	3	6	153445	153450	0 %	0 %	50 %	50 %	525826598
3117	NC_021812	AAAG	2	8	153465	153472	75 %	0 %	25 %	0 %	525826598
3118	NC_021812	A	6	6	153474	153479	100 %	0 %	0 %	0 %	525826598
3119	NC_021812	GAAA	2	8	153516	153523	75 %	0 %	25 %	0 %	525826598
3120	NC_021812	GCG	2	6	153535	153540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826598
3121	NC_021812	GCG	2	6	153559	153564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826598
3122	NC_021812	AGA	2	6	153605	153610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826598
3123	NC_021812	ATC	2	6	153638	153643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826598
3124	NC_021812	ACC	2	6	153682	153687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826598
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3126	NC_021812	GC	3	6	153766	153771	0 %	0 %	50 %	50 %	525826598
3127	NC_021812	GGC	2	6	153814	153819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826598
3128	NC_021812	TGA	2	6	153878	153883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826598
3129	NC_021812	CTG	2	6	153895	153900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826598
3130	NC_021812	CAG	2	6	153910	153915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826598
3131	NC_021812	CAT	2	6	153942	153947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826598
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3146	NC_021812	GAT	2	6	154917	154922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826598
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3154	NC_021812	GGT	2	6	155172	155177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826598
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3163	NC_021812	GTT	2	6	155604	155609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826598
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3222	NC_021812	TGGTC	2	10	158546	158555	0 %	40 %	40 %	20 %	525826600
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3229	NC_021812	TAT	2	6	158932	158937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_021812	AAATA	2	10	158953	158962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_021812	GCC	2	6	159265	159270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830097
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3237	NC_021812	GAA	2	6	159577	159582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_021812	AGT	2	6	159587	159592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_021812	TTTG	2	8	159622	159629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_021812	CCA	2	6	159643	159648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3241	NC_021812	TAAGC	2	10	159655	159664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3242	NC_021812	TTG	2	6	159694	159699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_021812	TC	3	6	159715	159720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3244	NC_021812	AAT	2	6	159725	159730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_021812	AAC	2	6	159747	159752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_021812	GTGA	2	8	159782	159789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_021812	CGA	2	6	159801	159806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_021812	ATA	3	9	159855	159863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_021812	ATT	2	6	159889	159894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3371	NC_021812	CTAT	2	8	165129	165136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3372	NC_021812	ATT	2	6	165153	165158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_021812	ATCC	2	8	170892	170899	25 %	25 %	0 %	50 %	525826607
3500	NC_021812	GAAT	2	8	170975	170982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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