MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_021812	AG	3	6	122044	122049	50 %	0 %	50 %	0 %	525830088
2503	NC_021812	CAT	2	6	122059	122064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830088
2504	NC_021812	AAG	2	6	122072	122077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830088
2505	NC_021812	AAG	2	6	122182	122187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830088
2506	NC_021812	CAAAT	2	10	122204	122213	60 %	20 %	0 %	20 %	525830088
2507	NC_021812	CTT	2	6	122308	122313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830088
2508	NC_021812	TAT	2	6	122323	122328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830088
2509	NC_021812	A	7	7	122330	122336	100 %	0 %	0 %	0 %	525830088
2510	NC_021812	GTG	2	6	122338	122343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830088
2511	NC_021812	ATA	2	6	122349	122354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830088
2512	NC_021812	ACA	2	6	122403	122408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830088
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2514	NC_021812	CCAG	2	8	122464	122471	25 %	0 %	25 %	50 %	525830088
2515	NC_021812	TGT	2	6	122483	122488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830088
2516	NC_021812	ATT	2	6	122570	122575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830088
2517	NC_021812	A	6	6	122589	122594	100 %	0 %	0 %	0 %	525830088
2518	NC_021812	TAG	2	6	122621	122626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830088
2519	NC_021812	A	6	6	122645	122650	100 %	0 %	0 %	0 %	525830088
2520	NC_021812	GATC	2	8	122704	122711	25 %	25 %	25 %	25 %	525830088
2521	NC_021812	AAG	2	6	122768	122773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830088
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2523	NC_021812	GCC	2	6	122881	122886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830088
2524	NC_021812	ATGA	2	8	122894	122901	50 %	25 %	25 %	0 %	525830088
2525	NC_021812	TCC	2	6	122921	122926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830088
2526	NC_021812	ATA	2	6	122940	122945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830088
2527	NC_021812	AGG	2	6	122948	122953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830088
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2529	NC_021812	AG	3	6	123088	123093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_021812	TTAA	2	8	123098	123105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_021812	AG	3	6	123147	123152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_021812	GCC	2	6	123202	123207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_021812	T	8	8	123341	123348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_021812	TTA	2	6	123414	123419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021812	AGA	2	6	123433	123438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_021812	TACAG	2	10	123475	123484	40 %	20 %	20 %	20 %	525826575
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2538	NC_021812	ATT	2	6	123516	123521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826575
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2541	NC_021812	AT	4	8	123607	123614	50 %	50 %	0 %	0 %	525826575
2542	NC_021812	TTG	2	6	123627	123632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826575
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2545	NC_021812	TAT	2	6	123773	123778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826575
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2547	NC_021812	ATGA	2	8	123834	123841	50 %	25 %	25 %	0 %	525826575
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2549	NC_021812	TTG	2	6	123881	123886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826575
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2553	NC_021812	AT	3	6	124168	124173	50 %	50 %	0 %	0 %	525826575
2554	NC_021812	A	7	7	124203	124209	100 %	0 %	0 %	0 %	525826575
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2557	NC_021812	T	7	7	124279	124285	0 %	100 %	0 %	0 %	525826575
2558	NC_021812	ATT	2	6	124306	124311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826575
2559	NC_021812	T	6	6	124317	124322	0 %	100 %	0 %	0 %	525826575
2560	NC_021812	CAT	3	9	124323	124331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826575
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2562	NC_021812	G	7	7	124398	124404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021812	AAGA	2	8	124426	124433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021812	ATT	2	6	124591	124596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_021812	TAA	2	6	124607	124612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2591	NC_021812	CAGG	2	8	125514	125521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2593	NC_021812	A	6	6	125557	125562	100 %	0 %	0 %	0 %	525826577
2594	NC_021812	AT	3	6	125574	125579	50 %	50 %	0 %	0 %	525826577
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2610	NC_021812	CTTG	2	8	126333	126340	0 %	50 %	25 %	25 %	525826577
2611	NC_021812	CGG	2	6	126372	126377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826577
2612	NC_021812	GCAG	2	8	126381	126388	25 %	0 %	50 %	25 %	525826577
2613	NC_021812	CTTCAG	2	12	126670	126681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525826577
2614	NC_021812	TCCT	2	8	126704	126711	0 %	50 %	0 %	50 %	525826577
2615	NC_021812	CGAC	2	8	126728	126735	25 %	0 %	25 %	50 %	525826577
2616	NC_021812	TTTA	2	8	126752	126759	25 %	75 %	0 %	0 %	525826577
2617	NC_021812	TGAC	2	8	126764	126771	25 %	25 %	25 %	25 %	525826577
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2619	NC_021812	ATCA	2	8	127004	127011	50 %	25 %	0 %	25 %	525826577
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2623	NC_021812	AAGC	2	8	127130	127137	50 %	0 %	25 %	25 %	525826577
2624	NC_021812	TAC	3	9	127172	127180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826577
2625	NC_021812	GAA	2	6	127246	127251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826577
2626	NC_021812	GTC	2	6	127276	127281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826577
2627	NC_021812	ATGAA	2	10	127364	127373	60 %	20 %	20 %	0 %	525826577
2628	NC_021812	CTT	2	6	127414	127419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826577
2629	NC_021812	AATA	2	8	127450	127457	75 %	25 %	0 %	0 %	525826577
2630	NC_021812	ATT	2	6	127471	127476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826577
2631	NC_021812	TTA	2	6	127570	127575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830089
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2633	NC_021812	TCG	2	6	127623	127628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830089
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2635	NC_021812	CTA	2	6	127852	127857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830089
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2638	NC_021812	TA	3	6	128271	128276	50 %	50 %	0 %	0 %	525830089
2639	NC_021812	GTA	2	6	128305	128310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830089
2640	NC_021812	AAT	2	6	128386	128391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830089
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2642	NC_021812	TTA	2	6	128537	128542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826578
2643	NC_021812	A	6	6	128566	128571	100 %	0 %	0 %	0 %	525826578
2644	NC_021812	ATT	2	6	128576	128581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826578
2645	NC_021812	GTC	2	6	128582	128587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826578
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2648	NC_021812	TCC	2	6	128976	128981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2649	NC_021812	ATG	2	6	129038	129043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830090
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2651	NC_021812	CTG	2	6	129138	129143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830090
2652	NC_021812	ATT	2	6	129153	129158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830090
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2654	NC_021812	TTA	2	6	129199	129204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830090
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2658	NC_021812	T	8	8	129318	129325	0 %	100 %	0 %	0 %	525830090
2659	NC_021812	ATCA	2	8	129379	129386	50 %	25 %	0 %	25 %	525826579
2660	NC_021812	ATT	2	6	129424	129429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826579
2661	NC_021812	T	6	6	129428	129433	0 %	100 %	0 %	0 %	525826579
2662	NC_021812	GTCA	2	8	129441	129448	25 %	25 %	25 %	25 %	525826579
2663	NC_021812	TCA	2	6	129472	129477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826579
2664	NC_021812	GTAC	2	8	129541	129548	25 %	25 %	25 %	25 %	525826579
2665	NC_021812	CTT	2	6	129641	129646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826579
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2683	NC_021812	AAC	2	6	130732	130737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2684	NC_021812	TTTTA	2	10	130796	130805	20 %	80 %	0 %	0 %	525826581
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2699	NC_021812	ATT	2	6	131641	131646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826581
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2701	NC_021812	TAAA	2	8	131681	131688	75 %	25 %	0 %	0 %	525826581
2702	NC_021812	A	6	6	131686	131691	100 %	0 %	0 %	0 %	525826581
2703	NC_021812	TTC	2	6	131717	131722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826581
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2705	NC_021812	ATT	2	6	131828	131833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826581
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2707	NC_021812	ATC	2	6	131909	131914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2709	NC_021812	TTG	2	6	132025	132030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2710	NC_021812	ATG	2	6	132074	132079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830091
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2715	NC_021812	CGG	2	6	132169	132174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830091
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2717	NC_021812	CTG	2	6	132275	132280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830091
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2723	NC_021812	CGT	2	6	132667	132672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826582
2724	NC_021812	ATTG	2	8	132713	132720	25 %	50 %	25 %	0 %	525826582
2725	NC_021812	GCC	2	6	132863	132868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826582
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2730	NC_021812	TTA	2	6	133129	133134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826582
2731	NC_021812	GGT	2	6	133175	133180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826582
2732	NC_021812	GCC	2	6	133226	133231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826582
2733	NC_021812	GTC	2	6	133274	133279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826582
2734	NC_021812	ACC	2	6	133296	133301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826582
2735	NC_021812	TGAA	2	8	133383	133390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2736	NC_021812	AGA	2	6	133445	133450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2737	NC_021812	GCC	2	6	133506	133511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826583
2738	NC_021812	CAG	2	6	133583	133588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826583
2739	NC_021812	GCG	2	6	133688	133693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826583
2740	NC_021812	TAAA	2	8	133704	133711	75 %	25 %	0 %	0 %	525826583
2741	NC_021812	TTC	2	6	133724	133729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826583
2742	NC_021812	TTC	2	6	133737	133742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826583
2743	NC_021812	TCA	2	6	133786	133791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826583
2744	NC_021812	CAT	2	6	133796	133801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826583
2745	NC_021812	GAT	2	6	133900	133905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826583
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2747	NC_021812	TCA	2	6	134037	134042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826583
2748	NC_021812	GAT	2	6	134090	134095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826583
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2751	NC_021812	TGA	2	6	134330	134335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2752	NC_021812	ATTT	2	8	134363	134370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2753	NC_021812	GTT	2	6	134371	134376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2868	NC_021812	A	6	6	140110	140115	100 %	0 %	0 %	0 %	525826588
2869	NC_021812	GC	3	6	140144	140149	0 %	0 %	50 %	50 %	525826588
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2994	NC_021812	A	6	6	146496	146501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_021812	TTTTA	2	10	146542	146551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_021812	GAG	2	6	146596	146601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_021812	A	6	6	146629	146634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_021812	GC	3	6	146666	146671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2999	NC_021812	CTG	2	6	146695	146700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3000	NC_021812	TAT	2	6	146703	146708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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