MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021812	CGG	2	6	71843	71848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830080
1502	NC_021812	GGT	2	6	71900	71905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830080
1503	NC_021812	TAC	2	6	71961	71966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021812	GAAG	2	8	72034	72041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021812	GC	4	8	72073	72080	0 %	0 %	50 %	50 %	525826534
1506	NC_021812	ATT	2	6	72112	72117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826534
1507	NC_021812	CGG	2	6	72230	72235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826534
1508	NC_021812	GCGCG	2	10	72339	72348	0 %	0 %	60 %	40 %	525826534
1509	NC_021812	ACC	2	6	72403	72408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826534
1510	NC_021812	CGG	2	6	72542	72547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826534
1511	NC_021812	GCG	3	9	72569	72577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826534
1512	NC_021812	CGTT	2	8	72681	72688	0 %	50 %	25 %	25 %	525826534
1513	NC_021812	CG	3	6	72719	72724	0 %	0 %	50 %	50 %	525826534
1514	NC_021812	CCG	2	6	72784	72789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826534
1515	NC_021812	TCG	2	6	72796	72801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826534
1516	NC_021812	CGT	3	9	72823	72831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826534
1517	NC_021812	CGC	2	6	72889	72894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826534
1518	NC_021812	TAA	2	6	72906	72911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826534
1519	NC_021812	ATC	2	6	72948	72953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_021812	GGC	2	6	72977	72982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021812	TAA	2	6	73009	73014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826535
1522	NC_021812	TAA	2	6	73124	73129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826535
1523	NC_021812	GC	3	6	73149	73154	0 %	0 %	50 %	50 %	525826535
1524	NC_021812	GC	3	6	73160	73165	0 %	0 %	50 %	50 %	525826535
1525	NC_021812	CCA	2	6	73199	73204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826535
1526	NC_021812	TAC	2	6	73224	73229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826535
1527	NC_021812	AGC	2	6	73237	73242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826535
1528	NC_021812	TGC	2	6	73267	73272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826535
1529	NC_021812	TGC	2	6	73287	73292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826535
1530	NC_021812	CAG	2	6	73368	73373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826535
1531	NC_021812	TAA	2	6	73403	73408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826535
1532	NC_021812	CAC	2	6	73413	73418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826535
1533	NC_021812	GCGG	2	8	73446	73453	0 %	0 %	75 %	25 %	525826535
1534	NC_021812	GCC	2	6	73465	73470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826535
1535	NC_021812	ATA	3	9	73504	73512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826535
1536	NC_021812	CTG	2	6	73566	73571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826535
1537	NC_021812	GCT	2	6	73574	73579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826535
1538	NC_021812	TCA	2	6	73588	73593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826535
1539	NC_021812	GTC	2	6	73661	73666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826536
1540	NC_021812	ATA	2	6	73692	73697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826536
1541	NC_021812	GC	3	6	73746	73751	0 %	0 %	50 %	50 %	525826536
1542	NC_021812	GCC	2	6	73766	73771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826536
1543	NC_021812	CAT	2	6	73829	73834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826536
1544	NC_021812	TGA	2	6	73901	73906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826536
1545	NC_021812	GCG	2	6	74094	74099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826536
1546	NC_021812	CAG	2	6	74141	74146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826536
1547	NC_021812	TGC	2	6	74193	74198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826536
1548	NC_021812	CAG	2	6	74231	74236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826536
1549	NC_021812	AAT	2	6	74312	74317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826536
1550	NC_021812	CTC	2	6	74362	74367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_021812	GTG	2	6	74374	74379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021812	T	8	8	74442	74449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021812	TTC	2	6	74500	74505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021812	AG	3	6	74526	74531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021812	TGT	2	6	74547	74552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021812	TTG	2	6	74600	74605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826537
1557	NC_021812	TGG	2	6	74646	74651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826537
1558	NC_021812	TGC	2	6	74667	74672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826537
1559	NC_021812	ACGCA	2	10	74687	74696	40 %	0 %	20 %	40 %	525826537
1560	NC_021812	GCG	2	6	74706	74711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826537
1561	NC_021812	GAGC	2	8	74731	74738	25 %	0 %	50 %	25 %	525826537
1562	NC_021812	TGC	2	6	74764	74769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826537
1563	NC_021812	GATG	2	8	74776	74783	25 %	25 %	50 %	0 %	525826537
1564	NC_021812	A	8	8	74816	74823	100 %	0 %	0 %	0 %	525826537
1565	NC_021812	AGG	2	6	74832	74837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826537
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1567	NC_021812	CGG	2	6	74964	74969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826537
1568	NC_021812	GGC	2	6	75049	75054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826537
1569	NC_021812	ATG	2	6	75134	75139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826537
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1572	NC_021812	GAA	2	6	75311	75316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826537
1573	NC_021812	GGC	2	6	75318	75323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826537
1574	NC_021812	CAG	2	6	75437	75442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826537
1575	NC_021812	TGA	2	6	75463	75468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826537
1576	NC_021812	A	6	6	75545	75550	100 %	0 %	0 %	0 %	525826537
1577	NC_021812	GATC	2	8	75553	75560	25 %	25 %	25 %	25 %	525826537
1578	NC_021812	GCG	2	6	75575	75580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826537
1579	NC_021812	GCT	3	9	75595	75603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826537
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1581	NC_021812	CCA	2	6	75687	75692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826538
1582	NC_021812	CGC	2	6	75792	75797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826538
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1584	NC_021812	TTG	2	6	75878	75883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826538
1585	NC_021812	CGAT	2	8	75905	75912	25 %	25 %	25 %	25 %	525826538
1586	NC_021812	T	6	6	75933	75938	0 %	100 %	0 %	0 %	525826538
1587	NC_021812	TAA	2	6	76054	76059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021812	CGT	2	6	76143	76148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_021812	GT	3	6	76159	76164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021812	A	6	6	76167	76172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021812	CGCAGA	2	12	76238	76249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_021812	AT	3	6	76254	76259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021812	TCG	2	6	76267	76272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_021812	GAA	2	6	76309	76314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021812	CAA	2	6	76386	76391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826539
1596	NC_021812	GTG	2	6	76411	76416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826539
1597	NC_021812	CAG	2	6	76460	76465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826539
1598	NC_021812	CCA	2	6	76490	76495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826539
1599	NC_021812	TGC	2	6	76589	76594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826539
1600	NC_021812	GTC	2	6	76609	76614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826539
1601	NC_021812	CTGAA	2	10	76616	76625	40 %	20 %	20 %	20 %	525826539
1602	NC_021812	ATCT	2	8	76651	76658	25 %	50 %	0 %	25 %	525826539
1603	NC_021812	CGG	2	6	76716	76721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826539
1604	NC_021812	CG	3	6	76728	76733	0 %	0 %	50 %	50 %	525826539
1605	NC_021812	GC	3	6	76834	76839	0 %	0 %	50 %	50 %	525826539
1606	NC_021812	CGC	2	6	76874	76879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826539
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1608	NC_021812	ACG	3	9	77011	77019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826539
1609	NC_021812	CCGG	2	8	77073	77080	0 %	0 %	50 %	50 %	525826539
1610	NC_021812	GCC	2	6	77101	77106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826539
1611	NC_021812	GC	3	6	77125	77130	0 %	0 %	50 %	50 %	525826539
1612	NC_021812	CAG	2	6	77163	77168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826539
1613	NC_021812	GC	3	6	77177	77182	0 %	0 %	50 %	50 %	525826539
1614	NC_021812	ACA	2	6	77202	77207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826539
1615	NC_021812	GGC	2	6	77208	77213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826539
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1617	NC_021812	ATG	3	9	77248	77256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826539
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1619	NC_021812	TGCC	2	8	77684	77691	0 %	25 %	25 %	50 %	525826539
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1621	NC_021812	A	6	6	77894	77899	100 %	0 %	0 %	0 %	525826539
1622	NC_021812	ACCG	2	8	77914	77921	25 %	0 %	25 %	50 %	525826539
1623	NC_021812	GAA	2	6	77926	77931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826539
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1756	NC_021812	TGA	2	6	84258	84263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830084
1757	NC_021812	TTA	2	6	84315	84320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830084
1758	NC_021812	GGT	2	6	84349	84354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830084
1759	NC_021812	CTT	2	6	84373	84378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830084
1760	NC_021812	TTC	2	6	84542	84547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830084
1761	NC_021812	CCA	2	6	84553	84558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830084
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1763	NC_021812	TCA	2	6	84697	84702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1764	NC_021812	TACT	2	8	84788	84795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1765	NC_021812	GCC	2	6	84845	84850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826541
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1769	NC_021812	CGG	2	6	85057	85062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826541
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1773	NC_021812	CTGG	2	8	85492	85499	0 %	25 %	50 %	25 %	525826541
1774	NC_021812	GCC	2	6	85525	85530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826541
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1777	NC_021812	TGG	2	6	85617	85622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1778	NC_021812	CATTTC	2	12	85626	85637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1779	NC_021812	GC	3	6	85787	85792	0 %	0 %	50 %	50 %	525826542
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1782	NC_021812	TTGC	2	8	85855	85862	0 %	50 %	25 %	25 %	525826542
1783	NC_021812	TGGC	2	8	85890	85897	0 %	25 %	50 %	25 %	525826542
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1851	NC_021812	TAAAA	2	10	88857	88866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1852	NC_021812	ACG	2	6	88958	88963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1854	NC_021812	AG	4	8	89017	89024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1855	NC_021812	GAT	2	6	89025	89030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1859	NC_021812	CAT	2	6	89271	89276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826546
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1861	NC_021812	T	7	7	89390	89396	0 %	100 %	0 %	0 %	525826546
1862	NC_021812	GAG	2	6	89412	89417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826546
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1869	NC_021812	ACAG	2	8	89844	89851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1870	NC_021812	AG	3	6	89854	89859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1871	NC_021812	AAT	2	6	89889	89894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1872	NC_021812	GCTCT	2	10	89965	89974	0 %	40 %	20 %	40 %	525830086
1873	NC_021812	CAA	2	6	90016	90021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830086
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1875	NC_021812	ATG	2	6	90116	90121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1876	NC_021812	TAT	2	6	90187	90192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1877	NC_021812	CGC	2	6	90193	90198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1878	NC_021812	T	7	7	90209	90215	0 %	100 %	0 %	0 %	525826547
1879	NC_021812	CGG	2	6	90251	90256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826547
1880	NC_021812	T	6	6	90301	90306	0 %	100 %	0 %	0 %	525826547
1881	NC_021812	TCT	2	6	90319	90324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826547
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1885	NC_021812	GCG	2	6	90827	90832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826547
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1999	NC_021812	GT	3	6	96702	96707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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