MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021812	AGC	2	6	48979	48984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826510
1002	NC_021812	TAC	2	6	49020	49025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826510
1003	NC_021812	CG	3	6	49031	49036	0 %	0 %	50 %	50 %	525826510
1004	NC_021812	TGGG	2	8	49050	49057	0 %	25 %	75 %	0 %	525826510
1005	NC_021812	ATA	2	6	49084	49089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826510
1006	NC_021812	TA	3	6	49105	49110	50 %	50 %	0 %	0 %	525826510
1007	NC_021812	T	6	6	49164	49169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021812	ATTT	2	8	49255	49262	25 %	75 %	0 %	0 %	525826511
1009	NC_021812	CGC	2	6	49265	49270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826511
1010	NC_021812	TTA	2	6	49302	49307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826511
1011	NC_021812	TCTT	2	8	49313	49320	0 %	75 %	0 %	25 %	525826511
1012	NC_021812	ATG	2	6	49322	49327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826511
1013	NC_021812	GC	3	6	49360	49365	0 %	0 %	50 %	50 %	525826511
1014	NC_021812	GCC	2	6	49369	49374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826511
1015	NC_021812	ATC	2	6	49404	49409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826511
1016	NC_021812	CAT	2	6	49420	49425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826511
1017	NC_021812	AGC	2	6	49449	49454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826511
1018	NC_021812	GCC	2	6	49517	49522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826511
1019	NC_021812	T	6	6	49558	49563	0 %	100 %	0 %	0 %	525826511
1020	NC_021812	ATT	2	6	49574	49579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826511
1021	NC_021812	CGT	2	6	49660	49665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826511
1022	NC_021812	TGG	2	6	49680	49685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826511
1023	NC_021812	CGC	2	6	49686	49691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826511
1024	NC_021812	GGC	3	9	49733	49741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826511
1025	NC_021812	CGG	2	6	49747	49752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826511
1026	NC_021812	CG	3	6	49824	49829	0 %	0 %	50 %	50 %	525826511
1027	NC_021812	CG	3	6	49870	49875	0 %	0 %	50 %	50 %	525826511
1028	NC_021812	GCT	2	6	49930	49935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826511
1029	NC_021812	ATT	2	6	49973	49978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826511
1030	NC_021812	GC	3	6	50043	50048	0 %	0 %	50 %	50 %	525826511
1031	NC_021812	ATT	2	6	50107	50112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826511
1032	NC_021812	GAT	2	6	50181	50186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826512
1033	NC_021812	TAAG	2	8	50189	50196	50 %	25 %	25 %	0 %	525826512
1034	NC_021812	GCG	2	6	50293	50298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826512
1035	NC_021812	ATG	2	6	50392	50397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826512
1036	NC_021812	CGG	2	6	50478	50483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826512
1037	NC_021812	GCC	2	6	50509	50514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826512
1038	NC_021812	TGG	2	6	50519	50524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826512
1039	NC_021812	GGC	2	6	50569	50574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826512
1040	NC_021812	TGA	2	6	50588	50593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826512
1041	NC_021812	GTT	2	6	50598	50603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826512
1042	NC_021812	T	6	6	50656	50661	0 %	100 %	0 %	0 %	525826512
1043	NC_021812	TCG	2	6	50684	50689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826512
1044	NC_021812	CGTG	2	8	50727	50734	0 %	25 %	50 %	25 %	525826512
1045	NC_021812	GGTG	2	8	50781	50788	0 %	25 %	75 %	0 %	525826512
1046	NC_021812	GT	3	6	50789	50794	0 %	50 %	50 %	0 %	525826512
1047	NC_021812	GTAGTG	2	12	50842	50853	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525826512
1048	NC_021812	GTT	2	6	50949	50954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826512
1049	NC_021812	GCT	3	9	50991	50999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826512
1050	NC_021812	GGCT	2	8	51006	51013	0 %	25 %	50 %	25 %	525826512
1051	NC_021812	GTG	2	6	51019	51024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826512
1052	NC_021812	CTG	2	6	51150	51155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826513
1053	NC_021812	CGG	2	6	51205	51210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826513
1054	NC_021812	TTG	2	6	51256	51261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826513
1055	NC_021812	CTG	2	6	51309	51314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826513
1056	NC_021812	CGA	2	6	51316	51321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826513
1057	NC_021812	CGG	2	6	51332	51337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826513
1058	NC_021812	GC	3	6	51398	51403	0 %	0 %	50 %	50 %	525826513
1059	NC_021812	GAT	2	6	51416	51421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826513
1060	NC_021812	TGC	2	6	51490	51495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826513
1061	NC_021812	GC	3	6	51567	51572	0 %	0 %	50 %	50 %	525826513
1062	NC_021812	CGG	2	6	51605	51610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826513
1063	NC_021812	TGA	2	6	51625	51630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826513
1064	NC_021812	TGT	2	6	51643	51648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826513
1065	NC_021812	GC	3	6	51852	51857	0 %	0 %	50 %	50 %	525826513
1066	NC_021812	GCTT	2	8	51895	51902	0 %	50 %	25 %	25 %	525826513
1067	NC_021812	TCC	2	6	51959	51964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826513
1068	NC_021812	AAT	2	6	52032	52037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826513
1069	NC_021812	GCC	2	6	52040	52045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826513
1070	NC_021812	GC	3	6	52073	52078	0 %	0 %	50 %	50 %	525826513
1071	NC_021812	GGA	2	6	52094	52099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826513
1072	NC_021812	AAC	2	6	52122	52127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826514
1073	NC_021812	AAG	2	6	52176	52181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826514
1074	NC_021812	CCG	2	6	52202	52207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826514
1075	NC_021812	TACGC	2	10	52234	52243	20 %	20 %	20 %	40 %	525826514
1076	NC_021812	GTG	2	6	52268	52273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826514
1077	NC_021812	GC	4	8	52304	52311	0 %	0 %	50 %	50 %	525826514
1078	NC_021812	ATT	2	6	52313	52318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826514
1079	NC_021812	CTGG	2	8	52351	52358	0 %	25 %	50 %	25 %	525826514
1080	NC_021812	GAT	2	6	52417	52422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826514
1081	NC_021812	ATC	2	6	52497	52502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826514
1082	NC_021812	CGTG	2	8	52522	52529	0 %	25 %	50 %	25 %	525826514
1083	NC_021812	ATG	2	6	52544	52549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826514
1084	NC_021812	GCT	2	6	52561	52566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826514
1085	NC_021812	TCA	2	6	52575	52580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826514
1086	NC_021812	G	6	6	52604	52609	0 %	0 %	100 %	0 %	525826514
1087	NC_021812	ATT	2	6	52661	52666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826514
1088	NC_021812	GGT	2	6	52711	52716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826514
1089	NC_021812	CAG	2	6	52727	52732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826514
1090	NC_021812	AG	4	8	52737	52744	50 %	0 %	50 %	0 %	525826514
1091	NC_021812	ATG	2	6	52851	52856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826514
1092	NC_021812	CGG	2	6	52902	52907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826514
1093	NC_021812	TCCCGA	2	12	52915	52926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525826514
1094	NC_021812	GC	3	6	53037	53042	0 %	0 %	50 %	50 %	525826514
1095	NC_021812	GGAA	2	8	53059	53066	50 %	0 %	50 %	0 %	525826514
1096	NC_021812	CTT	2	6	53137	53142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021812	CTTT	2	8	53164	53171	0 %	75 %	0 %	25 %	525826515
1098	NC_021812	GTC	2	6	53172	53177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826515
1099	NC_021812	CGT	2	6	53185	53190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826515
1100	NC_021812	GC	3	6	53249	53254	0 %	0 %	50 %	50 %	525826515
1101	NC_021812	GCT	2	6	53262	53267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826515
1102	NC_021812	TTG	2	6	53285	53290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826515
1103	NC_021812	TGA	2	6	53325	53330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826515
1104	NC_021812	CTGG	2	8	53346	53353	0 %	25 %	50 %	25 %	525826515
1105	NC_021812	TGTGGC	2	12	53483	53494	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525826515
1106	NC_021812	GCGA	2	8	53535	53542	25 %	0 %	50 %	25 %	525826515
1107	NC_021812	TGC	2	6	53549	53554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826515
1108	NC_021812	ATT	2	6	53608	53613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826515
1109	NC_021812	GC	3	6	53615	53620	0 %	0 %	50 %	50 %	525826515
1110	NC_021812	TCA	2	6	53622	53627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826515
1111	NC_021812	TGA	2	6	53660	53665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826515
1112	NC_021812	ACG	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826515
1113	NC_021812	CGC	2	6	53783	53788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826515
1114	NC_021812	CGC	2	6	53792	53797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826515
1115	NC_021812	AGC	2	6	53881	53886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826515
1116	NC_021812	GC	3	6	53951	53956	0 %	0 %	50 %	50 %	525826515
1117	NC_021812	CAG	2	6	54090	54095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830078
1118	NC_021812	ACC	2	6	54151	54156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830078
1119	NC_021812	A	6	6	54162	54167	100 %	0 %	0 %	0 %	525830078
1120	NC_021812	AAC	2	6	54220	54225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830078
1121	NC_021812	CGC	3	9	54230	54238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830078
1122	NC_021812	CTC	2	6	54240	54245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830078
1123	NC_021812	CCG	2	6	54290	54295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830078
1124	NC_021812	TCAG	2	8	54340	54347	25 %	25 %	25 %	25 %	525830078
1125	NC_021812	AAG	2	6	54421	54426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826516
1126	NC_021812	ATC	2	6	54549	54554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826516
1127	NC_021812	CGCC	2	8	54689	54696	0 %	0 %	25 %	75 %	525826516
1128	NC_021812	A	6	6	54711	54716	100 %	0 %	0 %	0 %	525826516
1129	NC_021812	CGA	2	6	54734	54739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826516
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1131	NC_021812	CGC	2	6	54782	54787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826516
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1134	NC_021812	CG	3	6	54863	54868	0 %	0 %	50 %	50 %	525826516
1135	NC_021812	ATA	2	6	54973	54978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826516
1136	NC_021812	CGG	2	6	54987	54992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826516
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1143	NC_021812	CGG	2	6	55354	55359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826516
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1146	NC_021812	CAT	2	6	55478	55483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826516
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1154	NC_021812	GTA	2	6	56015	56020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_021812	TG	3	6	56621	56626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_021812	ATC	2	6	56642	56647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1180	NC_021812	CTG	2	6	57501	57506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1181	NC_021812	GCG	2	6	57507	57512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1198	NC_021812	GAT	2	6	58068	58073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1215	NC_021812	TTC	2	6	58627	58632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826520
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1217	NC_021812	ATT	2	6	58683	58688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826521
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1219	NC_021812	CTG	2	6	58892	58897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826521
1220	NC_021812	CAAC	2	8	58929	58936	50 %	0 %	0 %	50 %	525826521
1221	NC_021812	ATA	2	6	58967	58972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826521
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1224	NC_021812	ATC	2	6	59117	59122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826521
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1229	NC_021812	TGC	2	6	59204	59209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826521
1230	NC_021812	CTGC	2	8	59249	59256	0 %	25 %	25 %	50 %	525826521
1231	NC_021812	ACC	2	6	59321	59326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826521
1232	NC_021812	CA	3	6	59337	59342	50 %	0 %	0 %	50 %	525826521
1233	NC_021812	TAA	2	6	59364	59369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826521
1234	NC_021812	A	6	6	59381	59386	100 %	0 %	0 %	0 %	525826521
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1236	NC_021812	CAG	2	6	59500	59505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826522
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1238	NC_021812	CG	4	8	59550	59557	0 %	0 %	50 %	50 %	525826522
1239	NC_021812	CCT	2	6	59586	59591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826522
1240	NC_021812	TGGT	2	8	59700	59707	0 %	50 %	50 %	0 %	525826522
1241	NC_021812	A	6	6	59724	59729	100 %	0 %	0 %	0 %	525826522
1242	NC_021812	CGT	2	6	59773	59778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826522
1243	NC_021812	CATG	2	8	59834	59841	25 %	25 %	25 %	25 %	525826522
1244	NC_021812	A	6	6	59869	59874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_021812	AGCC	2	8	59968	59975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1246	NC_021812	TTA	2	6	60136	60141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_021812	TCA	2	6	60159	60164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NC_021812	A	6	6	60198	60203	100 %	0 %	0 %	0 %	525826523
1249	NC_021812	GGC	2	6	60212	60217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826523
1250	NC_021812	AAC	2	6	60227	60232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826523
1251	NC_021812	TCT	2	6	60233	60238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826523
1252	NC_021812	GGT	2	6	60321	60326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826523
1253	NC_021812	TAA	2	6	60359	60364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826523
1254	NC_021812	GGC	2	6	60425	60430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826523
1255	NC_021812	CAG	2	6	60533	60538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826523
1256	NC_021812	ACC	2	6	60576	60581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826523
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1258	NC_021812	TAC	2	6	60737	60742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826523
1259	NC_021812	GCG	2	6	60760	60765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826523
1260	NC_021812	CAT	2	6	60771	60776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826523
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1262	NC_021812	TGT	2	6	60842	60847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_021812	A	6	6	60852	60857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_021812	A	6	6	60877	60882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_021812	AC	3	6	60890	60895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1266	NC_021812	TCT	2	6	60922	60927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826524
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1271	NC_021812	CGC	2	6	61055	61060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826524
1272	NC_021812	CAG	2	6	61067	61072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826524
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1276	NC_021812	CGG	2	6	61191	61196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826524
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1280	NC_021812	TCG	2	6	61294	61299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826524
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1282	NC_021812	CGC	2	6	61415	61420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826524
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1284	NC_021812	CAG	2	6	61452	61457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826524
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1286	NC_021812	AGCG	2	8	61492	61499	25 %	0 %	50 %	25 %	525826524
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1296	NC_021812	TTA	2	6	61806	61811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1297	NC_021812	T	6	6	61816	61821	0 %	100 %	0 %	0 %	525826525
1298	NC_021812	TCT	2	6	61910	61915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826525
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1301	NC_021812	GCC	3	9	61967	61975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826525
1302	NC_021812	TGC	2	6	62083	62088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826525
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1306	NC_021812	ATA	2	6	62353	62358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1313	NC_021812	CAGATT	2	12	62698	62709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525826526
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1318	NC_021812	TTACA	2	10	62971	62980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1322	NC_021812	CGC	2	6	63078	63083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826527
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1324	NC_021812	ATT	2	6	63169	63174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1326	NC_021812	A	6	6	63197	63202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1327	NC_021812	A	6	6	63301	63306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1330	NC_021812	TTGT	2	8	63424	63431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1340	NC_021812	AGA	2	6	63966	63971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826528
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1374	NC_021812	CAT	2	6	65811	65816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826530
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1378	NC_021812	CG	4	8	66145	66152	0 %	0 %	50 %	50 %	525826530
1379	NC_021812	AT	3	6	66181	66186	50 %	50 %	0 %	0 %	525826530
1380	NC_021812	AGC	2	6	66254	66259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826530
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1382	NC_021812	GCG	2	6	66272	66277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826530
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1492	NC_021812	CAA	2	6	71135	71140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826533
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1499	NC_021812	GGA	2	6	71795	71800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830080
1500	NC_021812	ATC	2	6	71835	71840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830080

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