MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_021812	TTCC	2	8	4735777	4735784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100002	NC_021812	GGT	2	6	4735820	4735825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100003	NC_021812	ACG	2	6	4735833	4735838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100004	NC_021812	TGG	2	6	4735884	4735889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830909
100005	NC_021812	TGG	3	9	4735893	4735901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830909
100006	NC_021812	GTT	2	6	4735972	4735977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830909
100007	NC_021812	GTT	2	6	4736002	4736007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830909
100008	NC_021812	CGC	2	6	4736009	4736014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830909
100009	NC_021812	AAG	2	6	4736040	4736045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830909
100010	NC_021812	ATT	2	6	4736090	4736095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830909
100011	NC_021812	TC	3	6	4736171	4736176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100012	NC_021812	TAC	2	6	4736198	4736203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100013	NC_021812	AT	3	6	4736223	4736228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100014	NC_021812	TC	4	8	4736320	4736327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100015	NC_021812	TTGT	2	8	4736342	4736349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100016	NC_021812	ATT	2	6	4736352	4736357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100017	NC_021812	CTTTT	2	10	4736411	4736420	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100018	NC_021812	TAT	2	6	4736422	4736427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100019	NC_021812	T	6	6	4736443	4736448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100020	NC_021812	GAA	2	6	4736529	4736534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100021	NC_021812	CAG	2	6	4736571	4736576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100022	NC_021812	AT	3	6	4736609	4736614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100023	NC_021812	TTG	2	6	4736626	4736631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100024	NC_021812	TG	3	6	4736766	4736771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100025	NC_021812	AAG	2	6	4736784	4736789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100026	NC_021812	ACGTTG	2	12	4736802	4736813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100027	NC_021812	GCA	2	6	4736994	4736999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830029
100028	NC_021812	GCT	2	6	4737104	4737109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830029
100029	NC_021812	TTG	2	6	4737250	4737255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100030	NC_021812	TTA	2	6	4737269	4737274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100031	NC_021812	T	6	6	4737281	4737286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100032	NC_021812	ATCA	2	8	4737314	4737321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100033	NC_021812	AAAAG	2	10	4737354	4737363	80 %	0 %	20 %	0 %	525830030
100034	NC_021812	ACT	2	6	4737403	4737408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830030
100035	NC_021812	TTG	2	6	4737437	4737442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830030
100036	NC_021812	AAG	2	6	4737495	4737500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830030
100037	NC_021812	GGC	2	6	4737632	4737637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830030
100038	NC_021812	TC	3	6	4737686	4737691	0 %	50 %	0 %	50 %	525830030
100039	NC_021812	GC	3	6	4737746	4737751	0 %	0 %	50 %	50 %	525830030
100040	NC_021812	GATA	2	8	4737778	4737785	50 %	25 %	25 %	0 %	525830030
100041	NC_021812	TGA	2	6	4738036	4738041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830030
100042	NC_021812	TC	3	6	4738144	4738149	0 %	50 %	0 %	50 %	525830030
100043	NC_021812	AAC	2	6	4738178	4738183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830030
100044	NC_021812	GC	3	6	4738191	4738196	0 %	0 %	50 %	50 %	525830030
100045	NC_021812	CG	3	6	4738217	4738222	0 %	0 %	50 %	50 %	525830030
100046	NC_021812	CAG	2	6	4738283	4738288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830030
100047	NC_021812	GA	3	6	4738512	4738517	50 %	0 %	50 %	0 %	525830030
100048	NC_021812	TTA	2	6	4738526	4738531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830030
100049	NC_021812	CGC	2	6	4738599	4738604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830030
100050	NC_021812	CCGT	2	8	4738651	4738658	0 %	25 %	25 %	50 %	525830030
100051	NC_021812	GAA	2	6	4738709	4738714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830030
100052	NC_021812	ATG	2	6	4738736	4738741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830030
100053	NC_021812	GGC	3	9	4738760	4738768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830030
100054	NC_021812	A	7	7	4738823	4738829	100 %	0 %	0 %	0 %	525830030
100055	NC_021812	GAT	2	6	4738835	4738840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830030
100056	NC_021812	TGG	3	9	4738911	4738919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830030
100057	NC_021812	TAA	2	6	4738924	4738929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830030
100058	NC_021812	TTA	2	6	4738945	4738950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830030
100059	NC_021812	GCGGT	2	10	4738953	4738962	0 %	20 %	60 %	20 %	525830030
100060	NC_021812	TGC	2	6	4738998	4739003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830030
100061	NC_021812	TAA	2	6	4739205	4739210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830031
100062	NC_021812	CTG	2	6	4739269	4739274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830031
100063	NC_021812	CG	3	6	4739294	4739299	0 %	0 %	50 %	50 %	525830031
100064	NC_021812	ATG	2	6	4739320	4739325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830031
100065	NC_021812	GAG	2	6	4739331	4739336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830031
100066	NC_021812	GCG	2	6	4739441	4739446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830031
100067	NC_021812	CAC	2	6	4739490	4739495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830031
100068	NC_021812	TGGAC	2	10	4739499	4739508	20 %	20 %	40 %	20 %	525830031
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100070	NC_021812	TG	3	6	4739563	4739568	0 %	50 %	50 %	0 %	525830031
100071	NC_021812	GTG	2	6	4739659	4739664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830031
100072	NC_021812	TGG	2	6	4739670	4739675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830031
100073	NC_021812	CGCCA	2	10	4739688	4739697	20 %	0 %	20 %	60 %	525830031
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100079	NC_021812	GC	3	6	4739874	4739879	0 %	0 %	50 %	50 %	525830031
100080	NC_021812	AAC	2	6	4739897	4739902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830031
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100082	NC_021812	ATC	3	9	4740073	4740081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830032
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100086	NC_021812	GAC	2	6	4740227	4740232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830032
100087	NC_021812	TCA	2	6	4740250	4740255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830032
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100089	NC_021812	GAT	2	6	4740276	4740281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830032
100090	NC_021812	CAG	2	6	4740303	4740308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830032
100091	NC_021812	TTCCA	2	10	4740328	4740337	20 %	40 %	0 %	40 %	525830032
100092	NC_021812	CATC	2	8	4740485	4740492	25 %	25 %	0 %	50 %	525830032
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100098	NC_021812	ATT	2	6	4740789	4740794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100099	NC_021812	TCA	2	6	4740832	4740837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100100	NC_021812	TTAAA	2	10	4740846	4740855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100101	NC_021812	TAT	2	6	4740891	4740896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100102	NC_021812	AAG	2	6	4740958	4740963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830910
100103	NC_021812	TA	3	6	4740966	4740971	50 %	50 %	0 %	0 %	525830910
100104	NC_021812	T	6	6	4740972	4740977	0 %	100 %	0 %	0 %	525830910
100105	NC_021812	TCG	2	6	4740983	4740988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830910
100106	NC_021812	AAGC	2	8	4741006	4741013	50 %	0 %	25 %	25 %	525830910
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100110	NC_021812	GAT	2	6	4741123	4741128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830910
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100118	NC_021812	AG	3	6	4741341	4741346	50 %	0 %	50 %	0 %	525830910
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100121	NC_021812	A	6	6	4741419	4741424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100122	NC_021812	ACA	2	6	4741450	4741455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100220	NC_021812	CG	5	10	4745784	4745793	0 %	0 %	50 %	50 %	525830036
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100226	NC_021812	ATC	2	6	4745983	4745988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830036
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100230	NC_021812	CGG	2	6	4746246	4746251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830037
100231	NC_021812	GCCA	2	8	4746262	4746269	25 %	0 %	25 %	50 %	525830037
100232	NC_021812	ATA	3	9	4746415	4746423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830037
100233	NC_021812	GGC	2	6	4746459	4746464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830037
100234	NC_021812	CCAG	2	8	4746509	4746516	25 %	0 %	25 %	50 %	525830037
100235	NC_021812	GAGC	2	8	4746519	4746526	25 %	0 %	50 %	25 %	525830037
100236	NC_021812	ATC	2	6	4746543	4746548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830037
100237	NC_021812	CGCGT	2	10	4746612	4746621	0 %	20 %	40 %	40 %	525830037
100238	NC_021812	AGT	2	6	4746758	4746763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830037
100239	NC_021812	GCG	2	6	4746803	4746808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830037
100240	NC_021812	GTT	2	6	4746873	4746878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830037
100241	NC_021812	TGC	2	6	4746910	4746915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830037
100242	NC_021812	CTG	2	6	4747000	4747005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830037
100243	NC_021812	GCCA	2	8	4747012	4747019	25 %	0 %	25 %	50 %	525830037
100244	NC_021812	CGCTGA	2	12	4747109	4747120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525830037
100245	NC_021812	T	7	7	4747167	4747173	0 %	100 %	0 %	0 %	525830037
100246	NC_021812	GCT	2	6	4747256	4747261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830037
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100252	NC_021812	TGAT	2	8	4747771	4747778	25 %	50 %	25 %	0 %	525830037
100253	NC_021812	GCC	2	6	4747804	4747809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100254	NC_021812	CGA	2	6	4747872	4747877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100255	NC_021812	AGGG	2	8	4747919	4747926	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100256	NC_021812	CGC	2	6	4747966	4747971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830038
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100260	NC_021812	CAG	2	6	4748228	4748233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830038
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100272	NC_021812	TTTC	2	8	4748773	4748780	0 %	75 %	0 %	25 %	525830038
100273	NC_021812	TCG	2	6	4748815	4748820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830038
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100282	NC_021812	ATA	2	6	4749303	4749308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100283	NC_021812	TA	3	6	4749481	4749486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100284	NC_021812	GAA	2	6	4749600	4749605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830039
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100320	NC_021812	GTG	2	6	4751342	4751347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830040
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100326	NC_021812	AAT	2	6	4751557	4751562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100327	NC_021812	AAC	2	6	4751623	4751628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830041
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100331	NC_021812	TCA	2	6	4751821	4751826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830042
100332	NC_021812	CGA	2	6	4751866	4751871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830042
100333	NC_021812	GGC	2	6	4751897	4751902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830042
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100336	NC_021812	GCC	2	6	4752177	4752182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100337	NC_021812	GACG	2	8	4752254	4752261	25 %	0 %	50 %	25 %	525830043
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100339	NC_021812	CG	3	6	4752310	4752315	0 %	0 %	50 %	50 %	525830043
100340	NC_021812	GTT	2	6	4752375	4752380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830043
100341	NC_021812	GC	3	6	4752431	4752436	0 %	0 %	50 %	50 %	525830043
100342	NC_021812	A	6	6	4752441	4752446	100 %	0 %	0 %	0 %	525830043
100343	NC_021812	ATT	2	6	4752450	4752455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830043
100344	NC_021812	AAC	2	6	4752589	4752594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830043
100345	NC_021812	GGCG	2	8	4752602	4752609	0 %	0 %	75 %	25 %	525830043
100346	NC_021812	TGC	2	6	4752646	4752651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830043
100347	NC_021812	GGA	2	6	4752707	4752712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830043
100348	NC_021812	ACC	3	9	4752841	4752849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830043
100349	NC_021812	TGG	2	6	4752865	4752870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830043
100350	NC_021812	AG	3	6	4752875	4752880	50 %	0 %	50 %	0 %	525830043
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100407	NC_021812	AAAT	2	8	4755637	4755644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100408	NC_021812	TAAT	2	8	4755675	4755682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100409	NC_021812	TTA	2	6	4755722	4755727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100448	NC_021812	T	8	8	4757499	4757506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100449	NC_021812	TG	3	6	4757574	4757579	0 %	50 %	50 %	0 %	525830047
100450	NC_021812	GATC	2	8	4757692	4757699	25 %	25 %	25 %	25 %	525830047
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100457	NC_021812	TGA	2	6	4758070	4758075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830047
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