MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021812	AG	3	6	24589	24594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021812	AGAC	2	8	24616	24623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_021812	T	6	6	24647	24652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021812	TAA	2	6	24678	24683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021812	TGA	2	6	24701	24706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021812	ATCAA	2	10	24766	24775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
507	NC_021812	GCA	2	6	24868	24873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826498
508	NC_021812	CTG	2	6	24926	24931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826498
509	NC_021812	GC	3	6	25044	25049	0 %	0 %	50 %	50 %	525826498
510	NC_021812	ATT	3	9	25190	25198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826498
511	NC_021812	TG	3	6	25206	25211	0 %	50 %	50 %	0 %	525826498
512	NC_021812	TTTC	2	8	25258	25265	0 %	75 %	0 %	25 %	525826498
513	NC_021812	GCG	2	6	25281	25286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826498
514	NC_021812	GGT	2	6	25301	25306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826498
515	NC_021812	GCGTGA	2	12	25320	25331	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525826498
516	NC_021812	TGG	2	6	25350	25355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826498
517	NC_021812	CT	3	6	25361	25366	0 %	50 %	0 %	50 %	525826498
518	NC_021812	GCC	2	6	25373	25378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826498
519	NC_021812	AGC	2	6	25398	25403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826498
520	NC_021812	GGC	2	6	25474	25479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826498
521	NC_021812	GAAC	2	8	25492	25499	50 %	0 %	25 %	25 %	525826498
522	NC_021812	CTG	2	6	25571	25576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826498
523	NC_021812	GC	3	6	25692	25697	0 %	0 %	50 %	50 %	525826498
524	NC_021812	GGC	2	6	25712	25717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826498
525	NC_021812	G	7	7	25735	25741	0 %	0 %	100 %	0 %	525826498
526	NC_021812	CTG	2	6	25790	25795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826498
527	NC_021812	GGC	2	6	25814	25819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826498
528	NC_021812	GAT	2	6	25903	25908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826498
529	NC_021812	GAA	2	6	25964	25969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826498
530	NC_021812	CGG	3	9	25998	26006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826498
531	NC_021812	GGC	2	6	26039	26044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826498
532	NC_021812	T	6	6	26045	26050	0 %	100 %	0 %	0 %	525826498
533	NC_021812	TCTT	2	8	26112	26119	0 %	75 %	0 %	25 %	525826498
534	NC_021812	CGT	2	6	26137	26142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826498
535	NC_021812	TAAAAA	2	12	26173	26184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525826498
536	NC_021812	GCG	2	6	26207	26212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021812	T	8	8	26224	26231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021812	ACA	2	6	26246	26251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021812	AAG	2	6	26263	26268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021812	AG	3	6	26267	26272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021812	TTG	2	6	26337	26342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021812	AATTT	2	10	26369	26378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021812	AT	4	8	26397	26404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021812	CTC	3	9	26413	26421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_021812	AGG	2	6	26436	26441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021812	GC	3	6	26445	26450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_021812	AG	3	6	26542	26547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021812	CA	3	6	26559	26564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_021812	AAAC	2	8	26655	26662	75 %	0 %	0 %	25 %	525826499
550	NC_021812	GGA	2	6	26671	26676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826499
551	NC_021812	GCA	2	6	26695	26700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826499
552	NC_021812	CG	3	6	26856	26861	0 %	0 %	50 %	50 %	525826499
553	NC_021812	TGA	2	6	26928	26933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826499
554	NC_021812	A	6	6	26951	26956	100 %	0 %	0 %	0 %	525826499
555	NC_021812	CAT	2	6	26989	26994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826499
556	NC_021812	GGC	2	6	27041	27046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
557	NC_021812	CTC	2	6	27055	27060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826499
558	NC_021812	CGC	2	6	27085	27090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
559	NC_021812	CCTG	2	8	27213	27220	0 %	25 %	25 %	50 %	525826499
560	NC_021812	GCC	2	6	27247	27252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
561	NC_021812	TAT	2	6	27322	27327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826499
562	NC_021812	CTT	2	6	27373	27378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826499
563	NC_021812	TGGC	2	8	27458	27465	0 %	25 %	50 %	25 %	525826499
564	NC_021812	GCG	2	6	27485	27490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
565	NC_021812	TGC	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
566	NC_021812	TTA	2	6	27619	27624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826499
567	NC_021812	TGC	2	6	27639	27644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
568	NC_021812	GC	3	6	27643	27648	0 %	0 %	50 %	50 %	525826499
569	NC_021812	TGG	2	6	27726	27731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826499
570	NC_021812	CAGCT	2	10	27824	27833	20 %	20 %	20 %	40 %	525826499
571	NC_021812	CGG	2	6	27880	27885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
572	NC_021812	CTG	2	6	27929	27934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
573	NC_021812	TTC	2	6	27973	27978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826499
574	NC_021812	CAC	2	6	27988	27993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826499
575	NC_021812	TGACC	2	10	28000	28009	20 %	20 %	20 %	40 %	525826499
576	NC_021812	GCC	2	6	28055	28060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
577	NC_021812	ATG	2	6	28065	28070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826499
578	NC_021812	ATC	2	6	28130	28135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826499
579	NC_021812	GCG	3	9	28287	28295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
580	NC_021812	CCAG	2	8	28422	28429	25 %	0 %	25 %	50 %	525826499
581	NC_021812	CCG	2	6	28449	28454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
582	NC_021812	GC	3	6	28519	28524	0 %	0 %	50 %	50 %	525826499
583	NC_021812	GCC	2	6	28661	28666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
584	NC_021812	AGC	2	6	28668	28673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826499
585	NC_021812	ACC	2	6	28689	28694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826499
586	NC_021812	CTG	2	6	28769	28774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
587	NC_021812	GAA	2	6	28832	28837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
588	NC_021812	TGG	2	6	28878	28883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826499
589	NC_021812	CCTG	2	8	28911	28918	0 %	25 %	25 %	50 %	525826499
590	NC_021812	GCC	2	6	29009	29014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
591	NC_021812	GAA	2	6	29068	29073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
592	NC_021812	CGT	2	6	29116	29121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
593	NC_021812	A	6	6	29186	29191	100 %	0 %	0 %	0 %	525826499
594	NC_021812	CGC	2	6	29223	29228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
595	NC_021812	CAT	2	6	29230	29235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826499
596	NC_021812	CGG	2	6	29311	29316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
597	NC_021812	TGC	2	6	29355	29360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
598	NC_021812	GAT	2	6	29437	29442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826499
599	NC_021812	GCG	2	6	29492	29497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
600	NC_021812	AGA	3	9	29545	29553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
601	NC_021812	CTGGT	2	10	29611	29620	0 %	40 %	40 %	20 %	525826499
602	NC_021812	CGC	2	6	29847	29852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
603	NC_021812	GGC	2	6	29915	29920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
604	NC_021812	CAGC	2	8	30028	30035	25 %	0 %	25 %	50 %	525826499
605	NC_021812	CGG	2	6	30042	30047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
606	NC_021812	ATG	2	6	30056	30061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826499
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609	NC_021812	CGG	2	6	30172	30177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
610	NC_021812	ACT	2	6	30204	30209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826499
611	NC_021812	TGG	2	6	30243	30248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826499
612	NC_021812	GAA	2	6	30259	30264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
613	NC_021812	CAA	2	6	30438	30443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826500
614	NC_021812	GGC	2	6	30505	30510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826500
615	NC_021812	GCT	3	9	30561	30569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826500
616	NC_021812	CGA	2	6	30606	30611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826500
617	NC_021812	CTA	2	6	30612	30617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826500
618	NC_021812	CG	3	6	30681	30686	0 %	0 %	50 %	50 %	525826500
619	NC_021812	CGCT	2	8	30691	30698	0 %	25 %	25 %	50 %	525826500
620	NC_021812	GCG	2	6	30758	30763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826500
621	NC_021812	ATG	2	6	30841	30846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826500
622	NC_021812	GCGT	2	8	30883	30890	0 %	25 %	50 %	25 %	525826500
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626	NC_021812	CTG	2	6	31129	31134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826500
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628	NC_021812	GCG	2	6	31282	31287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826500
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630	NC_021812	GCC	2	6	31405	31410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826500
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