MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021812	CAA	2	6	294432	294437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826701
6002	NC_021812	ACC	2	6	294458	294463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826701
6003	NC_021812	A	6	6	294473	294478	100 %	0 %	0 %	0 %	525826701
6004	NC_021812	CAT	2	6	294493	294498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826701
6005	NC_021812	ATT	2	6	294510	294515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021812	CTTTT	2	10	294566	294575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6007	NC_021812	AAC	2	6	294595	294600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_021812	AC	3	6	294599	294604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_021812	CAT	2	6	294658	294663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_021812	CAGG	2	8	294714	294721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_021812	ATCT	2	8	294819	294826	25 %	50 %	0 %	25 %	525830124
6012	NC_021812	CGT	2	6	294893	294898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830124
6013	NC_021812	TCGCCT	2	12	294967	294978	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525830124
6014	NC_021812	TTA	2	6	295039	295044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830124
6015	NC_021812	T	6	6	295060	295065	0 %	100 %	0 %	0 %	525830124
6016	NC_021812	ACA	2	6	295107	295112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830124
6017	NC_021812	T	6	6	295123	295128	0 %	100 %	0 %	0 %	525830124
6018	NC_021812	CGC	2	6	295171	295176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830124
6019	NC_021812	GCT	2	6	295184	295189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830124
6020	NC_021812	GCC	2	6	295224	295229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830124
6021	NC_021812	GCC	2	6	295284	295289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830124
6022	NC_021812	CTG	2	6	295329	295334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830124
6023	NC_021812	ATT	2	6	295346	295351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830124
6024	NC_021812	CCT	2	6	295378	295383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830124
6025	NC_021812	G	6	6	295388	295393	0 %	0 %	100 %	0 %	525830124
6026	NC_021812	CGT	2	6	295466	295471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830124
6027	NC_021812	CCG	2	6	295531	295536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830124
6028	NC_021812	ATG	2	6	295551	295556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830124
6029	NC_021812	T	6	6	295572	295577	0 %	100 %	0 %	0 %	525830124
6030	NC_021812	ATTT	2	8	295595	295602	25 %	75 %	0 %	0 %	525830124
6031	NC_021812	T	6	6	295600	295605	0 %	100 %	0 %	0 %	525830124
6032	NC_021812	T	7	7	295620	295626	0 %	100 %	0 %	0 %	525830124
6033	NC_021812	ATT	2	6	295662	295667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830124
6034	NC_021812	AT	3	6	295682	295687	50 %	50 %	0 %	0 %	525830124
6035	NC_021812	ACA	2	6	295696	295701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830124
6036	NC_021812	GCTGG	2	10	295745	295754	0 %	20 %	60 %	20 %	525830124
6037	NC_021812	GCG	2	6	295761	295766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830124
6038	NC_021812	GCG	2	6	295783	295788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830124
6039	NC_021812	GAC	2	6	295796	295801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830124
6040	NC_021812	TA	3	6	295963	295968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021812	CTG	2	6	295984	295989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_021812	AAAT	2	8	296058	296065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021812	T	6	6	296118	296123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_021812	A	6	6	296124	296129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_021812	ATT	2	6	296200	296205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830125
6046	NC_021812	GCC	2	6	296224	296229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830125
6047	NC_021812	GAT	2	6	296248	296253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830125
6048	NC_021812	TGC	2	6	296291	296296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_021812	GGCA	2	8	296329	296336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_021812	A	9	9	296336	296344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021812	CCG	2	6	296345	296350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_021812	GC	3	6	296597	296602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_021812	CGG	2	6	296711	296716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826702
6054	NC_021812	TCG	2	6	296767	296772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826702
6055	NC_021812	CAT	2	6	296816	296821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826702
6056	NC_021812	T	6	6	296849	296854	0 %	100 %	0 %	0 %	525826702
6057	NC_021812	CAT	2	6	296858	296863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826702
6058	NC_021812	GGC	3	9	296896	296904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826702
6059	NC_021812	T	7	7	296916	296922	0 %	100 %	0 %	0 %	525826702
6060	NC_021812	ATC	2	6	296934	296939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826702
6061	NC_021812	CT	3	6	296998	297003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_021812	TAA	2	6	297007	297012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_021812	AAT	2	6	297218	297223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021812	T	6	6	297232	297237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_021812	CGC	2	6	297275	297280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_021812	TTG	2	6	297312	297317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_021812	AAT	2	6	297330	297335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_021812	ATAAA	2	10	297353	297362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_021812	GAA	2	6	297377	297382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021812	TGA	2	6	297455	297460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826703
6071	NC_021812	A	7	7	297485	297491	100 %	0 %	0 %	0 %	525826703
6072	NC_021812	GCA	2	6	297576	297581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826703
6073	NC_021812	TGA	2	6	297626	297631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826703
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6076	NC_021812	CGG	2	6	297802	297807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826703
6077	NC_021812	GTTTG	2	10	297813	297822	0 %	60 %	40 %	0 %	525826703
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6081	NC_021812	AAC	2	6	297976	297981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_021812	A	7	7	297995	298001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_021812	AT	3	6	298042	298047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021812	AATT	2	8	298068	298075	50 %	50 %	0 %	0 %	525826704
6085	NC_021812	TCCG	2	8	298084	298091	0 %	25 %	25 %	50 %	525826704
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6092	NC_021812	ATATG	2	10	298285	298294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_021812	TCT	2	6	298295	298300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_021812	ATT	2	6	298363	298368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_021812	ATA	2	6	298372	298377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_021812	AT	3	6	298395	298400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021812	T	6	6	298400	298405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_021812	CAG	2	6	298413	298418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_021812	TAA	2	6	298427	298432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_021812	CCA	2	6	298449	298454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_021812	TCA	2	6	298533	298538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_021812	GTT	2	6	298564	298569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_021812	AAC	2	6	298581	298586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6109	NC_021812	CGG	2	6	298892	298897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826705
6110	NC_021812	CTG	2	6	298905	298910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826705
6111	NC_021812	CTGCT	2	10	298929	298938	0 %	40 %	20 %	40 %	525826705
6112	NC_021812	GCG	2	6	298978	298983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826705
6113	NC_021812	TAAA	2	8	299015	299022	75 %	25 %	0 %	0 %	525826705
6114	NC_021812	CAG	2	6	299051	299056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826705
6115	NC_021812	T	6	6	299060	299065	0 %	100 %	0 %	0 %	525826705
6116	NC_021812	CG	3	6	299083	299088	0 %	0 %	50 %	50 %	525826705
6117	NC_021812	GGGA	2	8	299135	299142	25 %	0 %	75 %	0 %	525826705
6118	NC_021812	CAAA	2	8	299201	299208	75 %	0 %	0 %	25 %	525826705
6119	NC_021812	TAA	2	6	299243	299248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826705
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6121	NC_021812	TA	3	6	299311	299316	50 %	50 %	0 %	0 %	525826705
6122	NC_021812	CGC	3	9	299369	299377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826705
6123	NC_021812	CG	3	6	299389	299394	0 %	0 %	50 %	50 %	525826705
6124	NC_021812	AAG	2	6	299395	299400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826705
6125	NC_021812	CGA	2	6	299492	299497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826705
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6127	NC_021812	GCC	2	6	299655	299660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826705
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6233	NC_021812	CGA	2	6	304848	304853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830126
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6244	NC_021812	GTG	2	6	305475	305480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830126
6245	NC_021812	CAT	2	6	305489	305494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830126
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6247	NC_021812	T	7	7	305516	305522	0 %	100 %	0 %	0 %	525830126
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6249	NC_021812	A	6	6	305639	305644	100 %	0 %	0 %	0 %	525830126
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6373	NC_021812	TGG	2	6	311617	311622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826716
6374	NC_021812	AAT	2	6	311634	311639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826716
6375	NC_021812	GCG	3	9	311659	311667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826716
6376	NC_021812	GC	3	6	311709	311714	0 %	0 %	50 %	50 %	525826716
6377	NC_021812	CGC	2	6	311795	311800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826716
6378	NC_021812	TGG	2	6	311803	311808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826716
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6381	NC_021812	CGC	2	6	311971	311976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826716
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6383	NC_021812	GC	3	6	312027	312032	0 %	0 %	50 %	50 %	525826716
6384	NC_021812	CGCCAT	2	12	312113	312124	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525826716
6385	NC_021812	GCG	2	6	312169	312174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826716
6386	NC_021812	ACCATT	2	12	312192	312203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826716
6387	NC_021812	GGAC	2	8	312259	312266	25 %	0 %	50 %	25 %	525826716
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6389	NC_021812	TAA	2	6	312395	312400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826716
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6394	NC_021812	CGA	2	6	312650	312655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826716
6395	NC_021812	A	7	7	312762	312768	100 %	0 %	0 %	0 %	525826716
6396	NC_021812	A	6	6	312816	312821	100 %	0 %	0 %	0 %	525826716
6397	NC_021812	GCC	2	6	313074	313079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826716
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6403	NC_021812	TGG	2	6	313351	313356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826716
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6410	NC_021812	CTGC	2	8	313681	313688	0 %	25 %	25 %	50 %	525826717
6411	NC_021812	GCCT	2	8	313775	313782	0 %	25 %	25 %	50 %	525826717
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6440	NC_021812	ACAG	2	8	315298	315305	50 %	0 %	25 %	25 %	525826717
6441	NC_021812	A	6	6	315317	315322	100 %	0 %	0 %	0 %	525826717
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6447	NC_021812	GA	3	6	315702	315707	50 %	0 %	50 %	0 %	525826717
6448	NC_021812	CGC	2	6	315729	315734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826717
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6460	NC_021812	CGC	2	6	316268	316273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826718
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6462	NC_021812	GCTG	2	8	316409	316416	0 %	25 %	50 %	25 %	525826718
6463	NC_021812	CG	4	8	316432	316439	0 %	0 %	50 %	50 %	525826718
6464	NC_021812	GCC	2	6	316483	316488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826718
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6482	NC_021812	GCCA	2	8	317176	317183	25 %	0 %	25 %	50 %	525826719
6483	NC_021812	CTTG	2	8	317226	317233	0 %	50 %	25 %	25 %	525826719
6484	NC_021812	GCT	2	6	317246	317251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826719
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6486	NC_021812	TGC	2	6	317297	317302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826719
6487	NC_021812	GTGCTG	2	12	317311	317322	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525826719
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6490	NC_021812	TGCG	2	8	317399	317406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6491	NC_021812	T	6	6	317445	317450	0 %	100 %	0 %	0 %	525826720
6492	NC_021812	TGA	2	6	317457	317462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826720
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6494	NC_021812	TTA	2	6	317499	317504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826720
6495	NC_021812	CTC	2	6	317528	317533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826720
6496	NC_021812	CGA	2	6	317553	317558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826720
6497	NC_021812	GGC	2	6	317604	317609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826720
6498	NC_021812	CCG	2	6	317689	317694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826720
6499	NC_021812	CTGG	2	8	317706	317713	0 %	25 %	50 %	25 %	525826720
6500	NC_021812	TAT	2	6	317726	317731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826720

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