MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021812	TCT	2	6	269142	269147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826676
5502	NC_021812	GGT	2	6	269260	269265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826676
5503	NC_021812	ATT	2	6	269281	269286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826676
5504	NC_021812	TGG	2	6	269385	269390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826676
5505	NC_021812	AATT	2	8	269404	269411	50 %	50 %	0 %	0 %	525826676
5506	NC_021812	AGTG	2	8	269506	269513	25 %	25 %	50 %	0 %	525826676
5507	NC_021812	GAT	2	6	269543	269548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826676
5508	NC_021812	A	6	6	269549	269554	100 %	0 %	0 %	0 %	525826676
5509	NC_021812	ATT	2	6	269593	269598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826676
5510	NC_021812	A	6	6	269680	269685	100 %	0 %	0 %	0 %	525826676
5511	NC_021812	GTGG	2	8	269739	269746	0 %	25 %	75 %	0 %	525826676
5512	NC_021812	ACC	2	6	269747	269752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826676
5513	NC_021812	ATCA	2	8	269844	269851	50 %	25 %	0 %	25 %	525826676
5514	NC_021812	CTA	2	6	269884	269889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826676
5515	NC_021812	AAAAT	2	10	269909	269918	80 %	20 %	0 %	0 %	525826676
5516	NC_021812	ATA	2	6	269945	269950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826676
5517	NC_021812	AT	3	6	270004	270009	50 %	50 %	0 %	0 %	525826676
5518	NC_021812	GAT	2	6	270026	270031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826676
5519	NC_021812	T	6	6	270031	270036	0 %	100 %	0 %	0 %	525826676
5520	NC_021812	ACA	2	6	270045	270050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826676
5521	NC_021812	TAT	2	6	270059	270064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826676
5522	NC_021812	ACT	2	6	270114	270119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826676
5523	NC_021812	GAA	2	6	270137	270142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826676
5524	NC_021812	TTA	2	6	270156	270161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826676
5525	NC_021812	A	7	7	270176	270182	100 %	0 %	0 %	0 %	525826676
5526	NC_021812	CAC	2	6	270209	270214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826676
5527	NC_021812	TCT	2	6	270217	270222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826676
5528	NC_021812	CAA	2	6	270271	270276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826676
5529	NC_021812	CAA	2	6	270346	270351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826676
5530	NC_021812	ATG	2	6	270420	270425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826676
5531	NC_021812	AG	3	6	270663	270668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021812	GAAAA	2	10	270735	270744	80 %	0 %	20 %	0 %	525826677
5533	NC_021812	TCT	2	6	270768	270773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826677
5534	NC_021812	CGC	2	6	270858	270863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826677
5535	NC_021812	GAT	2	6	270873	270878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826677
5536	NC_021812	T	6	6	270889	270894	0 %	100 %	0 %	0 %	525826677
5537	NC_021812	TGG	2	6	270921	270926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826677
5538	NC_021812	ATC	2	6	271093	271098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826677
5539	NC_021812	CGG	2	6	271164	271169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826677
5540	NC_021812	CTG	2	6	271195	271200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826677
5541	NC_021812	ATT	2	6	271234	271239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826677
5542	NC_021812	TAC	2	6	271262	271267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826677
5543	NC_021812	CAA	2	6	271295	271300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826677
5544	NC_021812	GAA	2	6	271321	271326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826677
5545	NC_021812	TGA	2	6	271365	271370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826677
5546	NC_021812	AAC	2	6	271406	271411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826677
5547	NC_021812	T	6	6	271437	271442	0 %	100 %	0 %	0 %	525826677
5548	NC_021812	T	7	7	271460	271466	0 %	100 %	0 %	0 %	525826677
5549	NC_021812	CGG	2	6	271578	271583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826677
5550	NC_021812	TGCTC	2	10	271620	271629	0 %	40 %	20 %	40 %	525826677
5551	NC_021812	TGT	2	6	271788	271793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826677
5552	NC_021812	CGG	2	6	271818	271823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826677
5553	NC_021812	CATG	2	8	271827	271834	25 %	25 %	25 %	25 %	525826677
5554	NC_021812	AT	3	6	271844	271849	50 %	50 %	0 %	0 %	525826677
5555	NC_021812	CTGG	2	8	271921	271928	0 %	25 %	50 %	25 %	525826677
5556	NC_021812	GCTATC	2	12	271930	271941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525826677
5557	NC_021812	TAA	2	6	272017	272022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826677
5558	NC_021812	AAGA	2	8	272063	272070	75 %	0 %	25 %	0 %	525826678
5559	NC_021812	ATTA	2	8	272080	272087	50 %	50 %	0 %	0 %	525826678
5560	NC_021812	CGGAT	2	10	272110	272119	20 %	20 %	40 %	20 %	525826678
5561	NC_021812	GAAC	2	8	272136	272143	50 %	0 %	25 %	25 %	525826678
5562	NC_021812	TTAC	2	8	272151	272158	25 %	50 %	0 %	25 %	525826678
5563	NC_021812	ATT	2	6	272165	272170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826678
5564	NC_021812	TTC	2	6	272193	272198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826678
5565	NC_021812	A	6	6	272228	272233	100 %	0 %	0 %	0 %	525826678
5566	NC_021812	TTG	2	6	272247	272252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826678
5567	NC_021812	TATT	2	8	272260	272267	25 %	75 %	0 %	0 %	525826678
5568	NC_021812	TTG	2	6	272305	272310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826678
5569	NC_021812	AGG	2	6	272355	272360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826678
5570	NC_021812	CAT	2	6	272497	272502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826678
5571	NC_021812	GGC	2	6	272527	272532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826678
5572	NC_021812	GC	3	6	272538	272543	0 %	0 %	50 %	50 %	525826678
5573	NC_021812	GAA	2	6	272582	272587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826678
5574	NC_021812	CGC	2	6	272632	272637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826678
5575	NC_021812	CGA	2	6	272805	272810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826678
5576	NC_021812	TGA	2	6	272869	272874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826678
5577	NC_021812	TGT	2	6	272917	272922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826678
5578	NC_021812	GTC	2	6	272930	272935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826678
5579	NC_021812	TGA	2	6	272941	272946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826678
5580	NC_021812	GCC	2	6	273081	273086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830123
5581	NC_021812	TCGCA	2	10	273153	273162	20 %	20 %	20 %	40 %	525830123
5582	NC_021812	TGT	2	6	273178	273183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830123
5583	NC_021812	TTG	2	6	273184	273189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830123
5584	NC_021812	TCA	2	6	273223	273228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830123
5585	NC_021812	GTT	2	6	273254	273259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830123
5586	NC_021812	AAC	2	6	273283	273288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830123
5587	NC_021812	TTA	2	6	273358	273363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830123
5588	NC_021812	GAT	2	6	273386	273391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830123
5589	NC_021812	TGA	2	6	273410	273415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830123
5590	NC_021812	GC	3	6	273444	273449	0 %	0 %	50 %	50 %	525830123
5591	NC_021812	AG	3	6	273477	273482	50 %	0 %	50 %	0 %	525830123
5592	NC_021812	TTC	2	6	273486	273491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830123
5593	NC_021812	T	6	6	273516	273521	0 %	100 %	0 %	0 %	525830123
5594	NC_021812	ATCC	2	8	273559	273566	25 %	25 %	0 %	50 %	525830123
5595	NC_021812	AGG	2	6	273599	273604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830123
5596	NC_021812	A	6	6	273649	273654	100 %	0 %	0 %	0 %	525830123
5597	NC_021812	ATG	2	6	273691	273696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830123
5598	NC_021812	TCT	2	6	273707	273712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830123
5599	NC_021812	CCTG	2	8	273725	273732	0 %	25 %	25 %	50 %	525830123
5600	NC_021812	TAAT	2	8	273820	273827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021812	CCG	2	6	273853	273858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_021812	TC	3	6	273933	273938	0 %	50 %	0 %	50 %	525826679
5603	NC_021812	CAT	2	6	274014	274019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826679
5604	NC_021812	ATA	2	6	274150	274155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826679
5605	NC_021812	GCG	2	6	274196	274201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826679
5606	NC_021812	TAA	2	6	274213	274218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826679
5607	NC_021812	CGC	2	6	274220	274225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826679
5608	NC_021812	ATT	2	6	274353	274358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826679
5609	NC_021812	TCA	2	6	274397	274402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826679
5610	NC_021812	TCC	2	6	274461	274466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826679
5611	NC_021812	GGC	2	6	274651	274656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826679
5612	NC_021812	TGG	2	6	274745	274750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826679
5613	NC_021812	T	7	7	274811	274817	0 %	100 %	0 %	0 %	525826679
5614	NC_021812	CCG	2	6	274832	274837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826679
5615	NC_021812	AT	3	6	274870	274875	50 %	50 %	0 %	0 %	525826679
5616	NC_021812	GCC	2	6	274942	274947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826679
5617	NC_021812	ATAA	2	8	274975	274982	75 %	25 %	0 %	0 %	525826679
5618	NC_021812	T	7	7	274994	275000	0 %	100 %	0 %	0 %	525826679
5619	NC_021812	CAT	2	6	275001	275006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826679
5620	NC_021812	TTGT	2	8	275014	275021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021812	TGGAT	2	10	275026	275035	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_021812	AT	3	6	275038	275043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021812	GCA	2	6	275068	275073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_021812	TAAT	2	8	275076	275083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021812	TAA	2	6	275104	275109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021812	A	7	7	275183	275189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_021812	CAT	2	6	275193	275198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_021812	A	6	6	275208	275213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5722	NC_021812	AGA	2	6	280430	280435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826686
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5733	NC_021812	T	6	6	281023	281028	0 %	100 %	0 %	0 %	525826686
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5746	NC_021812	CG	3	6	281651	281656	0 %	0 %	50 %	50 %	525826687
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5748	NC_021812	GTT	2	6	281713	281718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826687
5749	NC_021812	T	6	6	281756	281761	0 %	100 %	0 %	0 %	525826687
5750	NC_021812	GAT	2	6	281765	281770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826687
5751	NC_021812	CCGC	2	8	281838	281845	0 %	0 %	25 %	75 %	525826687
5752	NC_021812	TGGC	2	8	281846	281853	0 %	25 %	50 %	25 %	525826687
5753	NC_021812	CGT	2	6	281892	281897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826687
5754	NC_021812	TAA	2	6	281913	281918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826687
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5757	NC_021812	TGA	2	6	282076	282081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826687
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5759	NC_021812	TCA	2	6	282130	282135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826687
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5763	NC_021812	CATG	2	8	282322	282329	25 %	25 %	25 %	25 %	525826688
5764	NC_021812	GGA	2	6	282364	282369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826688
5765	NC_021812	CTGG	2	8	282409	282416	0 %	25 %	50 %	25 %	525826688
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5768	NC_021812	AGAT	2	8	282615	282622	50 %	25 %	25 %	0 %	525826688
5769	NC_021812	A	6	6	282670	282675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5770	NC_021812	ATA	2	6	282697	282702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5771	NC_021812	AAT	2	6	282718	282723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5772	NC_021812	AGG	2	6	282755	282760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5773	NC_021812	GATT	2	8	282868	282875	25 %	50 %	25 %	0 %	525826689
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5796	NC_021812	CTG	2	6	284094	284099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5802	NC_021812	TAA	2	6	284408	284413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5838	NC_021812	AACT	2	8	286277	286284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5839	NC_021812	TGT	2	6	286288	286293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5842	NC_021812	GCT	2	6	286392	286397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5843	NC_021812	CCAG	2	8	286421	286428	25 %	0 %	25 %	50 %	525826692
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5850	NC_021812	CGAA	2	8	286704	286711	50 %	0 %	25 %	25 %	525826692
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5873	NC_021812	CGC	2	6	287915	287920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826694
5874	NC_021812	TCG	2	6	287940	287945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826694
5875	NC_021812	TCG	2	6	287956	287961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826694
5876	NC_021812	GGC	2	6	288029	288034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826694
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5880	NC_021812	TGC	2	6	288263	288268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826694
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5882	NC_021812	GGC	3	9	288332	288340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826694
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5886	NC_021812	GC	3	6	288498	288503	0 %	0 %	50 %	50 %	525826694
5887	NC_021812	GTCACC	2	12	288513	288524	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525826694
5888	NC_021812	ATC	2	6	288546	288551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826694
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5890	NC_021812	CCAT	2	8	288581	288588	25 %	25 %	0 %	50 %	525826694
5891	NC_021812	ATC	2	6	288630	288635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826694
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5893	NC_021812	CTG	2	6	288788	288793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826694
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5900	NC_021812	CAT	2	6	289176	289181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5901	NC_021812	AAT	2	6	289209	289214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5902	NC_021812	GCA	2	6	289293	289298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826695
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5905	NC_021812	CAGC	2	8	289447	289454	25 %	0 %	25 %	50 %	525826695
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5921	NC_021812	CG	3	6	290637	290642	0 %	0 %	50 %	50 %	525826696
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5932	NC_021812	CGG	2	6	290996	291001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826696
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5937	NC_021812	CTG	3	9	291102	291110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826696
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5950	NC_021812	TGA	2	6	291720	291725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826697
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5953	NC_021812	C	6	6	291895	291900	0 %	0 %	0 %	100 %	525826697
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5957	NC_021812	CAATC	2	10	292108	292117	40 %	20 %	0 %	40 %	525826697
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5960	NC_021812	ATTA	2	8	292370	292377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5961	NC_021812	A	6	6	292465	292470	100 %	0 %	0 %	0 %	525826698
5962	NC_021812	A	6	6	292576	292581	100 %	0 %	0 %	0 %	525826698
5963	NC_021812	CTGT	2	8	292585	292592	0 %	50 %	25 %	25 %	525826698
5964	NC_021812	CTG	2	6	292627	292632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826698
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5967	NC_021812	CGG	2	6	292778	292783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826698
5968	NC_021812	A	6	6	292833	292838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5969	NC_021812	CGC	2	6	292920	292925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826699
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5971	NC_021812	TCAT	2	8	293002	293009	25 %	50 %	0 %	25 %	525826699
5972	NC_021812	AG	3	6	293062	293067	50 %	0 %	50 %	0 %	525826699
5973	NC_021812	ACT	2	6	293142	293147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826699
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5976	NC_021812	ACT	2	6	293226	293231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826699
5977	NC_021812	GTTT	2	8	293233	293240	0 %	75 %	25 %	0 %	525826699
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5979	NC_021812	T	7	7	293503	293509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5980	NC_021812	CCG	2	6	293533	293538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5981	NC_021812	TCT	2	6	293575	293580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5982	NC_021812	AGC	2	6	293843	293848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826701
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5984	NC_021812	TAA	2	6	293874	293879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826701
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5988	NC_021812	ACC	2	6	293960	293965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826701
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5990	NC_021812	T	7	7	294003	294009	0 %	100 %	0 %	0 %	525826701
5991	NC_021812	GCC	3	9	294041	294049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826701
5992	NC_021812	TCAA	2	8	294101	294108	50 %	25 %	0 %	25 %	525826701
5993	NC_021812	CGCT	2	8	294164	294171	0 %	25 %	25 %	50 %	525826701
5994	NC_021812	AAAC	2	8	294174	294181	75 %	0 %	0 %	25 %	525826701
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5996	NC_021812	ACG	2	6	294225	294230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826701
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