MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021812	ACCG	2	8	245698	245705	25 %	0 %	25 %	50 %	525826665
5002	NC_021812	TGA	2	6	245738	245743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826665
5003	NC_021812	GCT	2	6	245778	245783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826665
5004	NC_021812	GTT	2	6	245860	245865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826665
5005	NC_021812	GGCGA	2	10	245936	245945	20 %	0 %	60 %	20 %	525826665
5006	NC_021812	AAT	2	6	245981	245986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826665
5007	NC_021812	T	6	6	246127	246132	0 %	100 %	0 %	0 %	525830112
5008	NC_021812	G	6	6	246142	246147	0 %	0 %	100 %	0 %	525830112
5009	NC_021812	AT	3	6	246152	246157	50 %	50 %	0 %	0 %	525830112
5010	NC_021812	CGC	2	6	246158	246163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830112
5011	NC_021812	GTC	2	6	246168	246173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830112
5012	NC_021812	GTG	2	6	246250	246255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830112
5013	NC_021812	TGG	2	6	246328	246333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830112
5014	NC_021812	A	6	6	246358	246363	100 %	0 %	0 %	0 %	525830112
5015	NC_021812	GTG	2	6	246453	246458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830112
5016	NC_021812	CGC	2	6	246503	246508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830112
5017	NC_021812	GGC	2	6	246579	246584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830112
5018	NC_021812	CGC	2	6	246622	246627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830112
5019	NC_021812	GAT	2	6	246648	246653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830112
5020	NC_021812	CGC	2	6	246671	246676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830112
5021	NC_021812	CGT	2	6	246695	246700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830112
5022	NC_021812	ATT	2	6	246739	246744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830112
5023	NC_021812	ATG	2	6	246811	246816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830112
5024	NC_021812	GCG	2	6	246827	246832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830112
5025	NC_021812	ATC	2	6	246837	246842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830112
5026	NC_021812	ATT	2	6	247014	247019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830112
5027	NC_021812	CCG	2	6	247063	247068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830112
5028	NC_021812	GA	3	6	247114	247119	50 %	0 %	50 %	0 %	525830112
5029	NC_021812	CTA	2	6	247127	247132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830112
5030	NC_021812	CAC	2	6	247210	247215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830112
5031	NC_021812	GGCG	2	8	247334	247341	0 %	0 %	75 %	25 %	525830112
5032	NC_021812	GAAC	2	8	247344	247351	50 %	0 %	25 %	25 %	525830112
5033	NC_021812	TGC	2	6	247372	247377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830112
5034	NC_021812	GCT	2	6	247394	247399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830112
5035	NC_021812	CTTTT	2	10	247432	247441	0 %	80 %	0 %	20 %	525830112
5036	NC_021812	T	8	8	247438	247445	0 %	100 %	0 %	0 %	525830112
5037	NC_021812	TGGC	2	8	247605	247612	0 %	25 %	50 %	25 %	525830112
5038	NC_021812	ACT	2	6	247625	247630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830112
5039	NC_021812	TGT	2	6	247660	247665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830112
5040	NC_021812	GGA	2	6	247740	247745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830112
5041	NC_021812	ACG	2	6	247776	247781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830112
5042	NC_021812	TGC	2	6	247786	247791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830112
5043	NC_021812	GAAT	2	8	247826	247833	50 %	25 %	25 %	0 %	525830112
5044	NC_021812	CAT	2	6	247891	247896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830112
5045	NC_021812	GCG	2	6	247955	247960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826666
5046	NC_021812	CCTTA	2	10	247967	247976	20 %	40 %	0 %	40 %	525826666
5047	NC_021812	CCA	2	6	248022	248027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826666
5048	NC_021812	ATG	2	6	248046	248051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826666
5049	NC_021812	GGCG	2	8	248084	248091	0 %	0 %	75 %	25 %	525826666
5050	NC_021812	TGG	2	6	248109	248114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826666
5051	NC_021812	ATC	2	6	248144	248149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826666
5052	NC_021812	TGG	2	6	248192	248197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826666
5053	NC_021812	CG	3	6	248233	248238	0 %	0 %	50 %	50 %	525826666
5054	NC_021812	T	6	6	248278	248283	0 %	100 %	0 %	0 %	525826666
5055	NC_021812	TAT	2	6	248366	248371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826666
5056	NC_021812	TAT	2	6	248378	248383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826666
5057	NC_021812	CGCT	3	12	248503	248514	0 %	25 %	25 %	50 %	525826666
5058	NC_021812	CGA	2	6	248581	248586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826666
5059	NC_021812	A	6	6	248730	248735	100 %	0 %	0 %	0 %	525826666
5060	NC_021812	TGA	2	6	248761	248766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826666
5061	NC_021812	CAC	2	6	248782	248787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826666
5062	NC_021812	GC	3	6	248877	248882	0 %	0 %	50 %	50 %	525826666
5063	NC_021812	GCGG	2	8	248893	248900	0 %	0 %	75 %	25 %	525826666
5064	NC_021812	GGC	2	6	248908	248913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826666
5065	NC_021812	GCT	2	6	248959	248964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826666
5066	NC_021812	AG	3	6	249010	249015	50 %	0 %	50 %	0 %	525826666
5067	NC_021812	CGT	2	6	249016	249021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826666
5068	NC_021812	TTA	2	6	249041	249046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826666
5069	NC_021812	ACGGC	2	10	249072	249081	20 %	0 %	40 %	40 %	525826666
5070	NC_021812	CCG	2	6	249092	249097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826666
5071	NC_021812	TCC	2	6	249151	249156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826666
5072	NC_021812	TCT	2	6	249187	249192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826666
5073	NC_021812	CCAG	2	8	249213	249220	25 %	0 %	25 %	50 %	525826666
5074	NC_021812	GAG	2	6	249221	249226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826666
5075	NC_021812	CAA	2	6	249251	249256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826666
5076	NC_021812	TTTC	2	8	249298	249305	0 %	75 %	0 %	25 %	525826666
5077	NC_021812	GCGAG	2	10	249451	249460	20 %	0 %	60 %	20 %	525826666
5078	NC_021812	GGC	2	6	249528	249533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826666
5079	NC_021812	ATG	2	6	249564	249569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826666
5080	NC_021812	CGG	2	6	249585	249590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826666
5081	NC_021812	CGAAG	2	10	249712	249721	40 %	0 %	40 %	20 %	525826666
5082	NC_021812	CCG	2	6	249967	249972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826666
5083	NC_021812	GCA	2	6	249997	250002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826666
5084	NC_021812	CG	3	6	250032	250037	0 %	0 %	50 %	50 %	525826666
5085	NC_021812	AG	3	6	250039	250044	50 %	0 %	50 %	0 %	525826666
5086	NC_021812	CTGCGT	2	12	250088	250099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826666
5087	NC_021812	CAG	2	6	250100	250105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826666
5088	NC_021812	TA	3	6	250133	250138	50 %	50 %	0 %	0 %	525826666
5089	NC_021812	ATG	3	9	250197	250205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826666
5090	NC_021812	TTG	3	9	250212	250220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826666
5091	NC_021812	ATT	2	6	250295	250300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826666
5092	NC_021812	GCG	2	6	250395	250400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826666
5093	NC_021812	GTGG	2	8	250463	250470	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021812	ACA	2	6	250483	250488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826667
5095	NC_021812	ATCAG	2	10	250504	250513	40 %	20 %	20 %	20 %	525826667
5096	NC_021812	T	6	6	250568	250573	0 %	100 %	0 %	0 %	525826667
5097	NC_021812	CGA	2	6	250659	250664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5098	NC_021812	GC	3	6	250700	250705	0 %	0 %	50 %	50 %	525826667
5099	NC_021812	GCT	2	6	250770	250775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5100	NC_021812	TGG	2	6	250799	250804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826667
5101	NC_021812	TGA	2	6	250872	250877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826667
5102	NC_021812	GC	3	6	250886	250891	0 %	0 %	50 %	50 %	525826667
5103	NC_021812	TGAT	2	8	250913	250920	25 %	50 %	25 %	0 %	525826667
5104	NC_021812	GGA	2	6	250938	250943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826667
5105	NC_021812	ATT	2	6	250978	250983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826667
5106	NC_021812	T	6	6	251200	251205	0 %	100 %	0 %	0 %	525826667
5107	NC_021812	CTA	2	6	251220	251225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826667
5108	NC_021812	GC	3	6	251262	251267	0 %	0 %	50 %	50 %	525826667
5109	NC_021812	ATG	2	6	251273	251278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826667
5110	NC_021812	AG	3	6	251573	251578	50 %	0 %	50 %	0 %	525826667
5111	NC_021812	T	7	7	251583	251589	0 %	100 %	0 %	0 %	525826667
5112	NC_021812	AAACTG	2	12	251620	251631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525826667
5113	NC_021812	GGC	2	6	251659	251664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826667
5114	NC_021812	GGC	2	6	251674	251679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826667
5115	NC_021812	CCA	2	6	251683	251688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826667
5116	NC_021812	GAATG	2	10	251698	251707	40 %	20 %	40 %	0 %	525826667
5117	NC_021812	CGC	2	6	251766	251771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826667
5118	NC_021812	CTG	2	6	251776	251781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5119	NC_021812	TTA	2	6	251837	251842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826667
5120	NC_021812	ATA	2	6	251915	251920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826667
5121	NC_021812	CGA	3	9	251973	251981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5122	NC_021812	CAA	2	6	252004	252009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826667
5123	NC_021812	ACC	2	6	252025	252030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826667
5124	NC_021812	TTA	2	6	252058	252063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826667
5125	NC_021812	GC	3	6	252204	252209	0 %	0 %	50 %	50 %	525826667
5126	NC_021812	TGC	2	6	252221	252226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5127	NC_021812	CGG	2	6	252273	252278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826667
5128	NC_021812	GCA	2	6	252285	252290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5129	NC_021812	GGC	2	6	252439	252444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826667
5130	NC_021812	GAC	2	6	252459	252464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5131	NC_021812	GCA	2	6	252477	252482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826667
5132	NC_021812	GAA	2	6	252499	252504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826667
5133	NC_021812	T	6	6	252598	252603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021812	AGGT	2	8	252738	252745	25 %	25 %	50 %	0 %	525826668
5135	NC_021812	CCG	2	6	252784	252789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826668
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5142	NC_021812	CGC	2	6	253031	253036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826668
5143	NC_021812	ACG	2	6	253141	253146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826668
5144	NC_021812	GCA	2	6	253240	253245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826668
5145	NC_021812	CAT	2	6	253282	253287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826668
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5184	NC_021812	CGG	2	6	254929	254934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826669
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5187	NC_021812	CCA	2	6	255130	255135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826669
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5202	NC_021812	ATC	2	6	255664	255669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826670
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5220	NC_021812	TCT	2	6	256238	256243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826670
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5222	NC_021812	A	7	7	256264	256270	100 %	0 %	0 %	0 %	525826670
5223	NC_021812	CGC	2	6	256308	256313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826670
5224	NC_021812	GCG	2	6	256334	256339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826670
5225	NC_021812	CG	3	6	256386	256391	0 %	0 %	50 %	50 %	525826670
5226	NC_021812	GCAGC	2	10	256563	256572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5227	NC_021812	A	7	7	256599	256605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5228	NC_021812	CAG	2	6	256686	256691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5229	NC_021812	CCTC	2	8	256852	256859	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5230	NC_021812	GAA	2	6	256864	256869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_021812	AGC	2	6	256928	256933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5232	NC_021812	AAGA	2	8	256937	256944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_021812	TAA	2	6	257002	257007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_021812	GTAC	2	8	257046	257053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5235	NC_021812	T	6	6	257075	257080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5236	NC_021812	CCAG	2	8	257099	257106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5237	NC_021812	TTA	2	6	257142	257147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_021812	CAA	2	6	257200	257205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5239	NC_021812	A	6	6	257204	257209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_021812	GA	3	6	257317	257322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_021812	GCA	2	6	257338	257343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5242	NC_021812	TG	3	6	257356	257361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_021812	GTAA	2	8	257449	257456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_021812	AG	3	6	257510	257515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_021812	GGA	2	6	257552	257557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_021812	T	6	6	257560	257565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_021812	GGT	2	6	257662	257667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021812	GGA	2	6	257690	257695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_021812	GC	3	6	257757	257762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5250	NC_021812	TGC	2	6	257853	257858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830113
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5272	NC_021812	TTAA	2	8	258844	258851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5277	NC_021812	GAAA	2	8	259177	259184	75 %	0 %	25 %	0 %	525826671
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5303	NC_021812	CAGCG	3	15	260277	260291	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5343	NC_021812	TCA	2	6	261840	261845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830116
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5347	NC_021812	CGC	2	6	262009	262014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5348	NC_021812	ATTG	2	8	262063	262070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5349	NC_021812	AACC	2	8	262086	262093	50 %	0 %	0 %	50 %	525830117
5350	NC_021812	AGCT	2	8	262156	262163	25 %	25 %	25 %	25 %	525830117
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5352	NC_021812	ATC	2	6	262297	262302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830117
5353	NC_021812	ATA	2	6	262357	262362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830117
5354	NC_021812	CTT	2	6	262377	262382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830117
5355	NC_021812	ATT	2	6	262453	262458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_021812	AT	4	8	262469	262476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_021812	AAT	2	6	262526	262531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_021812	AGC	2	6	262546	262551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5359	NC_021812	GGT	2	6	262676	262681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826672
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5361	NC_021812	A	7	7	262738	262744	100 %	0 %	0 %	0 %	525826672
5362	NC_021812	CATC	2	8	262746	262753	25 %	25 %	0 %	50 %	525826672
5363	NC_021812	TCA	2	6	262766	262771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826672
5364	NC_021812	T	6	6	262819	262824	0 %	100 %	0 %	0 %	525826672
5365	NC_021812	CAT	2	6	262842	262847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826672
5366	NC_021812	CTT	2	6	262850	262855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826672
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5370	NC_021812	GTT	2	6	263043	263048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830118
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5372	NC_021812	CAG	2	6	263145	263150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_021812	TTA	2	6	263201	263206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_021812	TCA	2	6	263232	263237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5375	NC_021812	AGG	2	6	263241	263246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5389	NC_021812	CT	3	6	263790	263795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5494	NC_021812	CTT	2	6	268960	268965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_021812	TTAT	2	8	268969	268976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_021812	GCTG	2	8	269028	269035	0 %	25 %	50 %	25 %	525826676
5497	NC_021812	A	7	7	269069	269075	100 %	0 %	0 %	0 %	525826676
5498	NC_021812	GTT	2	6	269084	269089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826676
5499	NC_021812	ACT	2	6	269125	269130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826676
5500	NC_021812	AAC	2	6	269135	269140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826676

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