MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 2334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021811	CCA	2	6	26234	26239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525811141
502	NC_021811	GGA	2	6	26413	26418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525811141
503	NC_021811	GTG	2	6	26444	26449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525811141
504	NC_021811	A	6	6	26450	26455	100 %	0 %	0 %	0 %	525811141
505	NC_021811	TGC	2	6	26531	26536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811141
506	NC_021811	G	6	6	26550	26555	0 %	0 %	100 %	0 %	525811141
507	NC_021811	GT	3	6	26616	26621	0 %	50 %	50 %	0 %	525811141
508	NC_021811	GAT	2	6	26707	26712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811141
509	NC_021811	GAA	2	6	26722	26727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811141
510	NC_021811	GAA	2	6	26809	26814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811141
511	NC_021811	ACA	2	6	26823	26828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811141
512	NC_021811	TC	3	6	26835	26840	0 %	50 %	0 %	50 %	525811141
513	NC_021811	GATATC	2	12	26911	26922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525811141
514	NC_021811	A	6	6	27094	27099	100 %	0 %	0 %	0 %	525811141
515	NC_021811	TGA	2	6	27132	27137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811141
516	NC_021811	GACA	2	8	27242	27249	50 %	0 %	25 %	25 %	525811141
517	NC_021811	GTA	2	6	27320	27325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811141
518	NC_021811	GCC	2	6	27346	27351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811141
519	NC_021811	GAA	2	6	27355	27360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811141
520	NC_021811	AAC	2	6	27376	27381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811141
521	NC_021811	TTGA	2	8	27472	27479	25 %	50 %	25 %	0 %	525811141
522	NC_021811	CAT	2	6	27533	27538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811141
523	NC_021811	GCA	2	6	27566	27571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811141
524	NC_021811	GTT	2	6	27580	27585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811141
525	NC_021811	CCG	2	6	27630	27635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811141
526	NC_021811	TAC	2	6	27648	27653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811141
527	NC_021811	CAT	2	6	27690	27695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811141
528	NC_021811	GGC	2	6	27795	27800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525811141
529	NC_021811	CGA	2	6	27901	27906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811141
530	NC_021811	ACC	2	6	28022	28027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525811141
531	NC_021811	TCA	2	6	28053	28058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811141
532	NC_021811	A	7	7	28060	28066	100 %	0 %	0 %	0 %	525811141
533	NC_021811	T	8	8	28129	28136	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
534	NC_021811	CGG	2	6	28174	28179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525811142
535	NC_021811	CGC	2	6	28207	28212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811142
536	NC_021811	GTA	2	6	28225	28230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811142
537	NC_021811	CTTC	2	8	28238	28245	0 %	50 %	0 %	50 %	525811142
538	NC_021811	TGA	2	6	28250	28255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811142
539	NC_021811	TTGT	2	8	28348	28355	0 %	75 %	25 %	0 %	525811142
540	NC_021811	AAT	2	6	28397	28402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525811142
541	NC_021811	AAC	2	6	28462	28467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811142
542	NC_021811	TTC	2	6	28532	28537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811142
543	NC_021811	GTC	2	6	28616	28621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811142
544	NC_021811	CAG	2	6	28680	28685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
545	NC_021811	AGC	2	6	28699	28704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
546	NC_021811	TCT	2	6	28784	28789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811142
547	NC_021811	ATC	2	6	28858	28863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811142
548	NC_021811	TG	3	6	28878	28883	0 %	50 %	50 %	0 %	525811142
549	NC_021811	TGA	2	6	28904	28909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811142
550	NC_021811	GCA	2	6	29028	29033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
551	NC_021811	CTG	2	6	29048	29053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811142
552	NC_021811	CAGC	2	8	29073	29080	25 %	0 %	25 %	50 %	525811142
553	NC_021811	CAAA	2	8	29115	29122	75 %	0 %	0 %	25 %	525811142
554	NC_021811	CTG	2	6	29124	29129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811142
555	NC_021811	TGC	2	6	29190	29195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811142
556	NC_021811	ACA	2	6	29237	29242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811142
557	NC_021811	TGT	2	6	29252	29257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811142
558	NC_021811	TGT	2	6	29276	29281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811142
559	NC_021811	AAC	2	6	29285	29290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811142
560	NC_021811	TG	3	6	29321	29326	0 %	50 %	50 %	0 %	525811142
561	NC_021811	TTC	2	6	29332	29337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811142
562	NC_021811	CTTT	2	8	29378	29385	0 %	75 %	0 %	25 %	525811142
563	NC_021811	ACG	2	6	29479	29484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
564	NC_021811	GCCA	2	8	29541	29548	25 %	0 %	25 %	50 %	525811142
565	NC_021811	CAG	2	6	29578	29583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
566	NC_021811	GAC	2	6	29760	29765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
567	NC_021811	CTG	2	6	29773	29778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811142
568	NC_021811	T	6	6	29799	29804	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
569	NC_021811	T	7	7	29901	29907	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
570	NC_021811	AGG	2	6	29928	29933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525811142
571	NC_021811	CCAT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	0 %	50 %	525811142
572	NC_021811	GAC	2	6	30036	30041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
573	NC_021811	GTTT	2	8	30119	30126	0 %	75 %	25 %	0 %	525811142
574	NC_021811	T	7	7	30124	30130	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
575	NC_021811	ACGAT	2	10	30179	30188	40 %	20 %	20 %	20 %	525811142
576	NC_021811	GGCA	2	8	30252	30259	25 %	0 %	50 %	25 %	525811142
577	NC_021811	TGCC	2	8	30514	30521	0 %	25 %	25 %	50 %	525811142
578	NC_021811	CAA	2	6	30672	30677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811142
579	NC_021811	GTT	2	6	30702	30707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811142
580	NC_021811	GAA	3	9	30716	30724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811142
581	NC_021811	GTCAT	2	10	30746	30755	20 %	40 %	20 %	20 %	525811142
582	NC_021811	CGAA	2	8	30786	30793	50 %	0 %	25 %	25 %	525811142
583	NC_021811	CAA	2	6	30895	30900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811143
584	NC_021811	AACA	2	8	30941	30948	75 %	0 %	0 %	25 %	525811143
585	NC_021811	CAT	2	6	30994	30999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811143
586	NC_021811	TGC	2	6	31028	31033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811143
587	NC_021811	TCATCC	2	12	31092	31103	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525811143
588	NC_021811	CTT	2	6	31155	31160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811143
589	NC_021811	TCAC	2	8	31170	31177	25 %	25 %	0 %	50 %	525811143
590	NC_021811	AGG	2	6	31218	31223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021811	CG	3	6	31236	31241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_021811	CAT	2	6	31307	31312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_021811	TGA	2	6	31365	31370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021811	GA	3	6	31396	31401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021811	A	6	6	31419	31424	100 %	0 %	0 %	0 %	525811144
596	NC_021811	GAT	2	6	31434	31439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811144
597	NC_021811	GCT	2	6	31458	31463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811144
598	NC_021811	TGA	2	6	31529	31534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811144
599	NC_021811	ATT	2	6	31536	31541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811144
600	NC_021811	GA	3	6	31615	31620	50 %	0 %	50 %	0 %	525811144
601	NC_021811	ATT	2	6	31635	31640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811144
602	NC_021811	A	6	6	31656	31661	100 %	0 %	0 %	0 %	525811144
603	NC_021811	TTC	2	6	31673	31678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811144
604	NC_021811	CAGG	2	8	31708	31715	25 %	0 %	50 %	25 %	525811144
605	NC_021811	AAC	2	6	31734	31739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811144
606	NC_021811	ATG	2	6	31776	31781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021811	A	8	8	31789	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021811	GGC	2	6	31841	31846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525811145
609	NC_021811	AAT	2	6	31870	31875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525811145
610	NC_021811	CAA	2	6	31890	31895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811145
611	NC_021811	CAG	2	6	32056	32061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
612	NC_021811	CAG	2	6	32140	32145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
613	NC_021811	AAT	2	6	32152	32157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525811145
614	NC_021811	ATT	2	6	32182	32187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811145
615	NC_021811	ATCA	2	8	32221	32228	50 %	25 %	0 %	25 %	525811145
616	NC_021811	TCA	2	6	32319	32324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
617	NC_021811	GCTG	2	8	32325	32332	0 %	25 %	50 %	25 %	525811145
618	NC_021811	TCA	2	6	32339	32344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
619	NC_021811	TCA	2	6	32385	32390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
620	NC_021811	CTT	2	6	32439	32444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811145
621	NC_021811	CGA	2	6	32459	32464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
622	NC_021811	GC	3	6	32533	32538	0 %	0 %	50 %	50 %	525811145
623	NC_021811	GAT	2	6	32596	32601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811145
624	NC_021811	CAG	2	6	32655	32660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
625	NC_021811	TCA	2	6	32676	32681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
626	NC_021811	GGA	2	6	32730	32735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021811	CAC	2	6	32805	32810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_021811	C	6	6	32888	32893	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
629	NC_021811	GAC	2	6	32896	32901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021811	ATGT	2	8	32919	32926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021811	GCG	2	6	32965	32970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021811	AC	3	6	33014	33019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_021811	GAA	2	6	33057	33062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021811	ACG	2	6	33065	33070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021811	CAA	2	6	33074	33079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021811	TGG	2	6	33087	33092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021811	CAC	2	6	33102	33107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_021811	A	7	7	33153	33159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021811	T	6	6	33175	33180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021811	TTAT	2	8	33185	33192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_021811	TGA	2	6	33212	33217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_021811	T	6	6	33233	33238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_021811	GGA	2	6	33392	33397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525811146
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762	NC_021811	TCC	2	6	39502	39507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
763	NC_021811	GTGCC	2	10	39536	39545	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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890	NC_021811	GCC	2	6	45131	45136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811161
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893	NC_021811	GGC	2	6	45333	45338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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985	NC_021811	GCCC	2	8	49396	49403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1000	NC_021811	CA	3	6	50169	50174	50 %	0 %	0 %	50 %	525811170

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