MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021810	T	6	6	170837	170842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021810	AAC	2	6	170937	170942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814344
3503	NC_021810	ACG	2	6	170952	170957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814344
3504	NC_021810	CGCC	2	8	171072	171079	0 %	0 %	25 %	75 %	525814344
3505	NC_021810	GC	3	6	171110	171115	0 %	0 %	50 %	50 %	525814344
3506	NC_021810	AAT	2	6	171212	171217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814344
3507	NC_021810	GCCGC	2	10	171234	171243	0 %	0 %	40 %	60 %	525814344
3508	NC_021810	ATC	2	6	171252	171257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814344
3509	NC_021810	GCC	2	6	171489	171494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814344
3510	NC_021810	T	6	6	171506	171511	0 %	100 %	0 %	0 %	525814344
3511	NC_021810	A	7	7	171655	171661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021810	ACA	2	6	171677	171682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021810	GC	3	6	171748	171753	0 %	0 %	50 %	50 %	525814345
3514	NC_021810	CCG	2	6	171780	171785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814345
3515	NC_021810	TCC	2	6	171847	171852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814345
3516	NC_021810	CTG	2	6	171887	171892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3517	NC_021810	CTG	2	6	171905	171910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3518	NC_021810	GAA	2	6	171911	171916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814345
3519	NC_021810	CGC	2	6	171948	171953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814345
3520	NC_021810	TGC	2	6	171954	171959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3521	NC_021810	GCT	2	6	171997	172002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3522	NC_021810	CGCA	2	8	172070	172077	25 %	0 %	25 %	50 %	525814345
3523	NC_021810	GCG	2	6	172087	172092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814345
3524	NC_021810	GGT	2	6	172099	172104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814345
3525	NC_021810	TGG	2	6	172146	172151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814345
3526	NC_021810	GTC	2	6	172231	172236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3527	NC_021810	GCT	2	6	172237	172242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
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3529	NC_021810	GAT	2	6	172274	172279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814345
3530	NC_021810	CGTGC	2	10	172327	172336	0 %	20 %	40 %	40 %	525814345
3531	NC_021810	CTG	2	6	172390	172395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3532	NC_021810	GCG	2	6	172434	172439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814345
3533	NC_021810	TGC	2	6	172464	172469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3534	NC_021810	GAT	2	6	172513	172518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814345
3535	NC_021810	GCT	2	6	172537	172542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3536	NC_021810	TGC	2	6	172560	172565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
3537	NC_021810	CT	3	6	172578	172583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_021810	GGC	2	6	172597	172602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021810	CTT	2	6	172647	172652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_021810	TCA	2	6	172659	172664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021810	GGC	2	6	172682	172687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021810	A	6	6	172688	172693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021810	T	6	6	172711	172716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021810	GGC	2	6	172720	172725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021810	TAA	2	6	172775	172780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021810	A	6	6	172786	172791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021810	GGC	2	6	172854	172859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814346
3548	NC_021810	TCG	2	6	172915	172920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814346
3549	NC_021810	GCT	2	6	172934	172939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814346
3550	NC_021810	GCA	2	6	172966	172971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814346
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3554	NC_021810	TGA	2	6	173086	173091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814346
3555	NC_021810	TCA	2	6	173098	173103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814346
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3557	NC_021810	CGAA	2	8	173163	173170	50 %	0 %	25 %	25 %	525814346
3558	NC_021810	GC	3	6	173192	173197	0 %	0 %	50 %	50 %	525814346
3559	NC_021810	CAG	2	6	173202	173207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814346
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3561	NC_021810	TGCG	2	8	173308	173315	0 %	25 %	50 %	25 %	525814346
3562	NC_021810	T	6	6	173337	173342	0 %	100 %	0 %	0 %	525814346
3563	NC_021810	AAGG	2	8	173361	173368	50 %	0 %	50 %	0 %	525814346
3564	NC_021810	CTT	2	6	173400	173405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814346
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3566	NC_021810	CGC	2	6	173424	173429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814346
3567	NC_021810	GCC	2	6	173560	173565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814346
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3569	NC_021810	TGT	2	6	173662	173667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3572	NC_021810	A	6	6	173835	173840	100 %	0 %	0 %	0 %	525814347
3573	NC_021810	ACG	2	6	173849	173854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814347
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3577	NC_021810	CAG	2	6	174111	174116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814347
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3581	NC_021810	CGA	2	6	174220	174225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814347
3582	NC_021810	TCA	2	6	174236	174241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814347
3583	NC_021810	GGC	2	6	174276	174281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814347
3584	NC_021810	ATA	2	6	174303	174308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814347
3585	NC_021810	ATT	2	6	174368	174373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021810	TAA	2	6	174399	174404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021810	GGC	2	6	174436	174441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_021810	GGCA	2	8	174496	174503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_021810	GGA	2	6	174509	174514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021810	GCG	2	6	174588	174593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814348
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3593	NC_021810	TGA	2	6	174683	174688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814348
3594	NC_021810	TCG	2	6	174741	174746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814348
3595	NC_021810	TCG	2	6	174757	174762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814348
3596	NC_021810	AGC	2	6	174765	174770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814348
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3598	NC_021810	TGA	2	6	174850	174855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814348
3599	NC_021810	AAT	2	6	174890	174895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814348
3600	NC_021810	CG	3	6	174908	174913	0 %	0 %	50 %	50 %	525814348
3601	NC_021810	GTACC	2	10	174943	174952	20 %	20 %	20 %	40 %	525814348
3602	NC_021810	GCC	2	6	174959	174964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814348
3603	NC_021810	ACGG	2	8	174991	174998	25 %	0 %	50 %	25 %	525814348
3604	NC_021810	GCG	2	6	175071	175076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814348
3605	NC_021810	AGAA	2	8	175169	175176	75 %	0 %	25 %	0 %	525814348
3606	NC_021810	CGCA	2	8	175205	175212	25 %	0 %	25 %	50 %	525814348
3607	NC_021810	CG	3	6	175240	175245	0 %	0 %	50 %	50 %	525814348
3608	NC_021810	GAT	3	9	175259	175267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814348
3609	NC_021810	CAA	2	6	175282	175287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814348
3610	NC_021810	CCAG	2	8	175327	175334	25 %	0 %	25 %	50 %	525814348
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3612	NC_021810	CAT	2	6	175479	175484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_021810	A	6	6	175488	175493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021810	CTAA	2	8	175528	175535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_021810	CGC	2	6	175536	175541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_021810	A	7	7	175559	175565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021810	CAG	2	6	175593	175598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3619	NC_021810	CG	3	6	175688	175693	0 %	0 %	50 %	50 %	525814349
3620	NC_021810	GTA	2	6	175773	175778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814349
3621	NC_021810	GTATCG	2	12	175810	175821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525814349
3622	NC_021810	GAACCG	2	12	175876	175887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814349
3623	NC_021810	TGT	2	6	175910	175915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814349
3624	NC_021810	GAAG	2	8	176016	176023	50 %	0 %	50 %	0 %	525814349
3625	NC_021810	GCTCA	2	10	176052	176061	20 %	20 %	20 %	40 %	525814349
3626	NC_021810	TGT	2	6	176120	176125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814349
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3697	NC_021810	GAA	2	6	179198	179203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3698	NC_021810	TCG	2	6	179298	179303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3742	NC_021810	CGG	2	6	181547	181552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814355
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3744	NC_021810	TGA	2	6	181613	181618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814355
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3747	NC_021810	TGGC	2	8	181877	181884	0 %	25 %	50 %	25 %	525814356
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3755	NC_021810	CGT	2	6	182350	182355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814356
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3764	NC_021810	CAGT	2	8	182762	182769	25 %	25 %	25 %	25 %	525814357
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3865	NC_021810	CTTT	2	8	187881	187888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3867	NC_021810	A	6	6	188012	188017	100 %	0 %	0 %	0 %	525814361
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3993	NC_021810	TCT	2	6	193859	193864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814367
3994	NC_021810	AG	3	6	193999	194004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_021810	TTTC	2	8	194011	194018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3996	NC_021810	CA	3	6	194042	194047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3997	NC_021810	CCA	2	6	194056	194061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3998	NC_021810	GGC	3	9	194132	194140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814368
3999	NC_021810	GTT	2	6	194149	194154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814368
4000	NC_021810	CCG	2	6	194157	194162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814368

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