MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021810	GC	3	6	119742	119747	0 %	0 %	50 %	50 %	525814293
2502	NC_021810	TTC	2	6	119854	119859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814293
2503	NC_021810	CGC	2	6	119929	119934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814293
2504	NC_021810	T	6	6	119964	119969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_021810	CATC	2	8	120008	120015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_021810	CTT	2	6	120059	120064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_021810	TG	3	6	120067	120072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_021810	AAT	2	6	120093	120098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814294
2509	NC_021810	CT	3	6	120125	120130	0 %	50 %	0 %	50 %	525814294
2510	NC_021810	TTCC	2	8	120175	120182	0 %	50 %	0 %	50 %	525814294
2511	NC_021810	TATT	2	8	120215	120222	25 %	75 %	0 %	0 %	525814294
2512	NC_021810	ATT	2	6	120332	120337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814294
2513	NC_021810	TAT	2	6	120357	120362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814294
2514	NC_021810	T	6	6	120385	120390	0 %	100 %	0 %	0 %	525814294
2515	NC_021810	AGAT	2	8	120458	120465	50 %	25 %	25 %	0 %	525814294
2516	NC_021810	GTA	2	6	120496	120501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814294
2517	NC_021810	CTT	2	6	120585	120590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814294
2518	NC_021810	ATT	2	6	120724	120729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814294
2519	NC_021810	CTGC	2	8	120849	120856	0 %	25 %	25 %	50 %	525814294
2520	NC_021810	CCG	2	6	120865	120870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814294
2521	NC_021810	CG	3	6	120885	120890	0 %	0 %	50 %	50 %	525814294
2522	NC_021810	GAT	2	6	120924	120929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814294
2523	NC_021810	CT	3	6	120949	120954	0 %	50 %	0 %	50 %	525814294
2524	NC_021810	TAT	2	6	120963	120968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814294
2525	NC_021810	CGT	2	6	120975	120980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814294
2526	NC_021810	CAG	2	6	121057	121062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814294
2527	NC_021810	A	7	7	121072	121078	100 %	0 %	0 %	0 %	525814294
2528	NC_021810	CTAT	2	8	121099	121106	25 %	50 %	0 %	25 %	525814294
2529	NC_021810	TAT	2	6	121131	121136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814294
2530	NC_021810	GAT	2	6	121197	121202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814294
2531	NC_021810	TAT	2	6	121209	121214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814294
2532	NC_021810	GTC	2	6	121285	121290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814294
2533	NC_021810	TA	3	6	121363	121368	50 %	50 %	0 %	0 %	525814295
2534	NC_021810	TCT	2	6	121400	121405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814295
2535	NC_021810	TCA	2	6	121418	121423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814295
2536	NC_021810	TGA	2	6	121427	121432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814295
2537	NC_021810	CCGCG	2	10	121485	121494	0 %	0 %	40 %	60 %	525814295
2538	NC_021810	CGC	2	6	121498	121503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814295
2539	NC_021810	TGT	2	6	121508	121513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814295
2540	NC_021810	T	8	8	121548	121555	0 %	100 %	0 %	0 %	525814295
2541	NC_021810	TTTG	2	8	121602	121609	0 %	75 %	25 %	0 %	525814295
2542	NC_021810	G	6	6	121683	121688	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_021810	G	7	7	121703	121709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021810	AAC	2	6	121732	121737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_021810	CTT	2	6	121770	121775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814296
2546	NC_021810	TTC	2	6	121794	121799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814296
2547	NC_021810	TTA	2	6	121815	121820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814296
2548	NC_021810	ATG	2	6	121860	121865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814296
2549	NC_021810	GCA	2	6	121923	121928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814296
2550	NC_021810	TGGG	2	8	121966	121973	0 %	25 %	75 %	0 %	525814296
2551	NC_021810	ATT	2	6	122040	122045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814296
2552	NC_021810	GGCGA	2	10	122080	122089	20 %	0 %	60 %	20 %	525814296
2553	NC_021810	GCA	2	6	122090	122095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814296
2554	NC_021810	TGGC	2	8	122097	122104	0 %	25 %	50 %	25 %	525814296
2555	NC_021810	CAT	2	6	122112	122117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814296
2556	NC_021810	ACCACG	10	60	122122	122181	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525814296
2557	NC_021810	CAT	2	6	122184	122189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814296
2558	NC_021810	TGC	2	6	122252	122257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814296
2559	NC_021810	GCG	2	6	122463	122468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814296
2560	NC_021810	GCA	2	6	122484	122489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814296
2561	NC_021810	CGG	2	6	122520	122525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814296
2562	NC_021810	TGGTC	2	10	122552	122561	0 %	40 %	40 %	20 %	525814296
2563	NC_021810	A	6	6	122746	122751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021810	CCACCG	2	12	122756	122767	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_021810	CAG	2	6	122873	122878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814297
2566	NC_021810	CA	3	6	122965	122970	50 %	0 %	0 %	50 %	525814297
2567	NC_021810	AAGC	2	8	123008	123015	50 %	0 %	25 %	25 %	525814297
2568	NC_021810	TCA	2	6	123079	123084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814297
2569	NC_021810	TCCTG	2	10	123167	123176	0 %	40 %	20 %	40 %	525814297
2570	NC_021810	CGC	2	6	123210	123215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814297
2571	NC_021810	CAG	2	6	123248	123253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814297
2572	NC_021810	GCC	2	6	123263	123268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814297
2573	NC_021810	ACC	2	6	123282	123287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814297
2574	NC_021810	CAGTAT	2	12	123392	123403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525814297
2575	NC_021810	TGC	2	6	123426	123431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814297
2576	NC_021810	AACAG	2	10	123432	123441	60 %	0 %	20 %	20 %	525814297
2577	NC_021810	CAG	2	6	123519	123524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814297
2578	NC_021810	GCCGG	2	10	123544	123553	0 %	0 %	60 %	40 %	525814297
2579	NC_021810	TCATCC	2	12	123571	123582	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525814297
2580	NC_021810	CTT	2	6	123585	123590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814298
2581	NC_021810	CGG	3	9	123687	123695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814298
2582	NC_021810	CGT	2	6	123763	123768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814298
2583	NC_021810	ACC	2	6	123805	123810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814298
2584	NC_021810	CTG	2	6	123906	123911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814298
2585	NC_021810	GAT	2	6	123933	123938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814298
2586	NC_021810	CAT	2	6	123989	123994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814298
2587	NC_021810	T	6	6	124045	124050	0 %	100 %	0 %	0 %	525814298
2588	NC_021810	GT	3	6	124053	124058	0 %	50 %	50 %	0 %	525814298
2589	NC_021810	GAA	2	6	124113	124118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_021810	TATT	2	8	124133	124140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_021810	TG	3	6	124146	124151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_021810	TCAG	2	8	124179	124186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2593	NC_021810	TATT	2	8	124195	124202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_021810	GTTA	2	8	124217	124224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_021810	AGTAAC	2	12	124227	124238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2596	NC_021810	GCA	2	6	124246	124251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_021810	C	6	6	124276	124281	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2598	NC_021810	TTA	2	6	124292	124297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_021810	TA	3	6	124304	124309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_021810	GTAATA	2	12	124339	124350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_021810	CTT	2	6	124361	124366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_021810	ATC	2	6	124395	124400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_021810	TTG	2	6	124435	124440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_021810	CCTG	2	8	124556	124563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_021810	GTCTG	2	10	124586	124595	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2606	NC_021810	ACT	2	6	124781	124786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_021810	CT	3	6	124785	124790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_021810	TA	3	6	124804	124809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_021810	CTGA	2	8	124891	124898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2610	NC_021810	ACA	2	6	124929	124934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_021810	TGAT	2	8	125085	125092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_021810	ATC	2	6	125126	125131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_021810	CTT	2	6	125148	125153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_021810	CATT	2	8	125184	125191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_021810	CA	3	6	125222	125227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_021810	ACA	2	6	125236	125241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_021810	TCA	2	6	125242	125247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_021810	GTTTT	2	10	125260	125269	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_021810	ATG	2	6	125292	125297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814299
2620	NC_021810	ATC	2	6	125368	125373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814299
2621	NC_021810	CCCA	2	8	125381	125388	25 %	0 %	0 %	75 %	525814299
2622	NC_021810	AGGC	2	8	125425	125432	25 %	0 %	50 %	25 %	525814299
2623	NC_021810	GGC	2	6	125441	125446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814299
2624	NC_021810	GCCAC	2	10	125499	125508	20 %	0 %	20 %	60 %	525814299
2625	NC_021810	GTA	2	6	125515	125520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814299
2626	NC_021810	CAG	2	6	125562	125567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814299
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2744	NC_021810	AT	3	6	131356	131361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2745	NC_021810	TAA	3	9	131381	131389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2746	NC_021810	AT	3	6	131432	131437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2747	NC_021810	AAT	2	6	131444	131449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2748	NC_021810	GGC	2	6	131464	131469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2749	NC_021810	ATGG	2	8	131580	131587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2750	NC_021810	TA	3	6	131635	131640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2751	NC_021810	AAG	2	6	131647	131652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2752	NC_021810	G	9	9	131711	131719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2753	NC_021810	A	6	6	131769	131774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2754	NC_021810	CTT	2	6	131945	131950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814304
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