MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021810	CGG	2	6	71193	71198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814253
1502	NC_021810	GCA	2	6	71207	71212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814253
1503	NC_021810	CACC	2	8	71216	71223	25 %	0 %	0 %	75 %	525814253
1504	NC_021810	GGCG	2	8	71234	71241	0 %	0 %	75 %	25 %	525814253
1505	NC_021810	GCCCA	2	10	71486	71495	20 %	0 %	20 %	60 %	525814254
1506	NC_021810	CGC	2	6	71508	71513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814254
1507	NC_021810	GCT	2	6	71608	71613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814254
1508	NC_021810	TAAA	2	8	71777	71784	75 %	25 %	0 %	0 %	525814254
1509	NC_021810	GCG	2	6	71795	71800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814254
1510	NC_021810	TGGTCA	2	12	71820	71831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525814254
1511	NC_021810	ATT	2	6	71844	71849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814255
1512	NC_021810	CGC	2	6	71884	71889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814255
1513	NC_021810	GGC	2	6	71914	71919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814255
1514	NC_021810	AC	3	6	71998	72003	50 %	0 %	0 %	50 %	525814255
1515	NC_021810	ATT	2	6	72040	72045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814255
1516	NC_021810	GT	3	6	72194	72199	0 %	50 %	50 %	0 %	525814255
1517	NC_021810	TAA	2	6	72244	72249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814255
1518	NC_021810	A	6	6	72324	72329	100 %	0 %	0 %	0 %	525814255
1519	NC_021810	CGACAT	2	12	72333	72344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525814255
1520	NC_021810	GC	3	6	72493	72498	0 %	0 %	50 %	50 %	525814255
1521	NC_021810	CTT	2	6	72567	72572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814255
1522	NC_021810	GCG	3	9	72595	72603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814255
1523	NC_021810	A	6	6	72620	72625	100 %	0 %	0 %	0 %	525814255
1524	NC_021810	TGG	2	6	72644	72649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814255
1525	NC_021810	TTC	2	6	72676	72681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814255
1526	NC_021810	GCT	2	6	72683	72688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814255
1527	NC_021810	GC	3	6	72706	72711	0 %	0 %	50 %	50 %	525814255
1528	NC_021810	GCA	2	6	72713	72718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814255
1529	NC_021810	AGG	2	6	72742	72747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814255
1530	NC_021810	GAAT	2	8	72782	72789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021810	AAC	2	6	72803	72808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_021810	T	7	7	72823	72829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021810	GGC	2	6	72884	72889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021810	TGT	2	6	72960	72965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021810	GTT	2	6	72966	72971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021810	CTGT	2	8	73043	73050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_021810	T	8	8	73088	73095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021810	CCA	2	6	73123	73128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814256
1539	NC_021810	CTG	2	6	73154	73159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814256
1540	NC_021810	TTG	2	6	73161	73166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814256
1541	NC_021810	CAT	2	6	73243	73248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814256
1542	NC_021810	TCT	3	9	73336	73344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814256
1543	NC_021810	ATT	2	6	73406	73411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021810	CCT	2	6	73420	73425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_021810	CG	3	6	73556	73561	0 %	0 %	50 %	50 %	525814257
1546	NC_021810	GCC	2	6	73604	73609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814257
1547	NC_021810	GCGCAG	2	12	73694	73705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525814257
1548	NC_021810	AGC	2	6	73741	73746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814257
1549	NC_021810	A	6	6	73770	73775	100 %	0 %	0 %	0 %	525814257
1550	NC_021810	CAC	2	6	73795	73800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814257
1551	NC_021810	TGG	2	6	73815	73820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814257
1552	NC_021810	TGG	2	6	73911	73916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814257
1553	NC_021810	CAA	2	6	73919	73924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814257
1554	NC_021810	GC	3	6	73929	73934	0 %	0 %	50 %	50 %	525814257
1555	NC_021810	GGC	2	6	74048	74053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814257
1556	NC_021810	CGG	2	6	74091	74096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814257
1557	NC_021810	GC	3	6	74118	74123	0 %	0 %	50 %	50 %	525814257
1558	NC_021810	CGG	2	6	74142	74147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814257
1559	NC_021810	CAG	2	6	74153	74158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814257
1560	NC_021810	CTT	2	6	74240	74245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814257
1561	NC_021810	CGG	3	9	74266	74274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814257
1562	NC_021810	GAT	2	6	74278	74283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814257
1563	NC_021810	CAC	2	6	74308	74313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814257
1564	NC_021810	GCGCT	2	10	74376	74385	0 %	20 %	40 %	40 %	525814257
1565	NC_021810	CGATAT	2	12	74398	74409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525814257
1566	NC_021810	TCGT	2	8	74482	74489	0 %	50 %	25 %	25 %	525814257
1567	NC_021810	CTG	2	6	74510	74515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814257
1568	NC_021810	CAC	2	6	74537	74542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814257
1569	NC_021810	GCT	2	6	74557	74562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814257
1570	NC_021810	CCGGG	2	10	74584	74593	0 %	0 %	60 %	40 %	525814257
1571	NC_021810	GC	3	6	74644	74649	0 %	0 %	50 %	50 %	525814257
1572	NC_021810	ATG	2	6	74676	74681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814257
1573	NC_021810	CG	3	6	74708	74713	0 %	0 %	50 %	50 %	525814257
1574	NC_021810	CTG	2	6	74720	74725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814257
1575	NC_021810	GGA	2	6	74823	74828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814258
1576	NC_021810	CTGG	2	8	74928	74935	0 %	25 %	50 %	25 %	525814258
1577	NC_021810	CTG	2	6	75004	75009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814258
1578	NC_021810	GGAA	2	8	75030	75037	50 %	0 %	50 %	0 %	525814258
1579	NC_021810	A	6	6	75036	75041	100 %	0 %	0 %	0 %	525814258
1580	NC_021810	CGC	2	6	75042	75047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814258
1581	NC_021810	TGA	2	6	75081	75086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814258
1582	NC_021810	AGCGA	2	10	75142	75151	40 %	0 %	40 %	20 %	525814258
1583	NC_021810	TTG	2	6	75152	75157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814258
1584	NC_021810	CGG	2	6	75216	75221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_021810	AAT	2	6	75239	75244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021810	TTA	2	6	75254	75259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021810	TAAA	2	8	75367	75374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021810	GTAGC	2	10	75385	75394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_021810	TAT	2	6	75499	75504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814259
1590	NC_021810	TAT	2	6	75522	75527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814259
1591	NC_021810	ATT	2	6	75590	75595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814259
1592	NC_021810	ATG	2	6	75637	75642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814259
1593	NC_021810	A	6	6	75654	75659	100 %	0 %	0 %	0 %	525814259
1594	NC_021810	T	6	6	75662	75667	0 %	100 %	0 %	0 %	525814259
1595	NC_021810	TGA	2	6	75691	75696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814259
1596	NC_021810	TTTA	2	8	75714	75721	25 %	75 %	0 %	0 %	525814259
1597	NC_021810	CAT	2	6	75732	75737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814259
1598	NC_021810	GTT	2	6	75824	75829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814259
1599	NC_021810	T	6	6	75844	75849	0 %	100 %	0 %	0 %	525814259
1600	NC_021810	GGCGCT	2	12	75899	75910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525814259
1601	NC_021810	ATG	2	6	75964	75969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814259
1602	NC_021810	TGA	2	6	75970	75975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814259
1603	NC_021810	CTTT	2	8	76069	76076	0 %	75 %	0 %	25 %	525814259
1604	NC_021810	TAT	2	6	76117	76122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814259
1605	NC_021810	AT	3	6	76172	76177	50 %	50 %	0 %	0 %	525814259
1606	NC_021810	ATTA	2	8	76227	76234	50 %	50 %	0 %	0 %	525814259
1607	NC_021810	CTGCT	2	10	76242	76251	0 %	40 %	20 %	40 %	525814259
1608	NC_021810	GTT	2	6	76271	76276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814259
1609	NC_021810	CTT	2	6	76352	76357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814259
1610	NC_021810	CGC	2	6	76428	76433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814260
1611	NC_021810	TCT	2	6	76445	76450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814260
1612	NC_021810	TCG	2	6	76496	76501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814260
1613	NC_021810	ATCC	2	8	76524	76531	25 %	25 %	0 %	50 %	525814260
1614	NC_021810	A	6	6	76607	76612	100 %	0 %	0 %	0 %	525814260
1615	NC_021810	TTC	2	6	76642	76647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814260
1616	NC_021810	TC	3	6	76671	76676	0 %	50 %	0 %	50 %	525814260
1617	NC_021810	GCC	2	6	76687	76692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814260
1618	NC_021810	GATC	2	8	76742	76749	25 %	25 %	25 %	25 %	525814260
1619	NC_021810	GCCC	2	8	76751	76758	0 %	0 %	25 %	75 %	525814260
1620	NC_021810	GCC	2	6	76761	76766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814260
1621	NC_021810	TGA	2	6	76895	76900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814260
1622	NC_021810	ATC	2	6	76902	76907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814260
1623	NC_021810	ACGCA	2	10	76989	76998	40 %	0 %	20 %	40 %	525814260
1624	NC_021810	ATCA	2	8	77040	77047	50 %	25 %	0 %	25 %	525814260
1625	NC_021810	GCC	2	6	77086	77091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814260
1626	NC_021810	CCG	2	6	77104	77109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814260
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1628	NC_021810	CG	3	6	77170	77175	0 %	0 %	50 %	50 %	525814260
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1759	NC_021810	CGG	3	9	83206	83214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814264
1760	NC_021810	A	6	6	83315	83320	100 %	0 %	0 %	0 %	525814264
1761	NC_021810	GC	3	6	83321	83326	0 %	0 %	50 %	50 %	525814264
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1764	NC_021810	CGC	2	6	83401	83406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814264
1765	NC_021810	CCG	2	6	83413	83418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814264
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1787	NC_021810	GCG	2	6	84399	84404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814265
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1869	NC_021810	GCTGA	2	10	88355	88364	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
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1878	NC_021810	TATC	2	8	88951	88958	25 %	50 %	0 %	25 %	525814266
1879	NC_021810	CGA	2	6	88999	89004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814266
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1882	NC_021810	ATCGG	2	10	89079	89088	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
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1885	NC_021810	GCA	2	6	89236	89241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814266
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1998	NC_021810	GCA	2	6	95251	95256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814271
1999	NC_021810	TGC	3	9	95298	95306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814271
2000	NC_021810	GCCA	2	8	95314	95321	25 %	0 %	25 %	50 %	525814271

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