MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021810	CAGC	2	8	528084	528091	25 %	0 %	25 %	50 %	525814698
11002	NC_021810	CTT	2	6	528102	528107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814698
11003	NC_021810	AGT	2	6	528121	528126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814698
11004	NC_021810	GGTAAT	2	12	528127	528138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814698
11005	NC_021810	GAT	2	6	528187	528192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814698
11006	NC_021810	CTG	3	9	528432	528440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814698
11007	NC_021810	CAG	2	6	528448	528453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814698
11008	NC_021810	TCT	2	6	528498	528503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814698
11009	NC_021810	ACT	2	6	528560	528565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814698
11010	NC_021810	GTA	2	6	528574	528579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814698
11011	NC_021810	TAC	2	6	528600	528605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_021810	GAA	2	6	528639	528644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814699
11013	NC_021810	T	6	6	528651	528656	0 %	100 %	0 %	0 %	525814699
11014	NC_021810	CTT	2	6	528740	528745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814699
11015	NC_021810	GCC	2	6	528756	528761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814699
11016	NC_021810	GGTT	2	8	528763	528770	0 %	50 %	50 %	0 %	525814699
11017	NC_021810	CAA	2	6	528818	528823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814699
11018	NC_021810	TCA	2	6	528901	528906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814699
11019	NC_021810	AG	3	6	528956	528961	50 %	0 %	50 %	0 %	525814700
11020	NC_021810	GCT	2	6	529029	529034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814700
11021	NC_021810	GCAT	2	8	529057	529064	25 %	25 %	25 %	25 %	525814700
11022	NC_021810	CGA	2	6	529097	529102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814700
11023	NC_021810	CTT	2	6	529108	529113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814700
11024	NC_021810	CAC	2	6	529120	529125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814700
11025	NC_021810	T	6	6	529147	529152	0 %	100 %	0 %	0 %	525814700
11026	NC_021810	CTT	2	6	529173	529178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814700
11027	NC_021810	ATG	2	6	529193	529198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814700
11028	NC_021810	ACT	3	9	529330	529338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_021810	A	7	7	529361	529367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_021810	A	6	6	529418	529423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_021810	GTT	2	6	529574	529579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814701
11032	NC_021810	TGA	2	6	529612	529617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814701
11033	NC_021810	CAA	3	9	529657	529665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814701
11034	NC_021810	TCAG	2	8	529742	529749	25 %	25 %	25 %	25 %	525814702
11035	NC_021810	ACG	2	6	529774	529779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814702
11036	NC_021810	GCA	2	6	529851	529856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814702
11037	NC_021810	GGT	2	6	529941	529946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814703
11038	NC_021810	GCT	2	6	529963	529968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814703
11039	NC_021810	TTACCT	2	12	530065	530076	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525814703
11040	NC_021810	ACG	2	6	530175	530180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814703
11041	NC_021810	TGC	2	6	530181	530186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814703
11042	NC_021810	GAC	2	6	530207	530212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814703
11043	NC_021810	GCT	3	9	530357	530365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814704
11044	NC_021810	AGC	2	6	530376	530381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814704
11045	NC_021810	GTT	2	6	530393	530398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814704
11046	NC_021810	CAG	2	6	530402	530407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814704
11047	NC_021810	ACC	2	6	530412	530417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814704
11048	NC_021810	GTG	2	6	530467	530472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814704
11049	NC_021810	CGC	2	6	530564	530569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814704
11050	NC_021810	ACG	2	6	530646	530651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814704
11051	NC_021810	T	6	6	530802	530807	0 %	100 %	0 %	0 %	525814704
11052	NC_021810	TTG	2	6	531270	531275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814705
11053	NC_021810	CAA	2	6	531331	531336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814705
11054	NC_021810	AGA	2	6	531353	531358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814705
11055	NC_021810	TCC	2	6	531396	531401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_021810	TCT	2	6	531411	531416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814706
11057	NC_021810	T	6	6	531421	531426	0 %	100 %	0 %	0 %	525814706
11058	NC_021810	CAG	2	6	531429	531434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814706
11059	NC_021810	GACC	2	8	531480	531487	25 %	0 %	25 %	50 %	525814706
11060	NC_021810	TCG	2	6	531491	531496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814706
11061	NC_021810	GAC	2	6	531519	531524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814706
11062	NC_021810	ACG	2	6	531574	531579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814706
11063	NC_021810	CTT	2	6	531598	531603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814706
11064	NC_021810	CTT	2	6	531631	531636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814706
11065	NC_021810	GA	3	6	531670	531675	50 %	0 %	50 %	0 %	525814706
11066	NC_021810	ATT	2	6	531700	531705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814707
11067	NC_021810	TTG	2	6	531741	531746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814707
11068	NC_021810	TCT	2	6	531754	531759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814707
11069	NC_021810	CAC	3	9	531817	531825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814707
11070	NC_021810	GGT	2	6	531832	531837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814707
11071	NC_021810	ACGCC	2	10	531876	531885	20 %	0 %	20 %	60 %	525814707
11072	NC_021810	GCA	2	6	531891	531896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814707
11073	NC_021810	GCA	2	6	531916	531921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814707
11074	NC_021810	ACGCAG	2	12	531992	532003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814707
11075	NC_021810	AACC	2	8	532108	532115	50 %	0 %	0 %	50 %	525814707
11076	NC_021810	GCA	2	6	532155	532160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814707
11077	NC_021810	CAA	2	6	532288	532293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814707
11078	NC_021810	TTG	2	6	532311	532316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814707
11079	NC_021810	CAA	2	6	532327	532332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814707
11080	NC_021810	ACC	3	9	532352	532360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814707
11081	NC_021810	GTG	2	6	532371	532376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814707
11082	NC_021810	TTG	2	6	532386	532391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814707
11083	NC_021810	ACC	2	6	532397	532402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814707
11084	NC_021810	T	7	7	532413	532419	0 %	100 %	0 %	0 %	525814707
11085	NC_021810	ACG	2	6	532473	532478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814707
11086	NC_021810	CGA	2	6	532482	532487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814707
11087	NC_021810	AAC	2	6	532511	532516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814707
11088	NC_021810	CTC	2	6	532530	532535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11089	NC_021810	GCC	2	6	532549	532554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814708
11090	NC_021810	CTT	2	6	532575	532580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814708
11091	NC_021810	T	6	6	532597	532602	0 %	100 %	0 %	0 %	525814708
11092	NC_021810	ACG	2	6	532612	532617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814708
11093	NC_021810	CGACTT	3	18	532671	532688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525814708
11094	NC_021810	CAG	2	6	532704	532709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814708
11095	NC_021810	T	6	6	532764	532769	0 %	100 %	0 %	0 %	525814708
11096	NC_021810	GTGCG	2	10	532798	532807	0 %	20 %	60 %	20 %	525814708
11097	NC_021810	GCA	2	6	532809	532814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814708
11098	NC_021810	CAG	2	6	532819	532824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814708
11099	NC_021810	TTC	2	6	532828	532833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814708
11100	NC_021810	CAG	2	6	532874	532879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814709
11101	NC_021810	TGA	2	6	532997	533002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814709
11102	NC_021810	CAG	2	6	533043	533048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814709
11103	NC_021810	GC	3	6	533132	533137	0 %	0 %	50 %	50 %	525814709
11104	NC_021810	TCT	2	6	533147	533152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814709
11105	NC_021810	AGC	2	6	533184	533189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814709
11106	NC_021810	T	6	6	533271	533276	0 %	100 %	0 %	0 %	525814709
11107	NC_021810	TCT	2	6	533303	533308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814709
11108	NC_021810	CAA	3	9	533345	533353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814709
11109	NC_021810	GC	3	6	533411	533416	0 %	0 %	50 %	50 %	525814709
11110	NC_021810	ACC	2	6	533509	533514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814710
11111	NC_021810	CAG	3	9	533521	533529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814710
11112	NC_021810	TAC	2	6	533551	533556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814710
11113	NC_021810	ACCTTT	2	12	533734	533745	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525814710
11114	NC_021810	T	6	6	533767	533772	0 %	100 %	0 %	0 %	525814710
11115	NC_021810	TTC	2	6	533818	533823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814710
11116	NC_021810	T	6	6	533917	533922	0 %	100 %	0 %	0 %	525814710
11117	NC_021810	GTA	2	6	533930	533935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814710
11118	NC_021810	T	6	6	534061	534066	0 %	100 %	0 %	0 %	525814710
11119	NC_021810	CG	3	6	534242	534247	0 %	0 %	50 %	50 %	525814711
11120	NC_021810	GA	3	6	534266	534271	50 %	0 %	50 %	0 %	525814711
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11127	NC_021810	CGT	2	6	534746	534751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11230	NC_021810	TCCA	2	8	539410	539417	25 %	25 %	0 %	50 %	525814717
11231	NC_021810	GTA	2	6	539491	539496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814717
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11233	NC_021810	TTG	2	6	539692	539697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814718
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11239	NC_021810	ACC	2	6	539892	539897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814718
11240	NC_021810	CGG	2	6	539902	539907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814718
11241	NC_021810	GC	3	6	539999	540004	0 %	0 %	50 %	50 %	525814718
11242	NC_021810	GATT	2	8	540012	540019	25 %	50 %	25 %	0 %	525814718
11243	NC_021810	T	6	6	540030	540035	0 %	100 %	0 %	0 %	525814718
11244	NC_021810	CAG	2	6	540069	540074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814718
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11247	NC_021810	AGTTT	2	10	540181	540190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11248	NC_021810	CTTA	2	8	540214	540221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11249	NC_021810	GCTT	2	8	540270	540277	0 %	50 %	25 %	25 %	525814719
11250	NC_021810	GC	3	6	540304	540309	0 %	0 %	50 %	50 %	525814719
11251	NC_021810	GGATCA	2	12	540361	540372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525814719
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11254	NC_021810	GTA	2	6	540489	540494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814719
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11256	NC_021810	TAA	2	6	540647	540652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11257	NC_021810	CA	3	6	540661	540666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11258	NC_021810	GAC	2	6	540796	540801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814720
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11264	NC_021810	GCA	2	6	541014	541019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814720
11265	NC_021810	CAT	2	6	541045	541050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814721
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11273	NC_021810	GC	3	6	541428	541433	0 %	0 %	50 %	50 %	525814722
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11292	NC_021810	ATT	2	6	542546	542551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11295	NC_021810	AT	3	6	542712	542717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11296	NC_021810	A	7	7	542729	542735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11328	NC_021810	GAT	2	6	544064	544069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11348	NC_021810	AC	3	6	544739	544744	50 %	0 %	0 %	50 %	525814726
11349	NC_021810	TCT	2	6	544747	544752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814726
11350	NC_021810	GTAC	2	8	544753	544760	25 %	25 %	25 %	25 %	525814726
11351	NC_021810	ACC	2	6	544777	544782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814726
11352	NC_021810	GAA	2	6	544821	544826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11353	NC_021810	A	7	7	544876	544882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11354	NC_021810	CTT	2	6	544929	544934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814727
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11357	NC_021810	CT	3	6	545191	545196	0 %	50 %	0 %	50 %	525814728
11358	NC_021810	GC	3	6	545198	545203	0 %	0 %	50 %	50 %	525814728
11359	NC_021810	CGA	2	6	545264	545269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814728
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11361	NC_021810	GC	3	6	545343	545348	0 %	0 %	50 %	50 %	525814728
11362	NC_021810	TAA	2	6	545389	545394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814728
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11478	NC_021810	GTG	2	6	550891	550896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814733
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11482	NC_021810	CGG	2	6	551040	551045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814733
11483	NC_021810	CTG	2	6	551062	551067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814733
11484	NC_021810	AAG	2	6	551072	551077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814733
11485	NC_021810	GGC	2	6	551097	551102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814733
11486	NC_021810	GGC	2	6	551223	551228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814733
11487	NC_021810	GAC	2	6	551293	551298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814733
11488	NC_021810	ACT	2	6	551339	551344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814733
11489	NC_021810	ATT	2	6	551398	551403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814733
11490	NC_021810	ATC	2	6	551429	551434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814733
11491	NC_021810	CTGA	2	8	551482	551489	25 %	25 %	25 %	25 %	525814733
11492	NC_021810	CGG	2	6	551514	551519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814733
11493	NC_021810	TCA	2	6	551590	551595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814733
11494	NC_021810	ATT	2	6	551834	551839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11495	NC_021810	GCG	2	6	551905	551910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814735
11496	NC_021810	ACC	4	12	551916	551927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814735
11497	NC_021810	CGC	2	6	551969	551974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814735
11498	NC_021810	CCCG	2	8	552007	552014	0 %	0 %	25 %	75 %	525814735
11499	NC_021810	GGC	2	6	552052	552057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814735
11500	NC_021810	ATG	2	6	552166	552171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814735

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