MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021810	GTC	2	6	22416	22421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814210
502	NC_021810	CGT	2	6	22425	22430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021810	GC	3	6	22491	22496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_021810	AAG	2	6	22629	22634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021810	TTA	2	6	22683	22688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021810	ATTG	2	8	22709	22716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021810	ATT	2	6	22720	22725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021810	A	6	6	22791	22796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021810	CGG	2	6	22816	22821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021810	T	7	7	22822	22828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021810	TCA	2	6	22842	22847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814211
512	NC_021810	CCA	2	6	22851	22856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814211
513	NC_021810	GCCT	2	8	22893	22900	0 %	25 %	25 %	50 %	525814211
514	NC_021810	GCC	2	6	22926	22931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814211
515	NC_021810	GCG	2	6	23021	23026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814211
516	NC_021810	ACT	2	6	23055	23060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814211
517	NC_021810	CCA	2	6	23091	23096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814211
518	NC_021810	CGT	2	6	23137	23142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814211
519	NC_021810	TTA	2	6	23213	23218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021810	GATT	2	8	23238	23245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021810	ACG	2	6	23259	23264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021810	GC	3	6	23289	23294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_021810	GCA	2	6	23307	23312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814212
524	NC_021810	CCG	2	6	23465	23470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814212
525	NC_021810	ATG	2	6	23555	23560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814212
526	NC_021810	GCC	2	6	23629	23634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814212
527	NC_021810	ACC	2	6	23660	23665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814212
528	NC_021810	CAT	2	6	23722	23727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814212
529	NC_021810	T	12	12	23761	23772	0 %	100 %	0 %	0 %	525814213
530	NC_021810	CG	3	6	23810	23815	0 %	0 %	50 %	50 %	525814213
531	NC_021810	GAT	2	6	23832	23837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814213
532	NC_021810	CGC	3	9	23864	23872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814213
533	NC_021810	CAC	2	6	23898	23903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814213
534	NC_021810	TTTAC	2	10	24139	24148	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
535	NC_021810	GATTAT	2	12	24178	24189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021810	TTG	2	6	24203	24208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021810	CTG	2	6	24325	24330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021810	AATT	2	8	24353	24360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021810	CGTT	2	8	24470	24477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_021810	ATCGA	2	10	24527	24536	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
541	NC_021810	AAT	2	6	24552	24557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021810	TCC	2	6	24674	24679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_021810	AC	3	6	24767	24772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_021810	T	8	8	24783	24790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021810	CCTGTT	2	12	24791	24802	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021810	T	6	6	24908	24913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021810	AGG	2	6	24956	24961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021810	TAC	2	6	24971	24976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021810	GTG	2	6	25015	25020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021810	AAAT	2	8	25026	25033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021810	GAG	2	6	25087	25092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021810	AC	3	6	25194	25199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_021810	ACT	2	6	25223	25228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021810	CAC	2	6	25238	25243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_021810	CAA	2	6	25262	25267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021810	ATT	2	6	25273	25278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021810	A	6	6	25309	25314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021810	T	6	6	25328	25333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021810	GCC	2	6	25532	25537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814214
560	NC_021810	CGCGT	2	10	25570	25579	0 %	20 %	40 %	40 %	525814214
561	NC_021810	CTT	2	6	25580	25585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814214
562	NC_021810	CG	3	6	25613	25618	0 %	0 %	50 %	50 %	525814214
563	NC_021810	ATC	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814214
564	NC_021810	GC	3	6	25702	25707	0 %	0 %	50 %	50 %	525814214
565	NC_021810	TCC	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814214
566	NC_021810	TGA	2	6	25892	25897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814214
567	NC_021810	GC	3	6	25905	25910	0 %	0 %	50 %	50 %	525814214
568	NC_021810	CAG	2	6	25938	25943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814214
569	NC_021810	GCA	2	6	25957	25962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814214
570	NC_021810	CT	3	6	25975	25980	0 %	50 %	0 %	50 %	525814214
571	NC_021810	ATT	2	6	26195	26200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021810	A	7	7	26253	26259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021810	CCG	2	6	26261	26266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_021810	CTT	2	6	26357	26362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814215
575	NC_021810	GA	3	6	26492	26497	50 %	0 %	50 %	0 %	525814215
576	NC_021810	CAG	2	6	26501	26506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814215
577	NC_021810	CTT	2	6	26612	26617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814215
578	NC_021810	GTC	2	6	26646	26651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814215
579	NC_021810	ACCA	2	8	26652	26659	50 %	0 %	0 %	50 %	525814215
580	NC_021810	TTC	2	6	26763	26768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814215
581	NC_021810	AAG	2	6	26770	26775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814215
582	NC_021810	TTC	2	6	26784	26789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814215
583	NC_021810	TTG	2	6	26803	26808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814215
584	NC_021810	GCCA	2	8	26814	26821	25 %	0 %	25 %	50 %	525814215
585	NC_021810	TGC	2	6	26853	26858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814215
586	NC_021810	GCC	2	6	26967	26972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814215
587	NC_021810	TGCCTT	2	12	26996	27007	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525814215
588	NC_021810	CTT	2	6	27056	27061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814215
589	NC_021810	GTT	2	6	27111	27116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814215
590	NC_021810	CGC	2	6	27128	27133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814215
591	NC_021810	TGA	2	6	27137	27142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814215
592	NC_021810	TCA	2	6	27146	27151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814215
593	NC_021810	GTTCA	2	10	27186	27195	20 %	40 %	20 %	20 %	525814215
594	NC_021810	GCA	3	9	27229	27237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814215
595	NC_021810	AG	3	6	27253	27258	50 %	0 %	50 %	0 %	525814215
596	NC_021810	GCC	3	9	27490	27498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814215
597	NC_021810	ACC	2	6	27510	27515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814215
598	NC_021810	GAT	2	6	27561	27566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814215
599	NC_021810	CCG	2	6	27665	27670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_021810	T	6	6	27678	27683	0 %	100 %	0 %	0 %	525814216
601	NC_021810	GGC	2	6	27712	27717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814216
602	NC_021810	AAC	2	6	27734	27739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814216
603	NC_021810	GAT	2	6	27801	27806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814216
604	NC_021810	ATC	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814216
605	NC_021810	GCT	2	6	27869	27874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814216
606	NC_021810	CAA	2	6	27886	27891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814216
607	NC_021810	TTG	2	6	27896	27901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814216
608	NC_021810	CAA	2	6	27927	27932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814216
609	NC_021810	TCG	2	6	27933	27938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814216
610	NC_021810	CTG	2	6	27985	27990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814216
611	NC_021810	GCC	2	6	28009	28014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
612	NC_021810	TCAA	2	8	28157	28164	50 %	25 %	0 %	25 %	525814216
613	NC_021810	GC	3	6	28222	28227	0 %	0 %	50 %	50 %	525814216
614	NC_021810	GCC	2	6	28264	28269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
615	NC_021810	CGC	2	6	28308	28313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
616	NC_021810	ACC	2	6	28372	28377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814216
617	NC_021810	AT	3	6	28424	28429	50 %	50 %	0 %	0 %	525814216
618	NC_021810	CTT	2	6	28470	28475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814216
619	NC_021810	ATC	2	6	28546	28551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814216
620	NC_021810	CG	3	6	28675	28680	0 %	0 %	50 %	50 %	525814216
621	NC_021810	CAG	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814216
622	NC_021810	GCC	2	6	28775	28780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
623	NC_021810	AGGTA	2	10	28781	28790	40 %	20 %	40 %	0 %	525814216
624	NC_021810	CCG	2	6	28892	28897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
625	NC_021810	CCA	2	6	28902	28907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814216
626	NC_021810	GTT	2	6	29053	29058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814216
627	NC_021810	GCG	2	6	29059	29064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814216
628	NC_021810	ATG	2	6	29204	29209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814216
629	NC_021810	GAGG	2	8	29245	29252	25 %	0 %	75 %	0 %	525814216
630	NC_021810	AG	3	6	29273	29278	50 %	0 %	50 %	0 %	525814216
631	NC_021810	CCG	2	6	29288	29293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
632	NC_021810	ATT	2	6	29410	29415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_021810	CA	3	6	29516	29521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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670	NC_021810	AT	3	6	30747	30752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NC_021810	ATA	2	6	30767	30772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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764	NC_021810	TCC	2	6	35980	35985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814222
765	NC_021810	GCC	2	6	36187	36192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814223
766	NC_021810	CTG	2	6	36424	36429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814223
767	NC_021810	TCG	2	6	36442	36447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814223
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771	NC_021810	TA	3	6	36659	36664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_021810	TTTA	2	8	36679	36686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_021810	AAT	2	6	36687	36692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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781	NC_021810	CAG	2	6	36971	36976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814224
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792	NC_021810	AT	3	6	37746	37751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
793	NC_021810	AAT	2	6	37792	37797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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802	NC_021810	A	6	6	38053	38058	100 %	0 %	0 %	0 %	525814225
803	NC_021810	ATT	2	6	38126	38131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
804	NC_021810	A	7	7	38155	38161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
805	NC_021810	ATT	2	6	38187	38192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
806	NC_021810	T	6	6	38219	38224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
807	NC_021810	CTA	2	6	38235	38240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
808	NC_021810	ATT	2	6	38313	38318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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813	NC_021810	CTT	2	6	38506	38511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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815	NC_021810	CTTA	2	8	38660	38667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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834	NC_021810	AATA	2	8	39641	39648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
835	NC_021810	T	7	7	39734	39740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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896	NC_021810	CTT	2	6	42671	42676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814229
897	NC_021810	TG	3	6	42778	42783	0 %	50 %	50 %	0 %	525814230
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