MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021810	CCG	2	6	268633	268638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814447
5502	NC_021810	T	6	6	268646	268651	0 %	100 %	0 %	0 %	525814447
5503	NC_021810	CTG	2	6	268667	268672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814447
5504	NC_021810	GTG	2	6	268811	268816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814447
5505	NC_021810	CGC	2	6	269018	269023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814448
5506	NC_021810	CGT	2	6	269041	269046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814448
5507	NC_021810	ATC	4	12	269049	269060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814448
5508	NC_021810	GCC	2	6	269163	269168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814448
5509	NC_021810	ATTTC	2	10	269197	269206	20 %	60 %	0 %	20 %	525814448
5510	NC_021810	AGC	2	6	269265	269270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814448
5511	NC_021810	CGC	2	6	269275	269280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814448
5512	NC_021810	AAT	2	6	269315	269320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814448
5513	NC_021810	GCC	2	6	269427	269432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814448
5514	NC_021810	TTGCAG	2	12	269480	269491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525814448
5515	NC_021810	ATG	2	6	269652	269657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814448
5516	NC_021810	ACA	2	6	269704	269709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814448
5517	NC_021810	CGCT	2	8	269727	269734	0 %	25 %	25 %	50 %	525814448
5518	NC_021810	ATT	2	6	269736	269741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814448
5519	NC_021810	ATT	2	6	269747	269752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814448
5520	NC_021810	T	6	6	269751	269756	0 %	100 %	0 %	0 %	525814448
5521	NC_021810	T	6	6	269816	269821	0 %	100 %	0 %	0 %	525814448
5522	NC_021810	GA	3	6	269914	269919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021810	ATG	2	6	269939	269944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021810	GCC	2	6	269960	269965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_021810	TCG	2	6	270054	270059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814449
5526	NC_021810	GGC	2	6	270107	270112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814449
5527	NC_021810	GAACC	2	10	270194	270203	40 %	0 %	20 %	40 %	525814449
5528	NC_021810	TGA	2	6	270219	270224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814449
5529	NC_021810	CGA	2	6	270244	270249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814449
5530	NC_021810	CTG	2	6	270263	270268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814449
5531	NC_021810	GGC	2	6	270275	270280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814449
5532	NC_021810	CGC	2	6	270310	270315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814449
5533	NC_021810	GCG	2	6	270317	270322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814449
5534	NC_021810	ACGG	2	8	270329	270336	25 %	0 %	50 %	25 %	525814449
5535	NC_021810	CGG	2	6	270364	270369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814449
5536	NC_021810	CTC	2	6	270490	270495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814449
5537	NC_021810	GCC	2	6	270547	270552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814449
5538	NC_021810	CGT	2	6	270571	270576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814449
5539	NC_021810	GAA	2	6	270674	270679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814449
5540	NC_021810	CTGC	2	8	270863	270870	0 %	25 %	25 %	50 %	525814449
5541	NC_021810	CGA	3	9	270952	270960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814449
5542	NC_021810	GCC	2	6	270971	270976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814449
5543	NC_021810	GCC	2	6	270980	270985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814449
5544	NC_021810	CCG	2	6	270988	270993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814449
5545	NC_021810	GCA	2	6	271047	271052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814449
5546	NC_021810	GCG	2	6	271151	271156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814449
5547	NC_021810	T	6	6	271165	271170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021810	CAT	2	6	271264	271269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814450
5549	NC_021810	AGCA	2	8	271339	271346	50 %	0 %	25 %	25 %	525814450
5550	NC_021810	ATCG	2	8	271392	271399	25 %	25 %	25 %	25 %	525814450
5551	NC_021810	GAA	2	6	271427	271432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814450
5552	NC_021810	AGC	2	6	271453	271458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814450
5553	NC_021810	CAC	2	6	271486	271491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814450
5554	NC_021810	A	6	6	271547	271552	100 %	0 %	0 %	0 %	525814450
5555	NC_021810	GCG	2	6	271842	271847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814450
5556	NC_021810	CGCC	2	8	271902	271909	0 %	0 %	25 %	75 %	525814450
5557	NC_021810	GTC	2	6	271946	271951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814450
5558	NC_021810	CGG	2	6	272086	272091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814450
5559	NC_021810	CGA	2	6	272120	272125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_021810	GTC	2	6	272127	272132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021810	T	6	6	272137	272142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021810	CA	4	8	272195	272202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_021810	ATT	2	6	272211	272216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021810	TAT	2	6	272244	272249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021810	TG	3	6	272283	272288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021810	A	8	8	272299	272306	100 %	0 %	0 %	0 %	525814451
5567	NC_021810	CGC	2	6	272351	272356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814451
5568	NC_021810	GC	3	6	272392	272397	0 %	0 %	50 %	50 %	525814451
5569	NC_021810	ATT	2	6	272415	272420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814451
5570	NC_021810	CGA	2	6	272428	272433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5571	NC_021810	TGC	2	6	272455	272460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5572	NC_021810	CGGT	2	8	272470	272477	0 %	25 %	50 %	25 %	525814451
5573	NC_021810	TGC	2	6	272510	272515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5574	NC_021810	GCG	2	6	272533	272538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814451
5575	NC_021810	GAGC	2	8	272555	272562	25 %	0 %	50 %	25 %	525814451
5576	NC_021810	TCG	3	9	272587	272595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5577	NC_021810	AACG	2	8	272674	272681	50 %	0 %	25 %	25 %	525814451
5578	NC_021810	CG	3	6	272747	272752	0 %	0 %	50 %	50 %	525814451
5579	NC_021810	GCG	3	9	272755	272763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814451
5580	NC_021810	GC	3	6	272790	272795	0 %	0 %	50 %	50 %	525814451
5581	NC_021810	GCA	2	6	272827	272832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5582	NC_021810	ACG	2	6	272872	272877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5583	NC_021810	CCG	2	6	272881	272886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814451
5584	NC_021810	CTG	2	6	272916	272921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5585	NC_021810	GGC	2	6	272933	272938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814451
5586	NC_021810	CGC	2	6	272978	272983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814451
5587	NC_021810	TGCCT	2	10	272989	272998	0 %	40 %	20 %	40 %	525814451
5588	NC_021810	GCT	2	6	273020	273025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5589	NC_021810	GC	3	6	273081	273086	0 %	0 %	50 %	50 %	525814451
5590	NC_021810	CG	3	6	273115	273120	0 %	0 %	50 %	50 %	525814451
5591	NC_021810	GCTC	2	8	273178	273185	0 %	25 %	25 %	50 %	525814451
5592	NC_021810	ACG	2	6	273198	273203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5593	NC_021810	TC	3	6	273218	273223	0 %	50 %	0 %	50 %	525814451
5594	NC_021810	TTA	2	6	273228	273233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814451
5595	NC_021810	GCG	2	6	273238	273243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814451
5596	NC_021810	GCT	2	6	273308	273313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5597	NC_021810	GAT	2	6	273314	273319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814451
5598	NC_021810	GAA	2	6	273332	273337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814451
5599	NC_021810	GCA	2	6	273385	273390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5600	NC_021810	ATC	2	6	273414	273419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814451
5601	NC_021810	CTG	3	9	273420	273428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5602	NC_021810	T	6	6	273458	273463	0 %	100 %	0 %	0 %	525814451
5603	NC_021810	CGC	2	6	273485	273490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814451
5604	NC_021810	CGG	2	6	273535	273540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814451
5605	NC_021810	CAG	2	6	273569	273574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814451
5606	NC_021810	CT	3	6	273584	273589	0 %	50 %	0 %	50 %	525814451
5607	NC_021810	CACG	2	8	273603	273610	25 %	0 %	25 %	50 %	525814451
5608	NC_021810	TGG	2	6	273654	273659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814451
5609	NC_021810	TAT	2	6	273671	273676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814451
5610	NC_021810	TGG	2	6	273720	273725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814451
5611	NC_021810	T	6	6	273868	273873	0 %	100 %	0 %	0 %	525814452
5612	NC_021810	A	6	6	273917	273922	100 %	0 %	0 %	0 %	525814452
5613	NC_021810	CCG	2	6	273950	273955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814452
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5616	NC_021810	GTC	2	6	274174	274179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814452
5617	NC_021810	TGA	3	9	274198	274206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814452
5618	NC_021810	GGC	2	6	274222	274227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814452
5619	NC_021810	AGCGC	2	10	274324	274333	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5620	NC_021810	TA	3	6	274356	274361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021810	CTT	2	6	274362	274367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_021810	AT	3	6	274378	274383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021810	TAC	2	6	274514	274519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814453
5624	NC_021810	AAC	2	6	274545	274550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814453
5625	NC_021810	TAT	2	6	274554	274559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814453
5626	NC_021810	AAT	3	9	274581	274589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814453
5627	NC_021810	CTC	2	6	274607	274612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_021810	CAT	2	6	274629	274634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_021810	AT	3	6	274653	274658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_021810	AATT	2	8	274659	274666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_021810	CAAT	2	8	274671	274678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5632	NC_021810	TAAA	2	8	274685	274692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_021810	AT	3	6	274737	274742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_021810	CTT	2	6	274825	274830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814454
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5636	NC_021810	GCA	2	6	275040	275045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814454
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5681	NC_021810	AT	3	6	277230	277235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5682	NC_021810	A	7	7	277236	277242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5685	NC_021810	ATTAA	2	10	277319	277328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5689	NC_021810	AC	3	6	277467	277472	50 %	0 %	0 %	50 %	525814455
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5747	NC_021810	CGG	2	6	279698	279703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814457
5748	NC_021810	CTGGCG	2	12	279750	279761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525814457
5749	NC_021810	CTG	2	6	279804	279809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814457
5750	NC_021810	GTA	2	6	279816	279821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814457
5751	NC_021810	GCT	2	6	279850	279855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814457
5752	NC_021810	AATGA	2	10	279906	279915	60 %	20 %	20 %	0 %	525814457
5753	NC_021810	AAAT	2	8	279932	279939	75 %	25 %	0 %	0 %	525814457
5754	NC_021810	TCG	2	6	279976	279981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814457
5755	NC_021810	TTCC	2	8	280029	280036	0 %	50 %	0 %	50 %	525814457
5756	NC_021810	ATT	2	6	280077	280082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814457
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5761	NC_021810	TCCT	2	8	280277	280284	0 %	50 %	0 %	50 %	525814457
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5765	NC_021810	TCG	2	6	280662	280667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814458
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5776	NC_021810	CTG	2	6	281288	281293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814458
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5784	NC_021810	GCT	2	6	281812	281817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814459
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5807	NC_021810	CGT	2	6	282738	282743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5832	NC_021810	CAG	2	6	284038	284043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814460
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5843	NC_021810	CCCG	2	8	284361	284368	0 %	0 %	25 %	75 %	525814460
5844	NC_021810	TCGG	2	8	284417	284424	0 %	25 %	50 %	25 %	525814460
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5850	NC_021810	CAG	2	6	284572	284577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814460
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5856	NC_021810	T	6	6	284884	284889	0 %	100 %	0 %	0 %	525814460
5857	NC_021810	GCG	2	6	284938	284943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814460
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5859	NC_021810	ATA	2	6	285125	285130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5860	NC_021810	AGAT	2	8	285193	285200	50 %	25 %	25 %	0 %	525814461
5861	NC_021810	CAG	2	6	285207	285212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814461
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5864	NC_021810	AATA	2	8	285307	285314	75 %	25 %	0 %	0 %	525814461
5865	NC_021810	CAC	2	6	285357	285362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814461
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5867	NC_021810	TGG	2	6	285424	285429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814461
5868	NC_021810	CGG	2	6	285462	285467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814461
5869	NC_021810	CGT	2	6	285468	285473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814461
5870	NC_021810	CTG	2	6	285508	285513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814461
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5872	NC_021810	CGC	2	6	285558	285563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814461
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5879	NC_021810	CCT	2	6	286052	286057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5881	NC_021810	GTC	2	6	286289	286294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814462
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5887	NC_021810	TTGCGT	2	12	286406	286417	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525814462
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5891	NC_021810	TAA	2	6	286547	286552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5892	NC_021810	AAC	2	6	286563	286568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5893	NC_021810	A	7	7	286579	286585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5894	NC_021810	T	7	7	286591	286597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5933	NC_021810	ATC	2	6	288291	288296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814464
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5935	NC_021810	CTG	2	6	288395	288400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5936	NC_021810	CGT	2	6	288433	288438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814464
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5938	NC_021810	CGTC	2	8	288580	288587	0 %	25 %	25 %	50 %	525814464
5939	NC_021810	CGC	2	6	288628	288633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814464
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5942	NC_021810	CAG	2	6	288743	288748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5949	NC_021810	A	7	7	289007	289013	100 %	0 %	0 %	0 %	525814465
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5952	NC_021810	A	6	6	289122	289127	100 %	0 %	0 %	0 %	525814465
5953	NC_021810	GGCGTA	2	12	289194	289205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525814465
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5958	NC_021810	TGA	2	6	289568	289573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814466
5959	NC_021810	TTA	2	6	289703	289708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5960	NC_021810	GATGC	2	10	289729	289738	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5968	NC_021810	TCT	2	6	290091	290096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814467
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5972	NC_021810	GC	3	6	290206	290211	0 %	0 %	50 %	50 %	525814467
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5976	NC_021810	CAC	2	6	290558	290563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814467
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5981	NC_021810	GTT	2	6	290617	290622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814467
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5984	NC_021810	CGA	2	6	290702	290707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814467
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5987	NC_021810	C	7	7	290888	290894	0 %	0 %	0 %	100 %	525814467
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5991	NC_021810	GAA	2	6	291197	291202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814467
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6000	NC_021810	ATTG	2	8	291738	291745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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