MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Serratia liquefaciens ATCC 27592 plasmid

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021742	CAATG	2	10	2147	2156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021742	TGGCG	2	10	4169	4178	0 %	20 %	60 %	20 %	525695033
3	NC_021742	TCACC	2	10	8620	8629	20 %	20 %	0 %	60 %	525695040
4	NC_021742	CCCAA	2	10	11488	11497	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_021742	CTGGT	2	10	12289	12298	0 %	40 %	40 %	20 %	525695044
6	NC_021742	ACCTG	2	10	12449	12458	20 %	20 %	20 %	40 %	525695044
7	NC_021742	GCCAG	2	10	14806	14815	20 %	0 %	40 %	40 %	525695046
8	NC_021742	AACCA	2	10	14951	14960	60 %	0 %	0 %	40 %	525695047
9	NC_021742	ACCAA	2	10	16221	16230	60 %	0 %	0 %	40 %	525695049
10	NC_021742	TGACC	2	10	17329	17338	20 %	20 %	20 %	40 %	525695050
11	NC_021742	GTGAT	4	20	17749	17768	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021742	GATAT	2	10	18788	18797	40 %	40 %	20 %	0 %	525695051
13	NC_021742	AGCCC	2	10	18991	19000	20 %	0 %	20 %	60 %	525695052
14	NC_021742	ACGGA	2	10	22794	22803	40 %	0 %	40 %	20 %	525695055
15	NC_021742	ACCAG	2	10	23430	23439	40 %	0 %	20 %	40 %	525695055
16	NC_021742	TTGCC	2	10	24109	24118	0 %	40 %	20 %	40 %	525695055
17	NC_021742	AGTAC	2	10	25027	25036	40 %	20 %	20 %	20 %	525695055
18	NC_021742	TTACC	2	10	26933	26942	20 %	40 %	0 %	40 %	525695056
19	NC_021742	GGAAT	2	10	27584	27593	40 %	20 %	40 %	0 %	525695056
20	NC_021742	TTGGC	2	10	28103	28112	0 %	40 %	40 %	20 %	525695056
21	NC_021742	ACGGA	2	10	28228	28237	40 %	0 %	40 %	20 %	525695056
22	NC_021742	ACCTG	2	10	31408	31417	20 %	20 %	20 %	40 %	525695035
23	NC_021742	GAACG	2	10	31670	31679	40 %	0 %	40 %	20 %	525695035
24	NC_021742	CTCAA	2	10	32381	32390	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_021742	GCCTT	2	10	33215	33224	0 %	40 %	20 %	40 %	525695060
26	NC_021742	CAAAC	2	10	33470	33479	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_021742	CAGAA	2	10	34928	34937	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021742	ATTGG	2	10	38438	38447	20 %	40 %	40 %	0 %	525695064
29	NC_021742	CAGCG	2	10	38927	38936	20 %	0 %	40 %	40 %	525695065
30	NC_021742	CCAGG	2	10	39319	39328	20 %	0 %	40 %	40 %	525695065
31	NC_021742	CCAGG	2	10	39346	39355	20 %	0 %	40 %	40 %	525695065
32	NC_021742	CCAAT	2	10	39906	39915	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021742	CTAGC	2	10	41797	41806	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021742	TCGGT	2	10	42503	42512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.