MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Serratia plymuthica 4Rx13 plasmid p75

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021594	CGGA	2	8	255	262	25 %	0 %	50 %	25 %	518658688
2	NC_021594	GGGT	2	8	1123	1130	0 %	25 %	75 %	0 %	518658689
3	NC_021594	GTTG	2	8	2210	2217	0 %	50 %	50 %	0 %	518658690
4	NC_021594	TGCT	2	8	2614	2621	0 %	50 %	25 %	25 %	518658690
5	NC_021594	TGGC	2	8	3092	3099	0 %	25 %	50 %	25 %	518658691
6	NC_021594	TCCT	2	8	3293	3300	0 %	50 %	0 %	50 %	518658691
7	NC_021594	AAAC	2	8	3572	3579	75 %	0 %	0 %	25 %	518658691
8	NC_021594	ACCA	2	8	3701	3708	50 %	0 %	0 %	50 %	518658691
9	NC_021594	GAGC	2	8	3896	3903	25 %	0 %	50 %	25 %	518658691
10	NC_021594	ATTT	2	8	4674	4681	25 %	75 %	0 %	0 %	518658692
11	NC_021594	GCTG	2	8	4887	4894	0 %	25 %	50 %	25 %	518658692
12	NC_021594	TCTT	2	8	5227	5234	0 %	75 %	0 %	25 %	518658692
13	NC_021594	AGTC	2	8	5341	5348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021594	ACCG	2	8	5768	5775	25 %	0 %	25 %	50 %	518658693
15	NC_021594	CGAT	2	8	6486	6493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021594	AAGG	2	8	6792	6799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021594	CCGG	2	8	6927	6934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021594	ATAC	2	8	7654	7661	50 %	25 %	0 %	25 %	518658695
19	NC_021594	TGCC	2	8	7920	7927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021594	CGGC	2	8	7936	7943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021594	CCCA	2	8	8303	8310	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_021594	TGGC	2	8	8988	8995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021594	ACCG	2	8	9161	9168	25 %	0 %	25 %	50 %	518658696
24	NC_021594	GGCT	2	8	9368	9375	0 %	25 %	50 %	25 %	518658696
25	NC_021594	TGGT	2	8	9910	9917	0 %	50 %	50 %	0 %	518658696
26	NC_021594	GTTG	2	8	10190	10197	0 %	50 %	50 %	0 %	518658696
27	NC_021594	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	518658696
28	NC_021594	GAAC	2	8	10706	10713	50 %	0 %	25 %	25 %	518658696
29	NC_021594	GCAG	2	8	11120	11127	25 %	0 %	50 %	25 %	518658696
30	NC_021594	ACAG	2	8	11142	11149	50 %	0 %	25 %	25 %	518658696
31	NC_021594	CATC	2	8	11908	11915	25 %	25 %	0 %	50 %	518658698
32	NC_021594	CAAA	2	8	12388	12395	75 %	0 %	0 %	25 %	518658698
33	NC_021594	TTGG	2	8	12536	12543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021594	AATA	2	8	12810	12817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021594	AAAG	2	8	13060	13067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021594	CTGG	2	8	13264	13271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021594	GGCC	2	8	13495	13502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021594	CGCC	2	8	13538	13545	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021594	AGGA	2	8	13909	13916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021594	GCGA	2	8	14061	14068	25 %	0 %	50 %	25 %	518658699
41	NC_021594	TTTA	2	8	14080	14087	25 %	75 %	0 %	0 %	518658699
42	NC_021594	TGAG	2	8	14174	14181	25 %	25 %	50 %	0 %	518658699
43	NC_021594	CTTC	2	8	15488	15495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021594	GCCG	2	8	15500	15507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021594	CTGC	2	8	15887	15894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021594	GCCT	2	8	16026	16033	0 %	25 %	25 %	50 %	518658701
47	NC_021594	TGCG	2	8	17085	17092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021594	AAAG	2	8	17255	17262	75 %	0 %	25 %	0 %	518658703
49	NC_021594	CGAA	2	8	17474	17481	50 %	0 %	25 %	25 %	518658703
50	NC_021594	TGGT	2	8	17499	17506	0 %	50 %	50 %	0 %	518658703
51	NC_021594	GAGC	2	8	17681	17688	25 %	0 %	50 %	25 %	518658703
52	NC_021594	TTTC	2	8	18243	18250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021594	GCCG	2	8	18377	18384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021594	CGAA	2	8	20520	20527	50 %	0 %	25 %	25 %	518658705
55	NC_021594	ATGT	2	8	20929	20936	25 %	50 %	25 %	0 %	518658705
56	NC_021594	AATG	2	8	21070	21077	50 %	25 %	25 %	0 %	518658705
57	NC_021594	CGGC	2	8	21691	21698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021594	ATTA	2	8	22160	22167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021594	CGTT	2	8	22301	22308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021594	CCGT	2	8	22924	22931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021594	CCAG	2	8	23469	23476	25 %	0 %	25 %	50 %	518658707
62	NC_021594	TGTT	2	8	23574	23581	0 %	75 %	25 %	0 %	518658707
63	NC_021594	CAAC	2	8	24152	24159	50 %	0 %	0 %	50 %	518658708
64	NC_021594	AACC	2	8	25925	25932	50 %	0 %	0 %	50 %	518658710
65	NC_021594	TTTC	2	8	26326	26333	0 %	75 %	0 %	25 %	518658710
66	NC_021594	ATCG	2	8	26667	26674	25 %	25 %	25 %	25 %	518658710
67	NC_021594	CTGT	2	8	27016	27023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021594	ATGG	2	8	27468	27475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021594	AATG	2	8	27509	27516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021594	CCGT	2	8	28142	28149	0 %	25 %	25 %	50 %	518658711
71	NC_021594	TCGT	2	8	28448	28455	0 %	50 %	25 %	25 %	518658712
72	NC_021594	TATC	2	8	29470	29477	25 %	50 %	0 %	25 %	518658712
73	NC_021594	GTCG	2	8	29892	29899	0 %	25 %	50 %	25 %	518658712
74	NC_021594	CCGT	2	8	31003	31010	0 %	25 %	25 %	50 %	518658713
75	NC_021594	GAAA	2	8	31019	31026	75 %	0 %	25 %	0 %	518658713
76	NC_021594	TCGC	2	8	31222	31229	0 %	25 %	25 %	50 %	518658713
77	NC_021594	GGCA	2	8	31552	31559	25 %	0 %	50 %	25 %	518658714
78	NC_021594	GTTT	2	8	32671	32678	0 %	75 %	25 %	0 %	518658715
79	NC_021594	AAAG	2	8	32704	32711	75 %	0 %	25 %	0 %	518658715
80	NC_021594	CCAT	2	8	32757	32764	25 %	25 %	0 %	50 %	518658715
81	NC_021594	CAGA	2	8	32949	32956	50 %	0 %	25 %	25 %	518658716
82	NC_021594	GAAG	2	8	33278	33285	50 %	0 %	50 %	0 %	518658716
83	NC_021594	ACAG	2	8	33814	33821	50 %	0 %	25 %	25 %	518658717
84	NC_021594	TGGC	2	8	34638	34645	0 %	25 %	50 %	25 %	518658717
85	NC_021594	GTGG	2	8	35091	35098	0 %	25 %	75 %	0 %	518658717
86	NC_021594	GAAT	2	8	36143	36150	50 %	25 %	25 %	0 %	518658718
87	NC_021594	AAAC	2	8	36190	36197	75 %	0 %	0 %	25 %	518658718
88	NC_021594	GGAA	2	8	36753	36760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021594	TGTT	2	8	37339	37346	0 %	75 %	25 %	0 %	518658719
90	NC_021594	CAGC	2	8	37406	37413	25 %	0 %	25 %	50 %	518658719
91	NC_021594	GATG	2	8	37643	37650	25 %	25 %	50 %	0 %	518658719
92	NC_021594	CAAT	2	8	37949	37956	50 %	25 %	0 %	25 %	518658720
93	NC_021594	GATG	2	8	38206	38213	25 %	25 %	50 %	0 %	518658720
94	NC_021594	TTAT	2	8	38289	38296	25 %	75 %	0 %	0 %	518658720
95	NC_021594	TATT	2	8	38301	38308	25 %	75 %	0 %	0 %	518658720
96	NC_021594	ATTT	2	8	38447	38454	25 %	75 %	0 %	0 %	518658721
97	NC_021594	CAAA	2	8	38747	38754	75 %	0 %	0 %	25 %	518658721
98	NC_021594	TTGC	2	8	39293	39300	0 %	50 %	25 %	25 %	518658721
99	NC_021594	AGTG	2	8	39509	39516	25 %	25 %	50 %	0 %	518658721
100	NC_021594	AGTT	2	8	39556	39563	25 %	50 %	25 %	0 %	518658721
101	NC_021594	GTTC	2	8	39932	39939	0 %	50 %	25 %	25 %	518658722
102	NC_021594	GATT	2	8	40361	40368	25 %	50 %	25 %	0 %	518658722
103	NC_021594	GCTG	2	8	41047	41054	0 %	25 %	50 %	25 %	518658722
104	NC_021594	AGCA	2	8	41408	41415	50 %	0 %	25 %	25 %	518658722
105	NC_021594	CAGT	2	8	42484	42491	25 %	25 %	25 %	25 %	518658722
106	NC_021594	AAAG	2	8	42562	42569	75 %	0 %	25 %	0 %	518658722
107	NC_021594	TTGG	2	8	43714	43721	0 %	50 %	50 %	0 %	518658724
108	NC_021594	AATA	2	8	44322	44329	75 %	25 %	0 %	0 %	518658724
109	NC_021594	CGGG	2	8	44383	44390	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021594	TCGC	2	8	45661	45668	0 %	25 %	25 %	50 %	518658725
111	NC_021594	AGGG	2	8	46775	46782	25 %	0 %	75 %	0 %	518658725
112	NC_021594	CACC	2	8	47261	47268	25 %	0 %	0 %	75 %	518658726
113	NC_021594	GAAA	2	8	47402	47409	75 %	0 %	25 %	0 %	518658726
114	NC_021594	GAAA	2	8	47513	47520	75 %	0 %	25 %	0 %	518658726
115	NC_021594	CGCA	2	8	49532	49539	25 %	0 %	25 %	50 %	518658726
116	NC_021594	ACCG	2	8	50895	50902	25 %	0 %	25 %	50 %	518658726
117	NC_021594	TCGG	2	8	51211	51218	0 %	25 %	50 %	25 %	518658726
118	NC_021594	CGGC	2	8	51337	51344	0 %	0 %	50 %	50 %	518658726
119	NC_021594	GACA	2	8	51457	51464	50 %	0 %	25 %	25 %	518658726
120	NC_021594	CACC	2	8	51655	51662	25 %	0 %	0 %	75 %	518658726
121	NC_021594	TAAA	2	8	52589	52596	75 %	25 %	0 %	0 %	518658727
122	NC_021594	GAAC	2	8	52714	52721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021594	CTTT	2	8	53215	53222	0 %	75 %	0 %	25 %	518658728
124	NC_021594	TTAG	2	8	54333	54340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021594	CTGG	2	8	55235	55242	0 %	25 %	50 %	25 %	518658729
126	NC_021594	ACAA	2	8	55484	55491	75 %	0 %	0 %	25 %	518658729
127	NC_021594	TTGA	2	8	55548	55555	25 %	50 %	25 %	0 %	518658729
128	NC_021594	ACCA	2	8	56418	56425	50 %	0 %	0 %	50 %	518658730
129	NC_021594	CAGC	2	8	56594	56601	25 %	0 %	25 %	50 %	518658730
130	NC_021594	GAAC	2	8	56734	56741	50 %	0 %	25 %	25 %	518658730
131	NC_021594	GCAT	2	8	56764	56771	25 %	25 %	25 %	25 %	518658730
132	NC_021594	TTTG	2	8	56847	56854	0 %	75 %	25 %	0 %	518658730
133	NC_021594	TCAA	2	8	56988	56995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021594	TGAT	2	8	57111	57118	25 %	50 %	25 %	0 %	518658731
135	NC_021594	ACTG	2	8	57345	57352	25 %	25 %	25 %	25 %	518658731
136	NC_021594	TTTG	2	8	58071	58078	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021594	ATTC	2	8	58256	58263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021594	TAAT	2	8	58311	58318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021594	TAAT	2	8	58399	58406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021594	CTGG	2	8	58696	58703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021594	AACG	2	8	58806	58813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021594	CAGA	2	8	58864	58871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021594	AGGT	2	8	58998	59005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021594	CTAT	2	8	59376	59383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021594	ACCG	2	8	59926	59933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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167	NC_021594	CATA	2	8	66620	66627	50 %	25 %	0 %	25 %	518658739
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183	NC_021594	TTAT	2	8	71674	71681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_021594	GGCT	2	8	72693	72700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_021594	CGGT	2	8	72828	72835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_021594	ATGT	2	8	72911	72918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_021594	CTGG	2	8	73224	73231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
191	NC_021594	AAAG	2	8	73967	73974	75 %	0 %	25 %	0 %	518658743
192	NC_021594	TGAC	2	8	74113	74120	25 %	25 %	25 %	25 %	518658743
193	NC_021594	CAGG	2	8	74476	74483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
194	NC_021594	GTCG	2	8	75623	75630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.