MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus CA-347 plasmid

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021552	TA	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021552	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021552	GA	3	6	2061	2066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021552	AC	3	6	2167	2172	50 %	0 %	0 %	50 %	514064936
5	NC_021552	TA	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	514064936
6	NC_021552	AT	3	6	2691	2696	50 %	50 %	0 %	0 %	514064937
7	NC_021552	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021552	AT	3	6	3210	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021552	AT	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021552	AT	3	6	3684	3689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021552	AG	3	6	4780	4785	50 %	0 %	50 %	0 %	514064938
12	NC_021552	TA	3	6	5046	5051	50 %	50 %	0 %	0 %	514064938
13	NC_021552	TG	3	6	5305	5310	0 %	50 %	50 %	0 %	514064939
14	NC_021552	TA	3	6	5374	5379	50 %	50 %	0 %	0 %	514064939
15	NC_021552	AG	3	6	5448	5453	50 %	0 %	50 %	0 %	514064939
16	NC_021552	TA	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021552	TC	3	6	5599	5604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021552	AG	3	6	5621	5626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021552	TA	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021552	AT	3	6	6038	6043	50 %	50 %	0 %	0 %	514064940
21	NC_021552	AT	3	6	6116	6121	50 %	50 %	0 %	0 %	514064940
22	NC_021552	AG	3	6	6984	6989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021552	TA	3	6	7488	7493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021552	AT	3	6	7657	7662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021552	TA	3	6	7781	7786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021552	AT	3	6	9426	9431	50 %	50 %	0 %	0 %	514064944
27	NC_021552	AT	3	6	9483	9488	50 %	50 %	0 %	0 %	514064944
28	NC_021552	AT	3	6	9728	9733	50 %	50 %	0 %	0 %	514064944
29	NC_021552	TA	3	6	10797	10802	50 %	50 %	0 %	0 %	514064945
30	NC_021552	AT	3	6	11104	11109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021552	TA	3	6	11268	11273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021552	TC	3	6	12258	12263	0 %	50 %	0 %	50 %	514064947
33	NC_021552	GT	3	6	12539	12544	0 %	50 %	50 %	0 %	514064947
34	NC_021552	AT	3	6	12727	12732	50 %	50 %	0 %	0 %	514064947
35	NC_021552	GT	3	6	13062	13067	0 %	50 %	50 %	0 %	514064947
36	NC_021552	TA	4	8	13874	13881	50 %	50 %	0 %	0 %	514064948
37	NC_021552	TA	4	8	14018	14025	50 %	50 %	0 %	0 %	514064948
38	NC_021552	TA	3	6	14065	14070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021552	AT	3	6	14970	14975	50 %	50 %	0 %	0 %	514064950
40	NC_021552	TC	3	6	14976	14981	0 %	50 %	0 %	50 %	514064950
41	NC_021552	AT	3	6	15899	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	514064951
42	NC_021552	CT	3	6	16201	16206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021552	TA	4	8	16381	16388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021552	AT	3	6	16800	16805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021552	AG	3	6	17194	17199	50 %	0 %	50 %	0 %	514064953
46	NC_021552	AT	3	6	17528	17533	50 %	50 %	0 %	0 %	514064953
47	NC_021552	AT	4	8	17801	17808	50 %	50 %	0 %	0 %	514064953
48	NC_021552	AT	3	6	17906	17911	50 %	50 %	0 %	0 %	514064953
49	NC_021552	AT	4	8	19302	19309	50 %	50 %	0 %	0 %	514064955
50	NC_021552	AT	3	6	21330	21335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021552	GA	3	6	21575	21580	50 %	0 %	50 %	0 %	514064959
52	NC_021552	TA	3	6	21587	21592	50 %	50 %	0 %	0 %	514064959
53	NC_021552	AG	3	6	22543	22548	50 %	0 %	50 %	0 %	514064960
54	NC_021552	AT	3	6	22582	22587	50 %	50 %	0 %	0 %	514064960
55	NC_021552	AG	4	8	22746	22753	50 %	0 %	50 %	0 %	514064960
56	NC_021552	AT	3	6	22968	22973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021552	CT	3	6	23179	23184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021552	GA	3	6	23202	23207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021552	TA	3	6	23275	23280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021552	TA	3	6	23666	23671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021552	AT	3	6	23868	23873	50 %	50 %	0 %	0 %	514064962
62	NC_021552	CT	3	6	24056	24061	0 %	50 %	0 %	50 %	514064962

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.