MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 1716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021485	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	512538240
2	NC_021485	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	512538240
3	NC_021485	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	512538240
4	NC_021485	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	512538241
5	NC_021485	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	512538241
6	NC_021485	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	512538242
7	NC_021485	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	512538242
8	NC_021485	TGGTA	2	10	4596	4605	20 %	40 %	40 %	0 %	512538245
9	NC_021485	TTTAT	2	10	5845	5854	20 %	80 %	0 %	0 %	512538246
10	NC_021485	TGGGT	2	10	10395	10404	0 %	40 %	60 %	0 %	512538249
11	NC_021485	ACTAT	2	10	12920	12929	40 %	40 %	0 %	20 %	512538252
12	NC_021485	GGATA	2	10	13149	13158	40 %	20 %	40 %	0 %	512538252
13	NC_021485	TCGTG	2	10	17476	17485	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021485	GTTAA	2	10	18231	18240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021485	GGGAG	2	10	18750	18759	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021485	AGGGA	2	10	20961	20970	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021485	TCGTG	2	10	23310	23319	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021485	GTTAA	2	10	24065	24074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021485	GGGAG	2	10	24584	24593	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021485	AGGGA	2	10	26795	26804	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021485	ATTTT	2	10	32778	32787	20 %	80 %	0 %	0 %	512538258
22	NC_021485	TCAAT	2	10	33206	33215	40 %	40 %	0 %	20 %	512538258
23	NC_021485	CTTTT	2	10	33825	33834	0 %	80 %	0 %	20 %	512538259
24	NC_021485	AACGG	2	10	34923	34932	40 %	0 %	40 %	20 %	512538260
25	NC_021485	TGGTG	2	10	35945	35954	0 %	40 %	60 %	0 %	512538262
26	NC_021485	AAACC	2	10	38333	38342	60 %	0 %	0 %	40 %	512538263
27	NC_021485	AGCGA	2	10	40349	40358	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021485	AGCAG	2	10	43265	43274	40 %	0 %	40 %	20 %	512538266
29	NC_021485	GGTCA	2	10	43629	43638	20 %	20 %	40 %	20 %	512538266
30	NC_021485	TTGGG	2	10	44630	44639	0 %	40 %	60 %	0 %	512538268
31	NC_021485	CTTTT	2	10	46164	46173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021485	AATGC	2	10	48577	48586	40 %	20 %	20 %	20 %	512538270
33	NC_021485	GAAAA	2	10	49841	49850	80 %	0 %	20 %	0 %	512538272
34	NC_021485	GTCAT	2	10	51471	51480	20 %	40 %	20 %	20 %	512538273
35	NC_021485	AATCA	2	10	52932	52941	60 %	20 %	0 %	20 %	512538275
36	NC_021485	AGTCT	2	10	53776	53785	20 %	40 %	20 %	20 %	512538276
37	NC_021485	GATGG	2	10	55414	55423	20 %	20 %	60 %	0 %	512538278
38	NC_021485	TCCTC	2	10	57542	57551	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_021485	GCAGG	2	10	58984	58993	20 %	0 %	60 %	20 %	512538281
40	NC_021485	CTCTA	2	10	59654	59663	20 %	40 %	0 %	40 %	512538282
41	NC_021485	CTGCC	2	10	59948	59957	0 %	20 %	20 %	60 %	512538283
42	NC_021485	CTTGA	2	10	60228	60237	20 %	40 %	20 %	20 %	512538283
43	NC_021485	CTCAG	2	10	60341	60350	20 %	20 %	20 %	40 %	512538283
44	NC_021485	GAATA	2	10	60982	60991	60 %	20 %	20 %	0 %	512538284
45	NC_021485	TAAAA	2	10	61525	61534	80 %	20 %	0 %	0 %	512538284
46	NC_021485	TATTT	2	10	61724	61733	20 %	80 %	0 %	0 %	512538284
47	NC_021485	TGATT	2	10	61855	61864	20 %	60 %	20 %	0 %	512538284
48	NC_021485	TATTT	2	10	61876	61885	20 %	80 %	0 %	0 %	512538284
49	NC_021485	TTTAT	2	10	62097	62106	20 %	80 %	0 %	0 %	512538284
50	NC_021485	TGATT	2	10	64301	64310	20 %	60 %	20 %	0 %	512538286
51	NC_021485	ATTTG	2	10	64861	64870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021485	TGAAA	2	10	65623	65632	60 %	20 %	20 %	0 %	512538287
53	NC_021485	TGTTT	2	10	66195	66204	0 %	80 %	20 %	0 %	512538288
54	NC_021485	TTTAC	2	10	67054	67063	20 %	60 %	0 %	20 %	512538290
55	NC_021485	TTTTA	2	10	68047	68056	20 %	80 %	0 %	0 %	512538290
56	NC_021485	CCAAC	2	10	69416	69425	40 %	0 %	0 %	60 %	512538291
57	NC_021485	GGTAT	2	10	69802	69811	20 %	40 %	40 %	0 %	512538291
58	NC_021485	AAATA	2	10	76473	76482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021485	GAAAA	2	10	79097	79106	80 %	0 %	20 %	0 %	512538300
60	NC_021485	TTTGG	2	10	79511	79520	0 %	60 %	40 %	0 %	512538301
61	NC_021485	TTCAC	2	10	79867	79876	20 %	40 %	0 %	40 %	512538302
62	NC_021485	GAAAT	2	10	80948	80957	60 %	20 %	20 %	0 %	512538304
63	NC_021485	AAGGA	2	10	82029	82038	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021485	ATTCA	2	10	82910	82919	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021485	TTCCA	2	10	86310	86319	20 %	40 %	0 %	40 %	512538316
66	NC_021485	TCCAA	2	10	86469	86478	40 %	20 %	0 %	40 %	512538316
67	NC_021485	GAATA	2	10	87040	87049	60 %	20 %	20 %	0 %	512538316
68	NC_021485	TCGTG	2	10	92091	92100	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021485	GTTAA	2	10	92848	92857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021485	GGGAG	2	10	93367	93376	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021485	AGGGA	2	10	95578	95587	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021485	TTTAA	2	10	98626	98635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021485	TAAAG	2	10	100622	100631	60 %	20 %	20 %	0 %	512538329
74	NC_021485	TATAA	2	10	101164	101173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021485	ATTTG	2	10	101573	101582	20 %	60 %	20 %	0 %	512538330
76	NC_021485	GTTTG	2	10	102907	102916	0 %	60 %	40 %	0 %	512538332
77	NC_021485	ATCAA	2	10	105340	105349	60 %	20 %	0 %	20 %	512538335
78	NC_021485	TATGG	2	10	105598	105607	20 %	40 %	40 %	0 %	512538335
79	NC_021485	CAACA	2	10	106293	106302	60 %	0 %	0 %	40 %	512538335
80	NC_021485	CATTA	2	10	109297	109306	40 %	40 %	0 %	20 %	512538337
81	NC_021485	TATTG	2	10	111394	111403	20 %	60 %	20 %	0 %	512538340
82	NC_021485	CTCTG	2	10	112376	112385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021485	AATAG	2	10	112995	113004	60 %	20 %	20 %	0 %	512538342
84	NC_021485	TAAAC	2	10	113361	113370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021485	ATTTA	2	10	115703	115712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021485	AAAAC	2	10	116285	116294	80 %	0 %	0 %	20 %	512538345
87	NC_021485	ATTTT	2	10	117357	117366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021485	CTTTT	2	10	117401	117410	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021485	AAAAT	2	10	118998	119007	80 %	20 %	0 %	0 %	512538347
90	NC_021485	CAAGT	2	10	119992	120001	40 %	20 %	20 %	20 %	512538348
91	NC_021485	ACTAT	2	10	121287	121296	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021485	TGCCA	2	10	122405	122414	20 %	20 %	20 %	40 %	512538350
93	NC_021485	TGGAT	2	10	123815	123824	20 %	40 %	40 %	0 %	512538351
94	NC_021485	TATAA	2	10	124295	124304	60 %	40 %	0 %	0 %	512538351
95	NC_021485	GTGAT	2	10	125611	125620	20 %	40 %	40 %	0 %	512538353
96	NC_021485	GCTTG	2	10	126817	126826	0 %	40 %	40 %	20 %	512538354
97	NC_021485	TTTGG	2	10	128493	128502	0 %	60 %	40 %	0 %	512538356
98	NC_021485	GAAAA	2	10	130545	130554	80 %	0 %	20 %	0 %	512538358
99	NC_021485	AGTCA	2	10	131106	131115	40 %	20 %	20 %	20 %	512538358
100	NC_021485	GGGTA	2	10	132690	132699	20 %	20 %	60 %	0 %	512538360
101	NC_021485	CTAAG	2	10	132715	132724	40 %	20 %	20 %	20 %	512538360
102	NC_021485	GAAAA	2	10	133939	133948	80 %	0 %	20 %	0 %	512538362
103	NC_021485	GATTT	2	10	134643	134652	20 %	60 %	20 %	0 %	512538362
104	NC_021485	AGTTA	2	10	134948	134957	40 %	40 %	20 %	0 %	512538362
105	NC_021485	TATGA	2	10	135249	135258	40 %	40 %	20 %	0 %	512538363
106	NC_021485	CTAGT	2	10	138731	138740	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021485	AAACC	2	10	138881	138890	60 %	0 %	0 %	40 %	512538366
108	NC_021485	ATAGA	2	10	139076	139085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021485	ATAAA	2	10	141147	141156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021485	GATTC	2	10	141978	141987	20 %	40 %	20 %	20 %	512538369
111	NC_021485	GTTAA	2	10	142729	142738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021485	TATAT	2	10	143105	143114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021485	ATTTT	2	10	143380	143389	20 %	80 %	0 %	0 %	512538372
114	NC_021485	TTGAT	2	10	145187	145196	20 %	60 %	20 %	0 %	512538373
115	NC_021485	TTTTG	2	10	145429	145438	0 %	80 %	20 %	0 %	512538373
116	NC_021485	AAGCA	2	10	145645	145654	60 %	0 %	20 %	20 %	512538373
117	NC_021485	ACTTT	2	10	148322	148331	20 %	60 %	0 %	20 %	512538375
118	NC_021485	GCTTT	2	10	150424	150433	0 %	60 %	20 %	20 %	512538377
119	NC_021485	AATAT	2	10	150698	150707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021485	ATTAC	2	10	151414	151423	40 %	40 %	0 %	20 %	512538378
121	NC_021485	AAATT	2	10	152227	152236	60 %	40 %	0 %	0 %	512538379
122	NC_021485	ATCCT	2	10	152629	152638	20 %	40 %	0 %	40 %	512538379
123	NC_021485	AGTTT	2	10	153775	153784	20 %	60 %	20 %	0 %	512538380
124	NC_021485	ATACC	2	10	155802	155811	40 %	20 %	0 %	40 %	512538382
125	NC_021485	AGGTT	2	10	157798	157807	20 %	40 %	40 %	0 %	512538384
126	NC_021485	ATTTT	2	10	158140	158149	20 %	80 %	0 %	0 %	512538384
127	NC_021485	AATAG	2	10	158659	158668	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021485	AAGAC	2	10	159164	159173	60 %	0 %	20 %	20 %	512538385
129	NC_021485	AAAAC	2	10	160243	160252	80 %	0 %	0 %	20 %	512538385
130	NC_021485	TGGGG	2	10	160274	160283	0 %	20 %	80 %	0 %	512538385
131	NC_021485	AATTA	2	10	160581	160590	60 %	40 %	0 %	0 %	512538385
132	NC_021485	ATGAT	2	10	160696	160705	40 %	40 %	20 %	0 %	512538386
133	NC_021485	CAATC	2	10	164443	164452	40 %	20 %	0 %	40 %	512538389
134	NC_021485	TCGTG	2	10	166120	166129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021485	GTTAA	2	10	166875	166884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021485	GGGAG	2	10	167394	167403	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021485	AGGGA	2	10	169605	169614	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021485	TGTTA	2	10	170139	170148	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021485	ATTGT	2	10	170330	170339	20 %	60 %	20 %	0 %	512538390
140	NC_021485	ATTAG	2	10	170443	170452	40 %	40 %	20 %	0 %	512538390
141	NC_021485	TTTTA	2	10	172699	172708	20 %	80 %	0 %	0 %	512538393
142	NC_021485	ATCTA	2	10	173837	173846	40 %	40 %	0 %	20 %	512538394
143	NC_021485	TTATT	2	10	174514	174523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021485	GATTG	2	10	178134	178143	20 %	40 %	40 %	0 %	512538396
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147	NC_021485	AGCAA	2	10	187100	187109	60 %	0 %	20 %	20 %	512538401
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153	NC_021485	ACTAT	2	10	193163	193172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_021485	TTTAT	2	10	194054	194063	20 %	80 %	0 %	0 %	512538412
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156	NC_021485	TATTT	2	10	197511	197520	20 %	80 %	0 %	0 %	512538417
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171	NC_021485	TAAAA	2	10	214033	214042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_021485	GTATT	2	10	226475	226484	20 %	60 %	20 %	0 %	512538445
179	NC_021485	TTCTA	2	10	227488	227497	20 %	60 %	0 %	20 %	512538447
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192	NC_021485	TAAAA	2	10	240861	240870	80 %	20 %	0 %	0 %	512538466
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197	NC_021485	ATTAT	2	10	245745	245754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021485	AAAGT	2	10	246563	246572	60 %	20 %	20 %	0 %	512538473
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209	NC_021485	TGATA	2	10	254575	254584	40 %	40 %	20 %	0 %	512538481
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213	NC_021485	GTTAA	2	10	262491	262500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_021485	ATAAA	2	10	299526	299535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021485	GAGCA	2	10	300063	300072	40 %	0 %	40 %	20 %	512538522
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250	NC_021485	GGTTT	2	10	301367	301376	0 %	60 %	40 %	0 %	512538523
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253	NC_021485	ATCAA	2	10	313465	313474	60 %	20 %	0 %	20 %	512538535
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255	NC_021485	GAAGG	2	10	315593	315602	40 %	0 %	60 %	0 %	512538536
256	NC_021485	TGACT	2	10	317392	317401	20 %	40 %	20 %	20 %	512538538
257	NC_021485	AGCAA	2	10	318817	318826	60 %	0 %	20 %	20 %	512538538
258	NC_021485	ACAAT	2	10	320456	320465	60 %	20 %	0 %	20 %	512538540
259	NC_021485	ATTTA	2	10	320664	320673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021485	AGAAA	2	10	323481	323490	80 %	0 %	20 %	0 %	512538543
261	NC_021485	GTAAA	2	10	323522	323531	60 %	20 %	20 %	0 %	512538543
262	NC_021485	CTAGA	2	10	324560	324569	40 %	20 %	20 %	20 %	512538544
263	NC_021485	ATCAT	2	10	324963	324972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_021485	ATATT	2	10	325077	325086	40 %	60 %	0 %	0 %	512538545
265	NC_021485	GCTTT	2	10	327888	327897	0 %	60 %	20 %	20 %	512538547
266	NC_021485	TATTT	2	10	328006	328015	20 %	80 %	0 %	0 %	512538547
267	NC_021485	GAGTT	2	10	329323	329332	20 %	40 %	40 %	0 %	512538549
268	NC_021485	TAGAT	2	10	333500	333509	40 %	40 %	20 %	0 %	512538554
269	NC_021485	GGATT	2	10	333894	333903	20 %	40 %	40 %	0 %	512538554
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271	NC_021485	TAAAG	2	10	334259	334268	60 %	20 %	20 %	0 %	512538554
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402	NC_021485	TAGAA	2	10	498913	498922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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