MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 46785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021314	TGG	2	6	22527	22532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021314	ACC	2	6	22537	22542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_021314	TGT	2	6	22615	22620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021314	TTC	2	6	22660	22665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021314	AAG	2	6	22755	22760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021314	TTTA	2	8	22767	22774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021314	TAG	2	6	22795	22800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021314	TTG	2	6	22806	22811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021314	TCAA	2	8	22860	22867	50 %	25 %	0 %	25 %	508126673
510	NC_021314	AAG	2	6	22890	22895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126673
511	NC_021314	A	6	6	22964	22969	100 %	0 %	0 %	0 %	508126673
512	NC_021314	AG	3	6	23045	23050	50 %	0 %	50 %	0 %	508126673
513	NC_021314	ATG	2	6	23058	23063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126673
514	NC_021314	AT	3	6	23107	23112	50 %	50 %	0 %	0 %	508126673
515	NC_021314	TC	3	6	23158	23163	0 %	50 %	0 %	50 %	508126673
516	NC_021314	A	7	7	23178	23184	100 %	0 %	0 %	0 %	508126673
517	NC_021314	T	6	6	23215	23220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021314	CAGTT	2	10	23272	23281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
519	NC_021314	ATT	2	6	23292	23297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021314	AGTT	2	8	23306	23313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021314	T	7	7	23383	23389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021314	TGTT	2	8	23427	23434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021314	AAG	2	6	23448	23453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021314	A	6	6	23456	23461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021314	GAT	2	6	23486	23491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021314	TAA	2	6	23504	23509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021314	AAG	2	6	23536	23541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021314	GAA	2	6	23545	23550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021314	A	7	7	23567	23573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021314	ATA	2	6	23606	23611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021314	A	7	7	23657	23663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021314	AAAC	2	8	23739	23746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_021314	GGC	2	6	23805	23810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_021314	ACCT	2	8	23896	23903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021314	CGA	2	6	24050	24055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021314	GCA	2	6	24124	24129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021314	CGC	2	6	24171	24176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_021314	GTGA	2	8	24177	24184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021314	TGT	2	6	24210	24215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021314	AGA	2	6	24219	24224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021314	TAAC	2	8	24260	24267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_021314	CAG	2	6	24293	24298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021314	AGCG	2	8	24348	24355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_021314	AT	3	6	24477	24482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021314	GGA	2	6	24483	24488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021314	CT	3	6	24508	24513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_021314	GAA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021314	GGT	2	6	24821	24826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021314	GTC	2	6	24835	24840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021314	TCGTG	2	10	24844	24853	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
551	NC_021314	CAT	2	6	24903	24908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021314	TAA	2	6	24938	24943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021314	GGA	2	6	24947	24952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021314	ATC	2	6	24971	24976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021314	AC	3	6	24998	25003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_021314	TGGT	2	8	25013	25020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021314	CGC	2	6	25137	25142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_021314	AC	3	6	25167	25172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_021314	CAC	2	6	25182	25187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_021314	AGCC	2	8	25230	25237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_021314	GAT	2	6	25253	25258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021314	CCT	2	6	25309	25314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021314	TAAGGA	2	12	25318	25329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021314	A	6	6	25368	25373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021314	ATA	2	6	25487	25492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021314	AGG	2	6	25575	25580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021314	A	7	7	25716	25722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021314	A	8	8	25741	25748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021314	AAG	2	6	25751	25756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021314	GTTAA	2	10	25777	25786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021314	GAA	2	6	25823	25828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021314	ACG	2	6	25840	25845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021314	GTAA	2	8	25863	25870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021314	GAAG	2	8	25945	25952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021314	TAG	2	6	26011	26016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021314	GCGA	2	8	26019	26026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
577	NC_021314	AGG	2	6	26033	26038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021314	GAG	2	6	26046	26051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021314	CTC	2	6	26056	26061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_021314	AGA	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021314	AG	3	6	26126	26131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021314	TCG	2	6	26201	26206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021314	GGA	2	6	26214	26219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021314	CT	3	6	26240	26245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_021314	GGGAG	2	10	26295	26304	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021314	ACA	2	6	26332	26337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021314	ATG	2	6	26399	26404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021314	TGT	2	6	26469	26474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021314	GGA	2	6	26532	26537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021314	TC	3	6	26618	26623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_021314	ACC	2	6	26797	26802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_021314	AAT	2	6	26817	26822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021314	AGC	2	6	26877	26882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021314	ATTC	2	8	26884	26891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_021314	GAA	2	6	27013	27018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021314	GAG	2	6	27029	27034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021314	GA	3	6	27159	27164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021314	TA	3	6	27213	27218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021314	CTAA	2	8	27240	27247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_021314	GAC	2	6	27252	27257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021314	GA	3	6	27454	27459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021314	CT	3	6	27571	27576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_021314	GAT	2	6	27589	27594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021314	CGG	2	6	27680	27685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021314	GA	3	6	27778	27783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021314	TAGG	2	8	27896	27903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021314	TAC	2	6	27950	27955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021314	CCT	2	6	28038	28043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_021314	TTGG	2	8	28079	28086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021314	AATC	2	8	28088	28095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_021314	GGT	2	6	28174	28179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021314	TCG	2	6	28289	28294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021314	CGT	2	6	28369	28374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021314	AGGGA	2	10	28507	28516	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021314	C	6	6	28545	28550	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
616	NC_021314	GA	3	6	28593	28598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021314	AAGTGT	2	12	28619	28630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021314	ACTAAT	2	12	28648	28659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
619	NC_021314	AGT	2	6	28796	28801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021314	AGT	2	6	28821	28826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021314	GCTTA	2	10	28858	28867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
622	NC_021314	AAAT	2	8	29103	29110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021314	TCA	2	6	29189	29194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021314	ACC	2	6	29398	29403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_021314	CGT	2	6	29435	29440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_021314	CTC	2	6	29613	29618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_021314	CGC	2	6	29779	29784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_021314	T	6	6	29790	29795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021314	GGA	2	6	29888	29893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021314	GCGT	2	8	29947	29954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
631	NC_021314	TCC	2	6	29971	29976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_021314	AGC	2	6	30000	30005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021314	TCG	2	6	30014	30019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021314	CGG	2	6	30131	30136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021314	TGT	2	6	30205	30210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021314	TAT	2	6	30238	30243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021314	GGT	2	6	30284	30289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021314	GGT	2	6	30319	30324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021314	ATT	3	9	30343	30351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021314	A	6	6	30466	30471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_021314	T	11	11	30481	30491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_021314	T	6	6	30493	30498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_021314	T	8	8	30539	30546	0 %	100 %	0 %	0 %	508126674
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777	NC_021314	ATT	2	6	35453	35458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126678
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779	NC_021314	GCT	2	6	35645	35650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126678
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797	NC_021314	TGA	2	6	36401	36406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126679
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803	NC_021314	TTG	2	6	36625	36630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126680
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