MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 46785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021314	AAT	2	6	230348	230353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126893
5002	NC_021314	ATT	2	6	230428	230433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126893
5003	NC_021314	TAC	2	6	230445	230450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126893
5004	NC_021314	TGA	2	6	230451	230456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126893
5005	NC_021314	ATT	2	6	230477	230482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126893
5006	NC_021314	AT	3	6	230499	230504	50 %	50 %	0 %	0 %	508126893
5007	NC_021314	A	6	6	230518	230523	100 %	0 %	0 %	0 %	508126893
5008	NC_021314	AAGA	2	8	230673	230680	75 %	0 %	25 %	0 %	508126893
5009	NC_021314	CA	3	6	230704	230709	50 %	0 %	0 %	50 %	508126893
5010	NC_021314	CATTA	2	10	230725	230734	40 %	40 %	0 %	20 %	508126893
5011	NC_021314	AGA	2	6	230761	230766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126893
5012	NC_021314	TTC	2	6	230793	230798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126893
5013	NC_021314	AT	3	6	230830	230835	50 %	50 %	0 %	0 %	508126893
5014	NC_021314	ATA	2	6	230925	230930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126893
5015	NC_021314	CAA	2	6	230965	230970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126893
5016	NC_021314	ATTT	2	8	230984	230991	25 %	75 %	0 %	0 %	508126893
5017	NC_021314	GTC	2	6	231011	231016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126893
5018	NC_021314	ATT	2	6	231026	231031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126893
5019	NC_021314	AAG	2	6	231054	231059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126893
5020	NC_021314	TGA	2	6	231118	231123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126893
5021	NC_021314	TGA	2	6	231136	231141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126893
5022	NC_021314	AGA	2	6	231183	231188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126893
5023	NC_021314	AAT	2	6	231245	231250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126893
5024	NC_021314	ATG	2	6	231276	231281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126893
5025	NC_021314	ATT	2	6	231308	231313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126893
5026	NC_021314	TAA	2	6	231343	231348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021314	CA	3	6	231394	231399	50 %	0 %	0 %	50 %	508126894
5028	NC_021314	TG	3	6	231440	231445	0 %	50 %	50 %	0 %	508126894
5029	NC_021314	ATG	2	6	231490	231495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021314	AGG	2	6	231560	231565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021314	A	7	7	231567	231573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021314	GGT	2	6	231592	231597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021314	CTT	2	6	231648	231653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_021314	AGA	2	6	231687	231692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021314	T	7	7	231796	231802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021314	T	6	6	231819	231824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021314	CT	3	6	231900	231905	0 %	50 %	0 %	50 %	508126895
5038	NC_021314	TAGG	2	8	232074	232081	25 %	25 %	50 %	0 %	508126895
5039	NC_021314	TGC	2	6	232108	232113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126895
5040	NC_021314	CAAT	2	8	232176	232183	50 %	25 %	0 %	25 %	508126895
5041	NC_021314	T	6	6	232206	232211	0 %	100 %	0 %	0 %	508126895
5042	NC_021314	GTAT	2	8	232235	232242	25 %	50 %	25 %	0 %	508126895
5043	NC_021314	CCA	2	6	232326	232331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508126895
5044	NC_021314	CGC	2	6	232336	232341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	508126895
5045	NC_021314	CA	3	6	232392	232397	50 %	0 %	0 %	50 %	508126895
5046	NC_021314	CAT	2	6	232401	232406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126895
5047	NC_021314	TAG	2	6	232560	232565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126895
5048	NC_021314	CT	3	6	232620	232625	0 %	50 %	0 %	50 %	508126895
5049	NC_021314	GCT	2	6	232640	232645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126895
5050	NC_021314	AAG	2	6	232730	232735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126895
5051	NC_021314	GGT	2	6	232744	232749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126895
5052	NC_021314	ATG	2	6	232760	232765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126895
5053	NC_021314	A	6	6	232793	232798	100 %	0 %	0 %	0 %	508126895
5054	NC_021314	AAGAC	2	10	232841	232850	60 %	0 %	20 %	20 %	508126895
5055	NC_021314	CCT	2	6	232866	232871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	508126895
5056	NC_021314	T	7	7	232890	232896	0 %	100 %	0 %	0 %	508126895
5057	NC_021314	TGG	2	6	232935	232940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126895
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5059	NC_021314	GAC	2	6	233003	233008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126895
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5061	NC_021314	TCAA	2	8	233172	233179	50 %	25 %	0 %	25 %	508126896
5062	NC_021314	TCT	2	6	233301	233306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126896
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5064	NC_021314	CATAA	2	10	233417	233426	60 %	20 %	0 %	20 %	508126896
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5068	NC_021314	CTT	2	6	233828	233833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126897
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5070	NC_021314	AAGAT	2	10	233926	233935	60 %	20 %	20 %	0 %	508126897
5071	NC_021314	GCAAAA	2	12	234034	234045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	508126897
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5075	NC_021314	CTG	2	6	234356	234361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126897
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5089	NC_021314	TCTCA	2	10	235080	235089	20 %	40 %	0 %	40 %	508126897
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5093	NC_021314	ATA	2	6	235311	235316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126897
5094	NC_021314	AAT	2	6	235437	235442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126897
5095	NC_021314	AAG	2	6	235476	235481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021314	A	7	7	235516	235522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021314	TAA	2	6	235526	235531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021314	TAG	2	6	235615	235620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126898
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5100	NC_021314	AAG	2	6	235680	235685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126898
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5102	NC_021314	TTGT	2	8	235776	235783	0 %	75 %	25 %	0 %	508126898
5103	NC_021314	GCT	2	6	235784	235789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126898
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5105	NC_021314	GT	3	6	235924	235929	0 %	50 %	50 %	0 %	508126898
5106	NC_021314	AAAG	2	8	235934	235941	75 %	0 %	25 %	0 %	508126898
5107	NC_021314	TG	3	6	235970	235975	0 %	50 %	50 %	0 %	508126898
5108	NC_021314	TCT	2	6	236030	236035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126898
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5110	NC_021314	GATAG	2	10	236137	236146	40 %	20 %	40 %	0 %	508126898
5111	NC_021314	GTC	2	6	236158	236163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126898
5112	NC_021314	GTT	2	6	236166	236171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126898
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5115	NC_021314	TTG	2	6	236296	236301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126898
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5120	NC_021314	TG	3	6	236483	236488	0 %	50 %	50 %	0 %	508126898
5121	NC_021314	TG	3	6	236522	236527	0 %	50 %	50 %	0 %	508126898
5122	NC_021314	TTG	2	6	236530	236535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126898
5123	NC_021314	GAG	2	6	236554	236559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508126898
5124	NC_021314	T	6	6	236622	236627	0 %	100 %	0 %	0 %	508126898
5125	NC_021314	AAG	2	6	236688	236693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126898
5126	NC_021314	GCC	2	6	236710	236715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	508126898
5127	NC_021314	CTGCAG	2	12	236757	236768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	508126898
5128	NC_021314	TGA	2	6	236776	236781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126898
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5132	NC_021314	T	6	6	236911	236916	0 %	100 %	0 %	0 %	508126898
5133	NC_021314	AAG	2	6	236954	236959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126898
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5140	NC_021314	AGT	2	6	237364	237369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126898
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5143	NC_021314	TAG	2	6	237453	237458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126898
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5146	NC_021314	GTC	2	6	237542	237547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5148	NC_021314	TCA	2	6	237620	237625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5151	NC_021314	T	6	6	237739	237744	0 %	100 %	0 %	0 %	508126899
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5155	NC_021314	AAT	2	6	237851	237856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126899
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5166	NC_021314	AAG	2	6	238352	238357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_021314	AAG	2	6	238371	238376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126900
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5192	NC_021314	CTTT	2	8	240073	240080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5193	NC_021314	T	7	7	240078	240084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5194	NC_021314	A	6	6	240172	240177	100 %	0 %	0 %	0 %	508126902
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5215	NC_021314	TG	3	6	241169	241174	0 %	50 %	50 %	0 %	508126902
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5223	NC_021314	ATA	2	6	241400	241405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126902
5224	NC_021314	ATA	2	6	241422	241427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_021314	GAA	2	6	241432	241437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_021314	AAAG	2	8	241546	241553	75 %	0 %	25 %	0 %	508126903
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5230	NC_021314	TTA	2	6	241632	241637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126903
5231	NC_021314	TAT	2	6	241645	241650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126903
5232	NC_021314	AG	3	6	241689	241694	50 %	0 %	50 %	0 %	508126903
5233	NC_021314	AAAG	2	8	241762	241769	75 %	0 %	25 %	0 %	508126903
5234	NC_021314	TGA	2	6	241784	241789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126903
5235	NC_021314	ATA	2	6	241892	241897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126903
5236	NC_021314	AGA	2	6	242034	242039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126903
5237	NC_021314	CAA	2	6	242047	242052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126903
5238	NC_021314	AG	3	6	242062	242067	50 %	0 %	50 %	0 %	508126903
5239	NC_021314	GAT	2	6	242094	242099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126903
5240	NC_021314	GAT	2	6	242170	242175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126903
5241	NC_021314	GAT	4	12	242200	242211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126903
5242	NC_021314	GTT	2	6	242229	242234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126903
5243	NC_021314	AGC	2	6	242325	242330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126903
5244	NC_021314	TTA	2	6	242354	242359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126903
5245	NC_021314	TAA	2	6	242412	242417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126903
5246	NC_021314	TCC	2	6	242506	242511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5247	NC_021314	TAA	2	6	242582	242587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021314	CAA	2	6	242594	242599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_021314	TGCT	2	8	242629	242636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5250	NC_021314	TCAA	2	8	242687	242694	50 %	25 %	0 %	25 %	508126904
5251	NC_021314	TTCTT	2	10	242699	242708	0 %	80 %	0 %	20 %	508126904
5252	NC_021314	CTG	2	6	242763	242768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126904
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5371	NC_021314	A	6	6	249900	249905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_021314	ACA	2	6	249926	249931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_021314	TCA	2	6	249943	249948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5374	NC_021314	T	6	6	249964	249969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5375	NC_021314	AAAT	2	8	249970	249977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5376	NC_021314	GAA	2	6	250029	250034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5484	NC_021314	GATG	2	8	255533	255540	25 %	25 %	50 %	0 %	508126914
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5494	NC_021314	AGA	2	6	255950	255955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126914
5495	NC_021314	TTGACA	2	12	256162	256173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508126914
5496	NC_021314	TCC	2	6	256202	256207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5497	NC_021314	AAT	2	6	256211	256216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_021314	A	6	6	256228	256233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_021314	AGAC	2	8	256265	256272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5500	NC_021314	TGG	2	6	256286	256291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126915

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