MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	ATTGAA	2	12	223	234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501675885
2	NC_021236	AAATTA	2	12	1742	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675886
3	NC_021236	AATAAA	2	12	3967	3978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021236	TGCTGG	2	12	4574	4585	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021236	ATAAAA	2	12	5925	5936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675889
6	NC_021236	CGTAAA	2	12	8061	8072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021236	AAATGA	2	12	9076	9087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501675890
8	NC_021236	TGATAT	2	12	10397	10408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501675891
9	NC_021236	TTTTTC	2	12	13332	13343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675893
10	NC_021236	TTATAT	2	12	15117	15128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021236	AAAATA	2	12	15582	15593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675894
12	NC_021236	TATTTT	2	12	16071	16082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021236	CTTTAT	2	12	17992	18003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501675895
14	NC_021236	TTGCTT	2	12	18455	18466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501675896
15	NC_021236	AAATTT	2	12	18584	18595	50 %	50 %	0 %	0 %	501675896
16	NC_021236	TTTTAT	2	12	18787	18798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675897
17	NC_021236	AAACAT	2	12	23383	23394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	501675902
18	NC_021236	TATTTT	2	12	24108	24119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675903
19	NC_021236	TAAATT	2	12	26075	26086	50 %	50 %	0 %	0 %	501675904
20	NC_021236	ATCTTT	2	12	27194	27205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501675905
21	NC_021236	TTTTCC	2	12	27244	27255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675905
22	NC_021236	AGATTC	2	12	27560	27571	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	501675905
23	NC_021236	TTTTCT	2	12	27882	27893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675905
24	NC_021236	CTAAAC	2	12	28802	28813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501675906
25	NC_021236	AAATAG	2	12	29902	29913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501675907
26	NC_021236	TTATTT	2	12	30138	30149	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675907
27	NC_021236	ATAATT	2	12	31413	31424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021236	AAACCA	2	12	32453	32464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675909
29	NC_021236	TGCTTC	2	12	33109	33120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	501675909
30	NC_021236	TGTTCT	2	12	33370	33381	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501675909
31	NC_021236	TAATTT	2	12	36027	36038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675913
32	NC_021236	TTATTT	2	12	36656	36667	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021236	GATTTG	2	12	38222	38233	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501675917
34	NC_021236	TTTACC	2	12	38292	38303	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501675917
35	NC_021236	TTTTAT	2	12	39031	39042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675917
36	NC_021236	TTGTTT	2	12	39990	40001	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	501675918
37	NC_021236	AAAAGA	2	12	42563	42574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501675921
38	NC_021236	TACATA	2	12	43645	43656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021236	CACAAA	2	12	44533	44544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675922
40	NC_021236	ACAAAA	2	12	46332	46343	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501675925
41	NC_021236	AAACAA	2	12	46652	46663	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021236	TTGAAT	2	12	48167	48178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501675927
43	NC_021236	AAAAGA	2	12	49368	49379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501675928
44	NC_021236	ATAAAA	2	12	50732	50743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675929
45	NC_021236	GGTAAA	2	12	51459	51470	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	501675929
46	NC_021236	CAAATC	2	12	51529	51540	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501675929
47	NC_021236	AGAATA	2	12	54886	54897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501675933
48	NC_021236	TTTCAA	2	12	55256	55267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	501675934
49	NC_021236	AATTTT	2	12	58761	58772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675939
50	NC_021236	ACCAAA	2	12	60144	60155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675944
51	NC_021236	CAATAT	2	12	60693	60704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	501675945
52	NC_021236	AAAACC	2	12	60914	60925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675947
53	NC_021236	AAAGAA	2	12	62581	62592	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501675948
54	NC_021236	AAACAA	2	12	62596	62607	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501675948
55	NC_021236	ATTTTT	2	12	64869	64880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021236	GTTGAA	2	12	70127	70138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675957
57	NC_021236	GATTCT	2	12	70223	70234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	501675957
58	NC_021236	AAATTA	2	12	73052	73063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675960
59	NC_021236	TTGCTT	2	12	75232	75243	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501675962
60	NC_021236	CCTTAA	2	12	76036	76047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675962
61	NC_021236	CCAAAA	2	12	76237	76248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021236	AAAAAC	2	12	76963	76974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021236	ATCTAA	2	12	78768	78779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	501675967
64	NC_021236	ATTTGG	2	12	79015	79026	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501675967
65	NC_021236	TCTTAT	2	12	79356	79367	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021236	TCTAAA	2	12	79877	79888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	501675968
67	NC_021236	TTTTAA	2	12	81469	81480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675971
68	NC_021236	AAAATA	2	12	82711	82722	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021236	CCAAAA	3	18	84828	84845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675976
70	NC_021236	TTCTTT	2	12	85257	85268	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675976
71	NC_021236	TTTTTA	2	12	87054	87065	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021236	ATAAAT	2	12	88717	88728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675978
73	NC_021236	TAAAAA	2	12	88806	88817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021236	AAAGTT	2	12	91349	91360	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021236	TGAAAT	2	12	93067	93078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501675984
76	NC_021236	TATGTA	2	12	95201	95212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021236	AATTAT	2	12	95894	95905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021236	GTTCTT	2	12	98340	98351	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021236	TTTCTT	2	12	100037	100048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675989
80	NC_021236	ATATTG	2	12	101926	101937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501675992
81	NC_021236	TTTGGT	2	12	102475	102486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675993
82	NC_021236	ATTCTT	2	12	107176	107187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676003
83	NC_021236	TAAAAA	2	12	110902	110913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021236	AAATTG	2	12	111061	111072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501676008
85	NC_021236	AGGAAA	2	12	112713	112724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021236	GTTTTT	2	12	117221	117232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021236	ATTTTG	2	12	121732	121743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	501676021
88	NC_021236	TATTTT	2	12	122536	122547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021236	TAATTT	2	12	124507	124518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676023
90	NC_021236	TTATTT	2	12	124994	125005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021236	ATTTTT	2	12	125261	125272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501676025
92	NC_021236	TCAATT	2	12	125948	125959	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	501676026
93	NC_021236	AAAAGA	2	12	129732	129743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676029
94	NC_021236	AAAGAA	2	12	133598	133609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676035
95	NC_021236	TGCTGG	2	12	135937	135948	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	501676039
96	NC_021236	ATAAAA	2	12	137305	137316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501676040
97	NC_021236	AATTTT	2	12	145434	145445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676052
98	NC_021236	AAAAGT	2	12	146229	146240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501676055
99	NC_021236	CCAAAT	2	12	147028	147039	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501676057
100	NC_021236	AAAGAA	2	12	150752	150763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676059
101	NC_021236	AAAAGA	2	12	152395	152406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676059
102	NC_021236	TAAAAA	2	12	152667	152678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021236	CAAAAA	2	12	154315	154326	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021236	AAAAGA	2	12	154347	154358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021236	AATCCA	2	12	155202	155213	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501676062
106	NC_021236	CAAAAA	2	12	156351	156362	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501676064
107	NC_021236	CTTTTT	2	12	158600	158611	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021236	TATGTA	2	12	158781	158792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021236	TTAAAA	2	12	159167	159178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676067
110	NC_021236	CTTTTT	2	12	160061	160072	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021236	GAAAAA	2	12	161290	161301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676068
112	NC_021236	CAAAGA	2	12	161597	161608	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	501676070
113	NC_021236	CAAAAT	2	12	165286	165297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	501676072
114	NC_021236	TAATTT	2	12	168181	168192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676073
115	NC_021236	AAAACA	2	12	168673	168684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021236	CTATTT	2	12	169686	169697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021236	ACCAGT	2	12	171047	171058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021236	TAATTT	2	12	172669	172680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676079
119	NC_021236	ATTTGG	2	12	175204	175215	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501676081
120	NC_021236	TTGAGT	2	12	177080	177091	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501676089
121	NC_021236	TGCCGT	2	12	178390	178401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501676092
122	NC_021236	TCTTTA	2	12	178867	178878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676093
123	NC_021236	ATTCTT	2	12	181403	181414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676096
124	NC_021236	ACCAGT	2	12	182784	182795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501676098
125	NC_021236	AAATAA	2	12	185019	185030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021236	CCTTTA	2	12	186166	186177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501676101
127	NC_021236	ATTATA	2	12	187201	187212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021236	TAATTT	2	12	187385	187396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021236	TTAAAA	2	12	188051	188062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676102
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244	NC_021236	AAATCA	2	12	354738	354749	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	501676293
245	NC_021236	AACATC	2	12	356545	356556	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501676294
246	NC_021236	TGGATT	2	12	357239	357250	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501676296
247	NC_021236	ATTAAA	2	12	358300	358311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676300
248	NC_021236	ATAAAA	2	12	360356	360367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501676303
249	NC_021236	GGTAAA	2	12	361083	361094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	501676304
250	NC_021236	CAAATC	2	12	361153	361164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501676304
251	NC_021236	ATTGAA	2	12	363219	363230	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501676305
252	NC_021236	CTTCTA	2	12	363346	363357	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501676305
253	NC_021236	AGATGA	2	12	364649	364660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	501676307
254	NC_021236	CATCGT	2	12	367782	367793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	501676310
255	NC_021236	AGCTAT	2	12	370719	370730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	501676314
256	NC_021236	CTAAAA	2	12	370772	370783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	501676314
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258	NC_021236	TAAGTA	2	12	371363	371374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021236	ATTTTT	2	12	371654	371665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021236	GATAAA	2	12	377115	377126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501676318
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264	NC_021236	GTGAGT	2	12	381210	381221	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	501676323
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301	NC_021236	AAAATA	2	12	428499	428510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_021236	TAAAAA	2	12	429647	429658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501676365
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349	NC_021236	AATCCA	2	12	518491	518502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501676465
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352	NC_021236	TATGTA	2	12	522327	522338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
353	NC_021236	CCATTT	2	12	524857	524868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501676472
354	NC_021236	TACATA	2	12	526802	526813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
355	NC_021236	TTTCTT	2	12	534021	534032	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501676481
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481	NC_021236	TTTTTC	2	12	685893	685904	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_021236	AAATTT	2	12	688684	688695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_021236	ATATTT	2	12	688712	688723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_021236	ATTTTT	2	12	691568	691579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501676673
485	NC_021236	GCAGTT	2	12	691768	691779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	501676674
486	NC_021236	TAATCT	2	12	693072	693083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	501676675
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