MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	AAAAG	2	10	208	217	80 %	0 %	20 %	0 %	501675885
2	NC_021236	AAATT	2	10	308	317	60 %	40 %	0 %	0 %	501675885
3	NC_021236	TCTAA	2	10	1898	1907	40 %	40 %	0 %	20 %	501675886
4	NC_021236	AATTT	2	10	2166	2175	40 %	60 %	0 %	0 %	501675886
5	NC_021236	TTGTT	2	10	2277	2286	0 %	80 %	20 %	0 %	501675886
6	NC_021236	AGTTC	2	10	2510	2519	20 %	40 %	20 %	20 %	501675886
7	NC_021236	TTTGA	2	10	4316	4325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021236	TAATA	2	10	4415	4424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021236	AATAT	2	10	4537	4546	60 %	40 %	0 %	0 %	501675888
10	NC_021236	AAATT	2	10	4668	4677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021236	TTTAG	2	10	4794	4803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021236	AAATA	2	10	6798	6807	80 %	20 %	0 %	0 %	501675889
13	NC_021236	ATTTT	2	10	7177	7186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021236	TTAAA	2	10	7503	7512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021236	TAATA	2	10	7614	7623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021236	TAAAT	2	10	7844	7853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021236	TTTTA	2	10	8181	8190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021236	AATTT	2	10	8192	8201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021236	TTAAA	2	10	9147	9156	60 %	40 %	0 %	0 %	501675890
20	NC_021236	GATTT	2	10	9284	9293	20 %	60 %	20 %	0 %	501675890
21	NC_021236	TAGCT	2	10	11545	11554	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021236	AAATT	2	10	11787	11796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021236	AAATT	3	15	12011	12025	60 %	40 %	0 %	0 %	501675892
24	NC_021236	AAATT	3	15	12239	12253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021236	CTATT	2	10	13045	13054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021236	TATAA	2	10	13126	13135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021236	TTTTA	2	10	14457	14466	20 %	80 %	0 %	0 %	501675893
28	NC_021236	GAATT	2	10	15222	15231	40 %	40 %	20 %	0 %	501675894
29	NC_021236	AAGAA	2	10	15878	15887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021236	AAAAT	2	10	15961	15970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021236	ATTTT	2	10	16113	16122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021236	ATAAA	2	10	16423	16432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021236	TAATA	2	10	16646	16655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021236	TAATA	2	10	16663	16672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021236	GGAAT	2	10	17101	17110	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021236	GAAAA	2	10	17359	17368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021236	TATAA	2	10	18596	18605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021236	TAAAT	2	10	18621	18630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021236	TTGTT	2	10	19243	19252	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021236	TAAAA	2	10	19307	19316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021236	TATTT	2	10	20119	20128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021236	TAAAA	2	10	20585	20594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021236	TAAGT	2	10	21101	21110	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021236	AATTG	2	10	21589	21598	40 %	40 %	20 %	0 %	501675901
45	NC_021236	TTCTT	2	10	22341	22350	0 %	80 %	0 %	20 %	501675901
46	NC_021236	TTAAA	2	10	23353	23362	60 %	40 %	0 %	0 %	501675902
47	NC_021236	CTTTT	2	10	23459	23468	0 %	80 %	0 %	20 %	501675902
48	NC_021236	AATTA	2	10	24659	24668	60 %	40 %	0 %	0 %	501675903
49	NC_021236	AAATA	2	10	24851	24860	80 %	20 %	0 %	0 %	501675903
50	NC_021236	TAAAA	2	10	25310	25319	80 %	20 %	0 %	0 %	501675903
51	NC_021236	CAAAA	2	10	26281	26290	80 %	0 %	0 %	20 %	501675904
52	NC_021236	ATAAA	2	10	27209	27218	80 %	20 %	0 %	0 %	501675905
53	NC_021236	AATCC	2	10	27313	27322	40 %	20 %	0 %	40 %	501675905
54	NC_021236	AAAAT	2	10	27927	27936	80 %	20 %	0 %	0 %	501675905
55	NC_021236	AAATA	2	10	28295	28304	80 %	20 %	0 %	0 %	501675905
56	NC_021236	CTTTT	2	10	29198	29207	0 %	80 %	0 %	20 %	501675906
57	NC_021236	TTCAT	2	10	29236	29245	20 %	60 %	0 %	20 %	501675906
58	NC_021236	AAAGG	2	10	30969	30978	60 %	0 %	40 %	0 %	501675908
59	NC_021236	GACTT	2	10	31259	31268	20 %	40 %	20 %	20 %	501675908
60	NC_021236	TATAT	2	10	31299	31308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021236	TATTT	2	10	31378	31387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021236	TTTAA	2	10	36004	36013	40 %	60 %	0 %	0 %	501675913
63	NC_021236	TTTTG	2	10	36717	36726	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021236	TGAAG	2	10	36730	36739	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021236	TATGA	2	10	36789	36798	40 %	40 %	20 %	0 %	501675916
66	NC_021236	TTTTG	2	10	37606	37615	0 %	80 %	20 %	0 %	501675917
67	NC_021236	CCAGT	2	10	37880	37889	20 %	20 %	20 %	40 %	501675917
68	NC_021236	TATTC	2	10	38475	38484	20 %	60 %	0 %	20 %	501675917
69	NC_021236	ATGTA	2	10	38622	38631	40 %	40 %	20 %	0 %	501675917
70	NC_021236	TTTAA	2	10	40135	40144	40 %	60 %	0 %	0 %	501675918
71	NC_021236	TTAAA	2	10	42135	42144	60 %	40 %	0 %	0 %	501675921
72	NC_021236	AATTA	2	10	43407	43416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021236	GAAAT	2	10	45610	45619	60 %	20 %	20 %	0 %	501675924
74	NC_021236	TAAAA	2	10	46245	46254	80 %	20 %	0 %	0 %	501675925
75	NC_021236	CAAAA	2	10	46498	46507	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021236	CAAAA	2	10	46827	46836	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021236	AAATT	2	10	46840	46849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021236	AAAAC	2	10	47085	47094	80 %	0 %	0 %	20 %	501675926
79	NC_021236	TAAAA	2	10	47222	47231	80 %	20 %	0 %	0 %	501675926
80	NC_021236	GAAAA	2	10	48664	48673	80 %	0 %	20 %	0 %	501675927
81	NC_021236	TTAAA	2	10	48940	48949	60 %	40 %	0 %	0 %	501675928
82	NC_021236	AAAAG	2	10	49092	49101	80 %	0 %	20 %	0 %	501675928
83	NC_021236	TTACA	2	10	51130	51139	40 %	40 %	0 %	20 %	501675929
84	NC_021236	GAATA	2	10	51278	51287	60 %	20 %	20 %	0 %	501675929
85	NC_021236	ACTGG	2	10	51873	51882	20 %	20 %	40 %	20 %	501675929
86	NC_021236	CAAAA	2	10	52147	52156	80 %	0 %	0 %	20 %	501675929
87	NC_021236	AAACC	2	10	54158	54167	60 %	0 %	0 %	40 %	501675933
88	NC_021236	TGGGA	2	10	54193	54202	20 %	20 %	60 %	0 %	501675933
89	NC_021236	TTTAG	2	10	54284	54293	20 %	60 %	20 %	0 %	501675933
90	NC_021236	TTAAT	2	10	55507	55516	40 %	60 %	0 %	0 %	501675934
91	NC_021236	AAATT	2	10	55634	55643	60 %	40 %	0 %	0 %	501675935
92	NC_021236	CAAAG	2	10	55843	55852	60 %	0 %	20 %	20 %	501675935
93	NC_021236	TTAAA	2	10	58157	58166	60 %	40 %	0 %	0 %	501675938
94	NC_021236	TAATT	2	10	58413	58422	40 %	60 %	0 %	0 %	501675939
95	NC_021236	AAACC	2	10	58900	58909	60 %	0 %	0 %	40 %	501675940
96	NC_021236	CCAAA	2	10	59820	59829	60 %	0 %	0 %	40 %	501675943
97	NC_021236	AAAAG	2	10	59839	59848	80 %	0 %	20 %	0 %	501675943
98	NC_021236	TAATT	2	10	60181	60190	40 %	60 %	0 %	0 %	501675944
99	NC_021236	AAATT	2	10	60707	60716	60 %	40 %	0 %	0 %	501675945
100	NC_021236	AACAA	2	10	60719	60728	80 %	0 %	0 %	20 %	501675945
101	NC_021236	ATTTT	2	10	60965	60974	20 %	80 %	0 %	0 %	501675947
102	NC_021236	CAAAA	2	10	62741	62750	80 %	0 %	0 %	20 %	501675948
103	NC_021236	AAATC	2	10	62835	62844	60 %	20 %	0 %	20 %	501675948
104	NC_021236	CAAAA	2	10	63287	63296	80 %	0 %	0 %	20 %	501675949
105	NC_021236	AAATT	2	10	63300	63309	60 %	40 %	0 %	0 %	501675949
106	NC_021236	ACCCA	2	10	63347	63356	40 %	0 %	0 %	60 %	501675949
107	NC_021236	AATCA	2	10	63571	63580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021236	TAATA	2	10	64213	64222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021236	TAATT	2	10	64816	64825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021236	TTTGT	2	10	64828	64837	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021236	AACAA	2	10	67815	67824	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021236	AATTT	2	10	68207	68216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021236	GGTTG	2	10	68881	68890	0 %	40 %	60 %	0 %	501675955
114	NC_021236	AATTA	2	10	70044	70053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021236	AATTA	2	10	71080	71089	60 %	40 %	0 %	0 %	501675957
116	NC_021236	AATTC	2	10	71913	71922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021236	TTGTC	2	10	73184	73193	0 %	60 %	20 %	20 %	501675961
118	NC_021236	AACAA	2	10	75109	75118	80 %	0 %	0 %	20 %	501675962
119	NC_021236	ATTAA	2	10	75186	75195	60 %	40 %	0 %	0 %	501675962
120	NC_021236	AAAAG	2	10	75320	75329	80 %	0 %	20 %	0 %	501675962
121	NC_021236	CAATA	2	10	76863	76872	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021236	TTAAA	2	10	76945	76954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021236	GTTTT	2	10	77997	78006	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021236	TTTTC	2	10	78599	78608	0 %	80 %	0 %	20 %	501675967
125	NC_021236	TTTTA	2	10	78660	78669	20 %	80 %	0 %	0 %	501675967
126	NC_021236	CCAAA	2	10	79960	79969	60 %	0 %	0 %	40 %	501675968
127	NC_021236	TTCTT	2	10	80044	80053	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021236	TTTTA	2	10	80459	80468	20 %	80 %	0 %	0 %	501675970
129	NC_021236	AAATT	2	10	80836	80845	60 %	40 %	0 %	0 %	501675970
130	NC_021236	AAATC	2	10	81143	81152	60 %	20 %	0 %	20 %	501675970
131	NC_021236	TTAAT	2	10	81300	81309	40 %	60 %	0 %	0 %	501675971
132	NC_021236	CCAAG	2	10	82925	82934	40 %	0 %	20 %	40 %	501675974
133	NC_021236	TTTTA	2	10	83081	83090	20 %	80 %	0 %	0 %	501675974
134	NC_021236	TATTT	2	10	85278	85287	20 %	80 %	0 %	0 %	501675976
135	NC_021236	ATTTA	2	10	86519	86528	40 %	60 %	0 %	0 %	501675976
136	NC_021236	CCAAC	2	10	88042	88051	40 %	0 %	0 %	60 %	501675978
137	NC_021236	CTTTA	2	10	88114	88123	20 %	60 %	0 %	20 %	501675978
138	NC_021236	TTTTA	2	10	88757	88766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021236	CAAAA	2	10	89536	89545	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021236	AAATT	2	10	89816	89825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021236	TCAAA	2	10	89933	89942	60 %	20 %	0 %	20 %	501675982
142	NC_021236	AAACA	2	10	90504	90513	80 %	0 %	0 %	20 %	501675982
143	NC_021236	ATTAA	2	10	91113	91122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021236	AGAAA	2	10	91267	91276	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_021236	TAATT	2	10	305016	305025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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