MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021236	T	6	6	115905	115910	0 %	100 %	0 %	0 %	501676016
4003	NC_021236	TAAT	2	8	115920	115927	50 %	50 %	0 %	0 %	501676016
4004	NC_021236	CTAT	2	8	115976	115983	25 %	50 %	0 %	25 %	501676016
4005	NC_021236	ATG	2	6	115988	115993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501676016
4006	NC_021236	TAA	2	6	116001	116006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676016
4007	NC_021236	T	6	6	116011	116016	0 %	100 %	0 %	0 %	501676016
4008	NC_021236	T	7	7	116040	116046	0 %	100 %	0 %	0 %	501676016
4009	NC_021236	T	6	6	116081	116086	0 %	100 %	0 %	0 %	501676016
4010	NC_021236	TGT	2	6	116093	116098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501676016
4011	NC_021236	TTG	2	6	116101	116106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501676016
4012	NC_021236	A	7	7	116129	116135	100 %	0 %	0 %	0 %	501676016
4013	NC_021236	TCT	2	6	116171	116176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501676016
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4015	NC_021236	CTT	2	6	116220	116225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501676016
4016	NC_021236	GAA	2	6	116249	116254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501676016
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4018	NC_021236	ATT	2	6	116332	116337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676016
4019	NC_021236	T	6	6	116389	116394	0 %	100 %	0 %	0 %	501676016
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4022	NC_021236	ATT	2	6	116513	116518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676016
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4034	NC_021236	ATTA	2	8	117035	117042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021236	ATT	2	6	117057	117062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021236	ATT	2	6	117065	117070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021236	ATTA	2	8	117081	117088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021236	TTTA	2	8	117132	117139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021236	T	7	7	117147	117153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4042	NC_021236	A	7	7	117214	117220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021236	GTTTTT	2	12	117221	117232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4046	NC_021236	TAATT	2	10	117279	117288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021236	ATT	2	6	117290	117295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4051	NC_021236	T	7	7	117388	117394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021236	AATT	2	8	117407	117414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021236	TAAA	2	8	117432	117439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021236	A	6	6	117437	117442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021236	TAAA	2	8	117446	117453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021236	AAC	2	6	117465	117470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_021236	A	7	7	117472	117478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021236	T	6	6	117484	117489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_021236	TA	3	6	117530	117535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021236	ATT	2	6	117542	117547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4066	NC_021236	A	7	7	117605	117611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021236	T	8	8	117624	117631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_021236	TA	3	6	117746	117751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021236	A	7	7	117769	117775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4100	NC_021236	ACT	2	6	118410	118415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501676018
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4102	NC_021236	ATA	2	6	118512	118517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676018
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4113	NC_021236	A	7	7	118894	118900	100 %	0 %	0 %	0 %	501676018
4114	NC_021236	AAT	2	6	118915	118920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676018
4115	NC_021236	TAA	2	6	118955	118960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676018
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4117	NC_021236	T	7	7	119024	119030	0 %	100 %	0 %	0 %	501676018
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4126	NC_021236	TTTC	2	8	119393	119400	0 %	75 %	0 %	25 %	501676018
4127	NC_021236	A	6	6	119428	119433	100 %	0 %	0 %	0 %	501676018
4128	NC_021236	A	6	6	119444	119449	100 %	0 %	0 %	0 %	501676018
4129	NC_021236	TAA	2	6	119457	119462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676018
4130	NC_021236	GCT	2	6	119503	119508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501676018
4131	NC_021236	T	6	6	119541	119546	0 %	100 %	0 %	0 %	501676018
4132	NC_021236	ATA	2	6	119617	119622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676018
4133	NC_021236	A	7	7	119680	119686	100 %	0 %	0 %	0 %	501676018
4134	NC_021236	A	7	7	119709	119715	100 %	0 %	0 %	0 %	501676018
4135	NC_021236	T	6	6	119738	119743	0 %	100 %	0 %	0 %	501676018
4136	NC_021236	AATT	2	8	119776	119783	50 %	50 %	0 %	0 %	501676018
4137	NC_021236	T	6	6	119800	119805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_021236	A	8	8	119822	119829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_021236	ATT	2	6	119863	119868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676019
4140	NC_021236	CT	3	6	119897	119902	0 %	50 %	0 %	50 %	501676019
4141	NC_021236	TAG	2	6	119961	119966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501676019
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4143	NC_021236	ATC	2	6	120040	120045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501676019
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4145	NC_021236	TCT	2	6	120147	120152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_021236	ACT	2	6	120202	120207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4147	NC_021236	ATAA	2	8	120227	120234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_021236	TTA	2	6	120235	120240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676020
4149	NC_021236	T	7	7	120244	120250	0 %	100 %	0 %	0 %	501676020
4150	NC_021236	AT	3	6	120252	120257	50 %	50 %	0 %	0 %	501676020
4151	NC_021236	ATT	2	6	120259	120264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676020
4152	NC_021236	CT	3	6	120272	120277	0 %	50 %	0 %	50 %	501676020
4153	NC_021236	T	6	6	120315	120320	0 %	100 %	0 %	0 %	501676020
4154	NC_021236	TTC	2	6	120340	120345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501676020
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4156	NC_021236	A	8	8	120379	120386	100 %	0 %	0 %	0 %	501676020
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4160	NC_021236	TAA	2	6	120433	120438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676020
4161	NC_021236	T	6	6	120447	120452	0 %	100 %	0 %	0 %	501676020
4162	NC_021236	AGC	2	6	120460	120465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501676020
4163	NC_021236	TAA	2	6	120477	120482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676020
4164	NC_021236	T	7	7	120485	120491	0 %	100 %	0 %	0 %	501676020
4165	NC_021236	AAC	2	6	120544	120549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501676020
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4168	NC_021236	A	7	7	120613	120619	100 %	0 %	0 %	0 %	501676020
4169	NC_021236	CTT	2	6	120687	120692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501676020
4170	NC_021236	CAT	2	6	120697	120702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501676020
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4172	NC_021236	AAT	2	6	120810	120815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676020
4173	NC_021236	A	6	6	120845	120850	100 %	0 %	0 %	0 %	501676020
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4175	NC_021236	A	6	6	120890	120895	100 %	0 %	0 %	0 %	501676020
4176	NC_021236	TAA	2	6	120948	120953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676020
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4178	NC_021236	T	6	6	120995	121000	0 %	100 %	0 %	0 %	501676020
4179	NC_021236	T	8	8	121026	121033	0 %	100 %	0 %	0 %	501676020
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4182	NC_021236	A	7	7	121138	121144	100 %	0 %	0 %	0 %	501676021
4183	NC_021236	TAT	2	6	121147	121152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676021
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4189	NC_021236	ATA	2	6	121268	121273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676021
4190	NC_021236	TAA	2	6	121305	121310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676021
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4200	NC_021236	AT	3	6	121626	121631	50 %	50 %	0 %	0 %	501676021
4201	NC_021236	GAT	2	6	121645	121650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501676021
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4204	NC_021236	ATTTTG	2	12	121732	121743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	501676021
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4207	NC_021236	TAATC	2	10	121839	121848	40 %	40 %	0 %	20 %	501676021
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4210	NC_021236	GCTA	2	8	121916	121923	25 %	25 %	25 %	25 %	501676021
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4220	NC_021236	A	6	6	122139	122144	100 %	0 %	0 %	0 %	501676021
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4227	NC_021236	TAAA	2	8	122294	122301	75 %	25 %	0 %	0 %	501676021
4228	NC_021236	TTG	2	6	122357	122362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501676021
4229	NC_021236	ATT	2	6	122406	122411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_021236	AT	3	6	122448	122453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_021236	A	6	6	122474	122479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_021236	TA	3	6	122506	122511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_021236	TATTTT	2	12	122536	122547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_021236	T	8	8	122544	122551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_021236	GTTAA	2	10	122552	122561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4236	NC_021236	CAA	2	6	122570	122575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4237	NC_021236	TTTA	2	8	122625	122632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_021236	T	8	8	122653	122660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_021236	TAT	2	6	122670	122675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_021236	CAAA	2	8	122714	122721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4241	NC_021236	ATT	2	6	122725	122730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_021236	T	7	7	122729	122735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_021236	T	7	7	122737	122743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_021236	AAT	2	6	122754	122759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_021236	ATA	2	6	122782	122787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_021236	T	8	8	122802	122809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_021236	TCT	2	6	122815	122820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_021236	TAAT	2	8	122835	122842	50 %	50 %	0 %	0 %	501676022
4249	NC_021236	CAT	2	6	122880	122885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501676022
4250	NC_021236	CAAAA	2	10	122905	122914	80 %	0 %	0 %	20 %	501676022
4251	NC_021236	AATG	2	8	123030	123037	50 %	25 %	25 %	0 %	501676022
4252	NC_021236	AAT	2	6	123049	123054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676022
4253	NC_021236	CTT	2	6	123060	123065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501676022
4254	NC_021236	TC	3	6	123131	123136	0 %	50 %	0 %	50 %	501676022
4255	NC_021236	GAA	2	6	123194	123199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501676022
4256	NC_021236	T	6	6	123261	123266	0 %	100 %	0 %	0 %	501676022
4257	NC_021236	TGC	2	6	123271	123276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501676022
4258	NC_021236	AAAG	2	8	123304	123311	75 %	0 %	25 %	0 %	501676022
4259	NC_021236	AAATA	2	10	123334	123343	80 %	20 %	0 %	0 %	501676022
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4262	NC_021236	ATTT	2	8	123417	123424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_021236	T	7	7	123422	123428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_021236	AT	3	6	123429	123434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_021236	TAT	2	6	123443	123448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4273	NC_021236	T	6	6	123628	123633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_021236	T	6	6	123635	123640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4276	NC_021236	T	7	7	123674	123680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4284	NC_021236	T	6	6	123835	123840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4331	NC_021236	TTATTT	2	12	124994	125005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4368	NC_021236	ATC	2	6	126126	126131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4370	NC_021236	T	6	6	126188	126193	0 %	100 %	0 %	0 %	501676027
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4387	NC_021236	TTG	2	6	126692	126697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501676027
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4477	NC_021236	AAAAGA	2	12	129732	129743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676029
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4486	NC_021236	TAA	2	6	130077	130082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_021236	TTC	2	6	130092	130097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4489	NC_021236	A	6	6	130254	130259	100 %	0 %	0 %	0 %	501676030
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4498	NC_021236	A	6	6	130720	130725	100 %	0 %	0 %	0 %	501676031
4499	NC_021236	TGG	2	6	130746	130751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501676031
4500	NC_021236	ACA	2	6	130795	130800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501676031

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