MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 5848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021213	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	499142349
2	NC_021213	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	499142349
3	NC_021213	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	499142349
4	NC_021213	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	499142349
5	NC_021213	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	499142349
6	NC_021213	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	499142350
7	NC_021213	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	499142350
8	NC_021213	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	499142350
9	NC_021213	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	499142350
10	NC_021213	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	499142351
11	NC_021213	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	499142351
12	NC_021213	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	499142351
13	NC_021213	GTAT	2	8	3645	3652	25 %	50 %	25 %	0 %	499142352
14	NC_021213	AAAT	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021213	CTTG	2	8	5245	5252	0 %	50 %	25 %	25 %	499142354
16	NC_021213	GTGC	2	8	5288	5295	0 %	25 %	50 %	25 %	499142354
17	NC_021213	TTGG	2	8	5624	5631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021213	ATCA	2	8	6275	6282	50 %	25 %	0 %	25 %	499142356
19	NC_021213	TCAA	2	8	6532	6539	50 %	25 %	0 %	25 %	499142356
20	NC_021213	CTTA	2	8	7005	7012	25 %	50 %	0 %	25 %	499142356
21	NC_021213	GATG	2	8	7588	7595	25 %	25 %	50 %	0 %	499142356
22	NC_021213	GCAA	2	8	8220	8227	50 %	0 %	25 %	25 %	499142356
23	NC_021213	TATT	2	8	8922	8929	25 %	75 %	0 %	0 %	499142356
24	NC_021213	TCAG	2	8	9160	9167	25 %	25 %	25 %	25 %	499142356
25	NC_021213	TTGA	2	8	9398	9405	25 %	50 %	25 %	0 %	499142356
26	NC_021213	TACT	2	8	9437	9444	25 %	50 %	0 %	25 %	499142356
27	NC_021213	AAGG	2	8	9718	9725	50 %	0 %	50 %	0 %	499142356
28	NC_021213	GAAG	2	8	9839	9846	50 %	0 %	50 %	0 %	499142357
29	NC_021213	TCTT	2	8	10169	10176	0 %	75 %	0 %	25 %	499142358
30	NC_021213	TGCC	2	8	10184	10191	0 %	25 %	25 %	50 %	499142358
31	NC_021213	TTTG	2	8	10568	10575	0 %	75 %	25 %	0 %	499142360
32	NC_021213	CTAT	2	8	10648	10655	25 %	50 %	0 %	25 %	499142360
33	NC_021213	AGTG	2	8	11511	11518	25 %	25 %	50 %	0 %	499142360
34	NC_021213	AGAT	2	8	11819	11826	50 %	25 %	25 %	0 %	499142361
35	NC_021213	GAAG	2	8	12134	12141	50 %	0 %	50 %	0 %	499142361
36	NC_021213	GATT	2	8	12202	12209	25 %	50 %	25 %	0 %	499142361
37	NC_021213	AGGC	2	8	12864	12871	25 %	0 %	50 %	25 %	499142361
38	NC_021213	TAAA	2	8	12898	12905	75 %	25 %	0 %	0 %	499142361
39	NC_021213	CTTG	2	8	14358	14365	0 %	50 %	25 %	25 %	499142363
40	NC_021213	TGTT	2	8	14432	14439	0 %	75 %	25 %	0 %	499142363
41	NC_021213	GTTC	2	8	14458	14465	0 %	50 %	25 %	25 %	499142363
42	NC_021213	GTCG	2	8	14527	14534	0 %	25 %	50 %	25 %	499142363
43	NC_021213	CAAC	2	8	14586	14593	50 %	0 %	0 %	50 %	499142363
44	NC_021213	ATGG	2	8	14605	14612	25 %	25 %	50 %	0 %	499142363
45	NC_021213	CAAC	2	8	14648	14655	50 %	0 %	0 %	50 %	499142363
46	NC_021213	TTGG	2	8	14713	14720	0 %	50 %	50 %	0 %	499142363
47	NC_021213	AAGA	2	8	14953	14960	75 %	0 %	25 %	0 %	499142363
48	NC_021213	TTAT	2	8	15769	15776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021213	ATTA	2	8	16352	16359	50 %	50 %	0 %	0 %	499142364
50	NC_021213	GTGA	2	8	17378	17385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021213	AGCG	2	8	17549	17556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021213	AGCC	2	8	18431	18438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021213	GTAA	2	8	18896	18903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021213	TCAC	2	8	18953	18960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021213	GCGA	2	8	19052	19059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021213	ATTC	2	8	19918	19925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021213	CTAA	2	8	20274	20281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021213	CTGA	2	8	20548	20555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021213	TAGG	2	8	20930	20937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021213	AATC	2	8	22076	22083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021213	GCGT	2	8	22987	22994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021213	TTTG	2	8	23516	23523	0 %	75 %	25 %	0 %	499142365
63	NC_021213	CAAA	2	8	24273	24280	75 %	0 %	0 %	25 %	499142365
64	NC_021213	GGTC	2	8	24371	24378	0 %	25 %	50 %	25 %	499142366
65	NC_021213	AACA	2	8	24780	24787	75 %	0 %	0 %	25 %	499142366
66	NC_021213	TCTA	2	8	24924	24931	25 %	50 %	0 %	25 %	499142367
67	NC_021213	AATC	2	8	25262	25269	50 %	25 %	0 %	25 %	499142367
68	NC_021213	TTTG	2	8	26175	26182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021213	ATTG	2	8	26691	26698	25 %	50 %	25 %	0 %	499142368
70	NC_021213	TTGA	2	8	26902	26909	25 %	50 %	25 %	0 %	499142368
71	NC_021213	TGAT	2	8	26915	26922	25 %	50 %	25 %	0 %	499142368
72	NC_021213	TTTG	2	8	27180	27187	0 %	75 %	25 %	0 %	499142368
73	NC_021213	ATTT	2	8	27242	27249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021213	TGCC	2	8	27652	27659	0 %	25 %	25 %	50 %	499142369
75	NC_021213	GAAA	2	8	28324	28331	75 %	0 %	25 %	0 %	499142369
76	NC_021213	GTCT	2	8	28652	28659	0 %	50 %	25 %	25 %	499142370
77	NC_021213	TGGG	2	8	29263	29270	0 %	25 %	75 %	0 %	499142371
78	NC_021213	TCAA	2	8	29302	29309	50 %	25 %	0 %	25 %	499142371
79	NC_021213	AAGA	2	8	29460	29467	75 %	0 %	25 %	0 %	499142371
80	NC_021213	CGTG	2	8	29729	29736	0 %	25 %	50 %	25 %	499142371
81	NC_021213	AACC	2	8	30031	30038	50 %	0 %	0 %	50 %	499142371
82	NC_021213	CTTG	2	8	30089	30096	0 %	50 %	25 %	25 %	499142371
83	NC_021213	AATT	2	8	30272	30279	50 %	50 %	0 %	0 %	499142372
84	NC_021213	AAGA	2	8	30715	30722	75 %	0 %	25 %	0 %	499142373
85	NC_021213	TGAA	2	8	30782	30789	50 %	25 %	25 %	0 %	499142373
86	NC_021213	TTCA	2	8	31909	31916	25 %	50 %	0 %	25 %	499142374
87	NC_021213	GAGC	2	8	32164	32171	25 %	0 %	50 %	25 %	499142374
88	NC_021213	CGTG	2	8	32532	32539	0 %	25 %	50 %	25 %	499142374
89	NC_021213	ACAG	2	8	32712	32719	50 %	0 %	25 %	25 %	499142374
90	NC_021213	GTCC	2	8	32983	32990	0 %	25 %	25 %	50 %	499142374
91	NC_021213	TTCC	2	8	33120	33127	0 %	50 %	0 %	50 %	499142374
92	NC_021213	GCAG	2	8	33570	33577	25 %	0 %	50 %	25 %	499142374
93	NC_021213	TACC	2	8	33787	33794	25 %	25 %	0 %	50 %	499142374
94	NC_021213	CTGG	2	8	34102	34109	0 %	25 %	50 %	25 %	499142374
95	NC_021213	GCAG	2	8	34119	34126	25 %	0 %	50 %	25 %	499142374
96	NC_021213	GGAA	2	8	34761	34768	50 %	0 %	50 %	0 %	499142374
97	NC_021213	GACG	2	8	34779	34786	25 %	0 %	50 %	25 %	499142374
98	NC_021213	AAGA	2	8	34990	34997	75 %	0 %	25 %	0 %	499142374
99	NC_021213	AAAT	2	8	35038	35045	75 %	25 %	0 %	0 %	499142374
100	NC_021213	TGGT	2	8	35911	35918	0 %	50 %	50 %	0 %	499142375
101	NC_021213	CAAC	2	8	36024	36031	50 %	0 %	0 %	50 %	499142375
102	NC_021213	ACCT	2	8	36321	36328	25 %	25 %	0 %	50 %	499142375
103	NC_021213	GATT	2	8	36959	36966	25 %	50 %	25 %	0 %	499142376
104	NC_021213	CTGG	2	8	37018	37025	0 %	25 %	50 %	25 %	499142376
105	NC_021213	CAGT	2	8	37472	37479	25 %	25 %	25 %	25 %	499142376
106	NC_021213	AAGA	2	8	37549	37556	75 %	0 %	25 %	0 %	499142376
107	NC_021213	AGGC	2	8	38170	38177	25 %	0 %	50 %	25 %	499142378
108	NC_021213	TTGG	2	8	38209	38216	0 %	50 %	50 %	0 %	499142378
109	NC_021213	TTGA	2	8	38415	38422	25 %	50 %	25 %	0 %	499142378
110	NC_021213	CAAG	2	8	38708	38715	50 %	0 %	25 %	25 %	499142378
111	NC_021213	GCAG	2	8	38981	38988	25 %	0 %	50 %	25 %	499142378
112	NC_021213	GCTA	2	8	39149	39156	25 %	25 %	25 %	25 %	499142378
113	NC_021213	AACC	2	8	39443	39450	50 %	0 %	0 %	50 %	499142378
114	NC_021213	CGTC	2	8	39457	39464	0 %	25 %	25 %	50 %	499142378
115	NC_021213	GGAG	2	8	39497	39504	25 %	0 %	75 %	0 %	499142378
116	NC_021213	AATA	2	8	39966	39973	75 %	25 %	0 %	0 %	499142379
117	NC_021213	GTCA	2	8	40184	40191	25 %	25 %	25 %	25 %	499142379
118	NC_021213	TTAT	2	8	40249	40256	25 %	75 %	0 %	0 %	499142379
119	NC_021213	GTTT	2	8	40314	40321	0 %	75 %	25 %	0 %	499142379
120	NC_021213	TGAT	2	8	40496	40503	25 %	50 %	25 %	0 %	499142379
121	NC_021213	CAAA	2	8	41087	41094	75 %	0 %	0 %	25 %	499142380
122	NC_021213	GGCG	2	8	41333	41340	0 %	0 %	75 %	25 %	499142380
123	NC_021213	GACC	2	8	41591	41598	25 %	0 %	25 %	50 %	499142380
124	NC_021213	AAAG	2	8	42153	42160	75 %	0 %	25 %	0 %	499142381
125	NC_021213	CCTG	2	8	42294	42301	0 %	25 %	25 %	50 %	499142381
126	NC_021213	TGCC	2	8	43176	43183	0 %	25 %	25 %	50 %	499142382
127	NC_021213	TGAA	2	8	43302	43309	50 %	25 %	25 %	0 %	499142382
128	NC_021213	AAAT	2	8	43829	43836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021213	AGGT	2	8	44013	44020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021213	TCAA	2	8	44281	44288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021213	TTAT	2	8	44735	44742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021213	TAAG	2	8	44845	44852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021213	TTGG	2	8	44939	44946	0 %	50 %	50 %	0 %	499142384
134	NC_021213	CAGC	2	8	45932	45939	25 %	0 %	25 %	50 %	499142384
135	NC_021213	ATTG	2	8	45953	45960	25 %	50 %	25 %	0 %	499142384
136	NC_021213	GATT	2	8	46922	46929	25 %	50 %	25 %	0 %	499142385
137	NC_021213	TTCT	2	8	47673	47680	0 %	75 %	0 %	25 %	499142385
138	NC_021213	AATA	2	8	47841	47848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021213	CTCC	2	8	47867	47874	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_021213	TAAG	2	8	48115	48122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021213	GTTT	2	8	48276	48283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021213	TTGC	2	8	48713	48720	0 %	50 %	25 %	25 %	499142386
143	NC_021213	ACAG	2	8	49099	49106	50 %	0 %	25 %	25 %	499142386
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