MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_021213	CAT	2	6	2026081	2026086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144274
41003	NC_021213	CCG	2	6	2026147	2026152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144274
41004	NC_021213	CAG	2	6	2026171	2026176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144274
41005	NC_021213	TAG	2	6	2026183	2026188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144274
41006	NC_021213	GCTTGT	2	12	2026194	2026205	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	499144274
41007	NC_021213	CAG	2	6	2026294	2026299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144274
41008	NC_021213	GCA	2	6	2026365	2026370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144274
41009	NC_021213	TCA	2	6	2026371	2026376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144274
41010	NC_021213	CCG	2	6	2026435	2026440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144274
41011	NC_021213	CAG	2	6	2026459	2026464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144274
41012	NC_021213	TGCTTG	2	12	2026481	2026492	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	499144274
41013	NC_021213	CAGTCT	2	12	2026534	2026545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	499144274
41014	NC_021213	TTC	2	6	2026572	2026577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144274
41015	NC_021213	CTT	2	6	2026585	2026590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144274
41016	NC_021213	CAT	2	6	2026657	2026662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144274
41017	NC_021213	ACA	2	6	2026743	2026748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144274
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41021	NC_021213	CAG	3	9	2026816	2026824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144274
41022	NC_021213	TGC	2	6	2026835	2026840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144274
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41039	NC_021213	AAC	2	6	2027580	2027585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41040	NC_021213	GAA	2	6	2027588	2027593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41050	NC_021213	TTA	3	9	2027974	2027982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41051	NC_021213	TAA	2	6	2028020	2028025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41052	NC_021213	T	7	7	2028108	2028114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41053	NC_021213	ATC	3	9	2028116	2028124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41055	NC_021213	TCT	2	6	2028276	2028281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144276
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41085	NC_021213	CA	3	6	2029227	2029232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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41093	NC_021213	CT	3	6	2029757	2029762	0 %	50 %	0 %	50 %	499144278
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41113	NC_021213	ATA	2	6	2030687	2030692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144278
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41118	NC_021213	CT	3	6	2030908	2030913	0 %	50 %	0 %	50 %	499144279
41119	NC_021213	CTT	2	6	2030952	2030957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144279
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41131	NC_021213	GCC	2	6	2031399	2031404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41132	NC_021213	CAA	2	6	2031408	2031413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41133	NC_021213	AGG	2	6	2031449	2031454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41137	NC_021213	AAT	2	6	2031488	2031493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41138	NC_021213	AGTC	2	8	2031633	2031640	25 %	25 %	25 %	25 %	499144280
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41200	NC_021213	TAAAA	2	10	2034371	2034380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41202	NC_021213	ACCT	2	8	2034467	2034474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41203	NC_021213	T	6	6	2034485	2034490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41204	NC_021213	TAAT	2	8	2034505	2034512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41206	NC_021213	TTC	2	6	2034549	2034554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41210	NC_021213	TAGT	2	8	2034824	2034831	25 %	50 %	25 %	0 %	499144284
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41222	NC_021213	T	7	7	2035289	2035295	0 %	100 %	0 %	0 %	499144285
41223	NC_021213	ACC	2	6	2035320	2035325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144285
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41228	NC_021213	T	6	6	2035520	2035525	0 %	100 %	0 %	0 %	499144285
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41230	NC_021213	CTT	2	6	2035592	2035597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144285
41231	NC_021213	TTTC	2	8	2035607	2035614	0 %	75 %	0 %	25 %	499144285
41232	NC_021213	ATTTT	2	10	2035634	2035643	20 %	80 %	0 %	0 %	499144285
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41234	NC_021213	GATT	2	8	2035753	2035760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41235	NC_021213	AAGA	2	8	2035784	2035791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41236	NC_021213	A	6	6	2035841	2035846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41237	NC_021213	T	6	6	2035880	2035885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.