MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021213	CAG	2	6	48456	48461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142386
1002	NC_021213	CTA	2	6	48479	48484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142386
1003	NC_021213	TTC	2	6	48554	48559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142386
1004	NC_021213	TGT	2	6	48585	48590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142386
1005	NC_021213	AAG	2	6	48621	48626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142386
1006	NC_021213	TTGC	2	8	48713	48720	0 %	50 %	25 %	25 %	499142386
1007	NC_021213	TGA	2	6	48757	48762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142386
1008	NC_021213	ACG	2	6	48836	48841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142386
1009	NC_021213	TCT	2	6	48843	48848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142386
1010	NC_021213	A	6	6	48968	48973	100 %	0 %	0 %	0 %	499142386
1011	NC_021213	TGT	2	6	49011	49016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142386
1012	NC_021213	ACAG	2	8	49099	49106	50 %	0 %	25 %	25 %	499142386
1013	NC_021213	CA	3	6	49154	49159	50 %	0 %	0 %	50 %	499142387
1014	NC_021213	ATAA	2	8	49170	49177	75 %	25 %	0 %	0 %	499142387
1015	NC_021213	GAT	2	6	49245	49250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142387
1016	NC_021213	GAA	2	6	49335	49340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142387
1017	NC_021213	AAT	2	6	49350	49355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142387
1018	NC_021213	TGT	2	6	49421	49426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142387
1019	NC_021213	CA	3	6	49463	49468	50 %	0 %	0 %	50 %	499142387
1020	NC_021213	TCA	2	6	49504	49509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142387
1021	NC_021213	CAT	2	6	49519	49524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142387
1022	NC_021213	TTCTA	2	10	49529	49538	20 %	60 %	0 %	20 %	499142387
1023	NC_021213	GAT	2	6	49595	49600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142387
1024	NC_021213	TGA	2	6	49639	49644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142387
1025	NC_021213	AAT	2	6	49832	49837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142387
1026	NC_021213	A	6	6	49840	49845	100 %	0 %	0 %	0 %	499142387
1027	NC_021213	CATT	2	8	49900	49907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_021213	TCGGTG	2	12	49909	49920	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1029	NC_021213	ATT	2	6	49926	49931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021213	GAA	2	6	49962	49967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142388
1031	NC_021213	TAT	2	6	49972	49977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142388
1032	NC_021213	AGG	2	6	49985	49990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499142388
1033	NC_021213	AT	3	6	49995	50000	50 %	50 %	0 %	0 %	499142388
1034	NC_021213	TAG	2	6	50003	50008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142388
1035	NC_021213	GTT	2	6	50026	50031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142388
1036	NC_021213	GGC	2	6	50040	50045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499142388
1037	NC_021213	ATT	2	6	50048	50053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142388
1038	NC_021213	AATA	2	8	50130	50137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021213	ATCT	2	8	50157	50164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_021213	AATATG	2	12	50185	50196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	499142389
1041	NC_021213	TAT	2	6	50282	50287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142389
1042	NC_021213	T	6	6	50331	50336	0 %	100 %	0 %	0 %	499142389
1043	NC_021213	GCA	2	6	50350	50355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142389
1044	NC_021213	ATT	2	6	50404	50409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142389
1045	NC_021213	CAG	2	6	50411	50416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142389
1046	NC_021213	TA	3	6	50453	50458	50 %	50 %	0 %	0 %	499142389
1047	NC_021213	TTAGT	2	10	50498	50507	20 %	60 %	20 %	0 %	499142389
1048	NC_021213	CTT	2	6	50568	50573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142389
1049	NC_021213	AGT	2	6	50589	50594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142389
1050	NC_021213	CTAT	2	8	50629	50636	25 %	50 %	0 %	25 %	499142389
1051	NC_021213	CAA	2	6	50642	50647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142389
1052	NC_021213	TCAA	2	8	50650	50657	50 %	25 %	0 %	25 %	499142389
1053	NC_021213	TAT	2	6	50658	50663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142389
1054	NC_021213	T	6	6	50729	50734	0 %	100 %	0 %	0 %	499142389
1055	NC_021213	ACA	2	6	50746	50751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142389
1056	NC_021213	CAC	2	6	50756	50761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142389
1057	NC_021213	TGT	2	6	50781	50786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142389
1058	NC_021213	TGG	2	6	50840	50845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142389
1059	NC_021213	TTG	2	6	50867	50872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142389
1060	NC_021213	CTAT	2	8	50873	50880	25 %	50 %	0 %	25 %	499142389
1061	NC_021213	TA	3	6	50927	50932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021213	ATCA	2	8	50954	50961	50 %	25 %	0 %	25 %	499142390
1063	NC_021213	CAA	2	6	51022	51027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142390
1064	NC_021213	TTG	2	6	51036	51041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142390
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1066	NC_021213	TGAT	2	8	51183	51190	25 %	50 %	25 %	0 %	499142390
1067	NC_021213	TCT	2	6	51195	51200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142390
1068	NC_021213	A	6	6	51254	51259	100 %	0 %	0 %	0 %	499142390
1069	NC_021213	AAC	2	6	51351	51356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142390
1070	NC_021213	ATTG	2	8	51448	51455	25 %	50 %	25 %	0 %	499142390
1071	NC_021213	GT	3	6	51738	51743	0 %	50 %	50 %	0 %	499142390
1072	NC_021213	ATTG	2	8	51757	51764	25 %	50 %	25 %	0 %	499142390
1073	NC_021213	GAAA	2	8	51793	51800	75 %	0 %	25 %	0 %	499142390
1074	NC_021213	TTTA	2	8	51907	51914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021213	GGA	2	6	51963	51968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499142391
1076	NC_021213	TTG	2	6	51983	51988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142391
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1078	NC_021213	TCCT	2	8	52028	52035	0 %	50 %	0 %	50 %	499142391
1079	NC_021213	AAG	2	6	52076	52081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142391
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1081	NC_021213	CAA	2	6	52160	52165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142391
1082	NC_021213	TCT	2	6	52184	52189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142391
1083	NC_021213	AG	3	6	52272	52277	50 %	0 %	50 %	0 %	499142391
1084	NC_021213	GAT	3	9	52407	52415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142391
1085	NC_021213	GTT	2	6	52423	52428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142391
1086	NC_021213	GAT	2	6	52443	52448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142391
1087	NC_021213	GCTT	2	8	52500	52507	0 %	50 %	25 %	25 %	499142391
1088	NC_021213	ATT	2	6	52531	52536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142391
1089	NC_021213	TGC	2	6	52560	52565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142391
1090	NC_021213	A	6	6	52567	52572	100 %	0 %	0 %	0 %	499142391
1091	NC_021213	AGA	2	6	52602	52607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021213	TCG	2	6	52609	52614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021213	GTT	2	6	52619	52624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021213	TACAG	2	10	52802	52811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_021213	ATT	2	6	52822	52827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021213	GTA	2	6	52843	52848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021213	CAA	2	6	52866	52871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_021213	TTG	2	6	52887	52892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021213	GTT	2	6	52965	52970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142392
1100	NC_021213	TTC	2	6	52982	52987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142392
1101	NC_021213	TGA	2	6	52997	53002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
1102	NC_021213	ATTT	2	8	53026	53033	25 %	75 %	0 %	0 %	499142392
1103	NC_021213	TCT	2	6	53072	53077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142392
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1105	NC_021213	TAC	2	6	53131	53136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142392
1106	NC_021213	TAG	2	6	53169	53174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
1107	NC_021213	TGA	2	6	53204	53209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
1108	NC_021213	GA	3	6	53240	53245	50 %	0 %	50 %	0 %	499142392
1109	NC_021213	TAG	2	6	53322	53327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
1110	NC_021213	TAT	2	6	53343	53348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142392
1111	NC_021213	TGA	2	6	53390	53395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
1112	NC_021213	ATG	2	6	53428	53433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
1113	NC_021213	TGAT	2	8	53438	53445	25 %	50 %	25 %	0 %	499142392
1114	NC_021213	TGC	2	6	53460	53465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142392
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1116	NC_021213	GTTG	2	8	53556	53563	0 %	50 %	50 %	0 %	499142392
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1118	NC_021213	TTG	2	6	53666	53671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142392
1119	NC_021213	TGA	2	6	53711	53716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
1120	NC_021213	CAA	2	6	53755	53760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142392
1121	NC_021213	GATT	2	8	53795	53802	25 %	50 %	25 %	0 %	499142392
1122	NC_021213	CT	3	6	53825	53830	0 %	50 %	0 %	50 %	499142392
1123	NC_021213	TAG	2	6	53930	53935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142392
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1125	NC_021213	TGC	2	6	54029	54034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142392
1126	NC_021213	ATTT	2	8	54046	54053	25 %	75 %	0 %	0 %	499142392
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1128	NC_021213	CAG	2	6	54235	54240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142392
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1132	NC_021213	TGA	2	6	54363	54368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021213	AATA	2	8	54379	54386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_021213	CCG	2	6	60995	61000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499142401
1258	NC_021213	CCA	2	6	61006	61011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142401
1259	NC_021213	GTCA	2	8	61092	61099	25 %	25 %	25 %	25 %	499142401
1260	NC_021213	GGT	2	6	61158	61163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142401
1261	NC_021213	GTC	2	6	61189	61194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142401
1262	NC_021213	ATTT	2	8	61222	61229	25 %	75 %	0 %	0 %	499142401
1263	NC_021213	TTG	2	6	61288	61293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142401
1264	NC_021213	TGT	2	6	61295	61300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142401
1265	NC_021213	AATT	2	8	61360	61367	50 %	50 %	0 %	0 %	499142401
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1271	NC_021213	AG	3	6	61848	61853	50 %	0 %	50 %	0 %	499142401
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1277	NC_021213	TATT	2	8	62139	62146	25 %	75 %	0 %	0 %	499142401
1278	NC_021213	AG	3	6	62195	62200	50 %	0 %	50 %	0 %	499142401
1279	NC_021213	TAC	2	6	62214	62219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142401
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1283	NC_021213	TCAA	2	8	62469	62476	50 %	25 %	0 %	25 %	499142401
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1286	NC_021213	GAT	2	6	62544	62549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142401
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1291	NC_021213	TAT	2	6	63013	63018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142402
1292	NC_021213	TGA	2	6	63025	63030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142402
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1301	NC_021213	ATG	2	6	63466	63471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1302	NC_021213	GTTTT	2	10	63480	63489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1303	NC_021213	GAAG	2	8	63646	63653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1304	NC_021213	CAA	2	6	63805	63810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142403
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1318	NC_021213	AGG	2	6	64376	64381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1352	NC_021213	TGC	2	6	65926	65931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142405
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1376	NC_021213	GTT	2	6	66832	66837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1377	NC_021213	T	6	6	66873	66878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_021213	TAA	2	6	66880	66885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_021213	T	7	7	66915	66921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_021213	A	6	6	66922	66927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1381	NC_021213	ATA	2	6	66957	66962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1382	NC_021213	TAA	2	6	66977	66982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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