MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021213	TGT	2	6	24119	24124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142365
502	NC_021213	CAAA	2	8	24273	24280	75 %	0 %	0 %	25 %	499142365
503	NC_021213	TTTAT	2	10	24325	24334	20 %	80 %	0 %	0 %	499142366
504	NC_021213	GGTC	2	8	24371	24378	0 %	25 %	50 %	25 %	499142366
505	NC_021213	ATT	2	6	24381	24386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142366
506	NC_021213	T	6	6	24422	24427	0 %	100 %	0 %	0 %	499142366
507	NC_021213	ATT	2	6	24456	24461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142366
508	NC_021213	TTTAC	2	10	24466	24475	20 %	60 %	0 %	20 %	499142366
509	NC_021213	CTA	2	6	24521	24526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142366
510	NC_021213	TCT	2	6	24560	24565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142366
511	NC_021213	TAG	2	6	24611	24616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142366
512	NC_021213	TTA	2	6	24635	24640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142366
513	NC_021213	TAA	2	6	24699	24704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142366
514	NC_021213	CTA	2	6	24718	24723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142366
515	NC_021213	TAC	2	6	24746	24751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142366
516	NC_021213	AACA	2	8	24780	24787	75 %	0 %	0 %	25 %	499142366
517	NC_021213	TAA	2	6	24801	24806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021213	T	7	7	24828	24834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021213	GA	3	6	24843	24848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021213	GAG	2	6	24862	24867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021213	GAA	2	6	24882	24887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142367
522	NC_021213	A	7	7	24886	24892	100 %	0 %	0 %	0 %	499142367
523	NC_021213	TCTA	2	8	24924	24931	25 %	50 %	0 %	25 %	499142367
524	NC_021213	ATG	2	6	24962	24967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142367
525	NC_021213	GCA	2	6	24982	24987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142367
526	NC_021213	A	6	6	24987	24992	100 %	0 %	0 %	0 %	499142367
527	NC_021213	CAA	2	6	25018	25023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
528	NC_021213	CAA	3	9	25033	25041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
529	NC_021213	AGA	2	6	25098	25103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142367
530	NC_021213	GGC	2	6	25137	25142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499142367
531	NC_021213	AATC	2	8	25262	25269	50 %	25 %	0 %	25 %	499142367
532	NC_021213	AATGC	2	10	25291	25300	40 %	20 %	20 %	20 %	499142367
533	NC_021213	TAA	2	6	25317	25322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142367
534	NC_021213	AAC	2	6	25334	25339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
535	NC_021213	TTG	2	6	25361	25366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142367
536	NC_021213	ACT	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142367
537	NC_021213	GCT	2	6	25471	25476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142367
538	NC_021213	CTG	2	6	25505	25510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142367
539	NC_021213	AGA	2	6	25551	25556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142367
540	NC_021213	AGC	2	6	25557	25562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142367
541	NC_021213	CAA	2	6	25621	25626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
542	NC_021213	CAT	2	6	25751	25756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142367
543	NC_021213	GCA	2	6	25777	25782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142367
544	NC_021213	AAT	2	6	25783	25788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142367
545	NC_021213	GGT	2	6	25963	25968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142367
546	NC_021213	TAT	2	6	25969	25974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142367
547	NC_021213	GTT	2	6	25987	25992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142367
548	NC_021213	CAA	2	6	26009	26014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
549	NC_021213	GTT	2	6	26023	26028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142367
550	NC_021213	GTC	2	6	26045	26050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142367
551	NC_021213	GTG	2	6	26069	26074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142367
552	NC_021213	CAA	2	6	26087	26092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
553	NC_021213	TAC	2	6	26113	26118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142367
554	NC_021213	TTTG	2	8	26175	26182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021213	AT	3	6	26222	26227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021213	AGG	2	6	26228	26233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021213	A	7	7	26305	26311	100 %	0 %	0 %	0 %	499142368
558	NC_021213	TTC	2	6	26408	26413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142368
559	NC_021213	CTG	2	6	26486	26491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142368
560	NC_021213	GTA	2	6	26503	26508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142368
561	NC_021213	TTA	2	6	26514	26519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142368
562	NC_021213	TGG	2	6	26576	26581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142368
563	NC_021213	TTG	2	6	26614	26619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142368
564	NC_021213	TGC	2	6	26634	26639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142368
565	NC_021213	TTC	2	6	26653	26658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142368
566	NC_021213	ATTG	2	8	26691	26698	25 %	50 %	25 %	0 %	499142368
567	NC_021213	ATT	2	6	26702	26707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142368
568	NC_021213	CGT	2	6	26713	26718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142368
569	NC_021213	TGT	3	9	26739	26747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142368
570	NC_021213	TGG	2	6	26760	26765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142368
571	NC_021213	TAT	2	6	26814	26819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142368
572	NC_021213	TGA	2	6	26861	26866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142368
573	NC_021213	ATT	2	6	26869	26874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142368
574	NC_021213	TTGA	2	8	26902	26909	25 %	50 %	25 %	0 %	499142368
575	NC_021213	TGAT	2	8	26915	26922	25 %	50 %	25 %	0 %	499142368
576	NC_021213	GTT	2	6	27058	27063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142368
577	NC_021213	AGA	2	6	27084	27089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142368
578	NC_021213	ATT	2	6	27129	27134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142368
579	NC_021213	ATT	2	6	27145	27150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142368
580	NC_021213	TTTG	2	8	27180	27187	0 %	75 %	25 %	0 %	499142368
581	NC_021213	CTT	2	6	27230	27235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_021213	T	6	6	27234	27239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021213	ATTT	2	8	27242	27249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021213	TAT	2	6	27258	27263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021213	TTA	2	6	27300	27305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142369
586	NC_021213	TAA	2	6	27314	27319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142369
587	NC_021213	GAT	2	6	27344	27349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142369
588	NC_021213	AAG	2	6	27439	27444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142369
589	NC_021213	GCT	2	6	27453	27458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142369
590	NC_021213	TTA	2	6	27476	27481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142369
591	NC_021213	CT	3	6	27576	27581	0 %	50 %	0 %	50 %	499142369
592	NC_021213	TTC	2	6	27646	27651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142369
593	NC_021213	TGCC	2	8	27652	27659	0 %	25 %	25 %	50 %	499142369
594	NC_021213	TGG	2	6	27694	27699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142369
595	NC_021213	ACG	2	6	27723	27728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142369
596	NC_021213	ATT	2	6	27771	27776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142369
597	NC_021213	CAT	2	6	28055	28060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142369
598	NC_021213	CAT	2	6	28199	28204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142369
599	NC_021213	CTT	2	6	28304	28309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142369
600	NC_021213	GAAA	2	8	28324	28331	75 %	0 %	25 %	0 %	499142369
601	NC_021213	GCA	2	6	28398	28403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142369
602	NC_021213	AGA	2	6	28451	28456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142369
603	NC_021213	TA	3	6	28490	28495	50 %	50 %	0 %	0 %	499142370
604	NC_021213	ATG	3	9	28643	28651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142370
605	NC_021213	GTCT	2	8	28652	28659	0 %	50 %	25 %	25 %	499142370
606	NC_021213	TCA	2	6	28674	28679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142370
607	NC_021213	CTTGGC	2	12	28740	28751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142370
608	NC_021213	CT	3	6	28787	28792	0 %	50 %	0 %	50 %	499142370
609	NC_021213	T	6	6	28797	28802	0 %	100 %	0 %	0 %	499142370
610	NC_021213	CAA	2	6	28990	28995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142370
611	NC_021213	TGA	2	6	29064	29069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142370
612	NC_021213	GAT	2	6	29179	29184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142370
613	NC_021213	TCT	2	6	29188	29193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142370
614	NC_021213	TGGG	2	8	29263	29270	0 %	25 %	75 %	0 %	499142371
615	NC_021213	TCAA	2	8	29302	29309	50 %	25 %	0 %	25 %	499142371
616	NC_021213	TGA	2	6	29351	29356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142371
617	NC_021213	ACG	2	6	29409	29414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142371
618	NC_021213	GAT	2	6	29430	29435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142371
619	NC_021213	TCG	2	6	29453	29458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142371
620	NC_021213	AAGA	2	8	29460	29467	75 %	0 %	25 %	0 %	499142371
621	NC_021213	GGC	2	6	29552	29557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499142371
622	NC_021213	GTC	2	6	29568	29573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142371
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625	NC_021213	TCA	2	6	29681	29686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142371
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627	NC_021213	AAC	2	6	29743	29748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142371
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629	NC_021213	AAG	2	6	29806	29811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142371
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758	NC_021213	AAG	2	6	36628	36633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142376
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772	NC_021213	CAGT	2	8	37472	37479	25 %	25 %	25 %	25 %	499142376
773	NC_021213	CAT	2	6	37539	37544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142376
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