MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021213	GTA	2	6	242954	242959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142570
5002	NC_021213	ACA	2	6	243020	243025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142570
5003	NC_021213	ATG	2	6	243039	243044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142570
5004	NC_021213	AGC	2	6	243064	243069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142570
5005	NC_021213	CTT	2	6	243105	243110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142570
5006	NC_021213	AGCTC	2	10	243182	243191	20 %	20 %	20 %	40 %	499142570
5007	NC_021213	CAT	2	6	243250	243255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142570
5008	NC_021213	GTA	2	6	243435	243440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021213	GAAT	2	8	243449	243456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021213	CAA	2	6	243530	243535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021213	GTT	2	6	243549	243554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021213	TCCC	2	8	243584	243591	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5013	NC_021213	AGT	2	6	243797	243802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021213	AAGAA	2	10	243918	243927	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021213	C	6	6	243938	243943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5016	NC_021213	AT	3	6	243977	243982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021213	AAAATT	2	12	244061	244072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021213	TTTA	2	8	244107	244114	25 %	75 %	0 %	0 %	499142571
5019	NC_021213	TGA	2	6	244185	244190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142571
5020	NC_021213	GTC	2	6	244210	244215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142571
5021	NC_021213	TTG	2	6	244250	244255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142571
5022	NC_021213	T	6	6	244407	244412	0 %	100 %	0 %	0 %	499142571
5023	NC_021213	TCCACG	2	12	244607	244618	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499142571
5024	NC_021213	TCCT	2	8	244726	244733	0 %	50 %	0 %	50 %	499142571
5025	NC_021213	CAA	2	6	244752	244757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142571
5026	NC_021213	GTT	2	6	244786	244791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142571
5027	NC_021213	TTC	2	6	244861	244866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142571
5028	NC_021213	AAAGTC	2	12	244867	244878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	499142571
5029	NC_021213	ATG	2	6	244880	244885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142571
5030	NC_021213	GTG	2	6	244921	244926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142571
5031	NC_021213	TTC	2	6	244948	244953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142571
5032	NC_021213	TGG	3	9	244989	244997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142571
5033	NC_021213	TCA	2	6	245052	245057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142571
5034	NC_021213	CGGT	2	8	245084	245091	0 %	25 %	50 %	25 %	499142571
5035	NC_021213	ATTG	2	8	245110	245117	25 %	50 %	25 %	0 %	499142571
5036	NC_021213	ACC	2	6	245204	245209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142571
5037	NC_021213	TTC	2	6	245218	245223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142571
5038	NC_021213	GTA	2	6	245281	245286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142571
5039	NC_021213	CCA	2	6	245321	245326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142571
5040	NC_021213	CAGT	2	8	245339	245346	25 %	25 %	25 %	25 %	499142571
5041	NC_021213	GTA	2	6	245377	245382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142571
5042	NC_021213	CCA	2	6	245484	245489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142571
5043	NC_021213	TTC	2	6	245491	245496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142571
5044	NC_021213	AAT	2	6	245638	245643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142571
5045	NC_021213	AAC	2	6	245707	245712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142571
5046	NC_021213	CT	4	8	245738	245745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_021213	CTT	2	6	245759	245764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_021213	AGG	2	6	245779	245784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021213	CCT	2	6	245802	245807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_021213	TGGT	2	8	245899	245906	0 %	50 %	50 %	0 %	499142572
5051	NC_021213	CGA	2	6	245927	245932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142572
5052	NC_021213	CAG	2	6	245936	245941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142572
5053	NC_021213	TCCAA	2	10	246031	246040	40 %	20 %	0 %	40 %	499142572
5054	NC_021213	AGA	2	6	246151	246156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142572
5055	NC_021213	AGC	2	6	246270	246275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142572
5056	NC_021213	CAA	2	6	246284	246289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142572
5057	NC_021213	CTT	2	6	246311	246316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142572
5058	NC_021213	TCT	2	6	246325	246330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142572
5059	NC_021213	T	7	7	246330	246336	0 %	100 %	0 %	0 %	499142572
5060	NC_021213	ACA	2	6	246382	246387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142572
5061	NC_021213	CAA	2	6	246392	246397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142572
5062	NC_021213	ACC	2	6	246456	246461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142572
5063	NC_021213	AGC	2	6	246474	246479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142572
5064	NC_021213	AG	3	6	246498	246503	50 %	0 %	50 %	0 %	499142572
5065	NC_021213	AGC	2	6	246531	246536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142572
5066	NC_021213	TAGG	2	8	246594	246601	25 %	25 %	50 %	0 %	499142572
5067	NC_021213	CTT	2	6	246632	246637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142572
5068	NC_021213	CTG	2	6	246674	246679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142572
5069	NC_021213	CCA	2	6	246727	246732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142572
5070	NC_021213	CAAT	2	8	246740	246747	50 %	25 %	0 %	25 %	499142572
5071	NC_021213	GAT	2	6	246924	246929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142572
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5073	NC_021213	AGA	2	6	246995	247000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142572
5074	NC_021213	AGG	2	6	247030	247035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499142572
5075	NC_021213	TGC	2	6	247116	247121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142572
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5079	NC_021213	AGA	2	6	247589	247594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142572
5080	NC_021213	GAT	2	6	247611	247616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142572
5081	NC_021213	CTG	2	6	247655	247660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142572
5082	NC_021213	T	6	6	247689	247694	0 %	100 %	0 %	0 %	499142572
5083	NC_021213	TTTTC	2	10	247750	247759	0 %	80 %	0 %	20 %	499142572
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5086	NC_021213	TC	3	6	247862	247867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_021213	T	6	6	247879	247884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021213	A	6	6	247934	247939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021213	T	8	8	247962	247969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021213	ATG	2	6	248038	248043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142573
5091	NC_021213	A	6	6	248044	248049	100 %	0 %	0 %	0 %	499142573
5092	NC_021213	A	6	6	248078	248083	100 %	0 %	0 %	0 %	499142573
5093	NC_021213	AAC	2	6	248126	248131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142573
5094	NC_021213	GAGG	2	8	248194	248201	25 %	0 %	75 %	0 %	499142573
5095	NC_021213	TGT	2	6	248328	248333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142573
5096	NC_021213	TAG	2	6	248358	248363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142573
5097	NC_021213	GAT	2	6	248623	248628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142573
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5099	NC_021213	AGCA	2	8	248692	248699	50 %	0 %	25 %	25 %	499142573
5100	NC_021213	GA	3	6	248755	248760	50 %	0 %	50 %	0 %	499142573
5101	NC_021213	T	6	6	248775	248780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021213	ATAG	2	8	248789	248796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021213	AAG	2	6	248797	248802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021213	AAAGA	2	10	248935	248944	80 %	0 %	20 %	0 %	499142574
5105	NC_021213	CGG	2	6	248951	248956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499142574
5106	NC_021213	CAAT	2	8	248984	248991	50 %	25 %	0 %	25 %	499142574
5107	NC_021213	CG	3	6	249011	249016	0 %	0 %	50 %	50 %	499142574
5108	NC_021213	TTGA	2	8	249088	249095	25 %	50 %	25 %	0 %	499142574
5109	NC_021213	ATT	2	6	249135	249140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142575
5110	NC_021213	TAT	2	6	249215	249220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142575
5111	NC_021213	TGG	2	6	249226	249231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142575
5112	NC_021213	A	6	6	249249	249254	100 %	0 %	0 %	0 %	499142575
5113	NC_021213	TCCT	2	8	249261	249268	0 %	50 %	0 %	50 %	499142575
5114	NC_021213	TAT	2	6	249315	249320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142575
5115	NC_021213	TGA	2	6	249323	249328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142575
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5117	NC_021213	GAT	2	6	249557	249562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142575
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5119	NC_021213	CAT	2	6	249596	249601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142575
5120	NC_021213	AC	3	6	249610	249615	50 %	0 %	0 %	50 %	499142575
5121	NC_021213	TAG	2	6	249623	249628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142575
5122	NC_021213	TC	3	6	249639	249644	0 %	50 %	0 %	50 %	499142575
5123	NC_021213	AAAATC	2	12	249711	249722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5124	NC_021213	TTG	2	6	249728	249733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021213	TTGAT	2	10	249736	249745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021213	GAGTGG	2	12	249746	249757	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021213	CAA	2	6	249789	249794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_021213	GTT	2	6	249808	249813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021213	CAGCCT	2	12	249968	249979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499142576
5130	NC_021213	TTCG	2	8	250035	250042	0 %	50 %	25 %	25 %	499142576
5131	NC_021213	TGATTT	2	12	250089	250100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	499142576
5132	NC_021213	AT	3	6	250215	250220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021213	AAT	2	6	250222	250227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142577
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5144	NC_021213	ATG	2	6	250631	250636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142577
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5181	NC_021213	GAA	2	6	253205	253210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5182	NC_021213	AGA	2	6	253234	253239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5183	NC_021213	TGG	2	6	253263	253268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5185	NC_021213	T	6	6	253300	253305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5191	NC_021213	T	9	9	253450	253458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5192	NC_021213	TAG	2	6	253471	253476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5201	NC_021213	TAA	2	6	253909	253914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5231	NC_021213	A	7	7	255462	255468	100 %	0 %	0 %	0 %	499142580
5232	NC_021213	AAG	2	6	255501	255506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_021213	GAAA	2	8	255517	255524	75 %	0 %	25 %	0 %	499142581
5234	NC_021213	GTT	2	6	255540	255545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142581
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5240	NC_021213	ATCA	2	8	255752	255759	50 %	25 %	0 %	25 %	499142581
5241	NC_021213	TGG	2	6	255865	255870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142581
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5246	NC_021213	TGAT	2	8	255999	256006	25 %	50 %	25 %	0 %	499142581
5247	NC_021213	CAA	2	6	256031	256036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142581
5248	NC_021213	GACC	2	8	256054	256061	25 %	0 %	25 %	50 %	499142581
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5375	NC_021213	ACTG	2	8	262454	262461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5376	NC_021213	GA	3	6	262481	262486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_021213	AGG	2	6	262669	262674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5496	NC_021213	AGA	2	6	268794	268799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142590
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5498	NC_021213	CAG	2	6	268874	268879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142590
5499	NC_021213	AAGA	2	8	269038	269045	75 %	0 %	25 %	0 %	499142590
5500	NC_021213	GTCAAA	2	12	269050	269061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	499142590

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