MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 11275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	ATTG	2	8	40	47	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021176	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021176	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	488652560
4	NC_021176	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	488652560
5	NC_021176	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	488652561
6	NC_021176	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	488652562
7	NC_021176	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	488652562
8	NC_021176	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	488652562
9	NC_021176	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	488652562
10	NC_021176	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	488652562
11	NC_021176	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	488652564
12	NC_021176	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	488652564
13	NC_021176	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	488652564
14	NC_021176	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	488652565
15	NC_021176	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	488652565
16	NC_021176	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021176	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021176	TGGC	2	8	8819	8826	0 %	25 %	50 %	25 %	488652566
19	NC_021176	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	488652567
20	NC_021176	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	488652568
21	NC_021176	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	488652569
22	NC_021176	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	488652569
23	NC_021176	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021176	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	488652570
25	NC_021176	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	488652570
26	NC_021176	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	488652570
27	NC_021176	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	488652570
28	NC_021176	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	488652570
29	NC_021176	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	488652571
30	NC_021176	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	488652572
31	NC_021176	GTAT	2	8	14770	14777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021176	TCAG	2	8	15249	15256	25 %	25 %	25 %	25 %	488652573
33	NC_021176	TTTG	2	8	15539	15546	0 %	75 %	25 %	0 %	488652573
34	NC_021176	CGAA	2	8	15754	15761	50 %	0 %	25 %	25 %	488652573
35	NC_021176	ATTG	2	8	15766	15773	25 %	50 %	25 %	0 %	488652573
36	NC_021176	ATAA	2	8	16526	16533	75 %	25 %	0 %	0 %	488652575
37	NC_021176	CAGC	2	8	16733	16740	25 %	0 %	25 %	50 %	488652575
38	NC_021176	AATA	2	8	18002	18009	75 %	25 %	0 %	0 %	488652577
39	NC_021176	GGGC	2	8	18588	18595	0 %	0 %	75 %	25 %	488652577
40	NC_021176	CGTG	2	8	19288	19295	0 %	25 %	50 %	25 %	488652577
41	NC_021176	TCCA	2	8	20073	20080	25 %	25 %	0 %	50 %	488652578
42	NC_021176	CCAA	2	8	21289	21296	50 %	0 %	0 %	50 %	488652579
43	NC_021176	GACG	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	488652579
44	NC_021176	GCCG	2	8	21887	21894	0 %	0 %	50 %	50 %	488652579
45	NC_021176	TGGC	2	8	22288	22295	0 %	25 %	50 %	25 %	488652579
46	NC_021176	TGGC	2	8	22394	22401	0 %	25 %	50 %	25 %	488652579
47	NC_021176	CGCC	2	8	22660	22667	0 %	0 %	25 %	75 %	488652579
48	NC_021176	CTGG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	488652579
49	NC_021176	TTAT	2	8	23271	23278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021176	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	488652580
51	NC_021176	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	488652580
52	NC_021176	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	488652580
53	NC_021176	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	488652581
54	NC_021176	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	488652581
55	NC_021176	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	488652582
56	NC_021176	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	488652582
57	NC_021176	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	488652583
58	NC_021176	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	488652583
59	NC_021176	CCTT	2	8	26622	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	488652583
60	NC_021176	TCAG	2	8	26981	26988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021176	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021176	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021176	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021176	GCGT	2	8	28181	28188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021176	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	488652584
66	NC_021176	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	488652584
67	NC_021176	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	488652585
68	NC_021176	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021176	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	488652587
70	NC_021176	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	488652587
71	NC_021176	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	488652587
72	NC_021176	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	488652588
73	NC_021176	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	488652589
74	NC_021176	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	488652589
75	NC_021176	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	488652590
76	NC_021176	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	488652590
77	NC_021176	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	488652590
78	NC_021176	CCAG	2	8	33350	33357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021176	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	488652591
80	NC_021176	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	488652591
81	NC_021176	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	488652591
82	NC_021176	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	488652591
83	NC_021176	TAAA	2	8	34389	34396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021176	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	488652592
85	NC_021176	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	488652592
86	NC_021176	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	488652592
87	NC_021176	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021176	TGAC	2	8	35736	35743	25 %	25 %	25 %	25 %	488652593
89	NC_021176	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	488652593
90	NC_021176	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	488652594
91	NC_021176	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	488652594
92	NC_021176	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	488652594
93	NC_021176	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	488652594
94	NC_021176	TCGT	2	8	38559	38566	0 %	50 %	25 %	25 %	488652594
95	NC_021176	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	488652594
96	NC_021176	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021176	AATT	2	8	40045	40052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021176	GCGG	2	8	40536	40543	0 %	0 %	75 %	25 %	488652596
99	NC_021176	CTGG	2	8	40754	40761	0 %	25 %	50 %	25 %	488652596
100	NC_021176	CCGA	2	8	41271	41278	25 %	0 %	25 %	50 %	488652596
101	NC_021176	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	488652596
102	NC_021176	TCAA	2	8	41488	41495	50 %	25 %	0 %	25 %	488652596
103	NC_021176	AACC	2	8	41754	41761	50 %	0 %	0 %	50 %	488652597
104	NC_021176	GAAA	2	8	41806	41813	75 %	0 %	25 %	0 %	488652597
105	NC_021176	GGTC	2	8	42378	42385	0 %	25 %	50 %	25 %	488652597
106	NC_021176	TTTG	2	8	42902	42909	0 %	75 %	25 %	0 %	488652597
107	NC_021176	GTAT	2	8	43196	43203	25 %	50 %	25 %	0 %	488652598
108	NC_021176	TCCG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	25 %	50 %	488652598
109	NC_021176	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	488652599
110	NC_021176	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	488652599
111	NC_021176	TGAC	2	8	46038	46045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021176	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	488652600
113	NC_021176	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	488652600
114	NC_021176	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	488652601
115	NC_021176	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	488652601
116	NC_021176	CCTG	3	12	47969	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	488652601
117	NC_021176	TACC	2	8	48317	48324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021176	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	488652602
119	NC_021176	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	488652602
120	NC_021176	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	488652602
121	NC_021176	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	488652602
122	NC_021176	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	488652603
123	NC_021176	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	488652603
124	NC_021176	TAAA	2	8	51240	51247	75 %	25 %	0 %	0 %	488652603
125	NC_021176	AGTA	2	8	51933	51940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021176	ATCA	2	8	51973	51980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021176	GAAA	2	8	52093	52100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021176	AGGG	2	8	52126	52133	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021176	CATA	2	8	52886	52893	50 %	25 %	0 %	25 %	488652606
130	NC_021176	TCAG	2	8	52897	52904	25 %	25 %	25 %	25 %	488652606
131	NC_021176	GCCC	2	8	53069	53076	0 %	0 %	25 %	75 %	488652606
132	NC_021176	TGGC	2	8	53611	53618	0 %	25 %	50 %	25 %	488652606
133	NC_021176	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	488652609
134	NC_021176	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	488652609
135	NC_021176	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	488652609
136	NC_021176	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	488652610
137	NC_021176	GCTG	2	8	58419	58426	0 %	25 %	50 %	25 %	488652610
138	NC_021176	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	488652611
139	NC_021176	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	488652611
140	NC_021176	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	488652611
141	NC_021176	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	488652612
142	NC_021176	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	488652612
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