MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021176	CTG	2	6	187376	187381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725
4003	NC_021176	CTGT	2	8	187397	187404	0 %	50 %	25 %	25 %	488652725
4004	NC_021176	TGC	2	6	187506	187511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725
4005	NC_021176	CGC	2	6	187525	187530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652725
4006	NC_021176	TGG	2	6	187537	187542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652725
4007	NC_021176	TAT	2	6	187564	187569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652725
4008	NC_021176	TGC	2	6	187605	187610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725
4009	NC_021176	ATT	2	6	187658	187663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652725
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4011	NC_021176	ATG	2	6	187712	187717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652725
4012	NC_021176	ATC	3	9	187721	187729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652725
4013	NC_021176	ATG	2	6	187730	187735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652725
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4020	NC_021176	GGT	2	6	187796	187801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652725
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4030	NC_021176	CATC	2	8	188131	188138	25 %	25 %	0 %	50 %	488652725
4031	NC_021176	TGGC	2	8	188259	188266	0 %	25 %	50 %	25 %	488652725
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4035	NC_021176	TGCC	2	8	188648	188655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_021176	T	6	6	188825	188830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021176	T	6	6	188838	188843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4041	NC_021176	GAG	2	6	188983	188988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021176	TCG	2	6	188992	188997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652726
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4045	NC_021176	GCT	2	6	189092	189097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652726
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4057	NC_021176	TCACCG	2	12	189493	189504	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	488652726
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4061	NC_021176	A	6	6	189678	189683	100 %	0 %	0 %	0 %	488652726
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4102	NC_021176	TAC	2	6	191253	191258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652726
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4111	NC_021176	T	7	7	191724	191730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021176	GCT	2	6	191738	191743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4119	NC_021176	AG	3	6	192066	192071	50 %	0 %	50 %	0 %	488652727
4120	NC_021176	GGA	2	6	192090	192095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652727
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4122	NC_021176	CT	3	6	192147	192152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_021176	CAC	2	6	192212	192217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_021176	T	6	6	192243	192248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021176	T	6	6	192261	192266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021176	TTA	2	6	192272	192277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021176	TTGA	2	8	192319	192326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4220	NC_021176	GTG	2	6	196372	196377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4221	NC_021176	GTA	2	6	196404	196409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652732
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4228	NC_021176	CA	3	6	196827	196832	50 %	0 %	0 %	50 %	488652732
4229	NC_021176	CCA	2	6	196856	196861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652732
4230	NC_021176	CCT	2	6	197184	197189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4231	NC_021176	CGG	2	6	197284	197289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652733
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4233	NC_021176	CGT	2	6	197335	197340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652733
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4237	NC_021176	ATCGG	2	10	197568	197577	20 %	20 %	40 %	20 %	488652733
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4241	NC_021176	CGC	3	9	197794	197802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652733
4242	NC_021176	CAG	2	6	197837	197842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652733
4243	NC_021176	TCA	2	6	197854	197859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652733
4244	NC_021176	ATAA	2	8	197867	197874	75 %	25 %	0 %	0 %	488652733
4245	NC_021176	TCG	2	6	197877	197882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652733
4246	NC_021176	GGT	2	6	197888	197893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652733
4247	NC_021176	GCG	2	6	197931	197936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652733
4248	NC_021176	GAT	2	6	197945	197950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652733
4249	NC_021176	T	6	6	197968	197973	0 %	100 %	0 %	0 %	488652733
4250	NC_021176	A	7	7	198085	198091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_021176	CAT	2	6	198100	198105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4253	NC_021176	GGA	2	6	198156	198161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_021176	T	6	6	198213	198218	0 %	100 %	0 %	0 %	488652734
4255	NC_021176	A	6	6	198324	198329	100 %	0 %	0 %	0 %	488652734
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4259	NC_021176	TAT	2	6	198572	198577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_021176	TTG	2	6	198604	198609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_021176	GCCGC	2	10	198778	198787	0 %	0 %	40 %	60 %	488652735
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4361	NC_021176	AACA	2	8	204066	204073	75 %	0 %	0 %	25 %	488652738
4362	NC_021176	ATCCA	2	10	204128	204137	40 %	20 %	0 %	40 %	488652738
4363	NC_021176	TTGCGC	2	12	204153	204164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652738
4364	NC_021176	A	6	6	204174	204179	100 %	0 %	0 %	0 %	488652738
4365	NC_021176	CCA	2	6	204194	204199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652738
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4369	NC_021176	AT	3	6	204322	204327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4476	NC_021176	GCGCT	2	10	209265	209274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4482	NC_021176	GCAC	2	8	209596	209603	25 %	0 %	25 %	50 %	488652745
4483	NC_021176	CCAGCA	2	12	209605	209616	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	488652745
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