MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_021176	GCC	2	6	163467	163472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652703
3503	NC_021176	CAG	2	6	163574	163579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3504	NC_021176	GCA	2	6	163710	163715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3505	NC_021176	TCT	2	6	163719	163724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652703
3506	NC_021176	CGA	2	6	163774	163779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3507	NC_021176	TCT	2	6	163974	163979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652703
3508	NC_021176	TCG	2	6	164137	164142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3509	NC_021176	CGA	2	6	164160	164165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3510	NC_021176	CATA	2	8	164209	164216	50 %	25 %	0 %	25 %	488652703
3511	NC_021176	GTC	2	6	164282	164287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3512	NC_021176	GGCA	2	8	164406	164413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_021176	GGCT	2	8	164468	164475	0 %	25 %	50 %	25 %	488652704
3514	NC_021176	TAA	2	6	164476	164481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652704
3515	NC_021176	ATG	2	6	164488	164493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652704
3516	NC_021176	GCG	2	6	164553	164558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652704
3517	NC_021176	GGA	2	6	164606	164611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652704
3518	NC_021176	ATT	2	6	164627	164632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652704
3519	NC_021176	GAACC	2	10	164633	164642	40 %	0 %	20 %	40 %	488652704
3520	NC_021176	TGA	2	6	164714	164719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652704
3521	NC_021176	TGCC	2	8	164732	164739	0 %	25 %	25 %	50 %	488652704
3522	NC_021176	CGG	2	6	164788	164793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652704
3523	NC_021176	AACG	2	8	164892	164899	50 %	0 %	25 %	25 %	488652704
3524	NC_021176	CGC	2	6	165019	165024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652704
3525	NC_021176	TCA	2	6	165040	165045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652704
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3527	NC_021176	CGC	2	6	165179	165184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652704
3528	NC_021176	GAG	2	6	165267	165272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652704
3529	NC_021176	CTGC	2	8	165276	165283	0 %	25 %	25 %	50 %	488652704
3530	NC_021176	TAT	2	6	165303	165308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652704
3531	NC_021176	CG	3	6	165315	165320	0 %	0 %	50 %	50 %	488652704
3532	NC_021176	TATT	2	8	165343	165350	25 %	75 %	0 %	0 %	488652704
3533	NC_021176	ATT	2	6	165352	165357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652704
3534	NC_021176	GTC	2	6	165419	165424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652705
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3538	NC_021176	GAC	2	6	165542	165547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652705
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3542	NC_021176	GATCA	2	10	165821	165830	40 %	20 %	20 %	20 %	488652706
3543	NC_021176	TGT	2	6	165906	165911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652706
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3551	NC_021176	TCT	2	6	166303	166308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652706
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3554	NC_021176	CG	3	6	166518	166523	0 %	0 %	50 %	50 %	488652707
3555	NC_021176	CAT	2	6	166527	166532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652707
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3557	NC_021176	CAG	2	6	166621	166626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652707
3558	NC_021176	CTG	2	6	166684	166689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652707
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3561	NC_021176	CGG	2	6	166782	166787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652707
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3563	NC_021176	GC	3	6	166855	166860	0 %	0 %	50 %	50 %	488652707
3564	NC_021176	ATA	2	6	166862	166867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652707
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3567	NC_021176	A	7	7	167085	167091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3570	NC_021176	TCG	2	6	167612	167617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652708
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3574	NC_021176	GGC	2	6	167848	167853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652708
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3581	NC_021176	CCGC	2	8	168101	168108	0 %	0 %	25 %	75 %	488652708
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3584	NC_021176	ATCCC	2	10	168267	168276	20 %	20 %	0 %	60 %	488652709
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3589	NC_021176	T	6	6	168512	168517	0 %	100 %	0 %	0 %	488652709
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3593	NC_021176	ATA	2	6	168848	168853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652709
3594	NC_021176	AGA	2	6	168863	168868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652709
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3603	NC_021176	ATGA	2	8	169252	169259	50 %	25 %	25 %	0 %	488652709
3604	NC_021176	TGA	2	6	169271	169276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652709
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3606	NC_021176	GCG	2	6	169310	169315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652709
3607	NC_021176	TGA	2	6	169368	169373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652709
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3610	NC_021176	GC	3	6	169714	169719	0 %	0 %	50 %	50 %	488652710
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3619	NC_021176	GGAT	2	8	170043	170050	25 %	25 %	50 %	0 %	488652710
3620	NC_021176	GC	3	6	170137	170142	0 %	0 %	50 %	50 %	488652710
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3622	NC_021176	GAC	2	6	170300	170305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652710
3623	NC_021176	CTT	2	6	170314	170319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652710
3624	NC_021176	GAA	2	6	170485	170490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652710
3625	NC_021176	GAT	2	6	170656	170661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652710
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3868	NC_021176	CTT	2	6	181914	181919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652720
3869	NC_021176	AAT	2	6	182052	182057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652721
3870	NC_021176	CGT	2	6	182211	182216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652721
3871	NC_021176	CCG	2	6	182282	182287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652721
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3884	NC_021176	CGA	2	6	182703	182708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652721
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3886	NC_021176	AGC	2	6	182934	182939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652721
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3891	NC_021176	CG	3	6	183163	183168	0 %	0 %	50 %	50 %	488652721
3892	NC_021176	GCT	2	6	183181	183186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652721
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3988	NC_021176	CG	3	6	187026	187031	0 %	0 %	50 %	50 %	488652725
3989	NC_021176	GCG	3	9	187029	187037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652725
3990	NC_021176	GCT	2	6	187168	187173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725
3991	NC_021176	GGCG	2	8	187198	187205	0 %	0 %	75 %	25 %	488652725
3992	NC_021176	TC	3	6	187209	187214	0 %	50 %	0 %	50 %	488652725
3993	NC_021176	TGT	2	6	187218	187223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652725
3994	NC_021176	TGC	2	6	187233	187238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725
3995	NC_021176	TGC	3	9	187266	187274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725
3996	NC_021176	GTG	2	6	187275	187280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652725
3997	NC_021176	CTG	2	6	187295	187300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725
3998	NC_021176	CGC	2	6	187301	187306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652725
3999	NC_021176	CGA	2	6	187311	187316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652725
4000	NC_021176	CTG	2	6	187317	187322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652725

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