MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021176	GCC	2	6	117199	117204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652662
2502	NC_021176	GTC	2	6	117238	117243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_021176	GGA	2	6	117292	117297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_021176	TGT	3	9	117304	117312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652663
2505	NC_021176	CG	3	6	117344	117349	0 %	0 %	50 %	50 %	488652663
2506	NC_021176	CGC	2	6	117423	117428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652663
2507	NC_021176	GCC	2	6	117456	117461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652663
2508	NC_021176	CG	3	6	117474	117479	0 %	0 %	50 %	50 %	488652663
2509	NC_021176	TGT	2	6	117487	117492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652663
2510	NC_021176	CG	3	6	117590	117595	0 %	0 %	50 %	50 %	488652663
2511	NC_021176	CTGA	2	8	117606	117613	25 %	25 %	25 %	25 %	488652663
2512	NC_021176	ATAGCG	2	12	117622	117633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488652663
2513	NC_021176	ATG	2	6	117664	117669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652663
2514	NC_021176	ATGA	2	8	117703	117710	50 %	25 %	25 %	0 %	488652663
2515	NC_021176	GTTC	2	8	117711	117718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_021176	ATG	2	6	117802	117807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_021176	TA	3	6	117812	117817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021176	CAG	2	6	117818	117823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_021176	TTTA	2	8	117860	117867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_021176	A	6	6	117975	117980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_021176	T	6	6	117987	117992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_021176	GTTT	2	8	117993	118000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_021176	TAAT	2	8	118001	118008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021176	ATA	2	6	118058	118063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021176	TAAA	2	8	118084	118091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_021176	TCG	2	6	118111	118116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_021176	CT	3	6	118121	118126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_021176	TAATT	2	10	118130	118139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_021176	ATTTT	2	10	118156	118165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_021176	CGGGTG	2	12	118172	118183	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2531	NC_021176	T	6	6	118318	118323	0 %	100 %	0 %	0 %	488652664
2532	NC_021176	ACAGA	2	10	118339	118348	60 %	0 %	20 %	20 %	488652664
2533	NC_021176	ATT	2	6	118363	118368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652664
2534	NC_021176	T	7	7	118383	118389	0 %	100 %	0 %	0 %	488652664
2535	NC_021176	ATT	2	6	118432	118437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652664
2536	NC_021176	CAA	2	6	118469	118474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652664
2537	NC_021176	TTC	2	6	118489	118494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652664
2538	NC_021176	GGAA	2	8	118503	118510	50 %	0 %	50 %	0 %	488652664
2539	NC_021176	ATA	2	6	118532	118537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652664
2540	NC_021176	AT	3	6	118590	118595	50 %	50 %	0 %	0 %	488652664
2541	NC_021176	TCA	2	6	118608	118613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652664
2542	NC_021176	C	6	6	118619	118624	0 %	0 %	0 %	100 %	488652664
2543	NC_021176	CAG	2	6	118698	118703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652665
2544	NC_021176	TGC	2	6	118708	118713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652665
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2546	NC_021176	GGC	2	6	118739	118744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652665
2547	NC_021176	AGA	2	6	118745	118750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652665
2548	NC_021176	CTT	2	6	118766	118771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652665
2549	NC_021176	GCG	2	6	118861	118866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652665
2550	NC_021176	CAA	2	6	118892	118897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652665
2551	NC_021176	GTGG	2	8	118989	118996	0 %	25 %	75 %	0 %	488652665
2552	NC_021176	GT	3	6	119056	119061	0 %	50 %	50 %	0 %	488652665
2553	NC_021176	TGC	2	6	119066	119071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652665
2554	NC_021176	GAC	2	6	119119	119124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652665
2555	NC_021176	ACC	3	9	119167	119175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652665
2556	NC_021176	CGC	2	6	119231	119236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652665
2557	NC_021176	TCT	2	6	119332	119337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652665
2558	NC_021176	CAGCG	2	10	119514	119523	20 %	0 %	40 %	40 %	488652666
2559	NC_021176	ATCA	2	8	119555	119562	50 %	25 %	0 %	25 %	488652666
2560	NC_021176	GC	3	6	119641	119646	0 %	0 %	50 %	50 %	488652666
2561	NC_021176	GCCA	2	8	119648	119655	25 %	0 %	25 %	50 %	488652666
2562	NC_021176	GCG	2	6	119737	119742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652666
2563	NC_021176	CAG	2	6	119768	119773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652666
2564	NC_021176	CGA	2	6	119806	119811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652666
2565	NC_021176	GCCGG	2	10	119814	119823	0 %	0 %	60 %	40 %	488652666
2566	NC_021176	GCC	2	6	119861	119866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652666
2567	NC_021176	AC	3	6	119921	119926	50 %	0 %	0 %	50 %	488652666
2568	NC_021176	CGAGC	2	10	119939	119948	20 %	0 %	40 %	40 %	488652666
2569	NC_021176	TCC	2	6	119985	119990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652666
2570	NC_021176	GCC	2	6	120002	120007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652666
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2572	NC_021176	CTG	2	6	120089	120094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652666
2573	NC_021176	GTT	2	6	120124	120129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652666
2574	NC_021176	AGT	3	9	120152	120160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652666
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2577	NC_021176	GGCG	2	8	120260	120267	0 %	0 %	75 %	25 %	488652666
2578	NC_021176	GCT	2	6	120278	120283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652666
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2581	NC_021176	ATTTG	2	10	120382	120391	20 %	60 %	20 %	0 %	488652666
2582	NC_021176	GTCA	2	8	120410	120417	25 %	25 %	25 %	25 %	488652666
2583	NC_021176	GAC	2	6	120545	120550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652666
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2586	NC_021176	GCC	2	6	120596	120601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652666
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2589	NC_021176	AGT	2	6	120684	120689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652666
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2591	NC_021176	GCTG	2	8	120937	120944	0 %	25 %	50 %	25 %	488652666
2592	NC_021176	TGT	2	6	121060	121065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652667
2593	NC_021176	CTG	2	6	121083	121088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652667
2594	NC_021176	GCG	2	6	121092	121097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
2595	NC_021176	GGC	2	6	121176	121181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
2596	NC_021176	CGG	2	6	121211	121216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
2597	NC_021176	GCG	2	6	121225	121230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
2598	NC_021176	CGA	2	6	121256	121261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652667
2599	NC_021176	GCA	2	6	121287	121292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652667
2600	NC_021176	GCC	2	6	121326	121331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652667
2601	NC_021176	GC	5	10	121387	121396	0 %	0 %	50 %	50 %	488652667
2602	NC_021176	CAC	2	6	121524	121529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652667
2603	NC_021176	GCT	2	6	121586	121591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652667
2604	NC_021176	CTGG	2	8	121593	121600	0 %	25 %	50 %	25 %	488652667
2605	NC_021176	TGC	2	6	121627	121632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652667
2606	NC_021176	GTT	2	6	121640	121645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652667
2607	NC_021176	CAC	2	6	121731	121736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652667
2608	NC_021176	CGC	2	6	121892	121897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652667
2609	NC_021176	CAC	2	6	121905	121910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652667
2610	NC_021176	CGG	2	6	121970	121975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
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2613	NC_021176	GGC	2	6	122050	122055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
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2618	NC_021176	CGG	2	6	122183	122188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
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2624	NC_021176	GCG	2	6	122482	122487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652667
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2992	NC_021176	GAC	2	6	139475	139480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2993	NC_021176	CAGG	2	8	139545	139552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2994	NC_021176	CCCAA	2	10	139584	139593	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2995	NC_021176	ATC	2	6	139595	139600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_021176	T	8	8	139609	139616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_021176	AAAGC	2	10	139812	139821	60 %	0 %	20 %	20 %	488652682
2998	NC_021176	CTG	2	6	140022	140027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652682
2999	NC_021176	CCG	2	6	140124	140129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652682
3000	NC_021176	TCG	2	6	140173	140178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652682

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