MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2132	NC_021176	AATG	2	8	98981	98988	50 %	25 %	25 %	0 %	488652648
2133	NC_021176	TGG	2	6	99067	99072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652648
2134	NC_021176	GAT	2	6	99074	99079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652648
2135	NC_021176	CTG	2	6	99084	99089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652648
2136	NC_021176	GCC	2	6	99090	99095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652648
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2140	NC_021176	GCGCT	2	10	99198	99207	0 %	20 %	40 %	40 %	488652648
2141	NC_021176	CG	3	6	99212	99217	0 %	0 %	50 %	50 %	488652648
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2143	NC_021176	CTG	2	6	99333	99338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652648
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2147	NC_021176	TGG	2	6	99448	99453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652648
2148	NC_021176	CTG	2	6	99471	99476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652648
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2151	NC_021176	GGCGC	2	10	99612	99621	0 %	0 %	60 %	40 %	488652648
2152	NC_021176	GGC	2	6	99686	99691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652648
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2160	NC_021176	GCGAC	2	10	99925	99934	20 %	0 %	40 %	40 %	488652648
2161	NC_021176	GCG	2	6	99963	99968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652648
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2164	NC_021176	GCTGGG	2	12	100178	100189	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	488652648
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2172	NC_021176	ACT	2	6	100497	100502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2240	NC_021176	CCCAA	2	10	104522	104531	40 %	0 %	0 %	60 %	488652654
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2252	NC_021176	CTT	2	6	105083	105088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652654
2253	NC_021176	CGA	2	6	105109	105114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652654
2254	NC_021176	GTT	2	6	105120	105125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652654
2255	NC_021176	ATC	2	6	105142	105147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652654
2256	NC_021176	TTGTT	2	10	105229	105238	0 %	80 %	20 %	0 %	488652654
2257	NC_021176	TCT	2	6	105293	105298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652654
2258	NC_021176	TGG	2	6	105346	105351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652654
2259	NC_021176	CGT	2	6	105362	105367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652654
2260	NC_021176	GCT	2	6	105374	105379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652654
2261	NC_021176	CCTG	2	8	105382	105389	0 %	25 %	25 %	50 %	488652654
2262	NC_021176	ACG	2	6	105442	105447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652654
2263	NC_021176	ATT	2	6	105450	105455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652654
2264	NC_021176	GAC	2	6	105456	105461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652654
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2267	NC_021176	TTC	2	6	105544	105549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652654
2268	NC_021176	ATCA	2	8	105595	105602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2269	NC_021176	GTT	2	6	105727	105732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652655
2270	NC_021176	AGC	2	6	105784	105789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652655
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2273	NC_021176	AT	3	6	105969	105974	50 %	50 %	0 %	0 %	488652655
2274	NC_021176	GCT	4	12	106037	106048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652655
2275	NC_021176	GTC	2	6	106157	106162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652655
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2277	NC_021176	TAG	2	6	106209	106214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652655
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2282	NC_021176	T	6	6	106541	106546	0 %	100 %	0 %	0 %	488652655
2283	NC_021176	CTG	2	6	106580	106585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652655
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2285	NC_021176	GTA	2	6	106763	106768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652655
2286	NC_021176	GCT	2	6	106799	106804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652655
2287	NC_021176	TGCGT	2	10	106890	106899	0 %	40 %	40 %	20 %	488652655
2288	NC_021176	TACT	2	8	106920	106927	25 %	50 %	0 %	25 %	488652655
2289	NC_021176	TGC	2	6	107010	107015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652655
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2291	NC_021176	CGG	2	6	107160	107165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652655
2292	NC_021176	TGG	2	6	107185	107190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652655
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2330	NC_021176	AAGCG	2	10	109086	109095	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2375	NC_021176	TCT	2	6	111037	111042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652658
2376	NC_021176	GGC	3	9	111054	111062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652658
2377	NC_021176	CGG	2	6	111101	111106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652658
2378	NC_021176	TTCGCG	2	12	111117	111128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652658
2379	NC_021176	GGT	2	6	111153	111158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652658
2380	NC_021176	CCA	2	6	111243	111248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652658
2381	NC_021176	CG	3	6	111328	111333	0 %	0 %	50 %	50 %	488652658
2382	NC_021176	CGGCAG	2	12	111375	111386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488652658
2383	NC_021176	TCA	2	6	111493	111498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652658
2384	NC_021176	GGC	2	6	111501	111506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652658
2385	NC_021176	CGT	2	6	111512	111517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652658
2386	NC_021176	TCG	2	6	111592	111597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652658
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2389	NC_021176	TGGCG	2	10	111750	111759	0 %	20 %	60 %	20 %	488652658
2390	NC_021176	CAG	3	9	111762	111770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652658
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2392	NC_021176	GAT	2	6	111845	111850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652658
2393	NC_021176	TCG	2	6	111856	111861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652658
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2399	NC_021176	GCA	2	6	112037	112042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652658
2400	NC_021176	GAT	2	6	112080	112085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652658
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2403	NC_021176	ATC	2	6	112129	112134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652658
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2406	NC_021176	CGA	2	6	112195	112200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652658
2407	NC_021176	CAT	2	6	112205	112210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652658
2408	NC_021176	GCTC	2	8	112283	112290	0 %	25 %	25 %	50 %	488652658
2409	NC_021176	AGCGC	2	10	112310	112319	20 %	0 %	40 %	40 %	488652658
2410	NC_021176	TCGA	2	8	112332	112339	25 %	25 %	25 %	25 %	488652658
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2412	NC_021176	TCT	2	6	112468	112473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652658
2413	NC_021176	GC	3	6	112563	112568	0 %	0 %	50 %	50 %	488652658
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2417	NC_021176	AGT	2	6	112896	112901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652659
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2447	NC_021176	GCA	2	6	114523	114528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652659
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2461	NC_021176	GCCA	2	8	115146	115153	25 %	0 %	25 %	50 %	488652659
2462	NC_021176	GCG	2	6	115174	115179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652659
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2464	NC_021176	GAT	2	6	115223	115228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2465	NC_021176	A	6	6	115238	115243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2472	NC_021176	ATC	2	6	115558	115563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652661
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2481	NC_021176	AC	3	6	116010	116015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2482	NC_021176	TGA	2	6	116020	116025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2483	NC_021176	A	7	7	116211	116217	100 %	0 %	0 %	0 %	488652662
2484	NC_021176	CAA	2	6	116262	116267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652662
2485	NC_021176	A	6	6	116345	116350	100 %	0 %	0 %	0 %	488652662
2486	NC_021176	GCC	2	6	116395	116400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652662
2487	NC_021176	TGGG	2	8	116435	116442	0 %	25 %	75 %	0 %	488652662
2488	NC_021176	TCAG	2	8	116494	116501	25 %	25 %	25 %	25 %	488652662
2489	NC_021176	GTTGAA	2	12	116532	116543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652662
2490	NC_021176	CA	3	6	116559	116564	50 %	0 %	0 %	50 %	488652662
2491	NC_021176	ACGGT	2	10	116620	116629	20 %	20 %	40 %	20 %	488652662
2492	NC_021176	ACCA	2	8	116632	116639	50 %	0 %	0 %	50 %	488652662
2493	NC_021176	CAG	2	6	116711	116716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652662
2494	NC_021176	GAT	2	6	116825	116830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652662
2495	NC_021176	CAG	2	6	116881	116886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652662
2496	NC_021176	GCC	2	6	116962	116967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652662
2497	NC_021176	TGGCG	2	10	116988	116997	0 %	20 %	60 %	20 %	488652662
2498	NC_021176	GAAA	2	8	117062	117069	75 %	0 %	25 %	0 %	488652662
2499	NC_021176	TG	3	6	117092	117097	0 %	50 %	50 %	0 %	488652662
2500	NC_021176	GCG	2	6	117153	117158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652662

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