MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_021176	AGA	2	6	69184	69189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652619
1503	NC_021176	T	7	7	69197	69203	0 %	100 %	0 %	0 %	488652619
1504	NC_021176	ACCG	2	8	69209	69216	25 %	0 %	25 %	50 %	488652619
1505	NC_021176	GAC	2	6	69338	69343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652619
1506	NC_021176	GATC	2	8	69355	69362	25 %	25 %	25 %	25 %	488652619
1507	NC_021176	GTC	2	6	69512	69517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652619
1508	NC_021176	ACGGC	2	10	69540	69549	20 %	0 %	40 %	40 %	488652619
1509	NC_021176	GC	3	6	69606	69611	0 %	0 %	50 %	50 %	488652619
1510	NC_021176	CTG	2	6	69618	69623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652619
1511	NC_021176	GCC	2	6	69650	69655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652619
1512	NC_021176	AC	3	6	69658	69663	50 %	0 %	0 %	50 %	488652619
1513	NC_021176	GGCA	2	8	69729	69736	25 %	0 %	50 %	25 %	488652620
1514	NC_021176	TGA	2	6	69755	69760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652620
1515	NC_021176	TCCA	2	8	69771	69778	25 %	25 %	0 %	50 %	488652620
1516	NC_021176	AG	3	6	69804	69809	50 %	0 %	50 %	0 %	488652620
1517	NC_021176	AGC	2	6	69818	69823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652620
1518	NC_021176	GCG	2	6	69832	69837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652620
1519	NC_021176	GGT	2	6	69846	69851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652620
1520	NC_021176	CG	3	6	69883	69888	0 %	0 %	50 %	50 %	488652620
1521	NC_021176	GC	3	6	69911	69916	0 %	0 %	50 %	50 %	488652620
1522	NC_021176	GGC	3	9	69945	69953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652620
1523	NC_021176	TCG	2	6	70004	70009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652621
1524	NC_021176	TGT	2	6	70015	70020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652621
1525	NC_021176	AGA	2	6	70094	70099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652621
1526	NC_021176	GTG	2	6	70185	70190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652621
1527	NC_021176	CGT	2	6	70238	70243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652621
1528	NC_021176	GTG	2	6	70246	70251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652621
1529	NC_021176	GCTGGA	2	12	70298	70309	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	488652621
1530	NC_021176	GGC	2	6	70370	70375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652621
1531	NC_021176	TGG	2	6	70435	70440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652621
1532	NC_021176	GGC	2	6	70451	70456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652621
1533	NC_021176	TGC	2	6	70528	70533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652621
1534	NC_021176	GCG	2	6	70536	70541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652621
1535	NC_021176	CG	3	6	70540	70545	0 %	0 %	50 %	50 %	488652621
1536	NC_021176	GCC	2	6	70557	70562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652621
1537	NC_021176	ATG	2	6	70564	70569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652621
1538	NC_021176	AAT	2	6	70587	70592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652621
1539	NC_021176	GAA	2	6	70593	70598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652621
1540	NC_021176	GAAG	2	8	70607	70614	50 %	0 %	50 %	0 %	488652621
1541	NC_021176	AAG	2	6	70708	70713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652621
1542	NC_021176	GCC	2	6	70737	70742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652621
1543	NC_021176	CGT	2	6	70772	70777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652621
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1545	NC_021176	GTG	2	6	70830	70835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652621
1546	NC_021176	AAGG	2	8	70864	70871	50 %	0 %	50 %	0 %	488652621
1547	NC_021176	CGT	2	6	71026	71031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652622
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1549	NC_021176	GTG	2	6	71078	71083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652622
1550	NC_021176	GTG	2	6	71206	71211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652622
1551	NC_021176	CGG	2	6	71301	71306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652622
1552	NC_021176	CGTGC	2	10	71361	71370	0 %	20 %	40 %	40 %	488652622
1553	NC_021176	CGA	2	6	71373	71378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652622
1554	NC_021176	TG	3	6	71461	71466	0 %	50 %	50 %	0 %	488652622
1555	NC_021176	CTGA	2	8	71473	71480	25 %	25 %	25 %	25 %	488652622
1556	NC_021176	TTGAT	2	10	71531	71540	20 %	60 %	20 %	0 %	488652622
1557	NC_021176	A	6	6	71570	71575	100 %	0 %	0 %	0 %	488652622
1558	NC_021176	GGC	2	6	71634	71639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652622
1559	NC_021176	TGG	2	6	71795	71800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652622
1560	NC_021176	GCT	2	6	71829	71834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652622
1561	NC_021176	CAT	2	6	71887	71892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652622
1562	NC_021176	CAAT	2	8	71907	71914	50 %	25 %	0 %	25 %	488652622
1563	NC_021176	GC	3	6	71972	71977	0 %	0 %	50 %	50 %	488652622
1564	NC_021176	TGA	2	6	72008	72013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652622
1565	NC_021176	TG	3	6	72032	72037	0 %	50 %	50 %	0 %	488652622
1566	NC_021176	GGC	2	6	72046	72051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652622
1567	NC_021176	GCA	2	6	72064	72069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652622
1568	NC_021176	ATT	2	6	72085	72090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652622
1569	NC_021176	ACCGC	2	10	72091	72100	20 %	0 %	20 %	60 %	488652622
1570	NC_021176	TGC	2	6	72237	72242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652622
1571	NC_021176	TGA	2	6	72254	72259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652622
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1574	NC_021176	GTG	2	6	72331	72336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652622
1575	NC_021176	TGA	2	6	72394	72399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652622
1576	NC_021176	CTG	2	6	72411	72416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652623
1577	NC_021176	GGA	2	6	72440	72445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652623
1578	NC_021176	GC	3	6	72456	72461	0 %	0 %	50 %	50 %	488652623
1579	NC_021176	GCC	2	6	72471	72476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652623
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1581	NC_021176	ATGG	2	8	72671	72678	25 %	25 %	50 %	0 %	488652623
1582	NC_021176	GGC	2	6	72748	72753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652623
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1584	NC_021176	CAG	2	6	72840	72845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652623
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1588	NC_021176	GCT	2	6	73011	73016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652624
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1590	NC_021176	TGGA	2	8	73129	73136	25 %	25 %	50 %	0 %	488652624
1591	NC_021176	T	6	6	73141	73146	0 %	100 %	0 %	0 %	488652624
1592	NC_021176	CAA	2	6	73155	73160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652624
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1595	NC_021176	TGC	2	6	73196	73201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652624
1596	NC_021176	CTG	2	6	73288	73293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652624
1597	NC_021176	CG	3	6	73317	73322	0 %	0 %	50 %	50 %	488652624
1598	NC_021176	TTG	2	6	73382	73387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652624
1599	NC_021176	GC	3	6	73463	73468	0 %	0 %	50 %	50 %	488652624
1600	NC_021176	CTG	2	6	73564	73569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652624
1601	NC_021176	TTG	2	6	73576	73581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652624
1602	NC_021176	ATG	2	6	73598	73603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652624
1603	NC_021176	TAC	2	6	73642	73647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652624
1604	NC_021176	GCA	3	9	73650	73658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652624
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1606	NC_021176	G	6	6	73698	73703	0 %	0 %	100 %	0 %	488652624
1607	NC_021176	GAT	2	6	73726	73731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652624
1608	NC_021176	TCT	2	6	73839	73844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_021176	TC	3	6	73850	73855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_021176	GGC	2	6	73947	73952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021176	GC	3	6	73959	73964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_021176	GCC	2	6	74082	74087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652625
1613	NC_021176	GGCGGG	2	12	74168	74179	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	488652625
1614	NC_021176	AGC	2	6	74202	74207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652625
1615	NC_021176	GAT	2	6	74223	74228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652625
1616	NC_021176	GCC	2	6	74287	74292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652625
1617	NC_021176	TAC	2	6	74318	74323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652625
1618	NC_021176	GAC	2	6	74331	74336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652625
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1621	NC_021176	ATT	2	6	74475	74480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652625
1622	NC_021176	CAC	2	6	74487	74492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652625
1623	NC_021176	CGGG	2	8	74646	74653	0 %	0 %	75 %	25 %	488652625
1624	NC_021176	TCG	2	6	74659	74664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652625
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