MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021176	CCG	2	6	45610	45615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652599
1003	NC_021176	GTG	2	6	45643	45648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652599
1004	NC_021176	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	488652599
1005	NC_021176	GC	3	6	45701	45706	0 %	0 %	50 %	50 %	488652599
1006	NC_021176	CAG	2	6	45742	45747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652599
1007	NC_021176	TGA	2	6	45786	45791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652599
1008	NC_021176	GCT	2	6	45867	45872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652599
1009	NC_021176	TAC	2	6	45937	45942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652599
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1011	NC_021176	ATC	2	6	46030	46035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021176	TGAC	2	8	46038	46045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_021176	A	6	6	46052	46057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021176	A	6	6	46086	46091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021176	TCA	2	6	46100	46105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021176	TA	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021176	TAG	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021176	GAA	2	6	46156	46161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021176	GA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021176	T	6	6	46204	46209	0 %	100 %	0 %	0 %	488652600
1021	NC_021176	AGC	2	6	46210	46215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652600
1022	NC_021176	CAT	2	6	46230	46235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652600
1023	NC_021176	TCA	2	6	46238	46243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652600
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1030	NC_021176	ACT	2	6	46532	46537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652600
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1039	NC_021176	CGG	2	6	46835	46840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652600
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1047	NC_021176	TTA	2	6	47255	47260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652600
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1049	NC_021176	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	488652600
1050	NC_021176	GAAGG	2	10	47360	47369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021176	GA	3	6	47407	47412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021176	TAT	2	6	47447	47452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652601
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1057	NC_021176	GCG	2	6	47759	47764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652601
1058	NC_021176	GTG	3	9	47765	47773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652601
1059	NC_021176	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	488652601
1060	NC_021176	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	488652601
1061	NC_021176	GCA	2	6	47884	47889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652601
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1063	NC_021176	GTT	2	6	48031	48036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652601
1064	NC_021176	TGA	2	6	48085	48090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652601
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1068	NC_021176	CGG	2	6	48258	48263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652601
1069	NC_021176	ACT	2	6	48285	48290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652601
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1071	NC_021176	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	488652602
1072	NC_021176	CCT	2	6	48456	48461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652602
1073	NC_021176	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	488652602
1074	NC_021176	CAG	2	6	48557	48562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652602
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1086	NC_021176	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	488652602
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1093	NC_021176	AGT	2	6	49759	49764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652602
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1098	NC_021176	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	488652602
1099	NC_021176	TGG	2	6	50214	50219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652602
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1101	NC_021176	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	488652602
1102	NC_021176	TTG	2	6	50390	50395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652602
1103	NC_021176	TGG	2	6	50407	50412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652602
1104	NC_021176	CCT	2	6	50415	50420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_021176	TCT	2	6	50479	50484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652603
1106	NC_021176	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	488652603
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1109	NC_021176	GGC	2	6	50816	50821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652603
1110	NC_021176	TGT	2	6	50836	50841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652603
1111	NC_021176	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	488652603
1112	NC_021176	CAT	2	6	50855	50860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652603
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1123	NC_021176	GC	3	6	51205	51210	0 %	0 %	50 %	50 %	488652603
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1246	NC_021176	GTG	2	6	57253	57258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_021176	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	488652609
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1253	NC_021176	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	488652609
1254	NC_021176	CGC	2	6	57544	57549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652609
1255	NC_021176	GGC	2	6	57604	57609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652609
1256	NC_021176	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	488652609
1257	NC_021176	TTG	2	6	57854	57859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652610
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1259	NC_021176	TCT	2	6	58001	58006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652610
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1261	NC_021176	GAA	2	6	58132	58137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652610
1262	NC_021176	G	6	6	58207	58212	0 %	0 %	100 %	0 %	488652610
1263	NC_021176	TGG	2	6	58220	58225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652610
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1274	NC_021176	CGC	2	6	58566	58571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652610
1275	NC_021176	GGC	3	9	58648	58656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652610
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1286	NC_021176	G	6	6	59505	59510	0 %	0 %	100 %	0 %	488652611
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1353	NC_021176	ACA	2	6	62831	62836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652614
1354	NC_021176	CGT	2	6	63038	63043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652614
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1357	NC_021176	TGG	2	6	63326	63331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652614
1358	NC_021176	GT	3	6	63387	63392	0 %	50 %	50 %	0 %	488652614
1359	NC_021176	TACT	2	8	63479	63486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1360	NC_021176	TTTC	2	8	63487	63494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1361	NC_021176	A	6	6	63497	63502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1362	NC_021176	CGG	2	6	63577	63582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652615
1363	NC_021176	CAG	2	6	63632	63637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652615
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1366	NC_021176	GCC	2	6	63780	63785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652615
1367	NC_021176	CAG	3	9	63812	63820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652615
1368	NC_021176	CCA	2	6	63940	63945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652615
1369	NC_021176	CAG	2	6	63986	63991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652615
1370	NC_021176	CGGCG	2	10	63992	64001	0 %	0 %	60 %	40 %	488652615
1371	NC_021176	GCA	3	9	64006	64014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652615
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1374	NC_021176	T	6	6	64051	64056	0 %	100 %	0 %	0 %	488652615
1375	NC_021176	GC	4	8	64117	64124	0 %	0 %	50 %	50 %	488652615
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1377	NC_021176	GCC	2	6	64170	64175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652615
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