MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021176	TGA	2	6	512076	512081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_021176	CCG	2	6	512092	512097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_021176	CCT	2	6	512102	512107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_021176	CGG	2	6	512167	512172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_021176	AGT	2	6	512184	512189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_021176	TGG	2	6	512190	512195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_021176	TGA	2	6	512197	512202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_021176	CCG	2	6	512213	512218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_021176	CCT	2	6	512223	512228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_021176	TG	3	6	512270	512275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_021176	TGTT	2	8	512329	512336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_021176	CGT	2	6	512337	512342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_021176	CGG	2	6	512574	512579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652994
11014	NC_021176	CG	3	6	512580	512585	0 %	0 %	50 %	50 %	488652994
11015	NC_021176	CAC	2	6	512617	512622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652994
11016	NC_021176	TGC	2	6	512636	512641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11017	NC_021176	CAT	2	6	512691	512696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652994
11018	NC_021176	CAT	2	6	512914	512919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652994
11019	NC_021176	CGA	2	6	512922	512927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11020	NC_021176	GTG	2	6	512938	512943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652994
11021	NC_021176	TGA	2	6	512979	512984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652994
11022	NC_021176	TCG	2	6	513039	513044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11023	NC_021176	TG	3	6	513073	513078	0 %	50 %	50 %	0 %	488652994
11024	NC_021176	GTG	3	9	513076	513084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652994
11025	NC_021176	GAC	2	6	513085	513090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11026	NC_021176	CAA	2	6	513135	513140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652994
11027	NC_021176	GAT	2	6	513207	513212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652994
11028	NC_021176	CGA	2	6	513219	513224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11029	NC_021176	CGGTG	2	10	513249	513258	0 %	20 %	60 %	20 %	488652994
11030	NC_021176	GCG	2	6	513335	513340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652994
11031	NC_021176	GAT	2	6	513366	513371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652994
11032	NC_021176	CGGTG	2	10	513387	513396	0 %	20 %	60 %	20 %	488652994
11033	NC_021176	CTG	2	6	513430	513435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11034	NC_021176	ACC	2	6	513443	513448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652994
11035	NC_021176	GCG	2	6	513646	513651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652994
11036	NC_021176	A	6	6	513652	513657	100 %	0 %	0 %	0 %	488652994
11037	NC_021176	GTG	2	6	513691	513696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652994
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11040	NC_021176	CGG	2	6	513761	513766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652994
11041	NC_021176	GCA	2	6	513878	513883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11042	NC_021176	CAA	2	6	513894	513899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652994
11043	NC_021176	CAG	2	6	513931	513936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652994
11044	NC_021176	GGCAG	2	10	513962	513971	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11045	NC_021176	TAT	2	6	513984	513989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_021176	TTCCTG	2	12	514068	514079	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	488652995
11047	NC_021176	AAT	2	6	514104	514109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652995
11048	NC_021176	GCAG	2	8	514177	514184	25 %	0 %	50 %	25 %	488652995
11049	NC_021176	GTT	2	6	514292	514297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652995
11050	NC_021176	CAGC	2	8	514343	514350	25 %	0 %	25 %	50 %	488652995
11051	NC_021176	ATT	2	6	514386	514391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652996
11052	NC_021176	CACG	2	8	514437	514444	25 %	0 %	25 %	50 %	488652996
11053	NC_021176	GA	3	6	514447	514452	50 %	0 %	50 %	0 %	488652996
11054	NC_021176	AGC	2	6	514502	514507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652996
11055	NC_021176	AT	3	6	514580	514585	50 %	50 %	0 %	0 %	488652996
11056	NC_021176	CTT	2	6	514662	514667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652996
11057	NC_021176	TTC	2	6	514720	514725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652996
11058	NC_021176	ACT	2	6	514829	514834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_021176	ATG	2	6	514934	514939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_021176	GCATG	2	10	515000	515009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11061	NC_021176	CCA	2	6	515041	515046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_021176	GCATG	2	10	515118	515127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11063	NC_021176	CCA	2	6	515159	515164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_021176	CGTT	2	8	515244	515251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11065	NC_021176	GCT	2	6	515256	515261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_021176	TTA	2	6	515312	515317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_021176	TA	3	6	515329	515334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_021176	ATG	2	6	515335	515340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_021176	A	6	6	515378	515383	100 %	0 %	0 %	0 %	488652997
11070	NC_021176	CTGGC	2	10	515484	515493	0 %	20 %	40 %	40 %	488652997
11071	NC_021176	GCC	2	6	515533	515538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652997
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11073	NC_021176	AATG	2	8	515577	515584	50 %	25 %	25 %	0 %	488652997
11074	NC_021176	TGC	2	6	515617	515622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652997
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11076	NC_021176	CCAA	2	8	515704	515711	50 %	0 %	0 %	50 %	488652997
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11081	NC_021176	GC	4	8	516365	516372	0 %	0 %	50 %	50 %	488652997
11082	NC_021176	GT	3	6	516408	516413	0 %	50 %	50 %	0 %	488652997
11083	NC_021176	GCT	3	9	516509	516517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652997
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11085	NC_021176	AT	3	6	516599	516604	50 %	50 %	0 %	0 %	488652997
11086	NC_021176	TAA	2	6	516617	516622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652997
11087	NC_021176	GCTG	2	8	516730	516737	0 %	25 %	50 %	25 %	488652997
11088	NC_021176	GAC	2	6	516806	516811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652997
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11090	NC_021176	GCGCG	2	10	516854	516863	0 %	0 %	60 %	40 %	488652997
11091	NC_021176	CGA	2	6	516938	516943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652997
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11093	NC_021176	CGG	2	6	517057	517062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652997
11094	NC_021176	GCT	2	6	517103	517108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652997
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11097	NC_021176	TC	3	6	517204	517209	0 %	50 %	0 %	50 %	488652997
11098	NC_021176	TGA	2	6	517271	517276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652997
11099	NC_021176	CAT	2	6	517328	517333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652997
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11103	NC_021176	CGT	2	6	517433	517438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652997
11104	NC_021176	TTG	2	6	517447	517452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652997
11105	NC_021176	GCC	2	6	517519	517524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652997
11106	NC_021176	A	7	7	517552	517558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_021176	AAT	2	6	517723	517728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652998
11108	NC_021176	GA	3	6	517791	517796	50 %	0 %	50 %	0 %	488652998
11109	NC_021176	CAT	2	6	517822	517827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652998
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11112	NC_021176	CGC	2	6	518035	518040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652998
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11118	NC_021176	T	7	7	518718	518724	0 %	100 %	0 %	0 %	488652998
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11122	NC_021176	AC	4	8	518874	518881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11123	NC_021176	TAA	2	6	518884	518889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_021176	TACTG	2	10	518934	518943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11125	NC_021176	ATGAAA	2	12	518947	518958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_021176	TGAC	2	8	519143	519150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11240	NC_021176	GCA	2	6	524216	524221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653003
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11368	NC_021176	CAT	2	6	530328	530333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11370	NC_021176	TCA	2	6	530379	530384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11386	NC_021176	ATT	2	6	531173	531178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11489	NC_021176	GTG	2	6	536233	536238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653012
11490	NC_021176	GAT	2	6	536263	536268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653012
11491	NC_021176	ATG	2	6	536274	536279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653012
11492	NC_021176	TGAT	2	8	536295	536302	25 %	50 %	25 %	0 %	488653013
11493	NC_021176	GCAG	2	8	536344	536351	25 %	0 %	50 %	25 %	488653013
11494	NC_021176	CGTG	2	8	536359	536366	0 %	25 %	50 %	25 %	488653013
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11499	NC_021176	CAG	2	6	536669	536674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653013
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