MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021176	CGCC	2	8	22660	22667	0 %	0 %	25 %	75 %	488652579
502	NC_021176	GGC	2	6	22686	22691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652579
503	NC_021176	AGA	2	6	22706	22711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652579
504	NC_021176	CGG	2	6	22748	22753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652579
505	NC_021176	T	6	6	22758	22763	0 %	100 %	0 %	0 %	488652579
506	NC_021176	CT	3	6	22800	22805	0 %	50 %	0 %	50 %	488652579
507	NC_021176	GGT	2	6	22953	22958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652579
508	NC_021176	CTA	2	6	22960	22965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652579
509	NC_021176	CGG	2	6	23000	23005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652579
510	NC_021176	CTGG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	488652579
511	NC_021176	TAT	2	6	23031	23036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652579
512	NC_021176	GCT	2	6	23037	23042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652579
513	NC_021176	ATA	2	6	23057	23062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652579
514	NC_021176	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021176	TCTTAA	2	12	23209	23220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_021176	TTAT	2	8	23271	23278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021176	A	7	7	23344	23350	100 %	0 %	0 %	0 %	488652580
518	NC_021176	TGA	2	6	23351	23356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652580
519	NC_021176	ACG	2	6	23357	23362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652580
520	NC_021176	ATA	2	6	23375	23380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652580
521	NC_021176	TTA	2	6	23389	23394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652580
522	NC_021176	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	488652580
523	NC_021176	T	6	6	23405	23410	0 %	100 %	0 %	0 %	488652580
524	NC_021176	CAG	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652580
525	NC_021176	TTG	2	6	23458	23463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652580
526	NC_021176	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	488652580
527	NC_021176	ATG	2	6	23519	23524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652580
528	NC_021176	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	488652580
529	NC_021176	TGA	2	6	23571	23576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652580
530	NC_021176	AT	3	6	23588	23593	50 %	50 %	0 %	0 %	488652580
531	NC_021176	CG	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	488652580
532	NC_021176	ACG	2	6	23759	23764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652580
533	NC_021176	TGA	2	6	23795	23800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652580
534	NC_021176	GC	4	8	23801	23808	0 %	0 %	50 %	50 %	488652580
535	NC_021176	GCT	2	6	23853	23858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652580
536	NC_021176	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	488652580
537	NC_021176	A	7	7	23973	23979	100 %	0 %	0 %	0 %	488652580
538	NC_021176	GGC	2	6	24005	24010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652580
539	NC_021176	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021176	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021176	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021176	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021176	ACA	2	6	24201	24206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021176	GAT	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021176	TAA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021176	TAA	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021176	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021176	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021176	T	6	6	24369	24374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021176	GAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021176	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021176	A	6	6	24429	24434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021176	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	488652581
554	NC_021176	TGT	2	6	24525	24530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652581
555	NC_021176	TAC	2	6	24547	24552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652581
556	NC_021176	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	488652581
557	NC_021176	CGC	2	6	24598	24603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652581
558	NC_021176	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	488652581
559	NC_021176	GGC	2	6	24685	24690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652581
560	NC_021176	AGA	2	6	24700	24705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652581
561	NC_021176	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	488652581
562	NC_021176	GCG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652581
563	NC_021176	CAG	2	6	24773	24778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652581
564	NC_021176	CGA	2	6	24828	24833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652581
565	NC_021176	T	7	7	25029	25035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021176	CG	3	6	25068	25073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_021176	A	8	8	25119	25126	100 %	0 %	0 %	0 %	488652582
568	NC_021176	ATT	2	6	25145	25150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652582
569	NC_021176	CTG	2	6	25155	25160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652582
570	NC_021176	CGG	2	6	25162	25167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652582
571	NC_021176	CCT	2	6	25249	25254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652582
572	NC_021176	ATT	2	6	25260	25265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652582
573	NC_021176	TTC	2	6	25268	25273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652582
574	NC_021176	T	7	7	25285	25291	0 %	100 %	0 %	0 %	488652582
575	NC_021176	CGC	2	6	25348	25353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652582
576	NC_021176	CT	3	6	25354	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	488652582
577	NC_021176	A	6	6	25374	25379	100 %	0 %	0 %	0 %	488652582
578	NC_021176	AT	3	6	25384	25389	50 %	50 %	0 %	0 %	488652582
579	NC_021176	TAT	2	6	25394	25399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652582
580	NC_021176	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	488652582
581	NC_021176	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	488652582
582	NC_021176	TAC	2	6	25635	25640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652582
583	NC_021176	A	6	6	25671	25676	100 %	0 %	0 %	0 %	488652582
584	NC_021176	CCG	2	6	25695	25700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652582
585	NC_021176	ACG	2	6	25770	25775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652582
586	NC_021176	ATG	2	6	25799	25804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652582
587	NC_021176	GCGCCT	2	12	25891	25902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488652583
588	NC_021176	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	488652583
589	NC_021176	GGC	2	6	25992	25997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
590	NC_021176	GAC	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
591	NC_021176	GC	3	6	26087	26092	0 %	0 %	50 %	50 %	488652583
592	NC_021176	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	488652583
593	NC_021176	GGC	3	9	26184	26192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
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596	NC_021176	GGC	2	6	26283	26288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
597	NC_021176	GGC	2	6	26401	26406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
598	NC_021176	ACT	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652583
599	NC_021176	GCG	2	6	26498	26503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
600	NC_021176	AGCGAC	2	12	26512	26523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
601	NC_021176	GCA	2	6	26526	26531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
602	NC_021176	ATT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652583
603	NC_021176	CCTT	2	8	26622	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	488652583
604	NC_021176	GAC	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
605	NC_021176	CAT	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021176	GCC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_021176	CCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_021176	GCG	2	6	26819	26824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021176	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_021176	GGC	2	6	26912	26917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021176	GCG	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021176	TAG	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021176	TCAG	2	8	26981	26988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_021176	GCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021176	ATA	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021176	GAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021176	ATT	2	6	27347	27352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021176	TAT	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021176	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021176	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_021176	TTA	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021176	TGA	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021176	TTG	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021176	ACA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021176	ATG	3	9	27620	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021176	ACT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021176	ACA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021176	GCG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021176	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021176	GCG	2	6	27890	27895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021176	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021176	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_021176	CG	3	6	28017	28022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_021176	GGT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021176	CGA	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021176	TGA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021176	TGA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021176	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
639	NC_021176	GC	3	6	28145	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_021176	GCGT	2	8	28181	28188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
641	NC_021176	ACGGTG	2	12	28237	28248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
642	NC_021176	TTG	2	6	28271	28276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_021176	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
644	NC_021176	ATC	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_021176	TC	3	6	28377	28382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_021176	TCC	2	6	28384	28389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_021176	CTG	2	6	28453	28458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652584
648	NC_021176	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	488652584
649	NC_021176	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	488652584
650	NC_021176	A	6	6	28595	28600	100 %	0 %	0 %	0 %	488652584
651	NC_021176	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	488652584
652	NC_021176	CCG	2	6	28631	28636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652584
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675	NC_021176	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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763	NC_021176	A	6	6	33930	33935	100 %	0 %	0 %	0 %	488652591
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