MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021176	GTG	2	6	254779	254784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652782
5503	NC_021176	TGG	2	6	254819	254824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652782
5504	NC_021176	CGC	2	6	254870	254875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652782
5505	NC_021176	AAT	2	6	254919	254924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652782
5506	NC_021176	CAG	2	6	254929	254934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652782
5507	NC_021176	CAG	2	6	254965	254970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652782
5508	NC_021176	GGC	2	6	254985	254990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652782
5509	NC_021176	TGA	2	6	254994	254999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652782
5510	NC_021176	GGC	2	6	255015	255020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652782
5511	NC_021176	GGC	2	6	255054	255059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652782
5512	NC_021176	CTG	2	6	255082	255087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652782
5513	NC_021176	GCGG	2	8	255113	255120	0 %	0 %	75 %	25 %	488652782
5514	NC_021176	GCA	2	6	255143	255148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652782
5515	NC_021176	TGG	2	6	255279	255284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652782
5516	NC_021176	GTC	2	6	255341	255346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652782
5517	NC_021176	CCA	2	6	255389	255394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652782
5518	NC_021176	TGA	2	6	255395	255400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652782
5519	NC_021176	ATCC	2	8	255469	255476	25 %	25 %	0 %	50 %	488652782
5520	NC_021176	TCAT	2	8	255485	255492	25 %	50 %	0 %	25 %	488652782
5521	NC_021176	ATGGC	2	10	255571	255580	20 %	20 %	40 %	20 %	488652782
5522	NC_021176	GC	3	6	255599	255604	0 %	0 %	50 %	50 %	488652782
5523	NC_021176	GC	3	6	255629	255634	0 %	0 %	50 %	50 %	488652782
5524	NC_021176	GC	3	6	255644	255649	0 %	0 %	50 %	50 %	488652782
5525	NC_021176	GGC	2	6	255708	255713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652782
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5527	NC_021176	GGAT	2	8	255818	255825	25 %	25 %	50 %	0 %	488652782
5528	NC_021176	TGA	2	6	255846	255851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652782
5529	NC_021176	CG	3	6	255873	255878	0 %	0 %	50 %	50 %	488652782
5530	NC_021176	AGA	2	6	255934	255939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021176	T	6	6	256006	256011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021176	T	6	6	256041	256046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021176	A	6	6	256219	256224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021176	TGT	2	6	256232	256237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021176	ATGG	2	8	256300	256307	25 %	25 %	50 %	0 %	488652783
5536	NC_021176	GTCC	2	8	256371	256378	0 %	25 %	25 %	50 %	488652783
5537	NC_021176	TGC	2	6	256395	256400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652783
5538	NC_021176	TAG	2	6	256437	256442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652783
5539	NC_021176	TG	3	6	256494	256499	0 %	50 %	50 %	0 %	488652783
5540	NC_021176	TAT	2	6	256551	256556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652783
5541	NC_021176	ATA	2	6	256625	256630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652783
5542	NC_021176	CGG	2	6	256662	256667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652783
5543	NC_021176	TGC	2	6	256724	256729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652783
5544	NC_021176	TGA	2	6	256743	256748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652783
5545	NC_021176	AG	3	6	256749	256754	50 %	0 %	50 %	0 %	488652783
5546	NC_021176	ACTTT	2	10	256866	256875	20 %	60 %	0 %	20 %	488652783
5547	NC_021176	CGT	2	6	256948	256953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652783
5548	NC_021176	CGG	2	6	256956	256961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652783
5549	NC_021176	TGA	2	6	256974	256979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652783
5550	NC_021176	T	7	7	257060	257066	0 %	100 %	0 %	0 %	488652784
5551	NC_021176	GCC	2	6	257070	257075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652784
5552	NC_021176	ATT	2	6	257089	257094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652784
5553	NC_021176	CGC	2	6	257148	257153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652784
5554	NC_021176	TGGC	2	8	257170	257177	0 %	25 %	50 %	25 %	488652784
5555	NC_021176	TG	3	6	257183	257188	0 %	50 %	50 %	0 %	488652784
5556	NC_021176	TTG	2	6	257215	257220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652784
5557	NC_021176	ATC	2	6	257228	257233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652784
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5559	NC_021176	TGG	2	6	257284	257289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652784
5560	NC_021176	CTG	2	6	257302	257307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652784
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5562	NC_021176	GC	3	6	257415	257420	0 %	0 %	50 %	50 %	488652784
5563	NC_021176	CGG	2	6	257583	257588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652784
5564	NC_021176	TGG	2	6	257675	257680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652784
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5571	NC_021176	CGT	2	6	258123	258128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652785
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5573	NC_021176	ATT	2	6	258168	258173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652785
5574	NC_021176	CTGG	2	8	258218	258225	0 %	25 %	50 %	25 %	488652785
5575	NC_021176	ATC	2	6	258231	258236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652785
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5580	NC_021176	CGTTAG	2	12	258682	258693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488652785
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5582	NC_021176	ATT	2	6	258792	258797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652785
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5585	NC_021176	TTA	2	6	259001	259006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652785
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5588	NC_021176	GTT	2	6	259178	259183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652785
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5590	NC_021176	AG	3	6	259223	259228	50 %	0 %	50 %	0 %	488652785
5591	NC_021176	TTAG	2	8	259229	259236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021176	GAA	2	6	259237	259242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_021176	ATA	2	6	259246	259251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021176	GCT	2	6	259284	259289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652786
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5596	NC_021176	CATT	2	8	259338	259345	25 %	50 %	0 %	25 %	488652786
5597	NC_021176	CTC	2	6	259381	259386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652786
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5605	NC_021176	GTG	2	6	259866	259871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652786
5606	NC_021176	CGT	2	6	259875	259880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652786
5607	NC_021176	GGCG	2	8	259911	259918	0 %	0 %	75 %	25 %	488652786
5608	NC_021176	CTA	2	6	259938	259943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652786
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5619	NC_021176	TACGG	2	10	260779	260788	20 %	20 %	40 %	20 %	488652786
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5621	NC_021176	GAC	2	6	260941	260946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652786
5622	NC_021176	GACG	2	8	261000	261007	25 %	0 %	50 %	25 %	488652786
5623	NC_021176	TAC	2	6	261061	261066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652786
5624	NC_021176	GTGG	2	8	261117	261124	0 %	25 %	75 %	0 %	488652786
5625	NC_021176	GGC	2	6	261163	261168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652786
5626	NC_021176	GGT	2	6	261202	261207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652786
5627	NC_021176	CGTG	2	8	261216	261223	0 %	25 %	50 %	25 %	488652786
5628	NC_021176	GAT	4	12	261289	261300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652786
5629	NC_021176	GAT	2	6	261337	261342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652786
5630	NC_021176	GGT	2	6	261349	261354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652786
5631	NC_021176	TTA	2	6	261383	261388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652786
5632	NC_021176	TCA	2	6	261401	261406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652786
5633	NC_021176	CCT	2	6	261434	261439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652786
5634	NC_021176	TCT	2	6	261440	261445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652786
5635	NC_021176	TCT	2	6	261584	261589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652786
5636	NC_021176	TTA	2	6	261801	261806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652787
5637	NC_021176	GCT	2	6	261846	261851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652787
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5639	NC_021176	A	6	6	261961	261966	100 %	0 %	0 %	0 %	488652787
5640	NC_021176	TCG	2	6	262106	262111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652787
5641	NC_021176	GAA	2	6	262119	262124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652787
5642	NC_021176	CAA	2	6	262127	262132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652787
5643	NC_021176	A	6	6	262161	262166	100 %	0 %	0 %	0 %	488652787
5644	NC_021176	TGG	2	6	262192	262197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652787
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5648	NC_021176	GCG	2	6	262491	262496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652788
5649	NC_021176	CG	3	6	262526	262531	0 %	0 %	50 %	50 %	488652788
5650	NC_021176	TAC	2	6	262550	262555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652788
5651	NC_021176	TGAT	2	8	262591	262598	25 %	50 %	25 %	0 %	488652788
5652	NC_021176	TCG	2	6	262699	262704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652788
5653	NC_021176	A	6	6	262706	262711	100 %	0 %	0 %	0 %	488652788
5654	NC_021176	TCCAG	2	10	262792	262801	20 %	20 %	20 %	40 %	488652788
5655	NC_021176	ATT	2	6	262881	262886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652788
5656	NC_021176	ACC	2	6	262914	262919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652788
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5658	NC_021176	ATT	2	6	262965	262970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652788
5659	NC_021176	CGT	2	6	262997	263002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652788
5660	NC_021176	GGC	2	6	263079	263084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652788
5661	NC_021176	CTC	2	6	263180	263185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652788
5662	NC_021176	CAA	2	6	263204	263209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652788
5663	NC_021176	CTG	2	6	263224	263229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652788
5664	NC_021176	TGA	2	6	263236	263241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652788
5665	NC_021176	TGA	2	6	263246	263251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652788
5666	NC_021176	CAA	2	6	263292	263297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652788
5667	NC_021176	TTA	2	6	263369	263374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5668	NC_021176	ACT	2	6	263412	263417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652789
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5674	NC_021176	GGT	2	6	263720	263725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652789
5675	NC_021176	GAT	2	6	263738	263743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652789
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5677	NC_021176	ATG	2	6	263835	263840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652789
5678	NC_021176	TG	3	6	263839	263844	0 %	50 %	50 %	0 %	488652789
5679	NC_021176	TGAT	2	8	263869	263876	25 %	50 %	25 %	0 %	488652790
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5684	NC_021176	CAA	2	6	264275	264280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652790
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5686	NC_021176	ATC	2	6	264321	264326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652790
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5694	NC_021176	GC	3	6	264746	264751	0 %	0 %	50 %	50 %	488652791
5695	NC_021176	TTG	2	6	264849	264854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652791
5696	NC_021176	TTG	2	6	264878	264883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652791
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5699	NC_021176	CATT	2	8	265006	265013	25 %	50 %	0 %	25 %	488652791
5700	NC_021176	CCGT	2	8	265022	265029	0 %	25 %	25 %	50 %	488652791
5701	NC_021176	ATGCC	2	10	265164	265173	20 %	20 %	20 %	40 %	488652791
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5704	NC_021176	TGC	2	6	265308	265313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652791
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5707	NC_021176	GC	3	6	265436	265441	0 %	0 %	50 %	50 %	488652791
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5711	NC_021176	CTG	2	6	265604	265609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652791
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5717	NC_021176	TCG	2	6	265919	265924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652792
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5720	NC_021176	CG	3	6	266014	266019	0 %	0 %	50 %	50 %	488652792
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5723	NC_021176	GC	3	6	266076	266081	0 %	0 %	50 %	50 %	488652792
5724	NC_021176	GTG	2	6	266164	266169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652792
5725	NC_021176	GCG	2	6	266200	266205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652792
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5728	NC_021176	CAC	2	6	266344	266349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652792
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5999	NC_021176	CT	3	6	280020	280025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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