MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021176	ATA	2	6	210159	210164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021176	TGA	2	6	210166	210171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021176	TTGCG	2	10	210230	210239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4504	NC_021176	GATT	2	8	210302	210309	25 %	50 %	25 %	0 %	488652746
4505	NC_021176	TGG	2	6	210398	210403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652746
4506	NC_021176	ACT	2	6	210459	210464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652746
4507	NC_021176	TTG	2	6	210520	210525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652746
4508	NC_021176	TAG	2	6	210528	210533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652746
4509	NC_021176	ATT	2	6	210555	210560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652746
4510	NC_021176	ATT	2	6	210582	210587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652746
4511	NC_021176	AGG	2	6	210599	210604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652746
4512	NC_021176	GGC	2	6	210750	210755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652746
4513	NC_021176	CTG	2	6	211031	211036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652746
4514	NC_021176	GAAG	2	8	211040	211047	50 %	0 %	50 %	0 %	488652746
4515	NC_021176	CAG	2	6	211118	211123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652746
4516	NC_021176	AGGT	2	8	211147	211154	25 %	25 %	50 %	0 %	488652746
4517	NC_021176	CAT	2	6	211310	211315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652746
4518	NC_021176	GTA	2	6	211348	211353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652746
4519	NC_021176	CAT	2	6	211383	211388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652746
4520	NC_021176	GGC	2	6	211398	211403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652746
4521	NC_021176	TGT	2	6	211410	211415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652746
4522	NC_021176	T	6	6	211417	211422	0 %	100 %	0 %	0 %	488652746
4523	NC_021176	TAA	2	6	211451	211456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021176	ATT	2	6	211466	211471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652747
4525	NC_021176	GCT	2	6	211497	211502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652747
4526	NC_021176	GTC	2	6	211513	211518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652747
4527	NC_021176	T	6	6	211538	211543	0 %	100 %	0 %	0 %	488652747
4528	NC_021176	GCA	2	6	211588	211593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652747
4529	NC_021176	GTG	2	6	211637	211642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4530	NC_021176	GGT	2	6	211647	211652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4531	NC_021176	CAC	2	6	211659	211664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652747
4532	NC_021176	CCA	2	6	211681	211686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652747
4533	NC_021176	TTG	2	6	211716	211721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652747
4534	NC_021176	GTG	2	6	211748	211753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4535	NC_021176	C	7	7	211827	211833	0 %	0 %	0 %	100 %	488652747
4536	NC_021176	GGCG	2	8	211872	211879	0 %	0 %	75 %	25 %	488652747
4537	NC_021176	TGG	2	6	211883	211888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4538	NC_021176	ATCT	2	8	211911	211918	25 %	50 %	0 %	25 %	488652747
4539	NC_021176	GGT	2	6	212084	212089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652748
4540	NC_021176	CCG	2	6	212130	212135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652748
4541	NC_021176	CAT	2	6	212147	212152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652748
4542	NC_021176	GTT	2	6	212178	212183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652748
4543	NC_021176	CAG	2	6	212226	212231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4544	NC_021176	GTC	2	6	212268	212273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4545	NC_021176	TGC	2	6	212294	212299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4546	NC_021176	TGT	2	6	212303	212308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652748
4547	NC_021176	GCT	2	6	212345	212350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4548	NC_021176	ATT	2	6	212366	212371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652748
4549	NC_021176	T	6	6	212393	212398	0 %	100 %	0 %	0 %	488652748
4550	NC_021176	TTTTA	2	10	212441	212450	20 %	80 %	0 %	0 %	488652748
4551	NC_021176	ACG	2	6	212646	212651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4552	NC_021176	ATC	2	6	212673	212678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_021176	TGC	2	6	212788	212793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4554	NC_021176	GC	3	6	212792	212797	0 %	0 %	50 %	50 %	488652749
4555	NC_021176	TCG	2	6	212798	212803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4556	NC_021176	TGAGCC	2	12	212818	212829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4557	NC_021176	TGG	2	6	212886	212891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652749
4558	NC_021176	GTG	3	9	212957	212965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652749
4559	NC_021176	T	7	7	213031	213037	0 %	100 %	0 %	0 %	488652749
4560	NC_021176	TGG	2	6	213084	213089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652749
4561	NC_021176	CGC	2	6	213118	213123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652749
4562	NC_021176	TGC	2	6	213132	213137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4563	NC_021176	GCT	2	6	213224	213229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4564	NC_021176	TATT	2	8	213236	213243	25 %	75 %	0 %	0 %	488652749
4565	NC_021176	TTA	2	6	213276	213281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652750
4566	NC_021176	CTGG	2	8	213314	213321	0 %	25 %	50 %	25 %	488652750
4567	NC_021176	GTTGC	2	10	213334	213343	0 %	40 %	40 %	20 %	488652750
4568	NC_021176	GCTG	2	8	213372	213379	0 %	25 %	50 %	25 %	488652750
4569	NC_021176	TTC	2	6	213383	213388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652750
4570	NC_021176	TGT	2	6	213457	213462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652750
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4572	NC_021176	CGAT	2	8	213711	213718	25 %	25 %	25 %	25 %	488652750
4573	NC_021176	GCC	2	6	213728	213733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4574	NC_021176	GC	4	8	213740	213747	0 %	0 %	50 %	50 %	488652750
4575	NC_021176	GCGA	2	8	213852	213859	25 %	0 %	50 %	25 %	488652750
4576	NC_021176	GCT	2	6	213869	213874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652750
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4578	NC_021176	CTG	2	6	214017	214022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652750
4579	NC_021176	CCG	2	6	214050	214055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4580	NC_021176	CCG	2	6	214110	214115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4581	NC_021176	CAG	2	6	214118	214123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652750
4582	NC_021176	ATC	2	6	214160	214165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652750
4583	NC_021176	AGT	2	6	214276	214281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652750
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4585	NC_021176	TCA	2	6	214425	214430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652750
4586	NC_021176	CAT	2	6	214444	214449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652750
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4588	NC_021176	TTA	2	6	214659	214664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652750
4589	NC_021176	TTA	2	6	214701	214706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652750
4590	NC_021176	GTA	2	6	214712	214717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652750
4591	NC_021176	TTCAC	2	10	214764	214773	20 %	40 %	0 %	40 %	488652750
4592	NC_021176	CTGCAT	2	12	214808	214819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488652750
4593	NC_021176	GAG	2	6	214824	214829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652750
4594	NC_021176	TGGC	2	8	214832	214839	0 %	25 %	50 %	25 %	488652750
4595	NC_021176	CCT	2	6	214864	214869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652750
4596	NC_021176	GCC	2	6	214964	214969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4597	NC_021176	CGC	2	6	215005	215010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
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4599	NC_021176	ACA	2	6	215127	215132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652750
4600	NC_021176	CGC	2	6	215270	215275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4601	NC_021176	ATAC	2	8	215276	215283	50 %	25 %	0 %	25 %	488652750
4602	NC_021176	TCT	2	6	215502	215507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652750
4603	NC_021176	TCC	2	6	215508	215513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652750
4604	NC_021176	T	6	6	215516	215521	0 %	100 %	0 %	0 %	488652750
4605	NC_021176	T	7	7	215577	215583	0 %	100 %	0 %	0 %	488652750
4606	NC_021176	CAGG	2	8	215588	215595	25 %	0 %	50 %	25 %	488652750
4607	NC_021176	TTC	2	6	215835	215840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_021176	TTC	2	6	215877	215882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_021176	TCAA	2	8	215924	215931	50 %	25 %	0 %	25 %	488652751
4610	NC_021176	GAT	2	6	216005	216010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652751
4611	NC_021176	TGG	2	6	216030	216035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652751
4612	NC_021176	GTAG	2	8	216067	216074	25 %	25 %	50 %	0 %	488652751
4613	NC_021176	GAGTT	2	10	216099	216108	20 %	40 %	40 %	0 %	488652751
4614	NC_021176	GTA	2	6	216117	216122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652751
4615	NC_021176	TCGC	2	8	216137	216144	0 %	25 %	25 %	50 %	488652751
4616	NC_021176	GTT	2	6	216159	216164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652751
4617	NC_021176	CAG	2	6	216174	216179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652751
4618	NC_021176	TCT	2	6	216257	216262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652751
4619	NC_021176	AGA	2	6	216306	216311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652751
4620	NC_021176	GC	3	6	216333	216338	0 %	0 %	50 %	50 %	488652751
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4622	NC_021176	TCG	2	6	216437	216442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652751
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4750	NC_021176	CA	3	6	222415	222420	50 %	0 %	0 %	50 %	488652758
4751	NC_021176	CG	3	6	222422	222427	0 %	0 %	50 %	50 %	488652758
4752	NC_021176	GC	4	8	222503	222510	0 %	0 %	50 %	50 %	488652758
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4861	NC_021176	GGCGG	2	10	226772	226781	0 %	0 %	80 %	20 %	488652760
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4866	NC_021176	GCG	2	6	227196	227201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652760
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4902	NC_021176	GTA	2	6	228192	228197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4933	NC_021176	GGAAT	2	10	229483	229492	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4934	NC_021176	CGG	2	6	229510	229515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4944	NC_021176	GTC	2	6	230165	230170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4953	NC_021176	TGG	2	6	230691	230696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652761
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4993	NC_021176	GCC	2	6	232494	232499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652763
4994	NC_021176	TCG	2	6	232516	232521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652763
4995	NC_021176	GC	3	6	232522	232527	0 %	0 %	50 %	50 %	488652763
4996	NC_021176	GGCGT	2	10	232536	232545	0 %	20 %	60 %	20 %	488652763
4997	NC_021176	TGG	2	6	232588	232593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652763
4998	NC_021176	CCA	2	6	232637	232642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652763
4999	NC_021176	GCG	2	6	232702	232707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652763
5000	NC_021176	GCG	2	6	232735	232740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652763

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