MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 3141

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021155	CAAA	2	8	141428	141435	75 %	0 %	0 %	25 %	482907324
3002	NC_021155	CTG	2	6	141437	141442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907324
3003	NC_021155	TGC	2	6	141503	141508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907324
3004	NC_021155	ACA	2	6	141550	141555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907324
3005	NC_021155	TGT	2	6	141565	141570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907324
3006	NC_021155	TGT	2	6	141589	141594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907324
3007	NC_021155	TG	3	6	141634	141639	0 %	50 %	50 %	0 %	482907324
3008	NC_021155	TTC	2	6	141645	141650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907324
3009	NC_021155	CTTT	2	8	141691	141698	0 %	75 %	0 %	25 %	482907324
3010	NC_021155	ACG	2	6	141792	141797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907324
3011	NC_021155	GCCA	2	8	141854	141861	25 %	0 %	25 %	50 %	482907324
3012	NC_021155	CAG	2	6	141891	141896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907324
3013	NC_021155	GAC	2	6	142073	142078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907324
3014	NC_021155	CTG	2	6	142086	142091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907324
3015	NC_021155	T	6	6	142112	142117	0 %	100 %	0 %	0 %	482907324
3016	NC_021155	T	7	7	142214	142220	0 %	100 %	0 %	0 %	482907324
3017	NC_021155	AGG	2	6	142241	142246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907324
3018	NC_021155	CCAT	2	8	142291	142298	25 %	25 %	0 %	50 %	482907324
3019	NC_021155	GAC	2	6	142349	142354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907324
3020	NC_021155	GTTT	2	8	142432	142439	0 %	75 %	25 %	0 %	482907324
3021	NC_021155	T	7	7	142437	142443	0 %	100 %	0 %	0 %	482907324
3022	NC_021155	ACGAT	2	10	142492	142501	40 %	20 %	20 %	20 %	482907324
3023	NC_021155	GGCA	2	8	142565	142572	25 %	0 %	50 %	25 %	482907324
3024	NC_021155	TGCC	2	8	142827	142834	0 %	25 %	25 %	50 %	482907324
3025	NC_021155	CAA	2	6	142985	142990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907324
3026	NC_021155	GTT	2	6	143015	143020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907324
3027	NC_021155	GAA	3	9	143029	143037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907324
3028	NC_021155	GTCAT	2	10	143059	143068	20 %	40 %	20 %	20 %	482907324
3029	NC_021155	CGAA	2	8	143099	143106	50 %	0 %	25 %	25 %	482907324
3030	NC_021155	CAA	2	6	143208	143213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907325
3031	NC_021155	AACA	2	8	143254	143261	75 %	0 %	0 %	25 %	482907325
3032	NC_021155	CAT	2	6	143307	143312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907325
3033	NC_021155	TGC	2	6	143341	143346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907325
3034	NC_021155	T	6	6	143389	143394	0 %	100 %	0 %	0 %	482907325
3035	NC_021155	GA	3	6	143418	143423	50 %	0 %	50 %	0 %	482907325
3036	NC_021155	TCTT	2	8	143466	143473	0 %	75 %	0 %	25 %	482907325
3037	NC_021155	TCAC	2	8	143483	143490	25 %	25 %	0 %	50 %	482907325
3038	NC_021155	CAT	2	6	143621	143626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021155	TGA	2	6	143679	143684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021155	GA	3	6	143710	143715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021155	A	6	6	143733	143738	100 %	0 %	0 %	0 %	482907326
3042	NC_021155	GAT	2	6	143748	143753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907326
3043	NC_021155	GCT	2	6	143772	143777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907326
3044	NC_021155	TGA	2	6	143843	143848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907326
3045	NC_021155	ATT	2	6	143850	143855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907326
3046	NC_021155	GA	3	6	143929	143934	50 %	0 %	50 %	0 %	482907326
3047	NC_021155	ATT	2	6	143949	143954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907326
3048	NC_021155	TTC	2	6	143987	143992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907326
3049	NC_021155	AAC	2	6	144048	144053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907326
3050	NC_021155	CAT	2	6	144073	144078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_021155	ATG	2	6	144090	144095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021155	AATA	2	8	144103	144110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021155	TCC	2	6	144111	144116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_021155	GGC	2	6	144156	144161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907327
3055	NC_021155	AAT	2	6	144185	144190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907327
3056	NC_021155	CAA	2	6	144205	144210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907327
3057	NC_021155	TGC	2	6	144337	144342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907327
3058	NC_021155	CAG	2	6	144371	144376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907327
3059	NC_021155	CAG	2	6	144455	144460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907327
3060	NC_021155	AAT	2	6	144467	144472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907327
3061	NC_021155	ATT	2	6	144497	144502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907327
3062	NC_021155	ATCA	2	8	144536	144543	50 %	25 %	0 %	25 %	482907327
3063	NC_021155	TCA	2	6	144634	144639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
3064	NC_021155	GCTG	2	8	144640	144647	0 %	25 %	50 %	25 %	482907327
3065	NC_021155	TCA	2	6	144654	144659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
3066	NC_021155	TCA	2	6	144700	144705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
3067	NC_021155	CTT	2	6	144754	144759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907327
3068	NC_021155	GC	3	6	144848	144853	0 %	0 %	50 %	50 %	482907327
3069	NC_021155	GAT	2	6	144911	144916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907327
3070	NC_021155	CAG	2	6	144970	144975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907327
3071	NC_021155	TCA	2	6	144991	144996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
3072	NC_021155	GGA	2	6	145045	145050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021155	CAC	2	6	145120	145125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_021155	TC	3	6	145200	145205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_021155	GAC	2	6	145211	145216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_021155	GCG	2	6	145280	145285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_021155	AC	3	6	145329	145334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_021155	GAA	2	6	145372	145377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907328
3079	NC_021155	ACG	2	6	145380	145385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907328
3080	NC_021155	CAA	2	6	145389	145394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907328
3081	NC_021155	TGG	2	6	145402	145407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907328
3082	NC_021155	CAC	2	6	145417	145422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907328
3083	NC_021155	A	7	7	145468	145474	100 %	0 %	0 %	0 %	482907328
3084	NC_021155	TTC	2	6	145482	145487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907328
3085	NC_021155	TGG	2	6	145518	145523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907328
3086	NC_021155	ATAAA	2	10	145532	145541	80 %	20 %	0 %	0 %	482907328
3087	NC_021155	T	6	6	145548	145553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021155	ACA	2	6	145780	145785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907329
3089	NC_021155	CCG	2	6	145786	145791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
3090	NC_021155	CAC	2	6	145798	145803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907329
3091	NC_021155	TGT	3	9	145873	145881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907329
3092	NC_021155	CAG	2	6	145934	145939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907329
3093	NC_021155	GCC	2	6	146046	146051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
3094	NC_021155	CTG	2	6	146062	146067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907329
3095	NC_021155	GTG	2	6	146127	146132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907329
3096	NC_021155	TGCA	2	8	146150	146157	25 %	25 %	25 %	25 %	482907329
3097	NC_021155	ACC	2	6	146234	146239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907329
3098	NC_021155	TGGA	2	8	146288	146295	25 %	25 %	50 %	0 %	482907329
3099	NC_021155	TCCGG	2	10	146302	146311	0 %	20 %	40 %	40 %	482907329
3100	NC_021155	CCG	2	6	146329	146334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
3101	NC_021155	TCA	2	6	146361	146366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907329
3102	NC_021155	ATC	2	6	146435	146440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907329
3103	NC_021155	CAG	2	6	146498	146503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907329
3104	NC_021155	GAC	2	6	146560	146565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907329
3105	NC_021155	ACA	2	6	146619	146624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907329
3106	NC_021155	GCT	2	6	146750	146755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907329
3107	NC_021155	ACATC	2	10	146778	146787	40 %	20 %	0 %	40 %	482907329
3108	NC_021155	CAC	3	9	146803	146811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907329
3109	NC_021155	CCGG	2	8	146833	146840	0 %	0 %	50 %	50 %	482907329
3110	NC_021155	TTC	2	6	146951	146956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907329
3111	NC_021155	GCC	2	6	147096	147101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
3112	NC_021155	GGCG	2	8	147178	147185	0 %	0 %	75 %	25 %	482907329
3113	NC_021155	CGTTC	2	10	147250	147259	0 %	40 %	20 %	40 %	482907330
3114	NC_021155	AAG	2	6	147288	147293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907330
3115	NC_021155	CCAG	2	8	147542	147549	25 %	0 %	25 %	50 %	482907330
3116	NC_021155	GA	3	6	147567	147572	50 %	0 %	50 %	0 %	482907330
3117	NC_021155	ATC	2	6	147574	147579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907330
3118	NC_021155	GCT	2	6	147584	147589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907331
3119	NC_021155	TAA	2	6	147617	147622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907331
3120	NC_021155	CCGG	2	8	147657	147664	0 %	0 %	50 %	50 %	482907331
3121	NC_021155	TAT	2	6	147739	147744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907331
3122	NC_021155	T	6	6	147786	147791	0 %	100 %	0 %	0 %	482907331
3123	NC_021155	GCA	2	6	147799	147804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907331
3124	NC_021155	CA	3	6	147881	147886	50 %	0 %	0 %	50 %	482907331
3125	NC_021155	GCC	2	6	147946	147951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907331
3126	NC_021155	T	7	7	147959	147965	0 %	100 %	0 %	0 %	482907331
3127	NC_021155	AGGC	2	8	148035	148042	25 %	0 %	50 %	25 %	482907331
3128	NC_021155	TAC	2	6	148114	148119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907331
3129	NC_021155	TTC	2	6	148175	148180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907331
3130	NC_021155	ATG	2	6	148245	148250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907331
3131	NC_021155	ATT	2	6	148254	148259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907331
3132	NC_021155	GGA	2	6	148271	148276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021155	CAGAC	2	10	148279	148288	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3134	NC_021155	GGA	2	6	148414	148419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907332
3135	NC_021155	CTG	2	6	148446	148451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907332
3136	NC_021155	ATC	2	6	148482	148487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907332
3137	NC_021155	TG	3	6	148526	148531	0 %	50 %	50 %	0 %	482907332
3138	NC_021155	TCA	2	6	148570	148575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907333
3139	NC_021155	T	6	6	148584	148589	0 %	100 %	0 %	0 %	482907333
3140	NC_021155	TTC	2	6	148593	148598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907333
3141	NC_021155	CCT	2	6	148616	148621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907333

< Previous1234567Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.