MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 3141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021155	TA	3	6	24074	24079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021155	GTGA	2	8	24087	24094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021155	TGTCA	2	10	24098	24107	20 %	40 %	20 %	20 %	482907172
504	NC_021155	GGA	2	6	24122	24127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907172
505	NC_021155	CAT	2	6	24137	24142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907172
506	NC_021155	ACGGC	2	10	24158	24167	20 %	0 %	40 %	40 %	482907172
507	NC_021155	GCC	2	6	24175	24180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907172
508	NC_021155	CTGC	2	8	24361	24368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_021155	GTG	2	6	24431	24436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021155	ATC	2	6	24437	24442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021155	CGT	2	6	24518	24523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021155	T	6	6	24531	24536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021155	CAA	2	6	24559	24564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021155	ATG	2	6	24601	24606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021155	TCA	2	6	24723	24728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907173
516	NC_021155	T	6	6	24737	24742	0 %	100 %	0 %	0 %	482907173
517	NC_021155	ATCT	2	8	24745	24752	25 %	50 %	0 %	25 %	482907173
518	NC_021155	GCT	2	6	24862	24867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907173
519	NC_021155	ACC	2	6	24923	24928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907173
520	NC_021155	CAT	2	6	24933	24938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021155	T	6	6	24946	24951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021155	TGGG	2	8	24971	24978	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021155	TCC	2	6	24994	24999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_021155	GAA	2	6	25020	25025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021155	GCAA	2	8	25044	25051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_021155	GAAA	2	8	25055	25062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021155	T	6	6	25090	25095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021155	A	7	7	25114	25120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021155	T	6	6	25347	25352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021155	TCT	2	6	25355	25360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021155	ATA	2	6	25432	25437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021155	TAT	2	6	25465	25470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021155	T	6	6	25472	25477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021155	T	6	6	25496	25501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021155	TATT	2	8	25519	25526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021155	T	6	6	25525	25530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021155	T	6	6	25532	25537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021155	AT	3	6	25539	25544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021155	TTGCA	2	10	25567	25576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
540	NC_021155	T	6	6	25587	25592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021155	TATG	2	8	25620	25627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021155	ATTT	2	8	25679	25686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021155	AAAC	2	8	25728	25735	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_021155	TA	3	6	25741	25746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021155	GTTT	2	8	25761	25768	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021155	ATG	2	6	25818	25823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907174
547	NC_021155	ATT	3	9	25843	25851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907174
548	NC_021155	AAG	2	6	25880	25885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907174
549	NC_021155	ATC	2	6	25943	25948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907174
550	NC_021155	ATT	2	6	25965	25970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907174
551	NC_021155	GT	3	6	25999	26004	0 %	50 %	50 %	0 %	482907174
552	NC_021155	AAC	2	6	26037	26042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907174
553	NC_021155	TCAG	2	8	26080	26087	25 %	25 %	25 %	25 %	482907174
554	NC_021155	GTT	2	6	26103	26108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907174
555	NC_021155	TAT	2	6	26109	26114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907174
556	NC_021155	TGT	2	6	26126	26131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021155	GC	3	6	26208	26213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_021155	TTA	2	6	26230	26235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021155	AT	3	6	26237	26242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021155	GGAA	2	8	26306	26313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021155	GCCA	2	8	26318	26325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_021155	AATGTG	2	12	26334	26345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021155	A	6	6	26367	26372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021155	TA	3	6	26388	26393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021155	ATT	2	6	26407	26412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907175
566	NC_021155	ATT	2	6	26419	26424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907175
567	NC_021155	CAA	2	6	26492	26497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907175
568	NC_021155	TGACC	2	10	26502	26511	20 %	20 %	20 %	40 %	482907175
569	NC_021155	GTT	2	6	26545	26550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907175
570	NC_021155	TTG	2	6	26588	26593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907175
571	NC_021155	CTG	2	6	26675	26680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907175
572	NC_021155	ACC	2	6	26818	26823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907175
573	NC_021155	GGT	2	6	26854	26859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907175
574	NC_021155	AAT	2	6	26909	26914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907175
575	NC_021155	TTTA	2	8	26940	26947	25 %	75 %	0 %	0 %	482907176
576	NC_021155	CCG	2	6	26962	26967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907176
577	NC_021155	TTA	2	6	27062	27067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021155	TCC	2	6	27103	27108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_021155	G	6	6	27130	27135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021155	TTG	2	6	27136	27141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907177
581	NC_021155	TCA	2	6	27149	27154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907177
582	NC_021155	CCGG	2	8	27294	27301	0 %	0 %	50 %	50 %	482907177
583	NC_021155	TAT	2	6	27306	27311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907177
584	NC_021155	GAA	2	6	27372	27377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907177
585	NC_021155	TGC	2	6	27464	27469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907177
586	NC_021155	CGG	2	6	27607	27612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907177
587	NC_021155	CTG	2	6	27813	27818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907177
588	NC_021155	GGC	2	6	27872	27877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907177
589	NC_021155	TGC	2	6	27898	27903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907177
590	NC_021155	GTG	2	6	28002	28007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907177
591	NC_021155	GAT	2	6	28029	28034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907177
592	NC_021155	TGG	2	6	28060	28065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907177
593	NC_021155	GGA	2	6	28073	28078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907177
594	NC_021155	ACC	3	9	28095	28103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907177
595	NC_021155	CAC	2	6	28115	28120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907177
596	NC_021155	GCT	2	6	28130	28135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907177
597	NC_021155	CGGT	2	8	28165	28172	0 %	25 %	50 %	25 %	482907177
598	NC_021155	A	6	6	28197	28202	100 %	0 %	0 %	0 %	482907177
599	NC_021155	CCA	2	6	28264	28269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907177
600	NC_021155	CGG	2	6	28310	28315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907177
601	NC_021155	GGC	2	6	28338	28343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907177
602	NC_021155	CCG	2	6	28357	28362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907177
603	NC_021155	ACA	2	6	28399	28404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907177
604	NC_021155	TACAG	2	10	28518	28527	40 %	20 %	20 %	20 %	482907177
605	NC_021155	ACA	2	6	28543	28548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907177
606	NC_021155	AGG	2	6	28618	28623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907177
607	NC_021155	ACT	2	6	28624	28629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907177
608	NC_021155	GAAAG	2	10	28637	28646	60 %	0 %	40 %	0 %	482907177
609	NC_021155	ACC	2	6	28674	28679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907177
610	NC_021155	GT	3	6	28690	28695	0 %	50 %	50 %	0 %	482907177
611	NC_021155	TGGG	2	8	28786	28793	0 %	25 %	75 %	0 %	482907177
612	NC_021155	CAG	2	6	28805	28810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907177
613	NC_021155	CAG	3	9	28826	28834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907177
614	NC_021155	ATG	2	6	28977	28982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907177
615	NC_021155	ACC	2	6	29004	29009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907177
616	NC_021155	TGA	3	9	29059	29067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907177
617	NC_021155	GC	3	6	29097	29102	0 %	0 %	50 %	50 %	482907177
618	NC_021155	CCA	2	6	29143	29148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907177
619	NC_021155	GTG	2	6	29166	29171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907177
620	NC_021155	ACC	2	6	29244	29249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907177
621	NC_021155	GTG	2	6	29259	29264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907177
622	NC_021155	TGC	2	6	29311	29316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907177
623	NC_021155	GACG	2	8	29343	29350	25 %	0 %	50 %	25 %	482907177
624	NC_021155	GC	3	6	29368	29373	0 %	0 %	50 %	50 %	482907177
625	NC_021155	CTG	2	6	29421	29426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907177
626	NC_021155	GC	3	6	29440	29445	0 %	0 %	50 %	50 %	482907177
627	NC_021155	G	6	6	29467	29472	0 %	0 %	100 %	0 %	482907177
628	NC_021155	AGG	2	6	29530	29535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907177
629	NC_021155	GAT	2	6	29550	29555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907178
630	NC_021155	CTG	2	6	29575	29580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907178
631	NC_021155	ACCA	2	8	29677	29684	50 %	0 %	0 %	50 %	482907178
632	NC_021155	GGC	2	6	29701	29706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907178
633	NC_021155	ACA	2	6	29720	29725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907178
634	NC_021155	GCA	2	6	29735	29740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907178
635	NC_021155	GCC	2	6	29763	29768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907178
636	NC_021155	CAT	2	6	29808	29813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907178
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639	NC_021155	CGG	2	6	30012	30017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907178
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655	NC_021155	GTA	2	6	30646	30651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907179
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666	NC_021155	TCA	2	6	31105	31110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_021155	TACCAA	2	12	31164	31175	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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670	NC_021155	TTG	2	6	31402	31407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_021155	ATG	2	6	31495	31500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
673	NC_021155	CACT	2	8	31564	31571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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675	NC_021155	ACT	2	6	31809	31814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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747	NC_021155	GGA	2	6	35879	35884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_021155	TGG	2	6	36337	36342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907186
762	NC_021155	CAA	2	6	36419	36424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907186
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765	NC_021155	GGT	2	6	36476	36481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907186
766	NC_021155	CTG	2	6	36489	36494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907186
767	NC_021155	TGA	2	6	36516	36521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907186
768	NC_021155	TCC	2	6	36548	36553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907187
769	NC_021155	CTG	3	9	36574	36582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907187
770	NC_021155	ATG	2	6	36651	36656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907187
771	NC_021155	CAC	3	9	36695	36703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
772	NC_021155	AGC	2	6	36731	36736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907188
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774	NC_021155	GGC	2	6	36761	36766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907188
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780	NC_021155	TGC	2	6	36958	36963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907188
781	NC_021155	CGG	2	6	37013	37018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907188
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786	NC_021155	CGGGGA	2	12	37167	37178	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	482907188
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795	NC_021155	GCG	2	6	37558	37563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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799	NC_021155	CGC	2	6	37809	37814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907189
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804	NC_021155	ATG	2	6	38251	38256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907190
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841	NC_021155	CTG	2	6	39726	39731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
842	NC_021155	CAT	2	6	39809	39814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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881	NC_021155	GCCA	2	8	41503	41510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
882	NC_021155	GACGA	2	10	41549	41558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
883	NC_021155	CTT	2	6	41580	41585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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889	NC_021155	CGT	2	6	41721	41726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907197
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892	NC_021155	CCT	2	6	41840	41845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
893	NC_021155	TAC	2	6	41877	41882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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