MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 9585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021151	GC	3	6	281	286	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
2	NC_021151	CT	3	6	811	816	0 %	50 %	0 %	50 %	482902550
3	NC_021151	TG	3	6	1123	1128	0 %	50 %	50 %	0 %	482902550
4	NC_021151	GC	3	6	1142	1147	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
5	NC_021151	CT	3	6	1960	1965	0 %	50 %	0 %	50 %	482902550
6	NC_021151	TC	3	6	1998	2003	0 %	50 %	0 %	50 %	482902550
7	NC_021151	GC	3	6	2020	2025	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
8	NC_021151	CG	3	6	2051	2056	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
9	NC_021151	CG	4	8	3209	3216	0 %	0 %	50 %	50 %	482902551
10	NC_021151	GC	3	6	3264	3269	0 %	0 %	50 %	50 %	482902551
11	NC_021151	CG	3	6	3668	3673	0 %	0 %	50 %	50 %	482902552
12	NC_021151	CG	3	6	3912	3917	0 %	0 %	50 %	50 %	482902552
13	NC_021151	CG	3	6	4368	4373	0 %	0 %	50 %	50 %	482902552
14	NC_021151	AG	3	6	4588	4593	50 %	0 %	50 %	0 %	482902552
15	NC_021151	TG	3	6	4854	4859	0 %	50 %	50 %	0 %	482902553
16	NC_021151	CG	3	6	4957	4962	0 %	0 %	50 %	50 %	482902553
17	NC_021151	CG	3	6	5176	5181	0 %	0 %	50 %	50 %	482902553
18	NC_021151	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	482902553
19	NC_021151	CG	3	6	5677	5682	0 %	0 %	50 %	50 %	482902554
20	NC_021151	GC	3	6	6595	6600	0 %	0 %	50 %	50 %	482902554
21	NC_021151	TC	3	6	7479	7484	0 %	50 %	0 %	50 %	482902555
22	NC_021151	CG	3	6	7566	7571	0 %	0 %	50 %	50 %	482902555
23	NC_021151	CG	3	6	7664	7669	0 %	0 %	50 %	50 %	482902555
24	NC_021151	CT	3	6	8157	8162	0 %	50 %	0 %	50 %	482902555
25	NC_021151	GC	3	6	8181	8186	0 %	0 %	50 %	50 %	482902555
26	NC_021151	TG	3	6	8607	8612	0 %	50 %	50 %	0 %	482902556
27	NC_021151	GC	3	6	9279	9284	0 %	0 %	50 %	50 %	482902557
28	NC_021151	CG	3	6	10239	10244	0 %	0 %	50 %	50 %	482902558
29	NC_021151	CG	3	6	12695	12700	0 %	0 %	50 %	50 %	482902560
30	NC_021151	GC	3	6	14256	14261	0 %	0 %	50 %	50 %	482902561
31	NC_021151	GA	3	6	14367	14372	50 %	0 %	50 %	0 %	482902561
32	NC_021151	AT	3	6	15078	15083	50 %	50 %	0 %	0 %	482902562
33	NC_021151	AT	3	6	15353	15358	50 %	50 %	0 %	0 %	482902562
34	NC_021151	AT	3	6	15606	15611	50 %	50 %	0 %	0 %	482902562
35	NC_021151	GA	3	6	16770	16775	50 %	0 %	50 %	0 %	482902565
36	NC_021151	GC	3	6	18072	18077	0 %	0 %	50 %	50 %	482902566
37	NC_021151	CT	3	6	20046	20051	0 %	50 %	0 %	50 %	482902567
38	NC_021151	GC	3	6	20362	20367	0 %	0 %	50 %	50 %	482902567
39	NC_021151	GC	3	6	20482	20487	0 %	0 %	50 %	50 %	482902567
40	NC_021151	GC	3	6	20887	20892	0 %	0 %	50 %	50 %	482902567
41	NC_021151	GC	3	6	21745	21750	0 %	0 %	50 %	50 %	482902567
42	NC_021151	CT	3	6	22500	22505	0 %	50 %	0 %	50 %	482902567
43	NC_021151	AT	3	6	23288	23293	50 %	50 %	0 %	0 %	482902568
44	NC_021151	CG	3	6	23358	23363	0 %	0 %	50 %	50 %	482902568
45	NC_021151	GC	4	8	23501	23508	0 %	0 %	50 %	50 %	482902568
46	NC_021151	AT	3	6	23762	23767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021151	CG	3	6	24770	24775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021151	CT	3	6	25056	25061	0 %	50 %	0 %	50 %	482902570
49	NC_021151	AT	3	6	25086	25091	50 %	50 %	0 %	0 %	482902570
50	NC_021151	GC	3	6	25789	25794	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
51	NC_021151	CG	3	6	27719	27724	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
52	NC_021151	GC	3	6	27847	27852	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
53	NC_021151	GC	3	6	27883	27888	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
54	NC_021151	TC	3	6	28079	28084	0 %	50 %	0 %	50 %	482902571
55	NC_021151	GT	3	6	28197	28202	0 %	50 %	50 %	0 %	482902572
56	NC_021151	GT	3	6	28326	28331	0 %	50 %	50 %	0 %	482902572
57	NC_021151	CT	3	6	29811	29816	0 %	50 %	0 %	50 %	482902574
58	NC_021151	AG	3	6	30080	30085	50 %	0 %	50 %	0 %	482902574
59	NC_021151	CG	3	6	30137	30142	0 %	0 %	50 %	50 %	482902574
60	NC_021151	AT	3	6	30238	30243	50 %	50 %	0 %	0 %	482902575
61	NC_021151	GC	3	6	30469	30474	0 %	0 %	50 %	50 %	482902575
62	NC_021151	GC	3	6	30759	30764	0 %	0 %	50 %	50 %	482902575
63	NC_021151	GT	3	6	32747	32752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021151	TC	3	6	33191	33196	0 %	50 %	0 %	50 %	482902579
65	NC_021151	AT	3	6	33441	33446	50 %	50 %	0 %	0 %	482902579
66	NC_021151	TA	3	6	33644	33649	50 %	50 %	0 %	0 %	482902579
67	NC_021151	AT	3	6	34140	34145	50 %	50 %	0 %	0 %	482902580
68	NC_021151	AT	3	6	34401	34406	50 %	50 %	0 %	0 %	482902580
69	NC_021151	AT	3	6	35147	35152	50 %	50 %	0 %	0 %	482902581
70	NC_021151	TG	4	8	35362	35369	0 %	50 %	50 %	0 %	482902581
71	NC_021151	GC	3	6	35955	35960	0 %	0 %	50 %	50 %	482902581
72	NC_021151	TA	3	6	36905	36910	50 %	50 %	0 %	0 %	482902582
73	NC_021151	AT	3	6	39221	39226	50 %	50 %	0 %	0 %	482902583
74	NC_021151	AT	3	6	39537	39542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021151	AT	3	6	39652	39657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021151	AT	5	10	39739	39748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021151	AT	3	6	39795	39800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021151	CG	3	6	40083	40088	0 %	0 %	50 %	50 %	482902584
79	NC_021151	CG	3	6	40771	40776	0 %	0 %	50 %	50 %	482902584
80	NC_021151	GT	3	6	41477	41482	0 %	50 %	50 %	0 %	482902585
81	NC_021151	TG	3	6	42507	42512	0 %	50 %	50 %	0 %	482902585
82	NC_021151	CG	3	6	43022	43027	0 %	0 %	50 %	50 %	482902586
83	NC_021151	TA	3	6	43395	43400	50 %	50 %	0 %	0 %	482902586
84	NC_021151	CA	3	6	44416	44421	50 %	0 %	0 %	50 %	482902587
85	NC_021151	CA	3	6	44708	44713	50 %	0 %	0 %	50 %	482902587
86	NC_021151	GC	3	6	45411	45416	0 %	0 %	50 %	50 %	482902587
87	NC_021151	TA	3	6	45816	45821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021151	GA	3	6	45883	45888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021151	TA	3	6	46515	46520	50 %	50 %	0 %	0 %	482902588
90	NC_021151	TG	3	6	46896	46901	0 %	50 %	50 %	0 %	482902588
91	NC_021151	GC	4	8	47035	47042	0 %	0 %	50 %	50 %	482902588
92	NC_021151	GA	3	6	47117	47122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021151	GA	3	6	47949	47954	50 %	0 %	50 %	0 %	482902589
94	NC_021151	CG	4	8	49016	49023	0 %	0 %	50 %	50 %	482902590
95	NC_021151	CG	3	6	49229	49234	0 %	0 %	50 %	50 %	482902590
96	NC_021151	TG	3	6	49847	49852	0 %	50 %	50 %	0 %	482902590
97	NC_021151	GC	3	6	50915	50920	0 %	0 %	50 %	50 %	482902591
98	NC_021151	GC	3	6	51215	51220	0 %	0 %	50 %	50 %	482902591
99	NC_021151	GC	3	6	52218	52223	0 %	0 %	50 %	50 %	482902592
100	NC_021151	GT	3	6	52625	52630	0 %	50 %	50 %	0 %	482902594
101	NC_021151	CG	3	6	52971	52976	0 %	0 %	50 %	50 %	482902594
102	NC_021151	CG	3	6	54059	54064	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
103	NC_021151	GC	3	6	54732	54737	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
104	NC_021151	CG	3	6	54806	54811	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
105	NC_021151	CG	3	6	55540	55545	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
106	NC_021151	CG	3	6	55795	55800	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
107	NC_021151	GC	3	6	56714	56719	0 %	0 %	50 %	50 %	482902596
108	NC_021151	GC	3	6	57590	57595	0 %	0 %	50 %	50 %	482902598
109	NC_021151	GC	4	8	57820	57827	0 %	0 %	50 %	50 %	482902598
110	NC_021151	CT	3	6	58810	58815	0 %	50 %	0 %	50 %	482902599
111	NC_021151	TG	3	6	60429	60434	0 %	50 %	50 %	0 %	482902600
112	NC_021151	TC	3	6	60833	60838	0 %	50 %	0 %	50 %	482902601
113	NC_021151	GC	3	6	62095	62100	0 %	0 %	50 %	50 %	482902602
114	NC_021151	AT	3	6	62770	62775	50 %	50 %	0 %	0 %	482902602
115	NC_021151	GC	3	6	64291	64296	0 %	0 %	50 %	50 %	482902603
116	NC_021151	GC	3	6	65935	65940	0 %	0 %	50 %	50 %	482902604
117	NC_021151	CG	3	6	66032	66037	0 %	0 %	50 %	50 %	482902604
118	NC_021151	GC	3	6	66439	66444	0 %	0 %	50 %	50 %	482902605
119	NC_021151	AT	3	6	67863	67868	50 %	50 %	0 %	0 %	482902606
120	NC_021151	GC	3	6	68742	68747	0 %	0 %	50 %	50 %	482902607
121	NC_021151	GC	3	6	69316	69321	0 %	0 %	50 %	50 %	482902607
122	NC_021151	AC	3	6	69368	69373	50 %	0 %	0 %	50 %	482902607
123	NC_021151	AG	3	6	69514	69519	50 %	0 %	50 %	0 %	482902608
124	NC_021151	CG	3	6	69593	69598	0 %	0 %	50 %	50 %	482902608
125	NC_021151	GC	3	6	69621	69626	0 %	0 %	50 %	50 %	482902608
126	NC_021151	CG	3	6	70250	70255	0 %	0 %	50 %	50 %	482902609
127	NC_021151	CG	3	6	70530	70535	0 %	0 %	50 %	50 %	482902609
128	NC_021151	TG	3	6	71171	71176	0 %	50 %	50 %	0 %	482902610
129	NC_021151	GC	3	6	71682	71687	0 %	0 %	50 %	50 %	482902610
130	NC_021151	CG	3	6	71917	71922	0 %	0 %	50 %	50 %	482902610
131	NC_021151	GC	3	6	71989	71994	0 %	0 %	50 %	50 %	482902610
132	NC_021151	GC	3	6	72166	72171	0 %	0 %	50 %	50 %	482902611
133	NC_021151	CG	3	6	73027	73032	0 %	0 %	50 %	50 %	482902612
134	NC_021151	GC	3	6	73173	73178	0 %	0 %	50 %	50 %	482902612
135	NC_021151	TC	3	6	73560	73565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021151	GC	3	6	73669	73674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021151	AT	3	6	74604	74609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021151	AT	3	6	75170	75175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021151	CT	3	6	75877	75882	0 %	50 %	0 %	50 %	482902615
140	NC_021151	GC	3	6	77045	77050	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
141	NC_021151	CG	3	6	77181	77186	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
142	NC_021151	CG	3	6	77657	77662	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
143	NC_021151	GC	5	10	78703	78712	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
144	NC_021151	CG	3	6	78763	78768	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
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