MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021151	GAA	2	6	164002	164007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902692
3502	NC_021151	A	6	6	164090	164095	100 %	0 %	0 %	0 %	482902692
3503	NC_021151	TCG	2	6	164180	164185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902692
3504	NC_021151	ACG	2	6	164317	164322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902692
3505	NC_021151	CGG	2	6	164357	164362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902692
3506	NC_021151	GGC	2	6	164416	164421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902692
3507	NC_021151	GGC	3	9	164455	164463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902692
3508	NC_021151	GGC	2	6	164482	164487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902692
3509	NC_021151	AG	3	6	164505	164510	50 %	0 %	50 %	0 %	482902692
3510	NC_021151	CGG	2	6	164511	164516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902692
3511	NC_021151	AGA	2	6	164526	164531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902692
3512	NC_021151	CGG	2	6	164595	164600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902692
3513	NC_021151	CG	3	6	164614	164619	0 %	0 %	50 %	50 %	482902692
3514	NC_021151	CAC	2	6	164748	164753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902692
3515	NC_021151	CTGG	2	8	164807	164814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_021151	ATCCC	2	10	164835	164844	20 %	20 %	0 %	60 %	482902693
3517	NC_021151	TGA	2	6	164916	164921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902693
3518	NC_021151	GCCAGC	2	12	164960	164971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482902693
3519	NC_021151	GCA	2	6	165003	165008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902693
3520	NC_021151	T	6	6	165080	165085	0 %	100 %	0 %	0 %	482902693
3521	NC_021151	GAA	2	6	165192	165197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902693
3522	NC_021151	AGA	2	6	165293	165298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902693
3523	NC_021151	CGCTGC	2	12	165299	165310	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482902693
3524	NC_021151	AAT	2	6	165415	165420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902693
3525	NC_021151	AGA	2	6	165431	165436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902693
3526	NC_021151	GGC	2	6	165466	165471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902693
3527	NC_021151	GCA	2	6	165492	165497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902693
3528	NC_021151	GGC	2	6	165514	165519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902693
3529	NC_021151	AAT	2	6	165529	165534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902693
3530	NC_021151	AGCGC	2	10	165543	165552	20 %	0 %	40 %	40 %	482902693
3531	NC_021151	AGC	2	6	165609	165614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902693
3532	NC_021151	ATC	2	6	165650	165655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902693
3533	NC_021151	GCG	2	6	165666	165671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902693
3534	NC_021151	ATGA	2	8	165820	165827	50 %	25 %	25 %	0 %	482902693
3535	NC_021151	TGA	2	6	165839	165844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902693
3536	NC_021151	CTT	2	6	165864	165869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902693
3537	NC_021151	GCG	2	6	165878	165883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902693
3538	NC_021151	TGA	2	6	165936	165941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902693
3539	NC_021151	TGCC	2	8	166265	166272	0 %	25 %	25 %	50 %	482902694
3540	NC_021151	CAC	2	6	166310	166315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902694
3541	NC_021151	ACC	2	6	166374	166379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902694
3542	NC_021151	ATC	2	6	166398	166403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902694
3543	NC_021151	TGC	2	6	166422	166427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902694
3544	NC_021151	TGG	2	6	166447	166452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902694
3545	NC_021151	GCC	2	6	166494	166499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902694
3546	NC_021151	ATG	3	9	166545	166553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902694
3547	NC_021151	GC	4	8	166573	166580	0 %	0 %	50 %	50 %	482902694
3548	NC_021151	GGAT	2	8	166611	166618	25 %	25 %	50 %	0 %	482902694
3549	NC_021151	GC	3	6	166705	166710	0 %	0 %	50 %	50 %	482902694
3550	NC_021151	CAA	2	6	166856	166861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902694
3551	NC_021151	GAC	2	6	166868	166873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902694
3552	NC_021151	CTT	2	6	166882	166887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902694
3553	NC_021151	CGCC	2	8	166924	166931	0 %	0 %	25 %	75 %	482902694
3554	NC_021151	GAA	2	6	167053	167058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902694
3555	NC_021151	GAT	2	6	167224	167229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902694
3556	NC_021151	CA	3	6	167253	167258	50 %	0 %	0 %	50 %	482902694
3557	NC_021151	ACC	2	6	167322	167327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902694
3558	NC_021151	TGA	2	6	167370	167375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902694
3559	NC_021151	TGAGC	2	10	167392	167401	20 %	20 %	40 %	20 %	482902694
3560	NC_021151	TGT	2	6	167457	167462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902695
3561	NC_021151	CCAG	2	8	167498	167505	25 %	0 %	25 %	50 %	482902695
3562	NC_021151	GGCG	2	8	167528	167535	0 %	0 %	75 %	25 %	482902695
3563	NC_021151	ATG	2	6	167538	167543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902695
3564	NC_021151	TGA	2	6	167581	167586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902695
3565	NC_021151	TGA	2	6	167623	167628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902695
3566	NC_021151	CGCAT	2	10	167654	167663	20 %	20 %	20 %	40 %	482902695
3567	NC_021151	CCA	2	6	167673	167678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902695
3568	NC_021151	GAT	2	6	167801	167806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902695
3569	NC_021151	GTT	2	6	167845	167850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902695
3570	NC_021151	AAT	2	6	168010	168015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021151	GA	3	6	168095	168100	50 %	0 %	50 %	0 %	482902696
3572	NC_021151	GC	4	8	168105	168112	0 %	0 %	50 %	50 %	482902696
3573	NC_021151	GC	3	6	168126	168131	0 %	0 %	50 %	50 %	482902696
3574	NC_021151	ATA	2	6	168275	168280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902696
3575	NC_021151	CGAAC	2	10	168383	168392	40 %	0 %	20 %	40 %	482902696
3576	NC_021151	ATA	2	6	168401	168406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902696
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3579	NC_021151	GCCA	2	8	168541	168548	25 %	0 %	25 %	50 %	482902696
3580	NC_021151	GCG	2	6	168562	168567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902696
3581	NC_021151	GTTCA	2	10	168649	168658	20 %	40 %	20 %	20 %	482902696
3582	NC_021151	TTGG	2	8	168667	168674	0 %	50 %	50 %	0 %	482902696
3583	NC_021151	CAT	2	6	168717	168722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902696
3584	NC_021151	CGCC	2	8	168723	168730	0 %	0 %	25 %	75 %	482902696
3585	NC_021151	CGG	2	6	168894	168899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902696
3586	NC_021151	GTCG	2	8	168939	168946	0 %	25 %	50 %	25 %	482902696
3587	NC_021151	GGC	2	6	168965	168970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902696
3588	NC_021151	AGC	2	6	169025	169030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_021151	CAC	2	6	169037	169042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_021151	GTTG	2	8	169076	169083	0 %	50 %	50 %	0 %	482902697
3591	NC_021151	TGG	2	6	169151	169156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902697
3592	NC_021151	ATA	2	6	169160	169165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902697
3593	NC_021151	C	6	6	169174	169179	0 %	0 %	0 %	100 %	482902697
3594	NC_021151	ATT	2	6	169209	169214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902697
3595	NC_021151	T	7	7	169245	169251	0 %	100 %	0 %	0 %	482902697
3596	NC_021151	TCG	2	6	169293	169298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902697
3597	NC_021151	GCGT	2	8	169335	169342	0 %	25 %	50 %	25 %	482902697
3598	NC_021151	CAG	2	6	169450	169455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902697
3599	NC_021151	GCC	2	6	169459	169464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902697
3600	NC_021151	GCTA	2	8	169483	169490	25 %	25 %	25 %	25 %	482902697
3601	NC_021151	TCG	2	6	169600	169605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902697
3602	NC_021151	ATGAC	2	10	169615	169624	40 %	20 %	20 %	20 %	482902697
3603	NC_021151	ATC	2	6	169693	169698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902698
3604	NC_021151	TGG	2	6	169771	169776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902698
3605	NC_021151	GCT	2	6	169808	169813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902698
3606	NC_021151	TGG	2	6	169831	169836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902698
3607	NC_021151	GCG	2	6	169908	169913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902698
3608	NC_021151	GCC	2	6	169976	169981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902698
3609	NC_021151	GTT	2	6	170024	170029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902698
3610	NC_021151	TGG	2	6	170104	170109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902698
3611	NC_021151	CTGG	2	8	170138	170145	0 %	25 %	50 %	25 %	482902698
3612	NC_021151	CGC	2	6	170158	170163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902698
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3614	NC_021151	CTGGA	2	10	170205	170214	20 %	20 %	40 %	20 %	482902698
3615	NC_021151	GGCG	2	8	170228	170235	0 %	0 %	75 %	25 %	482902698
3616	NC_021151	GC	3	6	170352	170357	0 %	0 %	50 %	50 %	482902698
3617	NC_021151	GCG	2	6	170391	170396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902698
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3620	NC_021151	ATT	2	6	170436	170441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902698
3621	NC_021151	TGC	2	6	170501	170506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3623	NC_021151	TGT	2	6	170739	170744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902699
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3744	NC_021151	A	6	6	176240	176245	100 %	0 %	0 %	0 %	482902703
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3749	NC_021151	GGC	2	6	176345	176350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902703
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3771	NC_021151	CGTG	2	8	177442	177449	0 %	25 %	50 %	25 %	482902703
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3868	NC_021151	ATC	2	6	181265	181270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902705
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3870	NC_021151	AGA	2	6	181444	181449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902705
3871	NC_021151	A	6	6	181475	181480	100 %	0 %	0 %	0 %	482902705
3872	NC_021151	ATG	2	6	181503	181508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902705
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3886	NC_021151	A	6	6	182170	182175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3887	NC_021151	T	7	7	182192	182198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3888	NC_021151	ATG	2	6	182224	182229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3889	NC_021151	GCA	2	6	182266	182271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3893	NC_021151	AT	3	6	182422	182427	50 %	50 %	0 %	0 %	482902706
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3907	NC_021151	CGT	2	6	182924	182929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902707
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3976	NC_021151	CTA	2	6	185474	185479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3988	NC_021151	CTG	2	6	185827	185832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3989	NC_021151	ACA	2	6	185852	185857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902709
3990	NC_021151	TGAT	2	8	185867	185874	25 %	50 %	25 %	0 %	482902709
3991	NC_021151	TGC	2	6	185904	185909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3992	NC_021151	CTG	2	6	185929	185934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3993	NC_021151	ACG	2	6	185951	185956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3994	NC_021151	AGA	2	6	185958	185963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902709
3995	NC_021151	CCG	2	6	186040	186045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902709
3996	NC_021151	A	6	6	186053	186058	100 %	0 %	0 %	0 %	482902709
3997	NC_021151	TCACCG	2	12	186059	186070	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482902709
3998	NC_021151	CGA	2	6	186099	186104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3999	NC_021151	TC	4	8	186105	186112	0 %	50 %	0 %	50 %	482902709
4000	NC_021151	CAAA	2	8	186222	186229	75 %	0 %	0 %	25 %	482902709

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