MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021151	CGGGTG	2	12	116472	116483	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2502	NC_021151	T	6	6	116618	116623	0 %	100 %	0 %	0 %	482902648
2503	NC_021151	ACAGA	2	10	116639	116648	60 %	0 %	20 %	20 %	482902648
2504	NC_021151	ATT	2	6	116663	116668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902648
2505	NC_021151	T	7	7	116683	116689	0 %	100 %	0 %	0 %	482902648
2506	NC_021151	A	6	6	116710	116715	100 %	0 %	0 %	0 %	482902648
2507	NC_021151	ATT	2	6	116732	116737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902648
2508	NC_021151	CAA	2	6	116769	116774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902648
2509	NC_021151	TTC	2	6	116789	116794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902648
2510	NC_021151	GGAA	2	8	116803	116810	50 %	0 %	50 %	0 %	482902648
2511	NC_021151	ATT	2	6	116837	116842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902648
2512	NC_021151	AT	3	6	116890	116895	50 %	50 %	0 %	0 %	482902648
2513	NC_021151	TCA	2	6	116908	116913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902648
2514	NC_021151	C	6	6	116919	116924	0 %	0 %	0 %	100 %	482902648
2515	NC_021151	CAG	2	6	116998	117003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902649
2516	NC_021151	TGC	2	6	117008	117013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902649
2517	NC_021151	GCG	2	6	117027	117032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902649
2518	NC_021151	GGC	2	6	117039	117044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902649
2519	NC_021151	AGA	2	6	117045	117050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902649
2520	NC_021151	CTT	2	6	117066	117071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902649
2521	NC_021151	GCG	2	6	117161	117166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902649
2522	NC_021151	CAA	2	6	117192	117197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902649
2523	NC_021151	GGT	2	6	117292	117297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902649
2524	NC_021151	GT	3	6	117356	117361	0 %	50 %	50 %	0 %	482902649
2525	NC_021151	GCC	2	6	117367	117372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902649
2526	NC_021151	ACA	2	6	117393	117398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902649
2527	NC_021151	GAC	2	6	117419	117424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902649
2528	NC_021151	ACC	3	9	117467	117475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902649
2529	NC_021151	CGC	2	6	117531	117536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902649
2530	NC_021151	TCT	2	6	117632	117637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902649
2531	NC_021151	CAGCG	2	10	117814	117823	20 %	0 %	40 %	40 %	482902650
2532	NC_021151	ATCA	2	8	117855	117862	50 %	25 %	0 %	25 %	482902650
2533	NC_021151	GC	3	6	117941	117946	0 %	0 %	50 %	50 %	482902650
2534	NC_021151	GCCA	2	8	117948	117955	25 %	0 %	25 %	50 %	482902650
2535	NC_021151	GCG	2	6	118037	118042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902650
2536	NC_021151	CAG	2	6	118068	118073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2537	NC_021151	CGA	2	6	118106	118111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2538	NC_021151	GCCGG	2	10	118114	118123	0 %	0 %	60 %	40 %	482902650
2539	NC_021151	GCC	2	6	118161	118166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2540	NC_021151	GGAC	2	8	118215	118222	25 %	0 %	50 %	25 %	482902650
2541	NC_021151	AC	3	6	118221	118226	50 %	0 %	0 %	50 %	482902650
2542	NC_021151	CGAGC	2	10	118239	118248	20 %	0 %	40 %	40 %	482902650
2543	NC_021151	TCC	2	6	118285	118290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902650
2544	NC_021151	GCC	2	6	118302	118307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2545	NC_021151	GCG	2	6	118348	118353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902650
2546	NC_021151	TGC	2	6	118390	118395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2547	NC_021151	GTA	2	6	118453	118458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902650
2548	NC_021151	GCC	2	6	118473	118478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2549	NC_021151	CGC	2	6	118515	118520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2550	NC_021151	GGCG	2	8	118560	118567	0 %	0 %	75 %	25 %	482902650
2551	NC_021151	GCT	2	6	118578	118583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2552	NC_021151	TCGCCG	2	12	118612	118623	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482902650
2553	NC_021151	CAC	2	6	118632	118637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902650
2554	NC_021151	ATTTG	2	10	118682	118691	20 %	60 %	20 %	0 %	482902650
2555	NC_021151	GTCA	2	8	118710	118717	25 %	25 %	25 %	25 %	482902650
2556	NC_021151	GAC	2	6	118845	118850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2557	NC_021151	TGC	2	6	118855	118860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2558	NC_021151	CG	3	6	118870	118875	0 %	0 %	50 %	50 %	482902650
2559	NC_021151	CCG	2	6	118897	118902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2560	NC_021151	GGTTCA	2	12	118913	118924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482902650
2561	NC_021151	GCG	2	6	118957	118962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902650
2562	NC_021151	AGT	2	6	118984	118989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902650
2563	NC_021151	ACC	2	6	119053	119058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902650
2564	NC_021151	GCTG	2	8	119237	119244	0 %	25 %	50 %	25 %	482902650
2565	NC_021151	TGT	2	6	119360	119365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902651
2566	NC_021151	CTG	2	6	119383	119388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2567	NC_021151	GCG	2	6	119392	119397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2568	NC_021151	GGC	2	6	119476	119481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2569	NC_021151	CGG	2	6	119511	119516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2570	NC_021151	GCG	2	6	119525	119530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2571	NC_021151	CGA	2	6	119556	119561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2572	NC_021151	GCA	2	6	119587	119592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2573	NC_021151	GCC	2	6	119626	119631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902651
2574	NC_021151	GC	5	10	119687	119696	0 %	0 %	50 %	50 %	482902651
2575	NC_021151	GCG	2	6	119800	119805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2576	NC_021151	CAC	2	6	119824	119829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902651
2577	NC_021151	GCT	2	6	119886	119891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2578	NC_021151	CTGG	2	8	119893	119900	0 %	25 %	50 %	25 %	482902651
2579	NC_021151	TGC	2	6	119927	119932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2580	NC_021151	CAC	2	6	120031	120036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902651
2581	NC_021151	CGC	2	6	120192	120197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902651
2582	NC_021151	CGG	2	6	120270	120275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2583	NC_021151	TCA	2	6	120332	120337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902651
2584	NC_021151	AAG	2	6	120338	120343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902651
2585	NC_021151	GGC	2	6	120350	120355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2586	NC_021151	CGG	2	6	120410	120415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2587	NC_021151	GTG	2	6	120431	120436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902651
2588	NC_021151	AGC	2	6	120443	120448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2589	NC_021151	CGG	2	6	120483	120488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2590	NC_021151	GCC	2	6	120559	120564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902651
2591	NC_021151	AGT	2	6	120576	120581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902651
2592	NC_021151	TCG	2	6	120617	120622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2593	NC_021151	CGG	2	6	120633	120638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2594	NC_021151	GCG	2	6	120782	120787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2595	NC_021151	CG	3	6	120840	120845	0 %	0 %	50 %	50 %	482902651
2596	NC_021151	GAT	2	6	120846	120851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902651
2597	NC_021151	GTT	2	6	120862	120867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902651
2598	NC_021151	CTT	2	6	120888	120893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902651
2599	NC_021151	TGG	2	6	120918	120923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902651
2600	NC_021151	TCG	2	6	120929	120934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2601	NC_021151	GC	3	6	120959	120964	0 %	0 %	50 %	50 %	482902651
2602	NC_021151	CAATTG	2	12	120990	121001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482902651
2603	NC_021151	TCCA	2	8	121014	121021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_021151	AG	3	6	121046	121051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021151	CAGG	2	8	121068	121075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2606	NC_021151	AATGCT	2	12	121098	121109	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2607	NC_021151	TCA	2	6	121250	121255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_021151	GTC	2	6	121286	121291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_021151	TCT	2	6	121315	121320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_021151	G	6	6	121330	121335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_021151	T	7	7	121444	121450	0 %	100 %	0 %	0 %	482902652
2612	NC_021151	ATCG	2	8	121451	121458	25 %	25 %	25 %	25 %	482902652
2613	NC_021151	AT	3	6	121477	121482	50 %	50 %	0 %	0 %	482902652
2614	NC_021151	TAA	3	9	121516	121524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902652
2615	NC_021151	TGTC	2	8	121537	121544	0 %	50 %	25 %	25 %	482902652
2616	NC_021151	AT	3	6	121554	121559	50 %	50 %	0 %	0 %	482902652
2617	NC_021151	CCG	2	6	121568	121573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902652
2618	NC_021151	TCA	2	6	121582	121587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902652
2619	NC_021151	GC	3	6	121718	121723	0 %	0 %	50 %	50 %	482902652
2620	NC_021151	ATC	2	6	121754	121759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902652
2621	NC_021151	CTG	2	6	121808	121813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902652
2622	NC_021151	GTT	2	6	121819	121824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902652
2623	NC_021151	TAAT	2	8	121842	121849	50 %	50 %	0 %	0 %	482902652
2624	NC_021151	CCG	2	6	121862	121867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902652
2625	NC_021151	TGCC	2	8	121888	121895	0 %	25 %	25 %	50 %	482902652
2626	NC_021151	CAG	2	6	121994	121999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902652
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2628	NC_021151	ATG	2	6	122199	122204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_021151	TCA	2	6	122288	122293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2631	NC_021151	CTG	2	6	122319	122324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902653
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2734	NC_021151	GC	4	8	126473	126480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2735	NC_021151	TAGTG	2	10	126511	126520	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2737	NC_021151	GCA	2	6	126534	126539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2745	NC_021151	CGG	2	6	127012	127017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902657
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2991	NC_021151	CTTG	2	8	139567	139574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2992	NC_021151	TCC	2	6	139584	139589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2993	NC_021151	AAG	2	6	139634	139639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_021151	G	6	6	139660	139665	0 %	0 %	100 %	0 %	482902668
2995	NC_021151	CATC	2	8	139769	139776	25 %	25 %	0 %	50 %	482902668
2996	NC_021151	CTG	2	6	139785	139790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902668
2997	NC_021151	CCTG	2	8	139799	139806	0 %	25 %	25 %	50 %	482902668
2998	NC_021151	ATT	2	6	139815	139820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902668
2999	NC_021151	GATG	2	8	139907	139914	25 %	25 %	50 %	0 %	482902668
3000	NC_021151	AAG	2	6	139969	139974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902668

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