MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021151	GC	3	6	92300	92305	0 %	0 %	50 %	50 %	482902629
2002	NC_021151	CGC	2	6	92324	92329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902629
2003	NC_021151	TGG	2	6	92362	92367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902629
2004	NC_021151	GGC	2	6	92391	92396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902629
2005	NC_021151	ATG	2	6	92517	92522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902629
2006	NC_021151	CCG	2	6	92597	92602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902629
2007	NC_021151	CTAT	2	8	92665	92672	25 %	50 %	0 %	25 %	482902629
2008	NC_021151	TCG	2	6	92689	92694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902629
2009	NC_021151	T	6	6	92754	92759	0 %	100 %	0 %	0 %	482902629
2010	NC_021151	ATG	2	6	92835	92840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902629
2011	NC_021151	GCT	2	6	92855	92860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902629
2012	NC_021151	CAT	2	6	92882	92887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902629
2013	NC_021151	GTG	2	6	92895	92900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902629
2014	NC_021151	CTT	2	6	92918	92923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902629
2015	NC_021151	CGG	2	6	92927	92932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902629
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2020	NC_021151	GCA	2	6	93346	93351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902630
2021	NC_021151	CGC	2	6	93474	93479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902630
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2023	NC_021151	TAAT	2	8	93537	93544	50 %	50 %	0 %	0 %	482902630
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2035	NC_021151	GC	4	8	94309	94316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2037	NC_021151	A	6	6	94356	94361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2055	NC_021151	ATA	2	6	95168	95173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_021151	TAT	2	6	95181	95186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2059	NC_021151	T	7	7	95435	95441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2063	NC_021151	AT	3	6	95531	95536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2099	NC_021151	ATC	2	6	97651	97656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2109	NC_021151	ATC	2	6	97944	97949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2115	NC_021151	CG	4	8	98121	98128	0 %	0 %	50 %	50 %	482902634
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2131	NC_021151	GGC	3	9	98745	98753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902635
2132	NC_021151	GCG	2	6	98773	98778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902635
2133	NC_021151	TCTGT	2	10	98789	98798	0 %	60 %	20 %	20 %	482902635
2134	NC_021151	AATG	2	8	98882	98889	50 %	25 %	25 %	0 %	482902635
2135	NC_021151	TGG	2	6	98968	98973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902635
2136	NC_021151	GAT	2	6	98975	98980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902635
2137	NC_021151	GCT	2	6	98984	98989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902635
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2139	NC_021151	GCG	2	6	98998	99003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902635
2140	NC_021151	CCA	2	6	99007	99012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902635
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2142	NC_021151	GCGCT	2	10	99099	99108	0 %	20 %	40 %	40 %	482902635
2143	NC_021151	CG	3	6	99113	99118	0 %	0 %	50 %	50 %	482902635
2144	NC_021151	GGCG	2	8	99224	99231	0 %	0 %	75 %	25 %	482902635
2145	NC_021151	CTG	2	6	99234	99239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902635
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2148	NC_021151	TGG	2	6	99349	99354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902635
2149	NC_021151	CTG	2	6	99372	99377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902635
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2152	NC_021151	GGCGC	2	10	99513	99522	0 %	0 %	60 %	40 %	482902635
2153	NC_021151	GGC	2	6	99587	99592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902635
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2166	NC_021151	TGG	2	6	100144	100149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902635
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2170	NC_021151	ACT	2	6	100398	100403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2174	NC_021151	T	8	8	100520	100527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2175	NC_021151	TAAT	2	8	100539	100546	50 %	50 %	0 %	0 %	482902636
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2252	NC_021151	CTT	2	6	104994	104999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902641
2253	NC_021151	CGA	2	6	105020	105025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902641
2254	NC_021151	TTG	2	6	105032	105037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902641
2255	NC_021151	ATC	2	6	105053	105058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902641
2256	NC_021151	TTGTT	2	10	105140	105149	0 %	80 %	20 %	0 %	482902641
2257	NC_021151	TCT	2	6	105204	105209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902641
2258	NC_021151	CGT	2	6	105273	105278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902641
2259	NC_021151	GCT	2	6	105285	105290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902641
2260	NC_021151	CCTG	2	8	105293	105300	0 %	25 %	25 %	50 %	482902641
2261	NC_021151	ACG	2	6	105353	105358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902641
2262	NC_021151	ATT	2	6	105361	105366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902641
2263	NC_021151	GAC	2	6	105367	105372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902641
2264	NC_021151	G	6	6	105396	105401	0 %	0 %	100 %	0 %	482902641
2265	NC_021151	AGC	2	6	105440	105445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902641
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2267	NC_021151	ATCA	2	8	105506	105513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2268	NC_021151	GTT	2	6	105638	105643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902642
2269	NC_021151	AGC	2	6	105695	105700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2270	NC_021151	AGT	2	6	105758	105763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902642
2271	NC_021151	TGAT	2	8	105820	105827	25 %	50 %	25 %	0 %	482902642
2272	NC_021151	AAT	2	6	105854	105859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902642
2273	NC_021151	AT	3	6	105880	105885	50 %	50 %	0 %	0 %	482902642
2274	NC_021151	GCT	4	12	105948	105959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2275	NC_021151	GTC	2	6	106068	106073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2276	NC_021151	TGT	2	6	106088	106093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902642
2277	NC_021151	TAG	2	6	106120	106125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902642
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2279	NC_021151	CAT	3	9	106163	106171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902642
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2282	NC_021151	GCTTC	2	10	106520	106529	0 %	40 %	20 %	40 %	482902642
2283	NC_021151	GTA	2	6	106680	106685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902642
2284	NC_021151	GCT	2	6	106716	106721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2285	NC_021151	TGCGT	2	10	106807	106816	0 %	40 %	40 %	20 %	482902642
2286	NC_021151	TACT	2	8	106837	106844	25 %	50 %	0 %	25 %	482902642
2287	NC_021151	TGC	2	6	106927	106932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2288	NC_021151	GCCT	2	8	107028	107035	0 %	25 %	25 %	50 %	482902642
2289	NC_021151	ATA	2	6	107065	107070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902642
2290	NC_021151	CGG	2	6	107077	107082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902642
2291	NC_021151	TGG	2	6	107102	107107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902642
2292	NC_021151	TTC	2	6	107298	107303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902642
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2305	NC_021151	TATT	2	8	107883	107890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2306	NC_021151	CAT	2	6	107895	107900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2323	NC_021151	TGA	2	6	108809	108814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902643
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2328	NC_021151	AATG	2	8	108985	108992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2329	NC_021151	AAGCG	2	10	109003	109012	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2330	NC_021151	CAC	2	6	109238	109243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902644
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2332	NC_021151	TAT	2	6	109252	109257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902644
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2338	NC_021151	CG	3	6	109399	109404	0 %	0 %	50 %	50 %	482902644
2339	NC_021151	CGC	2	6	109489	109494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902644
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2342	NC_021151	ACA	2	6	109597	109602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902644
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2344	NC_021151	CCAG	2	8	109654	109661	25 %	0 %	25 %	50 %	482902644
2345	NC_021151	GCG	2	6	109669	109674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902644
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2348	NC_021151	CTG	2	6	109780	109785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
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2351	NC_021151	GC	3	6	109894	109899	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
2352	NC_021151	ATCA	2	8	109903	109910	50 %	25 %	0 %	25 %	482902645
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2361	NC_021151	CGA	2	6	110436	110441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2362	NC_021151	GTC	3	9	110479	110487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
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2367	NC_021151	CG	3	6	110692	110697	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
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2369	NC_021151	GAC	2	6	110826	110831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
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2371	NC_021151	GC	3	6	110943	110948	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
2372	NC_021151	TCT	2	6	110954	110959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902645
2373	NC_021151	GGC	3	9	110971	110979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902645
2374	NC_021151	CGG	2	6	111018	111023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902645
2375	NC_021151	TTCGCG	2	12	111034	111045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2376	NC_021151	GGT	2	6	111070	111075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902645
2377	NC_021151	CCA	2	6	111160	111165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902645
2378	NC_021151	CG	3	6	111245	111250	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
2379	NC_021151	CGGCAG	2	12	111292	111303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482902645
2380	NC_021151	TCA	2	6	111410	111415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902645
2381	NC_021151	GGC	2	6	111418	111423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902645
2382	NC_021151	TCG	2	6	111431	111436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2383	NC_021151	TCG	2	6	111509	111514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2384	NC_021151	CAG	2	6	111535	111540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2385	NC_021151	TTC	2	6	111580	111585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902645
2386	NC_021151	CAG	2	6	111622	111627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2387	NC_021151	TGGCG	2	10	111667	111676	0 %	20 %	60 %	20 %	482902645
2388	NC_021151	CAG	3	9	111679	111687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2389	NC_021151	AT	3	6	111725	111730	50 %	50 %	0 %	0 %	482902645
2390	NC_021151	GAT	2	6	111762	111767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902645
2391	NC_021151	TCG	2	6	111773	111778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2392	NC_021151	ACC	2	6	111779	111784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902645
2393	NC_021151	GCT	2	6	111822	111827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2394	NC_021151	CGG	2	6	111833	111838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902645
2395	NC_021151	GTT	2	6	111864	111869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902645
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2397	NC_021151	GCA	2	6	111954	111959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2398	NC_021151	GAT	2	6	111997	112002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902645
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2403	NC_021151	CG	3	6	112098	112103	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
2404	NC_021151	CGA	2	6	112112	112117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2405	NC_021151	CAT	2	6	112122	112127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902645
2406	NC_021151	GCTC	2	8	112200	112207	0 %	25 %	25 %	50 %	482902645
2407	NC_021151	AGCGC	2	10	112227	112236	20 %	0 %	40 %	40 %	482902645
2408	NC_021151	TCGA	2	8	112249	112256	25 %	25 %	25 %	25 %	482902645
2409	NC_021151	TCT	2	6	112385	112390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902645
2410	NC_021151	GC	3	6	112480	112485	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
2411	NC_021151	CATC	2	8	112536	112543	25 %	25 %	0 %	50 %	482902645
2412	NC_021151	CAA	2	6	112545	112550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902645
2413	NC_021151	GGC	2	6	112768	112773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2414	NC_021151	AGT	2	6	112813	112818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902646
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2424	NC_021151	GCG	2	6	113210	113215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902646
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2441	NC_021151	CCG	2	6	114037	114042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902646
2442	NC_021151	TCG	2	6	114068	114073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902646
2443	NC_021151	CG	3	6	114072	114077	0 %	0 %	50 %	50 %	482902646
2444	NC_021151	GCG	2	6	114180	114185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902646
2445	NC_021151	A	7	7	114343	114349	100 %	0 %	0 %	0 %	482902646
2446	NC_021151	GCA	2	6	114440	114445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902646
2447	NC_021151	GAT	2	6	114477	114482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902646
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2450	NC_021151	TGG	2	6	114571	114576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902646
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2461	NC_021151	GCCA	2	8	115063	115070	25 %	0 %	25 %	50 %	482902646
2462	NC_021151	GCG	2	6	115091	115096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902646
2463	NC_021151	CCTG	2	8	115126	115133	0 %	25 %	25 %	50 %	482902646
2464	NC_021151	GAT	2	6	115140	115145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2479	NC_021151	TGCC	2	8	115767	115774	0 %	25 %	25 %	50 %	482902647
2480	NC_021151	TGA	2	6	115782	115787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902647
2481	NC_021151	ATGA	2	8	115802	115809	50 %	25 %	25 %	0 %	482902647
2482	NC_021151	GTTC	2	8	115810	115817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2483	NC_021151	AT	3	6	115896	115901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_021151	AAT	2	6	115908	115913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2485	NC_021151	GGC	2	6	115928	115933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2486	NC_021151	GAGT	2	8	115938	115945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2487	NC_021151	ATGG	2	8	116043	116050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2488	NC_021151	ATG	2	6	116102	116107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2489	NC_021151	CAG	2	6	116118	116123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2490	NC_021151	TTTA	2	8	116160	116167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_021151	A	6	6	116275	116280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2492	NC_021151	T	6	6	116287	116292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_021151	GTTT	2	8	116293	116300	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_021151	TAAT	2	8	116301	116308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_021151	ATA	2	6	116358	116363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2496	NC_021151	TAAA	2	8	116384	116391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_021151	TCG	2	6	116411	116416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2498	NC_021151	CT	3	6	116421	116426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2499	NC_021151	TAATT	2	10	116430	116439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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